RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000639501.1

PMS1-222, Transcript of PMS1 homolog 1, mismatch repair system component, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene PMS1, Length 2,506 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PMS1-222ENST00000639501 CCDC105Q8IYK2 499 aa22.03■■□□□ 1.12
PMS1-222ENST00000639501 FAM186BQ8IYM0 893 aa22.03■■□□□ 1.12
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PMS1-222ENST00000639501 TGS1Q96RS0 853 aaKnown RBP22.03■■□□□ 1.12
PMS1-222ENST00000639501 MXD3Q9BW11 206 aa22.03■■□□□ 1.12
PMS1-222ENST00000639501 AKR1B1P15121 316 aa22.02■■□□□ 1.12
PMS1-222ENST00000639501 COILP38432 576 aaPredicted RBP22.02■■□□□ 1.12
PMS1-222ENST00000639501 ATP11AP98196 1134 aa22.02■■□□□ 1.12
PMS1-222ENST00000639501 BIRC2Q13490 618 aa22.02■■□□□ 1.12
PMS1-222ENST00000639501 SIX1Q15475 284 aaPredicted RBP22.02■■□□□ 1.12
PMS1-222ENST00000639501 OSBPL1AQ9BXW6 950 aa22.02■■□□□ 1.12
PMS1-222ENST00000639501 SPATS2LQ9NUQ6 558 aaKnown RBP22.02■■□□□ 1.12
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PMS1-222ENST00000639501 A6NHS1 94 aa22.02■■□□□ 1.11
PMS1-222ENST00000639501 ATMINO43313 823 aaPredicted RBP22.02■■□□□ 1.11
PMS1-222ENST00000639501 PEX5P50542 639 aa22.02■■□□□ 1.11
PMS1-222ENST00000639501 CCNG1P51959 295 aa22.02■■□□□ 1.11
PMS1-222ENST00000639501 CYP4A11Q02928 519 aa22.02■■□□□ 1.11
PMS1-222ENST00000639501 ZNF543Q08ER8 600 aa22.02■■□□□ 1.11
PMS1-222ENST00000639501 SLC10A5Q5PT55 438 aa22.02■■□□□ 1.11
PMS1-222ENST00000639501 RC3H1Q5TC82 1133 aaKnown RBP22.02■■□□□ 1.11
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PMS1-222ENST00000639501 CYP4X1Q8N118 509 aa22.02■■□□□ 1.11
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PMS1-222ENST00000639501 ETNK1Q9HBU6 452 aa22.02■■□□□ 1.11
PMS1-222ENST00000639501 COMTP21964 271 aa22.01■■□□□ 1.11
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PMS1-222ENST00000639501 ZC2HC1CQ53FD0 456 aaPredicted RBP22.01■■□□□ 1.11
PMS1-222ENST00000639501 ZNF746Q6NUN9 644 aaPredicted RBP22.01■■□□□ 1.11
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PMS1-222ENST00000639501 MAP3K13O43283 966 aa22.01■■□□□ 1.11
PMS1-222ENST00000639501 CETPP11597 493 aa22.01■■□□□ 1.11
PMS1-222ENST00000639501 MESDQ14696 234 aa22.01■■□□□ 1.11
PMS1-222ENST00000639501 KCTD1Q719H9 257 aa22.01■■□□□ 1.11
PMS1-222ENST00000639501 ROPN1BQ9BZX4 212 aaPredicted RBP22.01■■□□□ 1.11
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PMS1-222ENST00000639501 ROPN1Q9HAT0 212 aaPredicted RBP22.01■■□□□ 1.11
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PMS1-222ENST00000639501 LIN7AO14910 233 aaPredicted RBP22■■□□□ 1.11
PMS1-222ENST00000639501 RPS6KA4O75676 772 aa22■■□□□ 1.11
PMS1-222ENST00000639501 UNC5CO95185 931 aa22■■□□□ 1.11
PMS1-222ENST00000639501 RHBDL3P58872 404 aa22■■□□□ 1.11
PMS1-222ENST00000639501 THEMIS2Q5TEJ8 643 aa22■■□□□ 1.11
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PMS1-222ENST00000639501 UBL4BQ8N7F7 174 aa22■■□□□ 1.11
PMS1-222ENST00000639501 BTBD6Q96KE9 485 aa22■■□□□ 1.11
PMS1-222ENST00000639501 TMEM237Q96Q45 408 aa22■■□□□ 1.11
PMS1-222ENST00000639501 BHMT2Q9H2M3 363 aa22■■□□□ 1.11
PMS1-222ENST00000639501 DNM3Q9UQ16 869 aa22■■□□□ 1.11
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PMS1-222ENST00000639501 PEX11AO75192 247 aa21.98■■□□□ 1.11
PMS1-222ENST00000639501 TTLL1O95922 423 aa21.98■■□□□ 1.11
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PMS1-222ENST00000639501 PSMC2P35998 433 aaKnown RBP21.98■■□□□ 1.11
PMS1-222ENST00000639501 KIF22Q14807 665 aa21.98■■□□□ 1.11
PMS1-222ENST00000639501 NFIXQ14938 502 aa21.98■■□□□ 1.11
PMS1-222ENST00000639501 CLUL1Q15846 466 aa21.98■■□□□ 1.11
PMS1-222ENST00000639501 RNF43Q68DV7 783 aa21.98■■□□□ 1.11
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