RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000608287.1

SGMS1-208, Transcript of sphingomyelin synthase 1, humanhuman

TSL 4

Gene SGMS1, Length 542 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGMS1-208ENST00000608287 SPIRE1Q08AE8 756 aa21.42■■□□□ 1.02
SGMS1-208ENST00000608287 PHLDB3Q6NSJ2 640 aa21.42■■□□□ 1.02
SGMS1-208ENST00000608287 HELQQ8TDG4 1101 aa21.42■■□□□ 1.02
SGMS1-208ENST00000608287 SH2D3AQ9BRG2 576 aa21.42■■□□□ 1.02
SGMS1-208ENST00000608287 NIFKQ9BYG3 293 aaKnown RBP21.42■■□□□ 1.02
SGMS1-208ENST00000608287 TTC12Q9H892 705 aaPredicted RBP21.42■■□□□ 1.02
SGMS1-208ENST00000608287 TBC1D17Q9HA65 648 aa21.42■■□□□ 1.02
SGMS1-208ENST00000608287 AKT3Q9Y243 479 aa21.42■■□□□ 1.02
SGMS1-208ENST00000608287 ZC3H11AO75152 810 aaKnown RBP eCLIP21.41■■□□□ 1.02
SGMS1-208ENST00000608287 KRT37O76014 449 aa21.41■■□□□ 1.02
SGMS1-208ENST00000608287 CFHP08603 1231 aa21.41■■□□□ 1.02
SGMS1-208ENST00000608287 SRFP11831 508 aa21.41■■□□□ 1.02
SGMS1-208ENST00000608287 TARBP2Q15633 366 aaKnown RBP21.41■■□□□ 1.02
SGMS1-208ENST00000608287 ZNF174Q15697 407 aa21.41■■□□□ 1.02
SGMS1-208ENST00000608287 RSPO4Q2I0M5 234 aaPredicted RBP21.41■■□□□ 1.02
SGMS1-208ENST00000608287 IGSF21Q96ID5 467 aa21.41■■□□□ 1.02
SGMS1-208ENST00000608287 DYDC2Q96IM9 177 aa21.41■■□□□ 1.02
SGMS1-208ENST00000608287 MTMR9Q96QG7 549 aa21.41■■□□□ 1.02
SGMS1-208ENST00000608287 RHOBTB2Q9BYZ6 727 aa21.41■■□□□ 1.02
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SGMS1-208ENST00000608287 RGL1Q9NZL6 768 aa21.41■■□□□ 1.02
SGMS1-208ENST00000608287 NOL7Q9UMY1 257 aaKnown RBP21.41■■□□□ 1.02
SGMS1-208ENST00000608287 SMC3Q9UQE7 1217 aa21.41■■□□□ 1.02
SGMS1-208ENST00000608287 ZSCAN21Q9Y5A6 473 aaPredicted RBP21.41■■□□□ 1.02
SGMS1-208ENST00000608287 DMXL1Q9Y485 3027 aa21.4■■□□□ 1.02
SGMS1-208ENST00000608287 NLRP11P59045 1033 aaKnown RBP21.4■■□□□ 1.02
SGMS1-208ENST00000608287 CYP4A11Q02928 519 aa21.4■■□□□ 1.02
SGMS1-208ENST00000608287 TTC38Q5R3I4 469 aa21.4■■□□□ 1.02
SGMS1-208ENST00000608287 KIAA0319Q5VV43 1072 aa21.4■■□□□ 1.02
SGMS1-208ENST00000608287 PLA2G4FQ68DD2 849 aa21.4■■□□□ 1.02
SGMS1-208ENST00000608287 ANO5Q75V66 913 aa21.4■■□□□ 1.02
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SGMS1-208ENST00000608287 C1orf210Q8IVY1 113 aa21.4■■□□□ 1.02
SGMS1-208ENST00000608287 LINC01465Q8N7H1 131 aa21.4■■□□□ 1.02
SGMS1-208ENST00000608287 CMASQ8NFW8 434 aaPredicted RBP21.4■■□□□ 1.02
SGMS1-208ENST00000608287 RIN2Q8WYP3 895 aaPredicted RBP21.4■■□□□ 1.02
SGMS1-208ENST00000608287 SCLT1Q96NL6 688 aa21.4■■□□□ 1.02
SGMS1-208ENST00000608287 LXNQ9BS40 222 aa21.4■■□□□ 1.02
SGMS1-208ENST00000608287 CHST12Q9NRB3 414 aa21.4■■□□□ 1.02
SGMS1-208ENST00000608287 WRAP73Q9P2S5 460 aaPredicted RBP21.4■■□□□ 1.02
SGMS1-208ENST00000608287 SIT1Q9Y3P8 196 aa21.4■■□□□ 1.02
SGMS1-208ENST00000608287 ACACBO00763 2458 aa21.4■■□□□ 1.02
SGMS1-208ENST00000608287 PRR5-ARHGAP8B1AHC4 643 aa21.39■■□□□ 1.01
SGMS1-208ENST00000608287 NT5C1B-RDH14C9J2C7 533 aa21.39■■□□□ 1.01
SGMS1-208ENST00000608287 SPTLC1O15269 473 aa21.39■■□□□ 1.01
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SGMS1-208ENST00000608287 U2AF2P26368 475 aaKnown RBP eCLIP21.39■■□□□ 1.01
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SGMS1-208ENST00000608287 GBP2P32456 591 aaPredicted RBP21.39■■□□□ 1.01
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SGMS1-208ENST00000608287 CDC42EP1Q00587 391 aa21.39■■□□□ 1.01
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SGMS1-208ENST00000608287 C4orf19Q8IY42 314 aa21.38■■□□□ 1.01
SGMS1-208ENST00000608287 CEP89Q96ST8 783 aa21.38■■□□□ 1.01
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SGMS1-208ENST00000608287 ZNF668Q96K58 619 aaPredicted RBP21.37■■□□□ 1.01
SGMS1-208ENST00000608287 CEP170P1Q96L14 293 aa21.37■■□□□ 1.01
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SGMS1-208ENST00000608287 TRAIPQ9BWF2 469 aa21.36■■□□□ 1.01
SGMS1-208ENST00000608287 ADAMTS10Q9H324 1103 aa21.36■■□□□ 1.01
SGMS1-208ENST00000608287 MRPL17Q9NRX2 175 aaKnown RBP21.36■■□□□ 1.01
SGMS1-208ENST00000608287 CDV3Q9UKY7 258 aaKnown RBP21.36■■□□□ 1.01
SGMS1-208ENST00000608287 DNAH14Q0VDD8 3507 aa21.35■■□□□ 1.01
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