RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000592483.5

CAPNS1-214, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

TSL 5

Gene CAPNS1, Length 431 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-214ENST00000592483 KAT6AQ92794 2004 aa26.12■■□□□ 1.77
CAPNS1-214ENST00000592483 MED19A0JLT2 244 aaPredicted RBP26.12■■□□□ 1.77
CAPNS1-214ENST00000592483 ACTN4O43707 911 aaKnown RBP26.12■■□□□ 1.77
CAPNS1-214ENST00000592483 SRGAP2BP0DMP2 458 aa26.12■■□□□ 1.77
CAPNS1-214ENST00000592483 RFC5P40937 340 aa26.12■■□□□ 1.77
CAPNS1-214ENST00000592483 PPFIA1Q13136 1202 aa26.12■■□□□ 1.77
CAPNS1-214ENST00000592483 TARBP2Q15633 366 aaKnown RBP26.12■■□□□ 1.77
CAPNS1-214ENST00000592483 XKR9Q5GH70 373 aa26.12■■□□□ 1.77
CAPNS1-214ENST00000592483 KRBA2Q6ZNG9 492 aa26.12■■□□□ 1.77
CAPNS1-214ENST00000592483 TSHZ1Q6ZSZ6 1077 aa26.12■■□□□ 1.77
CAPNS1-214ENST00000592483 SV2BQ7L1I2 683 aa26.12■■□□□ 1.77
CAPNS1-214ENST00000592483 CEP170P1Q96L14 293 aa26.12■■□□□ 1.77
CAPNS1-214ENST00000592483 HOOK1Q9UJC3 728 aaKnown RBP26.12■■□□□ 1.77
CAPNS1-214ENST00000592483 DGAT1O75907 488 aa26.11■■□□□ 1.77
CAPNS1-214ENST00000592483 MYL1P05976 194 aa26.11■■□□□ 1.77
CAPNS1-214ENST00000592483 STAG3L1P0CL83 205 aa26.11■■□□□ 1.77
CAPNS1-214ENST00000592483 INSRRP14616 1297 aa26.11■■□□□ 1.77
CAPNS1-214ENST00000592483 SLC12A3P55017 1021 aa26.11■■□□□ 1.77
CAPNS1-214ENST00000592483 PAN2Q504Q3 1202 aaKnown RBP26.11■■□□□ 1.77
CAPNS1-214ENST00000592483 RUFY4Q6ZNE9 571 aa26.11■■□□□ 1.77
CAPNS1-214ENST00000592483 RTN4RL1Q86UN2 441 aaPredicted RBP26.11■■□□□ 1.77
CAPNS1-214ENST00000592483 CNNM3Q8NE01 707 aa26.11■■□□□ 1.77
CAPNS1-214ENST00000592483 LINC01599Q8WXQ3 324 aa26.11■■□□□ 1.77
CAPNS1-214ENST00000592483 TIPINQ9BVW5 301 aa26.11■■□□□ 1.77
CAPNS1-214ENST00000592483 FTHL17Q9BXU8 183 aa26.11■■□□□ 1.77
CAPNS1-214ENST00000592483 KBTBD4Q9NVX7 518 aa26.11■■□□□ 1.77
CAPNS1-214ENST00000592483 SERTAD1Q9UHV2 236 aa26.11■■□□□ 1.77
CAPNS1-214ENST00000592483 PLXNA4Q9HCM2 1894 aa26.11■■□□□ 1.77
CAPNS1-214ENST00000592483 MAGEB2O15479 319 aa26.1■■□□□ 1.77
CAPNS1-214ENST00000592483 GAS2O43903 313 aaKnown RBP26.1■■□□□ 1.77
CAPNS1-214ENST00000592483 NR1I2O75469 434 aa26.1■■□□□ 1.77
CAPNS1-214ENST00000592483 CLCN5P51795 746 aa26.1■■□□□ 1.77
CAPNS1-214ENST00000592483 KCNC3Q14003 757 aa26.1■■□□□ 1.77
CAPNS1-214ENST00000592483 SKOR2Q2VWA4 1001 aaPredicted RBP26.1■■□□□ 1.77
CAPNS1-214ENST00000592483 LONRF3Q496Y0 759 aa26.1■■□□□ 1.77
CAPNS1-214ENST00000592483 PDE12Q6L8Q7 609 aaKnown RBP26.1■■□□□ 1.77
CAPNS1-214ENST00000592483 ANKRD54Q6NXT1 300 aa26.1■■□□□ 1.77
CAPNS1-214ENST00000592483 LRRC15Q8TF66 581 aa26.1■■□□□ 1.77
CAPNS1-214ENST00000592483 BMP2KQ9NSY1 1161 aaPredicted RBP26.1■■□□□ 1.77
CAPNS1-214ENST00000592483 DACT1Q9NYF0 836 aa26.1■■□□□ 1.77
CAPNS1-214ENST00000592483 DMXL1Q9Y485 3027 aa26.09■■□□□ 1.77
CAPNS1-214ENST00000592483 TPRP12270 2363 aaKnown RBP26.09■■□□□ 1.77
CAPNS1-214ENST00000592483 SP100P23497 879 aaPredicted RBP26.09■■□□□ 1.77
CAPNS1-214ENST00000592483 MCM6Q14566 821 aa26.09■■□□□ 1.77
CAPNS1-214ENST00000592483 GRIK4Q16099 956 aa26.09■■□□□ 1.77
CAPNS1-214ENST00000592483 MTERF2Q49AM1 385 aa26.09■■□□□ 1.77
CAPNS1-214ENST00000592483 PLA2G4FQ68DD2 849 aa26.09■■□□□ 1.77
CAPNS1-214ENST00000592483 AGO3Q9H9G7 860 aaKnown RBP26.09■■□□□ 1.77
CAPNS1-214ENST00000592483 PCDHB12Q9Y5F1 795 aa26.09■■□□□ 1.77
CAPNS1-214ENST00000592483 ZBTB39O15060 712 aa26.08■■□□□ 1.77
CAPNS1-214ENST00000592483 SSBP05455 408 aaKnown RBP eCLIP26.08■■□□□ 1.77
CAPNS1-214ENST00000592483 TBC1D8BQ0IIM8 1120 aa26.08■■□□□ 1.77
CAPNS1-214ENST00000592483 NFKBIBQ15653 356 aa26.08■■□□□ 1.77
CAPNS1-214ENST00000592483 SYCE2Q6PIF2 218 aa26.08■■□□□ 1.77
CAPNS1-214ENST00000592483 PADI6Q6TGC4 694 aa26.08■■□□□ 1.77
CAPNS1-214ENST00000592483 DGLUCYQ7Z3D6 616 aa26.08■■□□□ 1.77
CAPNS1-214ENST00000592483 MCPH1Q8NEM0 835 aa26.08■■□□□ 1.77
CAPNS1-214ENST00000592483 SLC7A3Q8WY07 619 aa26.08■■□□□ 1.77
CAPNS1-214ENST00000592483 RMDN1Q96DB5 314 aa26.08■■□□□ 1.77
CAPNS1-214ENST00000592483 CEP89Q96ST8 783 aa26.08■■□□□ 1.77
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CAPNS1-214ENST00000592483 ARID2Q68CP9 1835 aa26.08■■□□□ 1.77
CAPNS1-214ENST00000592483 ZBTB42B2RXF5 422 aa26.07■■□□□ 1.76
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CAPNS1-214ENST00000592483 HOXB8P17481 243 aaPredicted RBP26.07■■□□□ 1.76
CAPNS1-214ENST00000592483 GUCY2CP25092 1073 aa26.07■■□□□ 1.76
CAPNS1-214ENST00000592483 CD52P31358 61 aa26.07■■□□□ 1.76
CAPNS1-214ENST00000592483 POLGP54098 1239 aaPredicted RBP26.07■■□□□ 1.76
CAPNS1-214ENST00000592483 NPEPPSP55786 919 aa26.07■■□□□ 1.76
CAPNS1-214ENST00000592483 ERVFC1P60507 584 aa26.07■■□□□ 1.76
CAPNS1-214ENST00000592483 CNNM4Q6P4Q7 775 aa26.07■■□□□ 1.76
CAPNS1-214ENST00000592483 GPBP1Q86WP2 473 aa26.07■■□□□ 1.76
CAPNS1-214ENST00000592483 GPT2Q8TD30 523 aa26.07■■□□□ 1.76
CAPNS1-214ENST00000592483 ATP6V0A4Q9HBG4 840 aa26.07■■□□□ 1.76
CAPNS1-214ENST00000592483 CDY2AQ9Y6F7 541 aa26.07■■□□□ 1.76
CAPNS1-214ENST00000592483 SQORQ9Y6N5 450 aa26.07■■□□□ 1.76
CAPNS1-214ENST00000592483 KMT2BQ9UMN6 2715 aaPredicted RBP26.06■■□□□ 1.76
CAPNS1-214ENST00000592483 TMEM150BA6NC51 233 aa26.06■■□□□ 1.76
CAPNS1-214ENST00000592483 MAFO75444 373 aaPredicted RBP26.06■■□□□ 1.76
CAPNS1-214ENST00000592483 CYP11B2P19099 503 aa26.06■■□□□ 1.76
CAPNS1-214ENST00000592483 RINT1Q6NUQ1 792 aa26.06■■□□□ 1.76
CAPNS1-214ENST00000592483 TRMT1LQ7Z2T5 733 aaKnown RBP26.06■■□□□ 1.76
CAPNS1-214ENST00000592483 DNAJB3Q8WWF6 145 aa26.06■■□□□ 1.76
CAPNS1-214ENST00000592483 MFSD1Q9H3U5 465 aa26.06■■□□□ 1.76
CAPNS1-214ENST00000592483 AAASQ9NRG9 546 aa26.06■■□□□ 1.76
CAPNS1-214ENST00000592483 IGKV6-21A0A0C4DH24 114 aa26.05■■□□□ 1.76
CAPNS1-214ENST00000592483 MBLAC1A4D2B0 266 aaPredicted RBP26.05■■□□□ 1.76
CAPNS1-214ENST00000592483 FSCN2O14926 492 aa26.05■■□□□ 1.76
CAPNS1-214ENST00000592483 KRT37O76014 449 aa26.05■■□□□ 1.76
CAPNS1-214ENST00000592483 KLHL40Q2TBA0 621 aa26.05■■□□□ 1.76
CAPNS1-214ENST00000592483 C1orf186Q6ZWK4 172 aa26.05■■□□□ 1.76
CAPNS1-214ENST00000592483 TCP11Q8WWU5 503 aa26.05■■□□□ 1.76
CAPNS1-214ENST00000592483 PAGE5Q96GU1 130 aa26.05■■□□□ 1.76
CAPNS1-214ENST00000592483 C7orf25Q9BPX7 421 aa26.05■■□□□ 1.76
CAPNS1-214ENST00000592483 APOL5Q9BWW9 433 aa26.05■■□□□ 1.76
CAPNS1-214ENST00000592483 TUBE1Q9UJT0 475 aa26.05■■□□□ 1.76
CAPNS1-214ENST00000592483 ODF2LQ9ULJ1 636 aa26.05■■□□□ 1.76
CAPNS1-214ENST00000592483 A0A087WWV3 80 aa26.04■■□□□ 1.76
CAPNS1-214ENST00000592483 USO1O60763 962 aaKnown RBP26.04■■□□□ 1.76
CAPNS1-214ENST00000592483 FGF18O76093 207 aa26.04■■□□□ 1.76
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