RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000584760.1

SREBF1-223, Transcript of sterol regulatory element binding transcription factor 1, human

TSL 2

Gene SREBF1, Length 564 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SREBF1-223	ENST00000584760	PPP4R3CP	Q6ZMV5	832 aa		14.73	□□□□□ -0.05
SREBF1-223	ENST00000584760	AGMO	Q6ZNB7	445 aa		14.73	□□□□□ -0.05
SREBF1-223	ENST00000584760	KCNK18	Q7Z418	384 aa		14.73	□□□□□ -0.05
SREBF1-223	ENST00000584760	THNSL1	Q8IYQ7	743 aa		14.73	□□□□□ -0.05
SREBF1-223	ENST00000584760	CPB2	Q96IY4	423 aa		14.73	□□□□□ -0.05
SREBF1-223	ENST00000584760	TLE6	Q9H808	572 aa		14.73	□□□□□ -0.05
SREBF1-223	ENST00000584760	TBC1D13	Q9NVG8	400 aa		14.73	□□□□□ -0.05
SREBF1-223	ENST00000584760	WDFY4	Q6ZS81	3184 aa		14.73	□□□□□ -0.05
SREBF1-223	ENST00000584760	TECTA	O75443	2155 aa		14.73	□□□□□ -0.05
SREBF1-223	ENST00000584760	CNTNAP2	Q9UHC6	1331 aa		14.72	□□□□□ -0.05
SREBF1-223	ENST00000584760	PER2	O15055	1255 aa		14.72	□□□□□ -0.05
SREBF1-223	ENST00000584760	OFD1	O75665	1012 aa		14.72	□□□□□ -0.05
SREBF1-223	ENST00000584760	GLP2R	O95838	553 aa		14.72	□□□□□ -0.05
SREBF1-223	ENST00000584760	BMP15	O95972	392 aa		14.72	□□□□□ -0.05
SREBF1-223	ENST00000584760	NCL	P19338	710 aa	Known RBP	14.72	□□□□□ -0.05
SREBF1-223	ENST00000584760	PPM1A	P35813	382 aa		14.72	□□□□□ -0.05
SREBF1-223	ENST00000584760	NAMPT	P43490	491 aa		14.72	□□□□□ -0.05
SREBF1-223	ENST00000584760	RBM10	P98175	930 aa	Known RBP	14.72	□□□□□ -0.05
SREBF1-223	ENST00000584760	PLCB3	Q01970	1234 aa		14.72	□□□□□ -0.05
SREBF1-223	ENST00000584760	CBX2	Q14781	532 aa	Predicted RBP	14.72	□□□□□ -0.05
SREBF1-223	ENST00000584760	FAM187B	Q17R55	369 aa		14.72	□□□□□ -0.05
SREBF1-223	ENST00000584760	NOMO2	Q5JPE7	1267 aa		14.72	□□□□□ -0.05
SREBF1-223	ENST00000584760	SMG8	Q8ND04	991 aa	Known RBP	14.72	□□□□□ -0.05
SREBF1-223	ENST00000584760	PGBD4	Q96DM1	585 aa		14.72	□□□□□ -0.05
SREBF1-223	ENST00000584760	PRIMPOL	Q96LW4	560 aa		14.72	□□□□□ -0.05
SREBF1-223	ENST00000584760	AK8	Q96MA6	479 aa		14.72	□□□□□ -0.05
SREBF1-223	ENST00000584760	ZNF558	Q96NG5	402 aa		14.72	□□□□□ -0.05
SREBF1-223	ENST00000584760	PNMA5	Q96PV4	448 aa		14.72	□□□□□ -0.05
SREBF1-223	ENST00000584760	PHF7	Q9BWX1	381 aa	Predicted RBP	14.72	□□□□□ -0.05
SREBF1-223	ENST00000584760	EIF2A	Q9BY44	585 aa	Known RBP	14.72	□□□□□ -0.05
SREBF1-223	ENST00000584760	CCDC113	Q9H0I3	377 aa		14.72	□□□□□ -0.05
SREBF1-223	ENST00000584760	CSRNP2	Q9H175	543 aa		14.72	□□□□□ -0.05
SREBF1-223	ENST00000584760	C2orf40	Q9H1Z8	148 aa		14.72	□□□□□ -0.05
SREBF1-223	ENST00000584760	DNM3	Q9UQ16	869 aa		14.72	□□□□□ -0.05
SREBF1-223	ENST00000584760	MTMR6	Q9Y217	621 aa		14.72	□□□□□ -0.05
SREBF1-223	ENST00000584760	IPP	Q9Y573	584 aa		14.72	□□□□□ -0.05
SREBF1-223	ENST00000584760	C5orf42	Q9H799	3197 aa		14.72	□□□□□ -0.05
SREBF1-223	ENST00000584760	INPPL1	O15357	1258 aa		14.71	□□□□□ -0.05
SREBF1-223	ENST00000584760	B4GALT3	O60512	393 aa		14.71	□□□□□ -0.05
SREBF1-223	ENST00000584760	AFF1	P51825	1210 aa	Known RBP	14.71	□□□□□ -0.05
SREBF1-223	ENST00000584760	GRIN1	Q05586	938 aa		14.71	□□□□□ -0.05
SREBF1-223	ENST00000584760	SIGLEC14	Q08ET2	396 aa		14.71	□□□□□ -0.05
SREBF1-223	ENST00000584760	MAPK7	Q13164	816 aa		14.71	□□□□□ -0.05
SREBF1-223	ENST00000584760	PPP2R5A	Q15172	486 aa		14.71	□□□□□ -0.05
SREBF1-223	ENST00000584760	SF3A1	Q15459	793 aa	Known RBP	14.71	□□□□□ -0.05
SREBF1-223	ENST00000584760	TMEM119	Q4V9L6	283 aa		14.71	□□□□□ -0.05
SREBF1-223	ENST00000584760	ZBTB8OS	Q8IWT0	167 aa		14.71	□□□□□ -0.05
SREBF1-223	ENST00000584760	DAW1	Q8N136	415 aa		14.71	□□□□□ -0.05
SREBF1-223	ENST00000584760	SLC39A11	Q8N1S5	342 aa		14.71	□□□□□ -0.05
SREBF1-223	ENST00000584760	CNNM3	Q8NE01	707 aa		14.71	□□□□□ -0.05
SREBF1-223	ENST00000584760	MRPS27	Q92552	414 aa	Known RBP	14.71	□□□□□ -0.05
SREBF1-223	ENST00000584760	KIFAP3	Q92845	792 aa		14.71	□□□□□ -0.05
SREBF1-223	ENST00000584760	KIFC3	Q9BVG8	833 aa		14.71	□□□□□ -0.05
SREBF1-223	ENST00000584760	RUSC1	Q9BVN2	902 aa		14.71	□□□□□ -0.05
SREBF1-223	ENST00000584760	FZD8	Q9H461	694 aa		14.71	□□□□□ -0.05
SREBF1-223	ENST00000584760	RSAD1	Q9HA92	442 aa		14.71	□□□□□ -0.05
SREBF1-223	ENST00000584760	TLR9	Q9NR96	1032 aa		14.71	□□□□□ -0.05
SREBF1-223	ENST00000584760	FOXD4L1	Q9NU39	408 aa		14.71	□□□□□ -0.05
SREBF1-223	ENST00000584760	PRMT7	Q9NVM4	692 aa	Predicted RBP	14.71	□□□□□ -0.05
SREBF1-223	ENST00000584760	LZTS1	Q9Y250	596 aa		14.71	□□□□□ -0.05
SREBF1-223	ENST00000584760	INPP5F	Q9Y2H2	1132 aa		14.71	□□□□□ -0.05
SREBF1-223	ENST00000584760	TRIP11	Q15643	1979 aa		14.71	□□□□□ -0.06
SREBF1-223	ENST00000584760		A0A1B0GUA9	196 aa		14.7	□□□□□ -0.06
SREBF1-223	ENST00000584760	TTLL13P	A6NNM8	815 aa		14.7	□□□□□ -0.06
SREBF1-223	ENST00000584760	FSCN2	O14926	492 aa		14.7	□□□□□ -0.06
SREBF1-223	ENST00000584760	GFRA3	O60609	400 aa		14.7	□□□□□ -0.06
SREBF1-223	ENST00000584760	ZC3H11A	O75152	810 aa	Known RBP eCLIP	14.7	□□□□□ -0.06
SREBF1-223	ENST00000584760	EDN1	P05305	212 aa		14.7	□□□□□ -0.06
SREBF1-223	ENST00000584760	VCP	P55072	806 aa	Known RBP	14.7	□□□□□ -0.06
SREBF1-223	ENST00000584760	BCAR1	P56945	870 aa		14.7	□□□□□ -0.06
SREBF1-223	ENST00000584760	NCBP1	Q09161	790 aa	Known RBP	14.7	□□□□□ -0.06
SREBF1-223	ENST00000584760	PTPA	Q15257	358 aa		14.7	□□□□□ -0.06
SREBF1-223	ENST00000584760	RINT1	Q6NUQ1	792 aa		14.7	□□□□□ -0.06
SREBF1-223	ENST00000584760	SLC27A1	Q6PCB7	646 aa		14.7	□□□□□ -0.06
SREBF1-223	ENST00000584760	C1orf186	Q6ZWK4	172 aa		14.7	□□□□□ -0.06
SREBF1-223	ENST00000584760	TMEM173	Q86WV6	379 aa	Predicted RBP	14.7	□□□□□ -0.06
SREBF1-223	ENST00000584760	KCTD17	Q8N5Z5	321 aa		14.7	□□□□□ -0.06
SREBF1-223	ENST00000584760	ATOH1	Q92858	354 aa	Predicted RBP	14.7	□□□□□ -0.06
SREBF1-223	ENST00000584760	NT5C3A	Q9H0P0	336 aa		14.7	□□□□□ -0.06
SREBF1-223	ENST00000584760	NXF3	Q9H4D5	531 aa	Known RBP	14.7	□□□□□ -0.06
SREBF1-223	ENST00000584760	NRDE2	Q9H7Z3	1164 aa		14.7	□□□□□ -0.06
SREBF1-223	ENST00000584760	POLD4	Q9HCU8	107 aa		14.7	□□□□□ -0.06
SREBF1-223	ENST00000584760	SPG21	Q9NZD8	308 aa		14.7	□□□□□ -0.06
SREBF1-223	ENST00000584760	HES2	Q9Y543	173 aa		14.7	□□□□□ -0.06
SREBF1-223	ENST00000584760	SLC26A4	O43511	780 aa		14.69	□□□□□ -0.06
SREBF1-223	ENST00000584760	HIP1R	O75146	1068 aa		14.69	□□□□□ -0.06
SREBF1-223	ENST00000584760	ITGA4	P13612	1032 aa		14.69	□□□□□ -0.06
SREBF1-223	ENST00000584760	AVPR2	P30518	371 aa		14.69	□□□□□ -0.06
SREBF1-223	ENST00000584760	SLC12A3	P55017	1021 aa		14.69	□□□□□ -0.06
SREBF1-223	ENST00000584760	ERVFC1	P60507	584 aa		14.69	□□□□□ -0.06
SREBF1-223	ENST00000584760	ZRSR1	Q15695	479 aa	Known RBP	14.69	□□□□□ -0.06
SREBF1-223	ENST00000584760	MAPK6	Q16659	721 aa		14.69	□□□□□ -0.06
SREBF1-223	ENST00000584760	FAM173B	Q6P4H8	233 aa		14.69	□□□□□ -0.06
SREBF1-223	ENST00000584760	CABP7	Q86V35	215 aa		14.69	□□□□□ -0.06
SREBF1-223	ENST00000584760	CDR2L	Q86X02	465 aa	Predicted RBP	14.69	□□□□□ -0.06
SREBF1-223	ENST00000584760	VN1R2	Q8NFZ6	395 aa		14.69	□□□□□ -0.06
SREBF1-223	ENST00000584760	DEPTOR	Q8TB45	409 aa		14.69	□□□□□ -0.06
SREBF1-223	ENST00000584760	URGCP	Q8TCY9	931 aa		14.69	□□□□□ -0.06
SREBF1-223	ENST00000584760	LRRC15	Q8TF66	581 aa		14.69	□□□□□ -0.06
SREBF1-223	ENST00000584760	IFT74	Q96LB3	600 aa		14.69	□□□□□ -0.06

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