RNA–Protein interactions for RNA: YMR138W

CIN4, Transcript of GTP-binding protein involved in beta-tubulin (Tub2p) folding, yeast

Gene CIN4, Length 576 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
CIN4	YMR138W	YAE1	P47118	141 aa	Predicted RBP	5.2	□□□□□ -1.58
CIN4	YMR138W	ADO1	P47143	340 aa	Known RBP	5.2	□□□□□ -1.58
CIN4	YMR138W	RBL2	P48606	106 aa	Known RBP	5.2	□□□□□ -1.58
CIN4	YMR138W	PPT1	P53043	513 aa		5.2	□□□□□ -1.58
CIN4	YMR138W	RMD9	P53140	646 aa	Known RBP	5.2	□□□□□ -1.58
CIN4	YMR138W	SCW11	P53189	542 aa		5.2	□□□□□ -1.58
CIN4	YMR138W	PAU12	P53343	120 aa		5.2	□□□□□ -1.58
CIN4	YMR138W	MKC7	P53379	596 aa		5.2	□□□□□ -1.58
CIN4	YMR138W	YNL092W	P53934	400 aa		5.2	□□□□□ -1.58
CIN4	YMR138W	YDR102C	Q03864	110 aa		5.2	□□□□□ -1.58
CIN4	YMR138W	CTS2	Q06350	511 aa		5.2	□□□□□ -1.58
CIN4	YMR138W	MRL1	Q06815	381 aa		5.2	□□□□□ -1.58
CIN4	YMR138W	TGS1	Q12052	315 aa		5.2	□□□□□ -1.58
CIN4	YMR138W	BAG7	Q12128	409 aa		5.2	□□□□□ -1.58
CIN4	YMR138W	TY1A-BL	Q12266	440 aa		5.2	□□□□□ -1.58
CIN4	YMR138W	MSW1	P04803	379 aa		5.19	□□□□□ -1.58
CIN4	YMR138W	RPS13	P05756	151 aa	Known RBP	5.19	□□□□□ -1.58
CIN4	YMR138W	MRP1	P10662	321 aa	Known RBP	5.19	□□□□□ -1.58
CIN4	YMR138W	DBF2	P22204	572 aa		5.19	□□□□□ -1.58
CIN4	YMR138W	GIT1	P25346	518 aa		5.19	□□□□□ -1.58
CIN4	YMR138W	DOA4	P32571	926 aa		5.19	□□□□□ -1.58
CIN4	YMR138W	VPS17	P32913	551 aa		5.19	□□□□□ -1.58
CIN4	YMR138W	YBR063C	P38083	404 aa		5.19	□□□□□ -1.58
CIN4	YMR138W	PUG1	P40100	303 aa		5.19	□□□□□ -1.58
CIN4	YMR138W	SLZ1	P40167	298 aa		5.19	□□□□□ -1.58
CIN4	YMR138W	QDR1	P40475	563 aa		5.19	□□□□□ -1.58
CIN4	YMR138W	YJL218W	P40892	196 aa	Known RBP	5.19	□□□□□ -1.58
CIN4	YMR138W	GPP1	P41277	250 aa	Known RBP	5.19	□□□□□ -1.58
CIN4	YMR138W	GDS1	P41913	522 aa		5.19	□□□□□ -1.58
CIN4	YMR138W	RPL6A	Q02326	176 aa	Known RBP	5.19	□□□□□ -1.58
CIN4	YMR138W	YAP6	Q03935	383 aa		5.19	□□□□□ -1.58
CIN4	YMR138W	YDR387C	Q04162	555 aa		5.19	□□□□□ -1.58
CIN4	YMR138W	CRR1	Q05790	422 aa		5.19	□□□□□ -1.58
CIN4	YMR138W	SYC1	Q08553	188 aa	Predicted RBP	5.19	□□□□□ -1.58
CIN4	YMR138W	FRE5	Q08908	694 aa		5.19	□□□□□ -1.58
CIN4	YMR138W	RCN2	Q12044	265 aa		5.19	□□□□□ -1.58
CIN4	YMR138W	RRI1	Q12468	440 aa		5.19	□□□□□ -1.58
CIN4	YMR138W	NKP1	Q12493	238 aa		5.19	□□□□□ -1.58
CIN4	YMR138W	FOL3	Q12676	427 aa	Predicted RBP	5.19	□□□□□ -1.58
CIN4	YMR138W	AHC2	P25649	128 aa		5.18	□□□□□ -1.58
CIN4	YMR138W	RPS5	P26783	225 aa	Known RBP	5.18	□□□□□ -1.58
CIN4	YMR138W	ITR1	P30605	584 aa		5.18	□□□□□ -1.58
CIN4	YMR138W	TAT1	P38085	619 aa		5.18	□□□□□ -1.58
CIN4	YMR138W	PAU24	P38155	120 aa		5.18	□□□□□ -1.58
CIN4	YMR138W	CCZ1	P38273	704 aa		5.18	□□□□□ -1.58
CIN4	YMR138W	CHS7	P38843	316 aa		5.18	□□□□□ -1.58
CIN4	YMR138W	YIL165C	P40446	119 aa		5.18	□□□□□ -1.58
CIN4	YMR138W	SDP1	P40479	209 aa		5.18	□□□□□ -1.58
CIN4	YMR138W	DPB11	P47027	764 aa	Predicted RBP	5.18	□□□□□ -1.58
CIN4	YMR138W	EFM3	P47163	339 aa		5.18	□□□□□ -1.58
CIN4	YMR138W	LYS5	P50113	272 aa		5.18	□□□□□ -1.58
CIN4	YMR138W	YGL204C	P53089	101 aa		5.18	□□□□□ -1.58
CIN4	YMR138W	VOA1	P53262	265 aa		5.18	□□□□□ -1.58
CIN4	YMR138W	TNA1	P53322	534 aa		5.18	□□□□□ -1.58
CIN4	YMR138W	HHT1	P61830	136 aa		5.18	□□□□□ -1.58
CIN4	YMR138W	PRP3	Q03338	469 aa	Predicted RBP	5.18	□□□□□ -1.58
CIN4	YMR138W	YMR265C	Q03508	461 aa	Known RBP	5.18	□□□□□ -1.58
CIN4	YMR138W	HAS1	Q03532	505 aa	Known RBP	5.18	□□□□□ -1.58
CIN4	YMR138W	YDR391C	Q04170	232 aa		5.18	□□□□□ -1.58
CIN4	YMR138W	HLR1	Q04429	423 aa		5.18	□□□□□ -1.58
CIN4	YMR138W	MRX8	Q05473	314 aa		5.18	□□□□□ -1.58
CIN4	YMR138W	LUC7	Q07508	261 aa	Predicted RBP	5.18	□□□□□ -1.58
CIN4	YMR138W	RKM1	Q08961	583 aa	Predicted RBP	5.18	□□□□□ -1.58
CIN4	YMR138W	RTC5	Q12108	567 aa	Known RBP	5.18	□□□□□ -1.58
CIN4	YMR138W	TY1A-NL1	Q12391	440 aa	Known RBP	5.18	□□□□□ -1.58
CIN4	YMR138W	IZH2	Q12442	317 aa		5.18	□□□□□ -1.58
CIN4	YMR138W	KIN28	P06242	306 aa		5.17	□□□□□ -1.58
CIN4	YMR138W	RPS16A	P0CX51	143 aa	Known RBP	5.17	□□□□□ -1.58
CIN4	YMR138W	RPS16B	P0CX52	143 aa	Known RBP	5.17	□□□□□ -1.58
CIN4	YMR138W	MEK1	P24719	497 aa	Predicted RBP	5.17	□□□□□ -1.58
CIN4	YMR138W	SDS22	P36047	338 aa		5.17	□□□□□ -1.58
CIN4	YMR138W	PEX32	P38292	413 aa		5.17	□□□□□ -1.58
CIN4	YMR138W	YGP1	P38616	354 aa	Known RBP	5.17	□□□□□ -1.58
CIN4	YMR138W	YER084W	P40057	128 aa		5.17	□□□□□ -1.58
CIN4	YMR138W	AVT7	P40501	490 aa		5.17	□□□□□ -1.58
CIN4	YMR138W	IDP2	P41939	412 aa		5.17	□□□□□ -1.58
CIN4	YMR138W	BNA6	P43619	295 aa		5.17	□□□□□ -1.58
CIN4	YMR138W	YIP5	P53108	310 aa		5.17	□□□□□ -1.58
CIN4	YMR138W	SAY1	P53324	424 aa		5.17	□□□□□ -1.58
CIN4	YMR138W	SRL4	Q03085	281 aa		5.17	□□□□□ -1.58
CIN4	YMR138W	MAK3	Q03503	176 aa		5.17	□□□□□ -1.58
CIN4	YMR138W	RCE1	Q03530	315 aa		5.17	□□□□□ -1.58
CIN4	YMR138W	YDR514C	Q04408	483 aa		5.17	□□□□□ -1.58
CIN4	YMR138W	NNT1	Q05874	261 aa		5.17	□□□□□ -1.58
CIN4	YMR138W	TSR2	Q06672	205 aa	Known RBP	5.17	□□□□□ -1.58
CIN4	YMR138W	FRE3	Q08905	711 aa		5.17	□□□□□ -1.58
CIN4	YMR138W	SIR2	P06700	562 aa		5.16	□□□□□ -1.58
CIN4	YMR138W	MCM1	P11746	286 aa		5.16	□□□□□ -1.58
CIN4	YMR138W	STE18	P18852	110 aa		5.16	□□□□□ -1.58
CIN4	YMR138W	CPR2	P23285	205 aa		5.16	□□□□□ -1.58
CIN4	YMR138W	SED4	P25365	1065 aa		5.16	□□□□□ -1.58
CIN4	YMR138W	FUN26	P31381	517 aa		5.16	□□□□□ -1.58
CIN4	YMR138W	MRPS5	P33759	307 aa		5.16	□□□□□ -1.58
CIN4	YMR138W	SDS24	P38314	527 aa		5.16	□□□□□ -1.58
CIN4	YMR138W	FMC1	P40491	155 aa		5.16	□□□□□ -1.58
CIN4	YMR138W	YFL051C	P43552	160 aa		5.16	□□□□□ -1.58
CIN4	YMR138W	LOH1	P47055	219 aa		5.16	□□□□□ -1.58
CIN4	YMR138W	PMT5	P52867	743 aa		5.16	□□□□□ -1.58
CIN4	YMR138W	ACS2	P52910	683 aa	Known RBP	5.16	□□□□□ -1.58
CIN4	YMR138W	SAM50	P53969	484 aa		5.16	□□□□□ -1.58

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