RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000590061.1

SMAD4-210, Transcript of SMAD family member 4, humanhuman

TSL 4

Gene SMAD4, Length 544 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMAD4-210ENST00000590061 SPAG1Q07617 926 aa8.07□□□□□ -1.12
SMAD4-210ENST00000590061 PNOCQ13519 176 aa8.07□□□□□ -1.12
SMAD4-210ENST00000590061 MYBPC2Q14324 1141 aa8.07□□□□□ -1.12
SMAD4-210ENST00000590061 TLR1Q15399 786 aa8.07□□□□□ -1.12
SMAD4-210ENST00000590061 TPD52L1Q16890 204 aaPredicted RBP8.07□□□□□ -1.12
SMAD4-210ENST00000590061 HSDL1Q3SXM5 330 aa8.07□□□□□ -1.12
SMAD4-210ENST00000590061 SLC9C1Q4G0N8 1177 aa8.07□□□□□ -1.12
SMAD4-210ENST00000590061 GNASQ5JWF2 1037 aa8.07□□□□□ -1.12
SMAD4-210ENST00000590061 FAM26FQ5R3K3 315 aa8.07□□□□□ -1.12
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SMAD4-210ENST00000590061 MAP3K21Q5TCX8 1036 aa8.07□□□□□ -1.12
SMAD4-210ENST00000590061 TAF2Q6P1X5 1199 aa8.07□□□□□ -1.12
SMAD4-210ENST00000590061 C1orf186Q6ZWK4 172 aa8.07□□□□□ -1.12
SMAD4-210ENST00000590061 HS2ST1Q7LGA3 356 aa8.07□□□□□ -1.12
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SMAD4-210ENST00000590061 FAM178BQ8IXR5 827 aa8.07□□□□□ -1.12
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SMAD4-210ENST00000590061 PSPC1Q8WXF1 523 aaKnown RBP8.07□□□□□ -1.12
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SMAD4-210ENST00000590061 MAP7D2Q96T17 732 aa8.07□□□□□ -1.12
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SMAD4-210ENST00000590061 ST6GALNAC4Q9H4F1 302 aa8.07□□□□□ -1.12
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SMAD4-210ENST00000590061 DDX20Q9UHI6 824 aaKnown RBP8.07□□□□□ -1.12
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SMAD4-210ENST00000590061 E9PMD0 336 aa8.06□□□□□ -1.12
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SMAD4-210ENST00000590061 LGALS2P05162 132 aa8.06□□□□□ -1.12
SMAD4-210ENST00000590061 C6orf222P0C671 652 aaPredicted RBP8.06□□□□□ -1.12
SMAD4-210ENST00000590061 PLS3P13797 630 aa8.06□□□□□ -1.12
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SMAD4-210ENST00000590061 ZBTB8OSQ8IWT0 167 aa8.06□□□□□ -1.12
SMAD4-210ENST00000590061 C7orf31Q8N865 590 aa8.06□□□□□ -1.12
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SMAD4-210ENST00000590061 UCN2Q96RP3 112 aa8.06□□□□□ -1.12
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SMAD4-210ENST00000590061 PTPN22Q9Y2R2 807 aa8.06□□□□□ -1.12
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SMAD4-210ENST00000590061 MLLT1Q03111 559 aaPredicted RBP8.05□□□□□ -1.12
SMAD4-210ENST00000590061 STRN3Q13033 797 aa8.05□□□□□ -1.12
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SMAD4-210ENST00000590061 PAK1Q13153 545 aa8.05□□□□□ -1.12
SMAD4-210ENST00000590061 GIT2Q14161 759 aa8.05□□□□□ -1.12
SMAD4-210ENST00000590061 EMC2Q15006 297 aa8.05□□□□□ -1.12
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SMAD4-210ENST00000590061 TARBP2Q15633 366 aaKnown RBP8.05□□□□□ -1.12
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SMAD4-210ENST00000590061 FILIP1LQ4L180 1135 aa8.05□□□□□ -1.12
SMAD4-210ENST00000590061 FAM102BQ5T8I3 360 aa8.05□□□□□ -1.12
SMAD4-210ENST00000590061 SLFN12LQ6IEE8 588 aa8.05□□□□□ -1.12
SMAD4-210ENST00000590061 TMEM214Q6NUQ4 689 aaKnown RBP8.05□□□□□ -1.12
SMAD4-210ENST00000590061 LYPD4Q6UWN0 246 aa8.05□□□□□ -1.12
SMAD4-210ENST00000590061 DYMQ7RTS9 669 aa8.05□□□□□ -1.12
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SMAD4-210ENST00000590061 TMEM174Q8WUU8 243 aa8.05□□□□□ -1.12
SMAD4-210ENST00000590061 GJA10Q969M2 543 aa8.05□□□□□ -1.12
SMAD4-210ENST00000590061 DNAJC19Q96DA6 116 aa8.05□□□□□ -1.12
SMAD4-210ENST00000590061 GLT1D1Q96MS3 346 aa8.05□□□□□ -1.12
SMAD4-210ENST00000590061 ACCSQ96QU6 501 aa8.05□□□□□ -1.12
SMAD4-210ENST00000590061 REEP2Q9BRK0 252 aa8.05□□□□□ -1.12
SMAD4-210ENST00000590061 NFKBIZQ9BYH8 718 aa8.05□□□□□ -1.12
SMAD4-210ENST00000590061 ARHGAP39Q9C0H5 1083 aa8.05□□□□□ -1.12
SMAD4-210ENST00000590061 R3HDMLQ9H3Y0 253 aa8.05□□□□□ -1.12
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