RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000065330.7

Clk3-201, Transcript of Dual specificity protein kinase CLK3, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Clk3, Length 2,496 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clk3-201ENSMUST00000065330 B4galnt4Q766D5 1034 aa20.3■□□□□ 0.84
Clk3-201ENSMUST00000065330 TwistnbQ78WZ7 330 aaKnown RBP20.3■□□□□ 0.84
Clk3-201ENSMUST00000065330 AarsQ8BGQ7 968 aa20.3■□□□□ 0.84
Clk3-201ENSMUST00000065330 Tor4aQ8BH02 426 aa20.3■□□□□ 0.84
Clk3-201ENSMUST00000065330 Ipo5Q8BKC5 1097 aaKnown RBP20.3■□□□□ 0.84
Clk3-201ENSMUST00000065330 Ppfia2Q8BSS9 1257 aa20.3■□□□□ 0.84
Clk3-201ENSMUST00000065330 Als2cr12Q8BVM7 383 aa20.3■□□□□ 0.84
Clk3-201ENSMUST00000065330 Tor1aip2Q8BYU6 502 aa20.3■□□□□ 0.84
Clk3-201ENSMUST00000065330 Ranbp17Q99NF8 1088 aa20.3■□□□□ 0.84
Clk3-201ENSMUST00000065330 PrameQ9D4Z5 464 aa20.3■□□□□ 0.84
Clk3-201ENSMUST00000065330 Olr1Q9EQ09 363 aa20.3■□□□□ 0.84
Clk3-201ENSMUST00000065330 Ripor3A1L3T7 938 aa20.3■□□□□ 0.84
Clk3-201ENSMUST00000065330 Alkbh1P0CB42 389 aa20.3■□□□□ 0.84
Clk3-201ENSMUST00000065330 IvlP48997 467 aa20.3■□□□□ 0.84
Clk3-201ENSMUST00000065330 Wdr41Q3UDP0 460 aa20.3■□□□□ 0.84
Clk3-201ENSMUST00000065330 Nsun6Q7TS68 476 aa20.3■□□□□ 0.84
Clk3-201ENSMUST00000065330 Sestd1Q80UK0 696 aa20.3■□□□□ 0.84
Clk3-201ENSMUST00000065330 Bicd1Q8BR07 835 aa20.3■□□□□ 0.84
Clk3-201ENSMUST00000065330 Lrrc45Q8CIM1 670 aa20.3■□□□□ 0.84
Clk3-201ENSMUST00000065330 Gbp7Q91Z40 638 aa20.3■□□□□ 0.84
Clk3-201ENSMUST00000065330 Cpb2Q9JHH6 422 aa20.3■□□□□ 0.84
Clk3-201ENSMUST00000065330 Sv2aQ9JIS5 742 aa20.3■□□□□ 0.84
Clk3-201ENSMUST00000065330 Drg2Q9QXB9 364 aaKnown RBP20.3■□□□□ 0.84
Clk3-201ENSMUST00000065330 Cdc25cP48967 447 aa20.29■□□□□ 0.84
Clk3-201ENSMUST00000065330 Slc1a1P51906 523 aa20.29■□□□□ 0.84
Clk3-201ENSMUST00000065330 Tarbp2P97473 365 aa20.29■□□□□ 0.84
Clk3-201ENSMUST00000065330 Palb2Q3U0P1 1104 aa20.29■□□□□ 0.84
Clk3-201ENSMUST00000065330 HnrnpdQ60668 355 aaKnown RBP20.29■□□□□ 0.84
Clk3-201ENSMUST00000065330 Mageb18Q8BQR7 327 aa20.29■□□□□ 0.84
Clk3-201ENSMUST00000065330 C130026I21RikQ8C898 291 aa20.29■□□□□ 0.84
Clk3-201ENSMUST00000065330 Znf445Q8R2V3 986 aa20.29■□□□□ 0.84
Clk3-201ENSMUST00000065330 Ttc1Q91Z38 292 aa20.29■□□□□ 0.84
Clk3-201ENSMUST00000065330 Cntn6Q9JMB8 1028 aa20.29■□□□□ 0.84
Clk3-201ENSMUST00000065330 Krt17Q9QWL7 433 aa20.29■□□□□ 0.84
Clk3-201ENSMUST00000065330 Mta2Q9R190 668 aa20.29■□□□□ 0.84
Clk3-201ENSMUST00000065330 Mettl1Q9Z120 268 aa20.29■□□□□ 0.84
Clk3-201ENSMUST00000065330 Proca1B0QZF7 307 aa20.29■□□□□ 0.84
Clk3-201ENSMUST00000065330 DgkhD3YXJ0 1156 aa20.29■□□□□ 0.84
Clk3-201ENSMUST00000065330 Nptx2O70340 429 aa20.29■□□□□ 0.84
Clk3-201ENSMUST00000065330 Wfs1P56695 890 aa20.29■□□□□ 0.84
Clk3-201ENSMUST00000065330 SnrpfP62307 86 aaKnown RBP20.29■□□□□ 0.84
Clk3-201ENSMUST00000065330 Dab2ipQ3UHC7 1189 aa20.29■□□□□ 0.84
Clk3-201ENSMUST00000065330 Gm10488Q4KL05 212 aa20.29■□□□□ 0.84
Clk3-201ENSMUST00000065330 Tgoln2Q62314 363 aa20.29■□□□□ 0.84
Clk3-201ENSMUST00000065330 Apol9bQ8C7I4 310 aa20.29■□□□□ 0.84
Clk3-201ENSMUST00000065330 Apol9aQ8VDU3 310 aa20.29■□□□□ 0.84
Clk3-201ENSMUST00000065330 JmyQ9QXM1 983 aa20.29■□□□□ 0.84
Clk3-201ENSMUST00000065330 Krt71Q9R0H5 524 aa20.29■□□□□ 0.84
Clk3-201ENSMUST00000065330 Chmp6P0C0A3 200 aa20.28■□□□□ 0.84
Clk3-201ENSMUST00000065330 Tex35Q14BK3 207 aa20.28■□□□□ 0.84
Clk3-201ENSMUST00000065330 Pdlim7Q3TJD7 457 aa20.28■□□□□ 0.84
Clk3-201ENSMUST00000065330 Mtus1Q5HZI1 1210 aa20.28■□□□□ 0.84
Clk3-201ENSMUST00000065330 Sema5aQ62217 1077 aa20.28■□□□□ 0.84
Clk3-201ENSMUST00000065330 Six1Q62231 284 aa20.28■□□□□ 0.84
Clk3-201ENSMUST00000065330 Rhbdf2Q80WQ6 827 aa20.28■□□□□ 0.84
Clk3-201ENSMUST00000065330 Rassf10Q8BL43 508 aa20.28■□□□□ 0.84
Clk3-201ENSMUST00000065330 Bri3bpQ8BXV2 253 aa20.28■□□□□ 0.84
Clk3-201ENSMUST00000065330 Fsd1lQ8BYN5 507 aa20.28■□□□□ 0.84
Clk3-201ENSMUST00000065330 Rint1Q8BZ36 792 aa20.28■□□□□ 0.84
Clk3-201ENSMUST00000065330 Stard7Q8R1R3 373 aa20.28■□□□□ 0.84
Clk3-201ENSMUST00000065330 Cnot8Q9D8X5 292 aa20.28■□□□□ 0.84
Clk3-201ENSMUST00000065330 IdeQ9JHR7 1019 aa20.28■□□□□ 0.84
Clk3-201ENSMUST00000065330 SrcapA0A087WQ44 3271 aa20.28■□□□□ 0.84
Clk3-201ENSMUST00000065330 Zfp457L7N1X4 647 aa20.28■□□□□ 0.84
Clk3-201ENSMUST00000065330 Axin2O88566 840 aa20.28■□□□□ 0.84
Clk3-201ENSMUST00000065330 AfpP02772 605 aa20.28■□□□□ 0.84
Clk3-201ENSMUST00000065330 Ttc39dQ0VF76 604 aa20.28■□□□□ 0.84
Clk3-201ENSMUST00000065330 SpoplQ2M2N2 392 aa20.28■□□□□ 0.84
Clk3-201ENSMUST00000065330 Gga2Q6P5E6 603 aa20.28■□□□□ 0.84
Clk3-201ENSMUST00000065330 Cpa5Q8R4H4 436 aa20.28■□□□□ 0.84
Clk3-201ENSMUST00000065330 Tmx2Q9D710 295 aaKnown RBP20.28■□□□□ 0.84
Clk3-201ENSMUST00000065330 Znf804aA2AKY4 1200 aa20.27■□□□□ 0.84
Clk3-201ENSMUST00000065330 Map4k1P70218 827 aa20.27■□□□□ 0.84
Clk3-201ENSMUST00000065330 LdhdQ7TNG8 484 aa20.27■□□□□ 0.84
Clk3-201ENSMUST00000065330 Nxf1Q99JX7 618 aaKnown RBP20.27■□□□□ 0.84
Clk3-201ENSMUST00000065330 Fam133bQ9CVI2 245 aaKnown RBP20.27■□□□□ 0.84
Clk3-201ENSMUST00000065330 Ccdc91Q9D8L5 442 aa20.27■□□□□ 0.84
Clk3-201ENSMUST00000065330 Art2aP17981 287 aa20.27■□□□□ 0.83
Clk3-201ENSMUST00000065330 Efcab14Q8BGQ6 484 aa20.27■□□□□ 0.83
Clk3-201ENSMUST00000065330 Tll2Q9WVM6 1012 aa20.27■□□□□ 0.83
Clk3-201ENSMUST00000065330 Bpifb9bA2AJD1 591 aa20.26■□□□□ 0.83
Clk3-201ENSMUST00000065330 Gm382B1AXN3 1250 aa20.26■□□□□ 0.83
Clk3-201ENSMUST00000065330 Cap1P40124 474 aa20.26■□□□□ 0.83
Clk3-201ENSMUST00000065330 PklrP53657 574 aa20.26■□□□□ 0.83
Clk3-201ENSMUST00000065330 Mfsd14aP70187 490 aa20.26■□□□□ 0.83
Clk3-201ENSMUST00000065330 Rrp36Q3UFY0 244 aaKnown RBP20.26■□□□□ 0.83
Clk3-201ENSMUST00000065330 Bpifb9aQ80XI7 591 aa20.26■□□□□ 0.83
Clk3-201ENSMUST00000065330 Rassf3Q99P51 232 aa20.26■□□□□ 0.83
Clk3-201ENSMUST00000065330 Sf3a3Q9D554 501 aaKnown RBP20.26■□□□□ 0.83
Clk3-201ENSMUST00000065330 Mipol1Q9D9F8 279 aa20.26■□□□□ 0.83
Clk3-201ENSMUST00000065330 Prmt2Q9R144 448 aa20.26■□□□□ 0.83
Clk3-201ENSMUST00000065330 Per1O35973 1291 aa20.26■□□□□ 0.83
Clk3-201ENSMUST00000065330 Mt-CybP00158 381 aa20.26■□□□□ 0.83
Clk3-201ENSMUST00000065330 Ifnb1P01575 182 aa20.26■□□□□ 0.83
Clk3-201ENSMUST00000065330 Tcf12Q61286 706 aa20.26■□□□□ 0.83
Clk3-201ENSMUST00000065330 Ythdf3Q8BYK6 585 aaKnown RBP20.26■□□□□ 0.83
Clk3-201ENSMUST00000065330 Usp37Q8C0R0 979 aa20.26■□□□□ 0.83
Clk3-201ENSMUST00000065330 Kbtbd13Q8C828 458 aa20.26■□□□□ 0.83
Clk3-201ENSMUST00000065330 Fkbp6Q91XW8 327 aa20.26■□□□□ 0.83
Clk3-201ENSMUST00000065330 Tacc3Q9JJ11 631 aa20.26■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 32.1 ms