RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000589669.1

CCDC130-211, Transcript of coiled-coil domain containing 130, humanhuman

TSL 2

Gene CCDC130, Length 701 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC130-211ENST00000589669 CHST12Q9NRB3 414 aa14.7□□□□□ -0.06
CCDC130-211ENST00000589669 TMEM161AQ9NX61 479 aa14.7□□□□□ -0.06
CCDC130-211ENST00000589669 MRPL42Q9Y6G3 142 aaKnown RBP14.7□□□□□ -0.06
CCDC130-211ENST00000589669 NEMFO60524 1076 aa14.69□□□□□ -0.06
CCDC130-211ENST00000589669 XRCC6P12956 609 aaKnown RBP eCLIP14.69□□□□□ -0.06
CCDC130-211ENST00000589669 TXKP42681 527 aa14.69□□□□□ -0.06
CCDC130-211ENST00000589669 GUCY1B3Q02153 619 aa14.69□□□□□ -0.06
CCDC130-211ENST00000589669 TFF2Q03403 129 aa14.69□□□□□ -0.06
CCDC130-211ENST00000589669 FAM102BQ5T8I3 360 aa14.69□□□□□ -0.06
CCDC130-211ENST00000589669 PLA2G4FQ68DD2 849 aa14.69□□□□□ -0.06
CCDC130-211ENST00000589669 TPH2Q8IWU9 490 aa14.69□□□□□ -0.06
CCDC130-211ENST00000589669 SLC7A3Q8WY07 619 aa14.69□□□□□ -0.06
CCDC130-211ENST00000589669 EIF2AK1Q9BQI3 630 aaKnown RBP14.69□□□□□ -0.06
CCDC130-211ENST00000589669 ATP6V0A4Q9HBG4 840 aa14.69□□□□□ -0.06
CCDC130-211ENST00000589669 PGPEP1Q9NXJ5 209 aa14.69□□□□□ -0.06
CCDC130-211ENST00000589669 PLAGL2Q9UPG8 496 aa14.69□□□□□ -0.06
CCDC130-211ENST00000589669 SIP14410 1827 aa14.69□□□□□ -0.06
CCDC130-211ENST00000589669 EVPLQ92817 2033 aa14.68□□□□□ -0.06
CCDC130-211ENST00000589669 A0A087WZ62 844 aa14.68□□□□□ -0.06
CCDC130-211ENST00000589669 A0A0U1RQF3 1178 aa14.68□□□□□ -0.06
CCDC130-211ENST00000589669 FAM187AA6NFU0 413 aa14.68□□□□□ -0.06
CCDC130-211ENST00000589669 GRM6O15303 877 aa14.68□□□□□ -0.06
CCDC130-211ENST00000589669 ASAP2O43150 1006 aa14.68□□□□□ -0.06
CCDC130-211ENST00000589669 GAS2O43903 313 aaKnown RBP14.68□□□□□ -0.06
CCDC130-211ENST00000589669 GFRA3O60609 400 aa14.68□□□□□ -0.06
CCDC130-211ENST00000589669 EOMESO95936 686 aa14.68□□□□□ -0.06
CCDC130-211ENST00000589669 WDR4P57081 412 aaKnown RBP14.68□□□□□ -0.06
CCDC130-211ENST00000589669 ORC2Q13416 577 aaPredicted RBP14.68□□□□□ -0.06
CCDC130-211ENST00000589669 CTTNQ14247 550 aaKnown RBP14.68□□□□□ -0.06
CCDC130-211ENST00000589669 RHPN2Q8IUC4 686 aa14.68□□□□□ -0.06
CCDC130-211ENST00000589669 FAM184AQ8NB25 1140 aa14.68□□□□□ -0.06
CCDC130-211ENST00000589669 NEK9Q8TD19 979 aa14.68□□□□□ -0.06
CCDC130-211ENST00000589669 PRPF31Q8WWY3 499 aaKnown RBP14.68□□□□□ -0.06
CCDC130-211ENST00000589669 ITPKCQ96DU7 683 aa14.68□□□□□ -0.06
CCDC130-211ENST00000589669 ZNF668Q96K58 619 aaPredicted RBP14.68□□□□□ -0.06
CCDC130-211ENST00000589669 FDXACB1Q9BRP7 624 aaPredicted RBP14.68□□□□□ -0.06
CCDC130-211ENST00000589669 TRAIPQ9BWF2 469 aa14.68□□□□□ -0.06
CCDC130-211ENST00000589669 UPF2Q9HAU5 1272 aaKnown RBP14.68□□□□□ -0.06
CCDC130-211ENST00000589669 ANKEF1Q9NU02 776 aa14.68□□□□□ -0.06
CCDC130-211ENST00000589669 DACT1Q9NYF0 836 aa14.68□□□□□ -0.06
CCDC130-211ENST00000589669 NRG2O14511 850 aaPredicted RBP14.67□□□□□ -0.06
CCDC130-211ENST00000589669 ZBTB39O15060 712 aa14.67□□□□□ -0.06
CCDC130-211ENST00000589669 NCK2O43639 380 aa14.67□□□□□ -0.06
CCDC130-211ENST00000589669 LILRA1O75019 489 aa14.67□□□□□ -0.06
CCDC130-211ENST00000589669 TIMP2P16035 220 aa14.67□□□□□ -0.06
CCDC130-211ENST00000589669 U2AF2P26368 475 aaKnown RBP eCLIP14.67□□□□□ -0.062e-6■■■□□ 18.8
CCDC130-211ENST00000589669 TRAPPC10P48553 1259 aa14.67□□□□□ -0.06
CCDC130-211ENST00000589669 GATMP50440 423 aa14.67□□□□□ -0.06
CCDC130-211ENST00000589669 POLGP54098 1239 aaPredicted RBP14.67□□□□□ -0.06
CCDC130-211ENST00000589669 COL19A1Q14993 1142 aa14.67□□□□□ -0.06
CCDC130-211ENST00000589669 PAN2Q504Q3 1202 aaKnown RBP14.67□□□□□ -0.06
CCDC130-211ENST00000589669 TIGD5Q53EQ6 642 aa14.67□□□□□ -0.06
CCDC130-211ENST00000589669 ECHDC2Q86YB7 292 aa14.67□□□□□ -0.06
CCDC130-211ENST00000589669 NOSTRINQ8IVI9 506 aa14.67□□□□□ -0.06
CCDC130-211ENST00000589669 KSR1Q8IVT5 923 aa14.67□□□□□ -0.06
CCDC130-211ENST00000589669 SPPL3Q8TCT6 385 aa14.67□□□□□ -0.06
CCDC130-211ENST00000589669 TCP11Q8WWU5 503 aa14.67□□□□□ -0.06
CCDC130-211ENST00000589669 PBXIP1Q96AQ6 731 aa14.67□□□□□ -0.06
CCDC130-211ENST00000589669 SCLT1Q96NL6 688 aa14.67□□□□□ -0.06
CCDC130-211ENST00000589669 TMEM60Q9H2L4 133 aa14.67□□□□□ -0.06
CCDC130-211ENST00000589669 NSUN3Q9H649 340 aaKnown RBP14.67□□□□□ -0.06
CCDC130-211ENST00000589669 IFT122Q9HBG6 1241 aa14.67□□□□□ -0.06
CCDC130-211ENST00000589669 TYW1Q9NV66 732 aaKnown RBP14.67□□□□□ -0.06
CCDC130-211ENST00000589669 TBKBP1A7MCY6 615 aa14.66□□□□□ -0.06
CCDC130-211ENST00000589669 CSDE1O75534 798 aaKnown RBP14.66□□□□□ -0.06
CCDC130-211ENST00000589669 ZIC2O95409 532 aaPredicted RBP14.66□□□□□ -0.06
CCDC130-211ENST00000589669 ITGB1P05556 798 aa14.66□□□□□ -0.06
CCDC130-211ENST00000589669 ATP2B1P20020 1258 aa14.66□□□□□ -0.06
CCDC130-211ENST00000589669 FGFR4P22455 802 aa14.66□□□□□ -0.06
CCDC130-211ENST00000589669 SFPQP23246 707 aaKnown RBP eCLIP14.66□□□□□ -0.06
CCDC130-211ENST00000589669 MCM7P33993 719 aa14.66□□□□□ -0.06
CCDC130-211ENST00000589669 CYP4A11Q02928 519 aa14.66□□□□□ -0.06
CCDC130-211ENST00000589669 USP4Q13107 963 aa14.66□□□□□ -0.06
CCDC130-211ENST00000589669 CAMK1Q14012 370 aa14.66□□□□□ -0.06
CCDC130-211ENST00000589669 ZNF174Q15697 407 aa14.66□□□□□ -0.06
CCDC130-211ENST00000589669 XKR9Q5GH70 373 aa14.66□□□□□ -0.06
CCDC130-211ENST00000589669 TCEAL5Q5H9L2 206 aa14.66□□□□□ -0.06
CCDC130-211ENST00000589669 KLHL23Q8NBE8 558 aa14.66□□□□□ -0.06
CCDC130-211ENST00000589669 PSPC1Q8WXF1 523 aaKnown RBP14.66□□□□□ -0.06
CCDC130-211ENST00000589669 TMEM143Q96AN5 459 aa14.66□□□□□ -0.06
CCDC130-211ENST00000589669 CASD1Q96PB1 797 aa14.66□□□□□ -0.06
CCDC130-211ENST00000589669 TMEM117Q9H0C3 514 aa14.66□□□□□ -0.06
CCDC130-211ENST00000589669 ZFAND3Q9H8U3 227 aa14.66□□□□□ -0.06
CCDC130-211ENST00000589669 AAASQ9NRG9 546 aa14.66□□□□□ -0.06
CCDC130-211ENST00000589669 PCDHB12Q9Y5F1 795 aa14.66□□□□□ -0.06
CCDC130-211ENST00000589669 COL4A3BPQ9Y5P4 624 aa14.66□□□□□ -0.06
CCDC130-211ENST00000589669 BDP1A6H8Y1 2624 aa14.65□□□□□ -0.06
CCDC130-211ENST00000589669 SPATA31C1P0DKV0 1188 aa14.65□□□□□ -0.06
CCDC130-211ENST00000589669 FGFR1P11362 822 aa14.65□□□□□ -0.06
CCDC130-211ENST00000589669 MCM2P49736 904 aa14.65□□□□□ -0.06
CCDC130-211ENST00000589669 KCNQ1P51787 676 aa14.65□□□□□ -0.06
CCDC130-211ENST00000589669 POU5F1BQ06416 359 aa14.65□□□□□ -0.06
CCDC130-211ENST00000589669 LAMTOR4Q0VGL1 99 aa14.65□□□□□ -0.06
CCDC130-211ENST00000589669 MXD4Q14582 209 aaPredicted RBP14.65□□□□□ -0.06
CCDC130-211ENST00000589669 SRGAP1Q7Z6B7 1085 aa14.65□□□□□ -0.06
CCDC130-211ENST00000589669 C4orf32Q8N8J7 132 aa14.65□□□□□ -0.06
CCDC130-211ENST00000589669 POLR3CQ9BUI4 534 aaPredicted RBP14.65□□□□□ -0.06
CCDC130-211ENST00000589669 CWH43Q9H720 699 aa14.65□□□□□ -0.06
CCDC130-211ENST00000589669 UBE2ZQ9H832 354 aaPredicted RBP14.65□□□□□ -0.06
CCDC130-211ENST00000589669 ALG13Q9NP73 1137 aaKnown RBP14.65□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 22.6 ms