RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000628306.2

CAPNS1-216, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene CAPNS1, Length 1,389 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-216ENST00000628306 ZC3H11AO75152 810 aaKnown RBP eCLIP26.82■■□□□ 1.88
CAPNS1-216ENST00000628306 POLGP54098 1239 aaPredicted RBP26.82■■□□□ 1.88
CAPNS1-216ENST00000628306 MTERF2Q49AM1 385 aa26.82■■□□□ 1.88
CAPNS1-216ENST00000628306 CCDC183Q5T5S1 534 aa26.82■■□□□ 1.88
CAPNS1-216ENST00000628306 SCLT1Q96NL6 688 aa26.82■■□□□ 1.88
CAPNS1-216ENST00000628306 TEKT3Q9BXF9 490 aa26.82■■□□□ 1.88
CAPNS1-216ENST00000628306 GCOM2Q9BZD3 368 aaPredicted RBP26.82■■□□□ 1.88
CAPNS1-216ENST00000628306 DDX19AQ9NUU7 478 aaKnown RBP26.82■■□□□ 1.88
CAPNS1-216ENST00000628306 DZANK1Q9NVP4 752 aa26.82■■□□□ 1.88
CAPNS1-216ENST00000628306 DNAJB4Q9UDY4 337 aa26.82■■□□□ 1.88
CAPNS1-216ENST00000628306 FAM186AA6NE01 2351 aa26.82■■□□□ 1.88
CAPNS1-216ENST00000628306 OFD1O75665 1012 aa26.81■■□□□ 1.88
CAPNS1-216ENST00000628306 CMA1P23946 247 aa26.81■■□□□ 1.88
CAPNS1-216ENST00000628306 ZSCAN23Q3MJ62 389 aa26.81■■□□□ 1.88
CAPNS1-216ENST00000628306 LONRF3Q496Y0 759 aa26.81■■□□□ 1.88
CAPNS1-216ENST00000628306 Q4G0T1 1027 aa26.81■■□□□ 1.88
CAPNS1-216ENST00000628306 AXDND1Q5T1B0 1012 aaPredicted RBP26.81■■□□□ 1.88
CAPNS1-216ENST00000628306 KRT25Q7Z3Z0 450 aa26.81■■□□□ 1.88
CAPNS1-216ENST00000628306 RDM1Q8NG50 284 aa26.81■■□□□ 1.88
CAPNS1-216ENST00000628306 GZF1Q9H116 711 aaPredicted RBP26.81■■□□□ 1.88
CAPNS1-216ENST00000628306 SEPT9Q9UHD8 586 aaPredicted RBP26.81■■□□□ 1.88
CAPNS1-216ENST00000628306 USTQ9Y2C2 406 aa26.81■■□□□ 1.88
CAPNS1-216ENST00000628306 ZNF623O75123 536 aa26.8■■□□□ 1.88
CAPNS1-216ENST00000628306 NBL1P41271 181 aa26.8■■□□□ 1.88
CAPNS1-216ENST00000628306 SLC11A1P49279 550 aa26.8■■□□□ 1.88
CAPNS1-216ENST00000628306 PTPN14Q15678 1187 aa26.8■■□□□ 1.88
CAPNS1-216ENST00000628306 XKR3Q5GH77 459 aa26.8■■□□□ 1.88
CAPNS1-216ENST00000628306 ZNF579Q8NAF0 562 aaKnown RBP26.8■■□□□ 1.88
CAPNS1-216ENST00000628306 TDRD5Q8NAT2 981 aaKnown RBP26.8■■□□□ 1.88
CAPNS1-216ENST00000628306 MBOAT7Q96N66 472 aa26.8■■□□□ 1.88
CAPNS1-216ENST00000628306 FAM105AQ9NUU6 356 aa26.8■■□□□ 1.88
CAPNS1-216ENST00000628306 CYP3A7-CYP3A51PA0A087WV96 503 aa26.79■■□□□ 1.88
CAPNS1-216ENST00000628306 FAM237AA0A1B0GTK4 181 aa26.79■■□□□ 1.88
CAPNS1-216ENST00000628306 CUTAO60888 179 aa26.79■■□□□ 1.88
CAPNS1-216ENST00000628306 TDP2O95551 362 aa26.79■■□□□ 1.88
CAPNS1-216ENST00000628306 CYP3A7P24462 503 aa26.79■■□□□ 1.88
CAPNS1-216ENST00000628306 ORC2Q13416 577 aaPredicted RBP26.79■■□□□ 1.88
CAPNS1-216ENST00000628306 NOMO2Q5JPE7 1267 aa26.79■■□□□ 1.88
CAPNS1-216ENST00000628306 ASTLQ6HA08 431 aaPredicted RBP26.79■■□□□ 1.88
CAPNS1-216ENST00000628306 ZNF280BQ86YH2 543 aa26.79■■□□□ 1.88
CAPNS1-216ENST00000628306 KSR1Q8IVT5 923 aa26.79■■□□□ 1.88
CAPNS1-216ENST00000628306 ETNPPLQ8TBG4 499 aa26.79■■□□□ 1.88
CAPNS1-216ENST00000628306 TBCKQ8TEA7 893 aa26.79■■□□□ 1.88
CAPNS1-216ENST00000628306 RSPH1Q8WYR4 309 aa26.79■■□□□ 1.88
CAPNS1-216ENST00000628306 LILRB3O75022 631 aa26.78■■□□□ 1.88
CAPNS1-216ENST00000628306 MAFO75444 373 aaPredicted RBP26.78■■□□□ 1.88
CAPNS1-216ENST00000628306 AFF1P51825 1210 aaKnown RBP26.78■■□□□ 1.88
CAPNS1-216ENST00000628306 CDC42EP1Q00587 391 aa26.78■■□□□ 1.88
CAPNS1-216ENST00000628306 EARS2Q5JPH6 523 aaKnown RBP26.78■■□□□ 1.88
CAPNS1-216ENST00000628306 ATAT1Q5SQI0 421 aa26.78■■□□□ 1.88
CAPNS1-216ENST00000628306 CWF19L1Q69YN2 538 aaKnown RBP26.78■■□□□ 1.88
CAPNS1-216ENST00000628306 TWF2Q6IBS0 349 aaKnown RBP26.78■■□□□ 1.88
CAPNS1-216ENST00000628306 TMC5Q6UXY8 1006 aa26.78■■□□□ 1.88
CAPNS1-216ENST00000628306 ANO5Q75V66 913 aa26.78■■□□□ 1.88
CAPNS1-216ENST00000628306 MIER3Q7Z3K6 550 aa26.78■■□□□ 1.88
CAPNS1-216ENST00000628306 ZNF410Q86VK4 478 aa26.78■■□□□ 1.88
CAPNS1-216ENST00000628306 IFT122Q9HBG6 1241 aa26.78■■□□□ 1.88
CAPNS1-216ENST00000628306 SUCLA2Q9P2R7 463 aaPredicted RBP26.78■■□□□ 1.88
CAPNS1-216ENST00000628306 PIN4Q9Y237 131 aaKnown RBP26.78■■□□□ 1.88
CAPNS1-216ENST00000628306 C2orf16Q68DN1 1984 aa26.78■■□□□ 1.88
CAPNS1-216ENST00000628306 CCDC194A0A1B0GVG4 234 aa26.77■■□□□ 1.88
CAPNS1-216ENST00000628306 SFPQP23246 707 aaKnown RBP eCLIP26.77■■□□□ 1.88
CAPNS1-216ENST00000628306 CA8P35219 290 aa26.77■■□□□ 1.88
CAPNS1-216ENST00000628306 AGMOQ6ZNB7 445 aa26.77■■□□□ 1.88
CAPNS1-216ENST00000628306 KRI1Q8N9T8 703 aaKnown RBP26.77■■□□□ 1.88
CAPNS1-216ENST00000628306 ENGASEQ8NFI3 743 aa26.77■■□□□ 1.88
CAPNS1-216ENST00000628306 DBR1Q9UK59 544 aaKnown RBP26.77■■□□□ 1.88
CAPNS1-216ENST00000628306 PCDHB6Q9Y5E3 794 aa26.77■■□□□ 1.88
CAPNS1-216ENST00000628306 SRPRBQ9Y5M8 271 aaKnown RBP26.77■■□□□ 1.88
CAPNS1-216ENST00000628306 GVINP1Q7Z2Y8 2422 aa26.77■■□□□ 1.88
CAPNS1-216ENST00000628306 PRR23AA6NEV1 266 aa26.76■■□□□ 1.87
CAPNS1-216ENST00000628306 DDHD2O94830 711 aa26.76■■□□□ 1.87
CAPNS1-216ENST00000628306 GIT2Q14161 759 aa26.76■■□□□ 1.87
CAPNS1-216ENST00000628306 TTC38Q5R3I4 469 aa26.76■■□□□ 1.87
CAPNS1-216ENST00000628306 GLB1LQ6UWU2 654 aa26.76■■□□□ 1.87
CAPNS1-216ENST00000628306 PIK3AP1Q6ZUJ8 805 aa26.76■■□□□ 1.87
CAPNS1-216ENST00000628306 GPR149Q86SP6 731 aa26.76■■□□□ 1.87
CAPNS1-216ENST00000628306 PLCD3Q8N3E9 789 aa26.76■■□□□ 1.87
CAPNS1-216ENST00000628306 INPP5FQ9Y2H2 1132 aa26.76■■□□□ 1.87
CAPNS1-216ENST00000628306 NPR3P17342 541 aa26.75■■□□□ 1.87
CAPNS1-216ENST00000628306 LIG1P18858 919 aa26.75■■□□□ 1.87
CAPNS1-216ENST00000628306 FAM160A1Q05DH4 1040 aa26.75■■□□□ 1.87
CAPNS1-216ENST00000628306 BMS1Q14692 1282 aaKnown RBP26.75■■□□□ 1.87
CAPNS1-216ENST00000628306 CCDC73Q6ZRK6 1079 aa26.75■■□□□ 1.87
CAPNS1-216ENST00000628306 RHPN2Q8IUC4 686 aa26.75■■□□□ 1.87
CAPNS1-216ENST00000628306 KLHL5Q96PQ7 755 aa26.75■■□□□ 1.87
CAPNS1-216ENST00000628306 CYP26B1Q9NR63 512 aa26.75■■□□□ 1.87
CAPNS1-216ENST00000628306 EML1O00423 815 aa26.74■■□□□ 1.87
CAPNS1-216ENST00000628306 CLCN4P51793 760 aa26.74■■□□□ 1.87
CAPNS1-216ENST00000628306 CLCN5P51795 746 aa26.74■■□□□ 1.87
CAPNS1-216ENST00000628306 NONOQ15233 471 aaKnown RBP eCLIP26.74■■□□□ 1.87
CAPNS1-216ENST00000628306 PLA2G4FQ68DD2 849 aa26.74■■□□□ 1.87
CAPNS1-216ENST00000628306 MRPL10Q7Z7H8 261 aaKnown RBP26.74■■□□□ 1.87
CAPNS1-216ENST00000628306 AGPAT5Q9NUQ2 364 aa26.74■■□□□ 1.87
CAPNS1-216ENST00000628306 CNPP09543 421 aaKnown RBP26.73■■□□□ 1.87
CAPNS1-216ENST00000628306 SKIP12755 728 aa26.73■■□□□ 1.87
CAPNS1-216ENST00000628306 HOXA11P31270 313 aaPredicted RBP26.73■■□□□ 1.87
CAPNS1-216ENST00000628306 RAB27AP51159 221 aa26.73■■□□□ 1.87
CAPNS1-216ENST00000628306 UBXN11Q5T124 520 aa26.73■■□□□ 1.87
CAPNS1-216ENST00000628306 ARL6IP4Q66PJ3 421 aaKnown RBP26.73■■□□□ 1.87
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