RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000054666.10

VAMP3-201, Transcript of vesicle associated membrane protein 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene VAMP3, Length 2,205 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAMP3-201ENST00000054666 GOLGA6L10A0A0M3HER8 536 aa8.9□□□□□ -0.98
VAMP3-201ENST00000054666 ADM5C9JUS6 153 aa8.9□□□□□ -0.98
VAMP3-201ENST00000054666 KRIT1O00522 736 aa8.9□□□□□ -0.98
VAMP3-201ENST00000054666 HSF2BPO75031 334 aa8.9□□□□□ -0.98
VAMP3-201ENST00000054666 RNF40O75150 1001 aa8.9□□□□□ -0.98
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VAMP3-201ENST00000054666 MCCD1P59942 119 aaPredicted RBP8.9□□□□□ -0.98
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VAMP3-201ENST00000054666 C11orf63Q6NUN7 778 aa8.9□□□□□ -0.98
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VAMP3-201ENST00000054666 SEMA4DQ92854 862 aa8.9□□□□□ -0.98
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VAMP3-201ENST00000054666 SGPL1O95470 568 aa8.89□□□□□ -0.99
VAMP3-201ENST00000054666 SLC25A27O95847 323 aa8.89□□□□□ -0.99
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VAMP3-201ENST00000054666 TAS1R3Q7RTX0 852 aa8.89□□□□□ -0.99
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VAMP3-201ENST00000054666 ANKRD13AQ8IZ07 590 aa8.89□□□□□ -0.99
VAMP3-201ENST00000054666 HELQQ8TDG4 1101 aa8.89□□□□□ -0.99
VAMP3-201ENST00000054666 AFAP1L1Q8TED9 768 aa8.89□□□□□ -0.99
VAMP3-201ENST00000054666 ZNF526Q8TF50 670 aaPredicted RBP8.89□□□□□ -0.99
VAMP3-201ENST00000054666 SCFD2Q8WU76 684 aa8.89□□□□□ -0.99
VAMP3-201ENST00000054666 CNKSR2Q8WXI2 1034 aa8.89□□□□□ -0.99
VAMP3-201ENST00000054666 KCNN1Q92952 543 aa8.89□□□□□ -0.99
VAMP3-201ENST00000054666 POP1Q99575 1024 aaKnown RBP8.89□□□□□ -0.99
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