RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000589772.1

CNP-208, Transcript of 2',3'-cyclic nucleotide 3' phosphodiesterase, humanhuman

TSL 4

Gene CNP, Length 516 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNP-208ENST00000589772 NT5C3AQ9H0P0 336 aa14.6□□□□□ -0.07
CNP-208ENST00000589772 NXF3Q9H4D5 531 aaKnown RBP14.6□□□□□ -0.07
CNP-208ENST00000589772 TLE6Q9H808 572 aa14.6□□□□□ -0.07
CNP-208ENST00000589772 MTMR6Q9Y217 621 aa14.6□□□□□ -0.07
CNP-208ENST00000589772 LZTS1Q9Y250 596 aa14.6□□□□□ -0.07
CNP-208ENST00000589772 CNTNAP2Q9UHC6 1331 aa14.6□□□□□ -0.07
CNP-208ENST00000589772 ARL5CA6NH57 179 aa14.59□□□□□ -0.07
CNP-208ENST00000589772 CCDC169A6NNP5 214 aa14.59□□□□□ -0.07
CNP-208ENST00000589772 NCK2O43639 380 aa14.59□□□□□ -0.07
CNP-208ENST00000589772 STX6O43752 255 aa14.59□□□□□ -0.07
CNP-208ENST00000589772 DDHD2O94830 711 aa14.59□□□□□ -0.07
CNP-208ENST00000589772 EDN1P05305 212 aa14.59□□□□□ -0.07
CNP-208ENST00000589772 PRKCBP05771 671 aa14.59□□□□□ -0.07
CNP-208ENST00000589772 AKAP5P24588 427 aa14.59□□□□□ -0.07
CNP-208ENST00000589772 MARCKSP29966 332 aaPredicted RBP14.59□□□□□ -0.07
CNP-208ENST00000589772 UBA7P41226 1012 aa14.59□□□□□ -0.07
CNP-208ENST00000589772 PEX3P56589 373 aa14.59□□□□□ -0.07
CNP-208ENST00000589772 CLUL1Q15846 466 aa14.59□□□□□ -0.07
CNP-208ENST00000589772 FAM187BQ17R55 369 aa14.59□□□□□ -0.07
CNP-208ENST00000589772 CTC1Q2NKJ3 1217 aa14.59□□□□□ -0.07
CNP-208ENST00000589772 C1orf186Q6ZWK4 172 aa14.59□□□□□ -0.07
CNP-208ENST00000589772 HSCBQ8IWL3 235 aa14.59□□□□□ -0.07
CNP-208ENST00000589772 DAW1Q8N136 415 aa14.59□□□□□ -0.07
CNP-208ENST00000589772 GADD45GIP1Q8TAE8 222 aaPredicted RBP14.59□□□□□ -0.07
CNP-208ENST00000589772 RSPH1Q8WYR4 309 aa14.59□□□□□ -0.07
CNP-208ENST00000589772 TMEM169Q96HH4 297 aa14.59□□□□□ -0.07
CNP-208ENST00000589772 AK8Q96MA6 479 aa14.59□□□□□ -0.07
CNP-208ENST00000589772 ZFP42Q96MM3 310 aa14.59□□□□□ -0.07
CNP-208ENST00000589772 FAM193BQ96PV7 902 aaPredicted RBP14.59□□□□□ -0.07
CNP-208ENST00000589772 TCF25Q9BQ70 676 aa14.59□□□□□ -0.07
CNP-208ENST00000589772 CCDC113Q9H0I3 377 aa14.59□□□□□ -0.07
CNP-208ENST00000589772 ENTPD7Q9NQZ7 604 aa14.59□□□□□ -0.07
CNP-208ENST00000589772 ACKR2O00590 384 aa14.58□□□□□ -0.08
CNP-208ENST00000589772 FSCN2O14926 492 aa14.58□□□□□ -0.08
CNP-208ENST00000589772 GALTP07902 379 aa14.58□□□□□ -0.08
CNP-208ENST00000589772 PLA2G4BP0C869 781 aa14.58□□□□□ -0.08
CNP-208ENST00000589772 LONP1P36776 959 aaKnown RBP14.58□□□□□ -0.08
CNP-208ENST00000589772 MLH1P40692 756 aa14.58□□□□□ -0.08
CNP-208ENST00000589772 NPTX2P47972 431 aa14.58□□□□□ -0.08
CNP-208ENST00000589772 SLC11A1P49279 550 aa14.58□□□□□ -0.08
CNP-208ENST00000589772 MAPK7Q13164 816 aa14.58□□□□□ -0.08
CNP-208ENST00000589772 ADAM15Q13444 863 aa14.58□□□□□ -0.08
CNP-208ENST00000589772 DHX8Q14562 1220 aaKnown RBP14.58□□□□□ -0.08
CNP-208ENST00000589772 PTPAQ15257 358 aa14.58□□□□□ -0.08
CNP-208ENST00000589772 TMEM119Q4V9L6 283 aa14.58□□□□□ -0.08
CNP-208ENST00000589772 SPECC1Q5M775 1068 aa14.58□□□□□ -0.08
CNP-208ENST00000589772 PTCRAQ6ISU1 281 aaPredicted RBP14.58□□□□□ -0.08
CNP-208ENST00000589772 TMC7Q7Z402 723 aa14.58□□□□□ -0.08
CNP-208ENST00000589772 SYT2Q8N9I0 419 aaPredicted RBP14.58□□□□□ -0.08
CNP-208ENST00000589772 RASSF8Q8NHQ8 419 aa14.58□□□□□ -0.08
CNP-208ENST00000589772 BCL7CQ8WUZ0 217 aaPredicted RBP14.58□□□□□ -0.08
CNP-208ENST00000589772 CALML4Q96GE6 196 aa14.58□□□□□ -0.08
CNP-208ENST00000589772 PDZD7Q9H5P4 517 aa14.58□□□□□ -0.08
CNP-208ENST00000589772 UBN1Q9NPG3 1134 aa14.58□□□□□ -0.08
CNP-208ENST00000589772 MIOSQ9NXC5 875 aa14.58□□□□□ -0.08
CNP-208ENST00000589772 KLK14Q9P0G3 267 aa14.58□□□□□ -0.08
CNP-208ENST00000589772 KANSL3Q9P2N6 904 aa14.58□□□□□ -0.08
CNP-208ENST00000589772 PARP2Q9UGN5 583 aa14.58□□□□□ -0.08
CNP-208ENST00000589772 NCOR1O75376 2440 aa14.57□□□□□ -0.08
CNP-208ENST00000589772 NPHP3-ACAD11A0A0J9YXS1 232 aa14.57□□□□□ -0.08
CNP-208ENST00000589772 HIDE1A8MVS5 230 aa14.57□□□□□ -0.08
CNP-208ENST00000589772 K7ERI5 159 aa14.57□□□□□ -0.08
CNP-208ENST00000589772 N4BP3O15049 544 aa14.57□□□□□ -0.08
CNP-208ENST00000589772 TBX10O75333 385 aa14.57□□□□□ -0.08
CNP-208ENST00000589772 HSP90AA1P07900 732 aaKnown RBP14.57□□□□□ -0.08
CNP-208ENST00000589772 IL9P15248 144 aa14.57□□□□□ -0.08
CNP-208ENST00000589772 CA8P35219 290 aa14.57□□□□□ -0.08
CNP-208ENST00000589772 NDUFV1P49821 464 aa14.57□□□□□ -0.08
CNP-208ENST00000589772 SCNN1GP51170 649 aa14.57□□□□□ -0.08
CNP-208ENST00000589772 EFNA5P52803 228 aa14.57□□□□□ -0.08
CNP-208ENST00000589772 SLC12A3P55017 1021 aa14.57□□□□□ -0.08
CNP-208ENST00000589772 RBM10P98175 930 aaKnown RBP14.57□□□□□ -0.08
CNP-208ENST00000589772 CACNB1Q02641 598 aaPredicted RBP14.57□□□□□ -0.08
CNP-208ENST00000589772 DMP1Q13316 513 aaPredicted RBP14.57□□□□□ -0.08
CNP-208ENST00000589772 KARSQ15046 597 aaKnown RBP14.57□□□□□ -0.08
CNP-208ENST00000589772 EEF1DP3Q658K8 133 aa14.57□□□□□ -0.08
CNP-208ENST00000589772 PDE12Q6L8Q7 609 aaKnown RBP14.57□□□□□ -0.08
CNP-208ENST00000589772 HACE1Q8IYU2 909 aa14.57□□□□□ -0.08
CNP-208ENST00000589772 VPS52Q8N1B4 723 aa14.57□□□□□ -0.08
CNP-208ENST00000589772 EFHBQ8N7U6 833 aa14.57□□□□□ -0.08
CNP-208ENST00000589772 SPRYD3Q8NCJ5 442 aa14.57□□□□□ -0.08
CNP-208ENST00000589772 LRRC15Q8TF66 581 aa14.57□□□□□ -0.08
CNP-208ENST00000589772 IGSF21Q96ID5 467 aa14.57□□□□□ -0.08
CNP-208ENST00000589772 DRC1Q96MC2 740 aa14.57□□□□□ -0.08
CNP-208ENST00000589772 KMT5AQ9NQR1 393 aa14.57□□□□□ -0.08
CNP-208ENST00000589772 GRXCR2A6NFK2 248 aa14.56□□□□□ -0.08
CNP-208ENST00000589772 TNFRSF10AO00220 468 aa14.56□□□□□ -0.08
CNP-208ENST00000589772 SLC16A4O15374 487 aa14.56□□□□□ -0.08
CNP-208ENST00000589772 ALDH2P05091 517 aa14.56□□□□□ -0.08
CNP-208ENST00000589772 PLCG1P19174 1290 aa14.56□□□□□ -0.08
CNP-208ENST00000589772 GUCY2CP25092 1073 aa14.56□□□□□ -0.08
CNP-208ENST00000589772 NT5DC1Q5TFE4 455 aa14.56□□□□□ -0.08
CNP-208ENST00000589772 FOXD4L5Q5VV16 416 aaPredicted RBP14.56□□□□□ -0.08
CNP-208ENST00000589772 USP49Q70CQ1 688 aa14.56□□□□□ -0.08
CNP-208ENST00000589772 KCTD17Q8N5Z5 321 aa14.56□□□□□ -0.08
CNP-208ENST00000589772 FOXD4L4Q8WXT5 416 aaPredicted RBP14.56□□□□□ -0.08
CNP-208ENST00000589772 AUTS2Q8WXX7 1259 aa14.56□□□□□ -0.08
CNP-208ENST00000589772 EPSTI1Q96J88 318 aa14.56□□□□□ -0.08
CNP-208ENST00000589772 CLIC6Q96NY7 704 aa14.56□□□□□ -0.08
CNP-208ENST00000589772 USP28Q96RU2 1077 aa14.56□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 24.9 ms