RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000629983.2

CAPNS1-217, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene CAPNS1, Length 799 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-217ENST00000629983 HOXA11P31270 313 aaPredicted RBP30.56■■■□□ 2.48
CAPNS1-217ENST00000629983 RFC5P40937 340 aa30.56■■■□□ 2.48
CAPNS1-217ENST00000629983 MOXD1Q6UVY6 613 aa30.56■■■□□ 2.48
CAPNS1-217ENST00000629983 RNF149Q8NC42 400 aa30.56■■■□□ 2.48
CAPNS1-217ENST00000629983 APOL6Q9BWW8 343 aa30.56■■■□□ 2.48
CAPNS1-217ENST00000629983 MLH1P40692 756 aa30.55■■■□□ 2.48
CAPNS1-217ENST00000629983 INF2Q27J81 1249 aa30.55■■■□□ 2.48
CAPNS1-217ENST00000629983 GET4Q7L5D6 327 aaPredicted RBP30.55■■■□□ 2.48
CAPNS1-217ENST00000629983 PALB2Q86YC2 1186 aa30.55■■■□□ 2.48
CAPNS1-217ENST00000629983 COLGALT2Q8IYK4 626 aa30.55■■■□□ 2.48
CAPNS1-217ENST00000629983 KCNB2Q92953 911 aa30.55■■■□□ 2.48
CAPNS1-217ENST00000629983 MBOAT7Q96N66 472 aa30.55■■■□□ 2.48
CAPNS1-217ENST00000629983 GAD1Q99259 594 aa30.55■■■□□ 2.48
CAPNS1-217ENST00000629983 SEMA4AQ9H3S1 761 aa30.55■■■□□ 2.48
CAPNS1-217ENST00000629983 IPPQ9Y573 584 aa30.55■■■□□ 2.48
CAPNS1-217ENST00000629983 CPLX1O14810 134 aa30.54■■■□□ 2.48
CAPNS1-217ENST00000629983 SLC37A4O43826 429 aa30.54■■■□□ 2.48
CAPNS1-217ENST00000629983 SCNN1GP51170 649 aa30.54■■■□□ 2.48
CAPNS1-217ENST00000629983 GLYCTKQ8IVS8 523 aa30.54■■■□□ 2.48
CAPNS1-217ENST00000629983 SMG8Q8ND04 991 aaKnown RBP30.54■■■□□ 2.48
CAPNS1-217ENST00000629983 GPR152Q8TDT2 470 aa30.54■■■□□ 2.48
CAPNS1-217ENST00000629983 TCP11Q8WWU5 503 aa30.54■■■□□ 2.48
CAPNS1-217ENST00000629983 NXPE3Q969Y0 559 aa30.54■■■□□ 2.48
CAPNS1-217ENST00000629983 AGXT2Q9BYV1 514 aa30.54■■■□□ 2.48
CAPNS1-217ENST00000629983 DHX33Q9H6R0 707 aaKnown RBP30.54■■■□□ 2.48
CAPNS1-217ENST00000629983 PPME1Q9Y570 386 aa30.54■■■□□ 2.48
CAPNS1-217ENST00000629983 ARL5CA6NH57 179 aa30.53■■■□□ 2.48
CAPNS1-217ENST00000629983 MARCH6O60337 910 aa30.53■■■□□ 2.48
CAPNS1-217ENST00000629983 P4HBP07237 508 aaKnown RBP30.53■■■□□ 2.48
CAPNS1-217ENST00000629983 DCNP07585 359 aaKnown RBP30.53■■■□□ 2.48
CAPNS1-217ENST00000629983 PSMA5P28066 241 aa30.53■■■□□ 2.48
CAPNS1-217ENST00000629983 HSPA4P34932 840 aa30.53■■■□□ 2.48
CAPNS1-217ENST00000629983 EMC2Q15006 297 aa30.53■■■□□ 2.48
CAPNS1-217ENST00000629983 KIAA0319Q5VV43 1072 aa30.53■■■□□ 2.48
CAPNS1-217ENST00000629983 KIAA2013Q8IYS2 634 aa30.53■■■□□ 2.48
CAPNS1-217ENST00000629983 FBXL16Q8N461 479 aa30.53■■■□□ 2.48
CAPNS1-217ENST00000629983 EIF2AQ9BY44 585 aaKnown RBP30.53■■■□□ 2.48
CAPNS1-217ENST00000629983 RHOBTB2Q9BYZ6 727 aa30.53■■■□□ 2.48
CAPNS1-217ENST00000629983 RXFP1Q9HBX9 757 aa30.53■■■□□ 2.48
CAPNS1-217ENST00000629983 VPS13AQ96RL7 3174 aa30.52■■■□□ 2.48
CAPNS1-217ENST00000629983 F8W810 466 aa30.52■■■□□ 2.48
CAPNS1-217ENST00000629983 DEXIO95424 95 aa30.52■■■□□ 2.48
CAPNS1-217ENST00000629983 DSG1Q02413 1049 aa30.52■■■□□ 2.48
CAPNS1-217ENST00000629983 NCBP1Q09161 790 aaKnown RBP30.52■■■□□ 2.48
CAPNS1-217ENST00000629983 PPP2R5CQ13362 524 aa30.52■■■□□ 2.48
CAPNS1-217ENST00000629983 KRT25Q7Z3Z0 450 aa30.52■■■□□ 2.48
CAPNS1-217ENST00000629983 ZNF707Q96C28 371 aaPredicted RBP30.52■■■□□ 2.48
CAPNS1-217ENST00000629983 COLEC11Q9BWP8 271 aa30.52■■■□□ 2.48
CAPNS1-217ENST00000629983 RNF39Q9H2S5 420 aa30.52■■■□□ 2.48
CAPNS1-217ENST00000629983 ARHGEF3Q9NR81 526 aa30.52■■■□□ 2.48
CAPNS1-217ENST00000629983 WRAP73Q9P2S5 460 aaPredicted RBP30.52■■■□□ 2.48
CAPNS1-217ENST00000629983 VAV3Q9UKW4 847 aa30.52■■■□□ 2.48
CAPNS1-217ENST00000629983 HES2Q9Y543 173 aa30.52■■■□□ 2.48
CAPNS1-217ENST00000629983 ASAP2O43150 1006 aa30.51■■■□□ 2.47
CAPNS1-217ENST00000629983 GAS2O43903 313 aaKnown RBP30.51■■■□□ 2.47
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CAPNS1-217ENST00000629983 ZC3H14Q6PJT7 736 aaKnown RBP30.51■■■□□ 2.47
CAPNS1-217ENST00000629983 DAGLBQ8NCG7 672 aa30.51■■■□□ 2.47
CAPNS1-217ENST00000629983 ST13P5Q8NFI4 369 aaPredicted RBP30.51■■■□□ 2.47
CAPNS1-217ENST00000629983 CPB2Q96IY4 423 aa30.51■■■□□ 2.47
CAPNS1-217ENST00000629983 B3GALT6Q96L58 329 aa30.51■■■□□ 2.47
CAPNS1-217ENST00000629983 ZFP42Q96MM3 310 aa30.51■■■□□ 2.47
CAPNS1-217ENST00000629983 LXNQ9BS40 222 aa30.51■■■□□ 2.47
CAPNS1-217ENST00000629983 TRIM6Q9C030 488 aaPredicted RBP30.51■■■□□ 2.47
CAPNS1-217ENST00000629983 PLEKHA4Q9H4M7 779 aa30.51■■■□□ 2.47
CAPNS1-217ENST00000629983 C2orf16Q68DN1 1984 aa30.5■■■□□ 2.47
CAPNS1-217ENST00000629983 YWHABP31946 246 aaKnown RBP30.5■■■□□ 2.47
CAPNS1-217ENST00000629983 XKR9Q5GH70 373 aa30.5■■■□□ 2.47
CAPNS1-217ENST00000629983 OTUD6AQ7L8S5 288 aa30.5■■■□□ 2.47
CAPNS1-217ENST00000629983 FERMT3Q86UX7 667 aa30.5■■■□□ 2.47
CAPNS1-217ENST00000629983 HDAC7Q8WUI4 952 aa30.5■■■□□ 2.47
CAPNS1-217ENST00000629983 RMDN1Q96DB5 314 aa30.5■■■□□ 2.47
CAPNS1-217ENST00000629983 FAM20AQ96MK3 541 aa30.5■■■□□ 2.47
CAPNS1-217ENST00000629983 NT5C3AQ9H0P0 336 aa30.5■■■□□ 2.47
CAPNS1-217ENST00000629983 FAM120AQ9NZB2 1118 aaKnown RBP eCLIP30.5■■■□□ 2.47
CAPNS1-217ENST00000629983 SIT1Q9Y3P8 196 aa30.5■■■□□ 2.47
CAPNS1-217ENST00000629983 CCDC194A0A1B0GVG4 234 aa30.49■■■□□ 2.47
CAPNS1-217ENST00000629983 INO80B-WBP1J3KQ70 363 aa30.49■■■□□ 2.47
CAPNS1-217ENST00000629983 M0R2N6 131 aa30.49■■■□□ 2.47
CAPNS1-217ENST00000629983 TSPAN1O60635 241 aa30.49■■■□□ 2.47
CAPNS1-217ENST00000629983 AXLP30530 894 aa30.49■■■□□ 2.47
CAPNS1-217ENST00000629983 DSC1Q08554 894 aa30.49■■■□□ 2.47
CAPNS1-217ENST00000629983 NCAPH2Q6IBW4 605 aa30.49■■■□□ 2.47
CAPNS1-217ENST00000629983 GALNT17Q6IS24 598 aa30.49■■■□□ 2.47
CAPNS1-217ENST00000629983 DGLUCYQ7Z3D6 616 aa30.49■■■□□ 2.47
CAPNS1-217ENST00000629983 HACE1Q8IYU2 909 aa30.49■■■□□ 2.47
CAPNS1-217ENST00000629983 RNF168Q8IYW5 571 aaPredicted RBP30.49■■■□□ 2.47
CAPNS1-217ENST00000629983 CCDC51Q96ER9 411 aa30.49■■■□□ 2.47
CAPNS1-217ENST00000629983 AIFM3Q96NN9 605 aa30.49■■■□□ 2.47
CAPNS1-217ENST00000629983 MTRQ99707 1265 aa30.49■■■□□ 2.47
CAPNS1-217ENST00000629983 APOBEC3CQ9NRW3 190 aaKnown RBP eCLIP30.49■■■□□ 2.47
CAPNS1-217ENST00000629983 MIOSQ9NXC5 875 aa30.49■■■□□ 2.47
CAPNS1-217ENST00000629983 ZDHHC7Q9NXF8 308 aa30.49■■■□□ 2.47
CAPNS1-217ENST00000629983 TGM5O43548 720 aa30.48■■■□□ 2.47
CAPNS1-217ENST00000629983 LAMP2P13473 410 aa30.48■■■□□ 2.47
CAPNS1-217ENST00000629983 FUT10Q6P4F1 479 aa30.48■■■□□ 2.47
CAPNS1-217ENST00000629983 DCLRE1AQ6PJP8 1040 aa30.48■■■□□ 2.47
CAPNS1-217ENST00000629983 CPLX2Q6PUV4 134 aaKnown RBP30.48■■■□□ 2.47
CAPNS1-217ENST00000629983 CSRNP2Q9H175 543 aa30.48■■■□□ 2.47
CAPNS1-217ENST00000629983 RPL17P18621 184 aaKnown RBP30.47■■■□□ 2.47
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