RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000628018.2

CAPNS1-215, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 5 BASIC

Gene CAPNS1, Length 1,509 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-215ENST00000628018 INO80BQ9C086 356 aaPredicted RBP27.15■■□□□ 1.94
CAPNS1-215ENST00000628018 HMX1Q9NP08 348 aaPredicted RBP27.15■■□□□ 1.94
CAPNS1-215ENST00000628018 HTTP42858 3142 aa27.14■■□□□ 1.94
CAPNS1-215ENST00000628018 AKR1B15C9JRZ8 316 aaPredicted RBP27.14■■□□□ 1.94
CAPNS1-215ENST00000628018 ADRB2P07550 413 aa27.14■■□□□ 1.94
CAPNS1-215ENST00000628018 KRT13P13646 458 aa27.14■■□□□ 1.94
CAPNS1-215ENST00000628018 CASP14P31944 242 aa27.14■■□□□ 1.94
CAPNS1-215ENST00000628018 NLRP11P59045 1033 aaKnown RBP27.14■■□□□ 1.94
CAPNS1-215ENST00000628018 GOLGA8FQ08AF8 430 aa27.14■■□□□ 1.94
CAPNS1-215ENST00000628018 GOLGA8DPQ0D2H9 430 aa27.14■■□□□ 1.94
CAPNS1-215ENST00000628018 FAM187BQ17R55 369 aa27.14■■□□□ 1.94
CAPNS1-215ENST00000628018 NBPF20Q3BBV1 942 aa27.14■■□□□ 1.94
CAPNS1-215ENST00000628018 FIGNQ5HY92 759 aa27.14■■□□□ 1.94
CAPNS1-215ENST00000628018 PCSK9Q8NBP7 692 aaKnown RBP27.14■■□□□ 1.94
CAPNS1-215ENST00000628018 TTYH3Q9C0H2 523 aa27.14■■□□□ 1.94
CAPNS1-215ENST00000628018 KIAA1586Q9HCI6 787 aa27.14■■□□□ 1.94
CAPNS1-215ENST00000628018 PRMT7Q9NVM4 692 aaPredicted RBP27.14■■□□□ 1.94
CAPNS1-215ENST00000628018 A0A0B4J269 797 aa27.13■■□□□ 1.93
CAPNS1-215ENST00000628018 TOM1L1O75674 476 aa27.13■■□□□ 1.93
CAPNS1-215ENST00000628018 IQCF3P0C7M6 154 aa27.13■■□□□ 1.93
CAPNS1-215ENST00000628018 FXR1P51114 621 aaKnown RBP eCLIP27.13■■□□□ 1.93
CAPNS1-215ENST00000628018 ADKP55263 362 aaKnown RBP27.13■■□□□ 1.93
CAPNS1-215ENST00000628018 ZNF200P98182 395 aaPredicted RBP27.13■■□□□ 1.93
CAPNS1-215ENST00000628018 CPLX3Q8WVH0 158 aa27.13■■□□□ 1.93
CAPNS1-215ENST00000628018 NLRP7Q8WX94 980 aa27.13■■□□□ 1.93
CAPNS1-215ENST00000628018 PPP1R16BQ96T49 567 aa27.13■■□□□ 1.93
CAPNS1-215ENST00000628018 FAM49AQ9H0Q0 323 aaPredicted RBP27.13■■□□□ 1.93
CAPNS1-215ENST00000628018 AGO2Q9UKV8 859 aaKnown RBP27.13■■□□□ 1.93
CAPNS1-215ENST00000628018 EXTL3O43909 919 aa27.12■■□□□ 1.93
CAPNS1-215ENST00000628018 MFAP3LO75121 409 aa27.12■■□□□ 1.93
CAPNS1-215ENST00000628018 TPM1P09493 284 aa27.12■■□□□ 1.93
CAPNS1-215ENST00000628018 VAMP7P51809 220 aa27.12■■□□□ 1.93
CAPNS1-215ENST00000628018 LHX8Q68G74 356 aa27.12■■□□□ 1.93
CAPNS1-215ENST00000628018 TSHZ1Q6ZSZ6 1077 aa27.12■■□□□ 1.93
CAPNS1-215ENST00000628018 RNF180Q86T96 592 aa27.12■■□□□ 1.93
CAPNS1-215ENST00000628018 ZSCAN30Q86W11 494 aa27.12■■□□□ 1.93
CAPNS1-215ENST00000628018 IQCDQ96DY2 449 aa27.12■■□□□ 1.93
CAPNS1-215ENST00000628018 MFSD14AQ96MC6 490 aa27.12■■□□□ 1.93
CAPNS1-215ENST00000628018 PCMTD1Q96MG8 357 aaPredicted RBP27.12■■□□□ 1.93
CAPNS1-215ENST00000628018 ADAMTS10Q9H324 1103 aa27.12■■□□□ 1.93
CAPNS1-215ENST00000628018 GTF2IRD1Q9UHL9 959 aa27.12■■□□□ 1.93
CAPNS1-215ENST00000628018 CENPFP49454 3210 aa27.11■■□□□ 1.93
CAPNS1-215ENST00000628018 RNF225M0QZC1 329 aaPredicted RBP27.11■■□□□ 1.93
CAPNS1-215ENST00000628018 GPR32O75388 356 aa27.11■■□□□ 1.93
CAPNS1-215ENST00000628018 CCZ1BP86790 482 aa27.11■■□□□ 1.93
CAPNS1-215ENST00000628018 CCZ1P86791 482 aaPredicted RBP27.11■■□□□ 1.93
CAPNS1-215ENST00000628018 PRPF4BQ13523 1007 aaKnown RBP27.11■■□□□ 1.93
CAPNS1-215ENST00000628018 AMHR2Q16671 573 aa27.11■■□□□ 1.93
CAPNS1-215ENST00000628018 SRGAP1Q7Z6B7 1085 aa27.11■■□□□ 1.93
CAPNS1-215ENST00000628018 CNGA4Q8IV77 575 aa27.11■■□□□ 1.93
CAPNS1-215ENST00000628018 PLEKHO2Q8TD55 490 aa27.11■■□□□ 1.93
CAPNS1-215ENST00000628018 ANKFY1Q9P2R3 1169 aa27.11■■□□□ 1.93
CAPNS1-215ENST00000628018 CAPN11Q9UMQ6 739 aa27.11■■□□□ 1.93
CAPNS1-215ENST00000628018 TRIP12Q14669 1992 aaPredicted RBP27.11■■□□□ 1.93
CAPNS1-215ENST00000628018 TTC26A0AVF1 554 aa27.11■■□□□ 1.93
CAPNS1-215ENST00000628018 GTPBP10A4D1E9 387 aaKnown RBP27.11■■□□□ 1.93
CAPNS1-215ENST00000628018 ABLIM1O14639 778 aa27.11■■□□□ 1.93
CAPNS1-215ENST00000628018 CLDN3O15551 220 aa27.11■■□□□ 1.93
CAPNS1-215ENST00000628018 LDHAP00338 332 aaKnown RBP27.11■■□□□ 1.93
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CAPNS1-215ENST00000628018 TRIM49CP0CI26 452 aa27.11■■□□□ 1.93
CAPNS1-215ENST00000628018 TRIM21P19474 475 aaKnown RBP27.11■■□□□ 1.93
CAPNS1-215ENST00000628018 PROZP22891 400 aa27.11■■□□□ 1.93
CAPNS1-215ENST00000628018 FMO5P49326 533 aa27.11■■□□□ 1.93
CAPNS1-215ENST00000628018 DLG4P78352 724 aa27.11■■□□□ 1.93
CAPNS1-215ENST00000628018 ENPEPQ07075 957 aa27.11■■□□□ 1.93
CAPNS1-215ENST00000628018 C1orf220Q5T0J3 134 aa27.11■■□□□ 1.93
CAPNS1-215ENST00000628018 SESTD1Q86VW0 696 aa27.11■■□□□ 1.93
CAPNS1-215ENST00000628018 DNAJB3Q8WWF6 145 aa27.11■■□□□ 1.93
CAPNS1-215ENST00000628018 PRIMPOLQ96LW4 560 aa27.11■■□□□ 1.93
CAPNS1-215ENST00000628018 FAM213AQ9BRX8 229 aa27.11■■□□□ 1.93
CAPNS1-215ENST00000628018 MSTO1Q9BUK6 570 aa27.11■■□□□ 1.93
CAPNS1-215ENST00000628018 TMX1Q9H3N1 280 aa27.11■■□□□ 1.93
CAPNS1-215ENST00000628018 MMRN2Q9H8L6 949 aa27.11■■□□□ 1.93
CAPNS1-215ENST00000628018 PTPRHQ9HD43 1115 aa27.11■■□□□ 1.93
CAPNS1-215ENST00000628018 PTPN22Q9Y2R2 807 aa27.11■■□□□ 1.93
CAPNS1-215ENST00000628018 B4GALT5O43286 388 aa27.1■■□□□ 1.93
CAPNS1-215ENST00000628018 MYCNP04198 464 aaPredicted RBP27.1■■□□□ 1.93
CAPNS1-215ENST00000628018 CYP24A1Q07973 514 aa27.1■■□□□ 1.93
CAPNS1-215ENST00000628018 HSP90AA2PQ14568 343 aaPredicted RBP27.1■■□□□ 1.93
CAPNS1-215ENST00000628018 KIZQ2M2Z5 673 aa27.1■■□□□ 1.93
CAPNS1-215ENST00000628018 ATF7IP2Q5U623 682 aa27.1■■□□□ 1.93
CAPNS1-215ENST00000628018 TMC2Q8TDI7 906 aa27.1■■□□□ 1.93
CAPNS1-215ENST00000628018 FRMPD3Q5JV73 1810 aa27.1■■□□□ 1.93
CAPNS1-215ENST00000628018 A0A1W2PQJ5 194 aa27.09■■□□□ 1.93
CAPNS1-215ENST00000628018 ZNF233A6NK53 670 aa27.09■■□□□ 1.93
CAPNS1-215ENST00000628018 MATR3P43243 847 aaKnown RBP eCLIP27.09■■□□□ 1.93
CAPNS1-215ENST00000628018 MCL1Q07820 350 aa27.09■■□□□ 1.93
CAPNS1-215ENST00000628018 CRELD2Q6UXH1 353 aaPredicted RBP27.09■■□□□ 1.93
CAPNS1-215ENST00000628018 NME8Q8N427 588 aa27.09■■□□□ 1.93
CAPNS1-215ENST00000628018 PARD3BQ8TEW8 1205 aa27.09■■□□□ 1.93
CAPNS1-215ENST00000628018 CCDC51Q96ER9 411 aa27.09■■□□□ 1.93
CAPNS1-215ENST00000628018 SCLT1Q96NL6 688 aa27.09■■□□□ 1.93
CAPNS1-215ENST00000628018 PANX2Q96RD6 677 aa27.09■■□□□ 1.93
CAPNS1-215ENST00000628018 CRACR2AQ9BSW2 395 aa27.09■■□□□ 1.93
CAPNS1-215ENST00000628018 TNFSF13BQ9Y275 285 aa27.09■■□□□ 1.93
CAPNS1-215ENST00000628018 CSDE1O75534 798 aaKnown RBP27.08■■□□□ 1.93
CAPNS1-215ENST00000628018 CABYRO75952 493 aa27.08■■□□□ 1.93
CAPNS1-215ENST00000628018 TMEM62Q0P6H9 643 aa27.08■■□□□ 1.93
CAPNS1-215ENST00000628018 GDF6Q6KF10 455 aaPredicted RBP27.08■■□□□ 1.93
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