RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000215941.8

ANKRD54-201, Transcript of ankyrin repeat domain 54, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene ANKRD54, Length 2,184 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD54-201ENST00000215941 SEPT11Q9NVA2 429 aaKnown RBP24.51■■□□□ 1.51
ANKRD54-201ENST00000215941 IFNAR2P48551 515 aa24.5■■□□□ 1.51
ANKRD54-201ENST00000215941 CCDC15Q0P6D6 951 aa24.5■■□□□ 1.51
ANKRD54-201ENST00000215941 CETN1Q12798 172 aa24.5■■□□□ 1.51
ANKRD54-201ENST00000215941 NAA25Q14CX7 972 aa24.5■■□□□ 1.51
ANKRD54-201ENST00000215941 SYDE1Q6ZW31 735 aaPredicted RBP24.5■■□□□ 1.51
ANKRD54-201ENST00000215941 C1orf186Q6ZWK4 172 aa24.5■■□□□ 1.51
ANKRD54-201ENST00000215941 SLC13A5Q86YT5 568 aaPredicted RBP24.5■■□□□ 1.51
ANKRD54-201ENST00000215941 CCDC105Q8IYK2 499 aa24.5■■□□□ 1.51
ANKRD54-201ENST00000215941 TMEM174Q8WUU8 243 aa24.5■■□□□ 1.51
ANKRD54-201ENST00000215941 GRAMD1AQ96CP6 724 aa24.5■■□□□ 1.51
ANKRD54-201ENST00000215941 MTFR1LQ9H019 292 aa24.5■■□□□ 1.51
ANKRD54-201ENST00000215941 NYAP2Q9P242 653 aa24.5■■□□□ 1.51
ANKRD54-201ENST00000215941 MSH4O15457 936 aa24.5■■□□□ 1.51
ANKRD54-201ENST00000215941 WFS1O76024 890 aa24.5■■□□□ 1.51
ANKRD54-201ENST00000215941 FTLP02792 175 aaPredicted RBP24.5■■□□□ 1.51
ANKRD54-201ENST00000215941 SHROOM1Q2M3G4 852 aaPredicted RBP24.5■■□□□ 1.51
ANKRD54-201ENST00000215941 TATDN1Q6P1N9 297 aa24.5■■□□□ 1.51
ANKRD54-201ENST00000215941 AGAP11Q8TF27 550 aa24.5■■□□□ 1.51
ANKRD54-201ENST00000215941 CKAP2Q8WWK9 683 aa24.5■■□□□ 1.51
ANKRD54-201ENST00000215941 KRT35Q92764 455 aa24.5■■□□□ 1.51
ANKRD54-201ENST00000215941 ARHGEF2Q92974 986 aaKnown RBP24.5■■□□□ 1.51
ANKRD54-201ENST00000215941 PLVAPQ9BX97 442 aa24.5■■□□□ 1.51
ANKRD54-201ENST00000215941 PDGFDQ9GZP0 370 aaPredicted RBP24.5■■□□□ 1.51
ANKRD54-201ENST00000215941 AGPAT3Q9NRZ7 376 aa24.5■■□□□ 1.51
ANKRD54-201ENST00000215941 LOXHD1Q8IVV2 1947 aa24.5■■□□□ 1.51
ANKRD54-201ENST00000215941 FAM86B1E9PN63 330 aa24.49■■□□□ 1.51
ANKRD54-201ENST00000215941 LIN7AO14910 233 aaPredicted RBP24.49■■□□□ 1.51
ANKRD54-201ENST00000215941 RAD21O60216 631 aa24.49■■□□□ 1.51
ANKRD54-201ENST00000215941 ECEL1O95672 775 aa24.49■■□□□ 1.51
ANKRD54-201ENST00000215941 FAM86B2P0C5J1 330 aa24.49■■□□□ 1.51
ANKRD54-201ENST00000215941 CCNG1P51959 295 aa24.49■■□□□ 1.51
ANKRD54-201ENST00000215941 BFSP1Q12934 665 aa24.49■■□□□ 1.51
ANKRD54-201ENST00000215941 ZNF720Q7Z2F6 126 aa24.49■■□□□ 1.51
ANKRD54-201ENST00000215941 LMO3Q8TAP4 145 aa24.49■■□□□ 1.51
ANKRD54-201ENST00000215941 KLHL29Q96CT2 875 aa24.49■■□□□ 1.51
ANKRD54-201ENST00000215941 FOXN3O00409 490 aaPredicted RBP24.49■■□□□ 1.51
ANKRD54-201ENST00000215941 RPSAP08865 295 aaKnown RBP24.49■■□□□ 1.51
ANKRD54-201ENST00000215941 MAN1A1P33908 653 aa24.49■■□□□ 1.51
ANKRD54-201ENST00000215941 ALDH5A1P51649 535 aaPredicted RBP24.49■■□□□ 1.51
ANKRD54-201ENST00000215941 MAP2K1Q02750 393 aaPredicted RBP24.49■■□□□ 1.51
ANKRD54-201ENST00000215941 CAV1Q03135 178 aa24.49■■□□□ 1.51
ANKRD54-201ENST00000215941 PHLDB3Q6NSJ2 640 aa24.49■■□□□ 1.51
ANKRD54-201ENST00000215941 SPATA21Q7Z572 469 aa24.49■■□□□ 1.51
ANKRD54-201ENST00000215941 TTLL6Q8N841 843 aa24.49■■□□□ 1.51
ANKRD54-201ENST00000215941 UIMC1Q96RL1 719 aa24.49■■□□□ 1.51
ANKRD54-201ENST00000215941 HSD17B14Q9BPX1 270 aa24.49■■□□□ 1.51
ANKRD54-201ENST00000215941 TRIM7Q9C029 511 aa24.49■■□□□ 1.51
ANKRD54-201ENST00000215941 CCDC113Q9H0I3 377 aa24.49■■□□□ 1.51
ANKRD54-201ENST00000215941 PRKAG3Q9UGI9 489 aa24.49■■□□□ 1.51
ANKRD54-201ENST00000215941 TCP11X1B4DZS4 312 aa24.48■■□□□ 1.51
ANKRD54-201ENST00000215941 ENTPD3O75355 529 aa24.48■■□□□ 1.51
ANKRD54-201ENST00000215941 ITIH2P19823 946 aa24.48■■□□□ 1.51
ANKRD54-201ENST00000215941 COMTP21964 271 aa24.48■■□□□ 1.51
ANKRD54-201ENST00000215941 NMT1P30419 496 aaKnown RBP24.48■■□□□ 1.51
ANKRD54-201ENST00000215941 SLCO1A2P46721 670 aa24.48■■□□□ 1.51
ANKRD54-201ENST00000215941 ACVR2BQ13705 512 aa24.48■■□□□ 1.51
ANKRD54-201ENST00000215941 ASRGL1Q7L266 308 aa24.48■■□□□ 1.51
ANKRD54-201ENST00000215941 MIGA2Q7L4E1 593 aa24.48■■□□□ 1.51
ANKRD54-201ENST00000215941 PALB2Q86YC2 1186 aa24.48■■□□□ 1.51
ANKRD54-201ENST00000215941 ZDHHC14Q8IZN3 488 aa24.48■■□□□ 1.51
ANKRD54-201ENST00000215941 PRMT6Q96LA8 375 aaPredicted RBP24.48■■□□□ 1.51
ANKRD54-201ENST00000215941 DBR1Q9UK59 544 aaKnown RBP24.48■■□□□ 1.51
ANKRD54-201ENST00000215941 TMEM120BA0PK00 339 aa24.47■■□□□ 1.51
ANKRD54-201ENST00000215941 IGF2BP3O00425 579 aaKnown RBP eCLIP24.47■■□□□ 1.51
ANKRD54-201ENST00000215941 IBSPP21815 317 aaPredicted RBP24.47■■□□□ 1.51
ANKRD54-201ENST00000215941 KCNJ2P63252 427 aa24.47■■□□□ 1.51
ANKRD54-201ENST00000215941 CYP4A11Q02928 519 aa24.47■■□□□ 1.51
ANKRD54-201ENST00000215941 ZKSCAN8Q15776 578 aaPredicted RBP24.47■■□□□ 1.51
ANKRD54-201ENST00000215941 GRIPAP1Q4V328 841 aa24.47■■□□□ 1.51
ANKRD54-201ENST00000215941 RNF43Q68DV7 783 aa24.47■■□□□ 1.51
ANKRD54-201ENST00000215941 CDC42EP4Q9H3Q1 356 aaKnown RBP24.47■■□□□ 1.51
ANKRD54-201ENST00000215941 FGFR1OP2Q9NVK5 253 aa24.47■■□□□ 1.51
ANKRD54-201ENST00000215941 CCNB1P14635 433 aa24.47■■□□□ 1.51
ANKRD54-201ENST00000215941 LACTBP83111 547 aaPredicted RBP24.47■■□□□ 1.51
ANKRD54-201ENST00000215941 RRP1BQ14684 758 aaKnown RBP24.47■■□□□ 1.51
ANKRD54-201ENST00000215941 SIX1Q15475 284 aaPredicted RBP24.47■■□□□ 1.51
ANKRD54-201ENST00000215941 ARHGAP44Q17R89 818 aa24.47■■□□□ 1.51
ANKRD54-201ENST00000215941 SLFN13Q68D06 897 aa24.47■■□□□ 1.51
ANKRD54-201ENST00000215941 CHADLQ6NUI6 762 aa24.47■■□□□ 1.51
ANKRD54-201ENST00000215941 TMEM179Q6ZVK1 233 aa24.47■■□□□ 1.51
ANKRD54-201ENST00000215941 FIZ1Q96SL8 496 aa24.47■■□□□ 1.51
ANKRD54-201ENST00000215941 USP20Q9Y2K6 914 aa24.47■■□□□ 1.51
ANKRD54-201ENST00000215941 CD2APQ9Y5K6 639 aa24.47■■□□□ 1.51
ANKRD54-201ENST00000215941 ACTL7BQ9Y614 415 aa24.47■■□□□ 1.51
ANKRD54-201ENST00000215941 KCTD19Q17RG1 926 aaPredicted RBP24.46■■□□□ 1.51
ANKRD54-201ENST00000215941 ABCB5Q2M3G0 1257 aa24.46■■□□□ 1.51
ANKRD54-201ENST00000215941 AADACL2Q6P093 401 aa24.46■■□□□ 1.51
ANKRD54-201ENST00000215941 VSTM1Q6UX27 236 aa24.46■■□□□ 1.51
ANKRD54-201ENST00000215941 FAM178BQ8IXR5 827 aa24.46■■□□□ 1.51
ANKRD54-201ENST00000215941 MAIP1Q8WWC4 291 aa24.46■■□□□ 1.51
ANKRD54-201ENST00000215941 CCDC189A1A4V9 331 aa24.46■■□□□ 1.51
ANKRD54-201ENST00000215941 GDF11O95390 407 aa24.46■■□□□ 1.51
ANKRD54-201ENST00000215941 PYGMP11217 842 aa24.46■■□□□ 1.51
ANKRD54-201ENST00000215941 ATP11AP98196 1134 aa24.46■■□□□ 1.51
ANKRD54-201ENST00000215941 ICA1Q05084 483 aa24.46■■□□□ 1.51
ANKRD54-201ENST00000215941 NUGGCQ68CJ6 796 aa24.46■■□□□ 1.51
ANKRD54-201ENST00000215941 RHBDF2Q6PJF5 856 aa24.46■■□□□ 1.51
ANKRD54-201ENST00000215941 INTS8Q75QN2 995 aaKnown RBP24.46■■□□□ 1.51
ANKRD54-201ENST00000215941 RTKN2Q8IZC4 609 aa24.46■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 37.9 ms