RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000591956.1

SNHG16-208, Transcript of small nucleolar RNA host gene 16, human

TSL 2

Gene SNHG16, Length 556 nt, Biotype lincRNA, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SNHG16-208	ENST00000591956	MRPL4	Q9BYD3	311 aa	Known RBP	12.53	□□□□□ -0.4
SNHG16-208	ENST00000591956	LMAN2L	Q9H0V9	348 aa		12.53	□□□□□ -0.4
SNHG16-208	ENST00000591956	OLFML3	Q9NRN5	406 aa		12.53	□□□□□ -0.4
SNHG16-208	ENST00000591956	STK39	Q9UEW8	545 aa		12.53	□□□□□ -0.4
SNHG16-208	ENST00000591956	GIT1	Q9Y2X7	761 aa		12.53	□□□□□ -0.4
SNHG16-208	ENST00000591956	SFI1	A8K8P3	1242 aa		12.52	□□□□□ -0.41
SNHG16-208	ENST00000591956	PRKCB	P05771	671 aa		12.52	□□□□□ -0.41
SNHG16-208	ENST00000591956	GAP43	P17677	238 aa		12.52	□□□□□ -0.41
SNHG16-208	ENST00000591956	CCDC85B	Q15834	202 aa	Predicted RBP	12.52	□□□□□ -0.41
SNHG16-208	ENST00000591956	GLB1L	Q6UWU2	654 aa		12.52	□□□□□ -0.41
SNHG16-208	ENST00000591956	ZNF720	Q7Z2F6	126 aa		12.52	□□□□□ -0.41
SNHG16-208	ENST00000591956	HAUS6	Q7Z4H7	955 aa		12.52	□□□□□ -0.41
SNHG16-208	ENST00000591956	ABI1	Q8IZP0	508 aa		12.52	□□□□□ -0.41
SNHG16-208	ENST00000591956	MYCT1	Q8N699	235 aa		12.52	□□□□□ -0.41
SNHG16-208	ENST00000591956	SMG8	Q8ND04	991 aa	Known RBP	12.52	□□□□□ -0.41
SNHG16-208	ENST00000591956	ACO2	Q99798	780 aa	Known RBP	12.52	□□□□□ -0.41
SNHG16-208	ENST00000591956	C7orf25	Q9BPX7	421 aa		12.52	□□□□□ -0.41
SNHG16-208	ENST00000591956	C11orf84	Q9BUA3	381 aa	Predicted RBP	12.52	□□□□□ -0.41
SNHG16-208	ENST00000591956	PTPRH	Q9HD43	1115 aa		12.52	□□□□□ -0.41
SNHG16-208	ENST00000591956	RNF19A	Q9NV58	838 aa		12.52	□□□□□ -0.41
SNHG16-208	ENST00000591956	KCNH3	Q9ULD8	1083 aa		12.52	□□□□□ -0.41
SNHG16-208	ENST00000591956	HPSE	Q9Y251	543 aa		12.52	□□□□□ -0.41
SNHG16-208	ENST00000591956	TTC28	Q96AY4	2481 aa		12.51	□□□□□ -0.41
SNHG16-208	ENST00000591956		A0A087X0B3	334 aa		12.51	□□□□□ -0.41
SNHG16-208	ENST00000591956	MYMK	A6NI61	221 aa		12.51	□□□□□ -0.41
SNHG16-208	ENST00000591956	TBKBP1	A7MCY6	615 aa		12.51	□□□□□ -0.41
SNHG16-208	ENST00000591956	POLR2D	O15514	142 aa	Known RBP	12.51	□□□□□ -0.41
SNHG16-208	ENST00000591956	LPXN	O60711	386 aa		12.51	□□□□□ -0.41
SNHG16-208	ENST00000591956	TOM1L1	O75674	476 aa		12.51	□□□□□ -0.41
SNHG16-208	ENST00000591956	FAM13A	O94988	1023 aa		12.51	□□□□□ -0.41
SNHG16-208	ENST00000591956	ARHGEF15	O94989	841 aa		12.51	□□□□□ -0.41
SNHG16-208	ENST00000591956	PIGR	P01833	764 aa		12.51	□□□□□ -0.41
SNHG16-208	ENST00000591956	KRT18	P05783	430 aa	Known RBP	12.51	□□□□□ -0.41
SNHG16-208	ENST00000591956	SLFN14	P0C7P3	912 aa		12.51	□□□□□ -0.41
SNHG16-208	ENST00000591956	ITGA4	P13612	1032 aa		12.51	□□□□□ -0.41
SNHG16-208	ENST00000591956	PROZ	P22891	400 aa		12.51	□□□□□ -0.41
SNHG16-208	ENST00000591956	POU5F1	Q01860	360 aa	Known RBP	12.51	□□□□□ -0.41
SNHG16-208	ENST00000591956	PLCB3	Q01970	1234 aa		12.51	□□□□□ -0.41
SNHG16-208	ENST00000591956	UBE3A	Q05086	875 aa		12.51	□□□□□ -0.41
SNHG16-208	ENST00000591956	STRN3	Q13033	797 aa		12.51	□□□□□ -0.41
SNHG16-208	ENST00000591956	ADGRE1	Q14246	886 aa		12.51	□□□□□ -0.41
SNHG16-208	ENST00000591956	KYAT1	Q16773	422 aa		12.51	□□□□□ -0.41
SNHG16-208	ENST00000591956	DCAF4L1	Q3SXM0	396 aa		12.51	□□□□□ -0.41
SNHG16-208	ENST00000591956	FOXD4L6	Q3SYB3	417 aa	Predicted RBP	12.51	□□□□□ -0.41
SNHG16-208	ENST00000591956	NT5DC1	Q5TFE4	455 aa		12.51	□□□□□ -0.41
SNHG16-208	ENST00000591956	ATF7IP2	Q5U623	682 aa		12.51	□□□□□ -0.41
SNHG16-208	ENST00000591956	FOXD4L3	Q6VB84	417 aa	Predicted RBP	12.51	□□□□□ -0.41
SNHG16-208	ENST00000591956	AGMO	Q6ZNB7	445 aa		12.51	□□□□□ -0.41
SNHG16-208	ENST00000591956	LRRC43	Q8N309	656 aa		12.51	□□□□□ -0.41
SNHG16-208	ENST00000591956	FBXO22	Q8NEZ5	403 aa		12.51	□□□□□ -0.41
SNHG16-208	ENST00000591956	HVCN1	Q96D96	273 aa		12.51	□□□□□ -0.41
SNHG16-208	ENST00000591956	FIZ1	Q96SL8	496 aa		12.51	□□□□□ -0.41
SNHG16-208	ENST00000591956	STRA6	Q9BX79	667 aa		12.51	□□□□□ -0.41
SNHG16-208	ENST00000591956	PANK2	Q9BZ23	570 aa		12.51	□□□□□ -0.41
SNHG16-208	ENST00000591956	PDZD7	Q9H5P4	517 aa		12.51	□□□□□ -0.41
SNHG16-208	ENST00000591956	CWH43	Q9H720	699 aa		12.51	□□□□□ -0.41
SNHG16-208	ENST00000591956	RSAD1	Q9HA92	442 aa		12.51	□□□□□ -0.41
SNHG16-208	ENST00000591956	POLD4	Q9HCU8	107 aa		12.51	□□□□□ -0.41
SNHG16-208	ENST00000591956	TYW1	Q9NV66	732 aa	Known RBP	12.51	□□□□□ -0.41
SNHG16-208	ENST00000591956	TBX20	Q9UMR3	447 aa		12.51	□□□□□ -0.41
SNHG16-208	ENST00000591956	LZTS1	Q9Y250	596 aa		12.51	□□□□□ -0.41
SNHG16-208	ENST00000591956	IPP	Q9Y573	584 aa		12.51	□□□□□ -0.41
SNHG16-208	ENST00000591956	PCDHB12	Q9Y5F1	795 aa		12.51	□□□□□ -0.41
SNHG16-208	ENST00000591956	TCF20	Q9UGU0	1960 aa	Known RBP	12.5	□□□□□ -0.41
SNHG16-208	ENST00000591956	SPTBN5	Q9NRC6	3674 aa	Known RBP	12.5	□□□□□ -0.41
SNHG16-208	ENST00000591956	PVALEF	A0A1B0GWK0	134 aa		12.5	□□□□□ -0.41
SNHG16-208	ENST00000591956	SLC16A4	O15374	487 aa		12.5	□□□□□ -0.41
SNHG16-208	ENST00000591956	B4GALT5	O43286	388 aa		12.5	□□□□□ -0.41
SNHG16-208	ENST00000591956	TBCA	O75347	108 aa	Known RBP	12.5	□□□□□ -0.41
SNHG16-208	ENST00000591956	FGFR1	P11362	822 aa		12.5	□□□□□ -0.41
SNHG16-208	ENST00000591956	LAG3	P18627	525 aa		12.5	□□□□□ -0.41
SNHG16-208	ENST00000591956	RAD51AP2	Q09MP3	1159 aa		12.5	□□□□□ -0.41
SNHG16-208	ENST00000591956	ALCAM	Q13740	583 aa		12.5	□□□□□ -0.41
SNHG16-208	ENST00000591956	DHX8	Q14562	1220 aa	Known RBP	12.5	□□□□□ -0.41
SNHG16-208	ENST00000591956	PTPRO	Q16827	1216 aa		12.5	□□□□□ -0.41
SNHG16-208	ENST00000591956	NOMO2	Q5JPE7	1267 aa		12.5	□□□□□ -0.41
SNHG16-208	ENST00000591956	TJAP1	Q5JTD0	557 aa		12.5	□□□□□ -0.41
SNHG16-208	ENST00000591956	CLLU1OS	Q5K130	101 aa		12.5	□□□□□ -0.41
SNHG16-208	ENST00000591956	PDE12	Q6L8Q7	609 aa	Known RBP	12.5	□□□□□ -0.41
SNHG16-208	ENST00000591956	LRRC55	Q6ZSA7	311 aa		12.5	□□□□□ -0.41
SNHG16-208	ENST00000591956	TAS1R3	Q7RTX0	852 aa		12.5	□□□□□ -0.41
SNHG16-208	ENST00000591956	FAM178B	Q8IXR5	827 aa		12.5	□□□□□ -0.41
SNHG16-208	ENST00000591956	PDILT	Q8N807	584 aa		12.5	□□□□□ -0.41
SNHG16-208	ENST00000591956	ARNTL2	Q8WYA1	636 aa		12.5	□□□□□ -0.41
SNHG16-208	ENST00000591956	CPB2	Q96IY4	423 aa		12.5	□□□□□ -0.41
SNHG16-208	ENST00000591956	TSPAN18	Q96SJ8	248 aa		12.5	□□□□□ -0.41
SNHG16-208	ENST00000591956	C17orf80	Q9BSJ5	609 aa		12.5	□□□□□ -0.41
SNHG16-208	ENST00000591956	EIF2A	Q9BY44	585 aa	Known RBP	12.5	□□□□□ -0.41
SNHG16-208	ENST00000591956	TRIM9	Q9C026	710 aa		12.5	□□□□□ -0.41
SNHG16-208	ENST00000591956	TRIM6	Q9C030	488 aa	Predicted RBP	12.5	□□□□□ -0.41
SNHG16-208	ENST00000591956	PLAGL2	Q9UPG8	496 aa		12.5	□□□□□ -0.41
SNHG16-208	ENST00000591956	PCDHB13	Q9Y5F0	798 aa		12.5	□□□□□ -0.41
SNHG16-208	ENST00000591956	GTF3C5	Q9Y5Q8	519 aa	Predicted RBP	12.5	□□□□□ -0.41
SNHG16-208	ENST00000591956	MRPL42	Q9Y6G3	142 aa	Known RBP	12.5	□□□□□ -0.41
SNHG16-208	ENST00000591956	NLRC5	Q86WI3	1866 aa		12.5	□□□□□ -0.41
SNHG16-208	ENST00000591956	NPHP3-ACAD11	A0A0J9YXS1	232 aa		12.49	□□□□□ -0.41
SNHG16-208	ENST00000591956	GTPBP6	O43824	516 aa	Predicted RBP	12.49	□□□□□ -0.41
SNHG16-208	ENST00000591956	ALDH2	P05091	517 aa		12.49	□□□□□ -0.41
SNHG16-208	ENST00000591956	MCF2	P10911	925 aa		12.49	□□□□□ -0.41
SNHG16-208	ENST00000591956	PPM1A	P35813	382 aa		12.49	□□□□□ -0.41

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