RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000576691.5

TBCD-223, Transcript of tubulin folding cofactor D, human

TSL 3

Gene TBCD, Length 929 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
TBCD-223	ENST00000576691	TNFSF13B	Q9Y275	285 aa		18.42	■□□□□ 0.54
TBCD-223	ENST00000576691	STYXL1	Q9Y6J8	313 aa		18.42	■□□□□ 0.54
TBCD-223	ENST00000576691	HNRNPDL	O14979	420 aa	Known RBP	18.41	■□□□□ 0.54
TBCD-223	ENST00000576691	N4BP3	O15049	544 aa		18.41	■□□□□ 0.54
TBCD-223	ENST00000576691	KIAA0391	O15091	583 aa	Known RBP	18.41	■□□□□ 0.54
TBCD-223	ENST00000576691	TGFB1I1	O43294	461 aa		18.41	■□□□□ 0.54
TBCD-223	ENST00000576691	CALU	O43852	315 aa	Predicted RBP	18.41	■□□□□ 0.54
TBCD-223	ENST00000576691	NBN	O60934	754 aa		18.41	■□□□□ 0.54
TBCD-223	ENST00000576691	PFKM	P08237	780 aa		18.41	■□□□□ 0.54
TBCD-223	ENST00000576691	ARF4	P18085	180 aa	Predicted RBP	18.41	■□□□□ 0.54
TBCD-223	ENST00000576691	HOXA11	P31270	313 aa	Predicted RBP	18.41	■□□□□ 0.54
TBCD-223	ENST00000576691	CCL23	P55773	120 aa		18.41	■□□□□ 0.54
TBCD-223	ENST00000576691	NFX1	Q12986	1120 aa	Known RBP	18.41	■□□□□ 0.54
TBCD-223	ENST00000576691	PAK1	Q13153	545 aa		18.41	■□□□□ 0.54
TBCD-223	ENST00000576691	NFIL3	Q16649	462 aa		18.41	■□□□□ 0.54
TBCD-223	ENST00000576691	EDRF1	Q3B7T1	1238 aa		18.41	■□□□□ 0.54
TBCD-223	ENST00000576691	PLEKHG4	Q58EX7	1191 aa		18.41	■□□□□ 0.54
TBCD-223	ENST00000576691	ATF7IP2	Q5U623	682 aa		18.41	■□□□□ 0.54
TBCD-223	ENST00000576691	NOTUM	Q6P988	496 aa		18.41	■□□□□ 0.54
TBCD-223	ENST00000576691	LRSAM1	Q6UWE0	723 aa		18.41	■□□□□ 0.54
TBCD-223	ENST00000576691	C12orf56	Q8IXR9	622 aa		18.41	■□□□□ 0.54
TBCD-223	ENST00000576691	RPUSD2	Q8IZ73	545 aa	Known RBP	18.41	■□□□□ 0.54
TBCD-223	ENST00000576691	SEPT8	Q92599	483 aa		18.41	■□□□□ 0.54
TBCD-223	ENST00000576691	P2RX5	Q93086	422 aa		18.41	■□□□□ 0.54
TBCD-223	ENST00000576691	TSG101	Q99816	390 aa		18.41	■□□□□ 0.54
TBCD-223	ENST00000576691	TARS2	Q9BW92	718 aa	Known RBP	18.41	■□□□□ 0.54
TBCD-223	ENST00000576691	IFIH1	Q9BYX4	1025 aa	Known RBP	18.41	■□□□□ 0.54
TBCD-223	ENST00000576691	RWDD2A	Q9UIY3	292 aa		18.41	■□□□□ 0.54
TBCD-223	ENST00000576691	UMODL1	Q5DID0	1318 aa		18.41	■□□□□ 0.54
TBCD-223	ENST00000576691	ZSCAN20	P17040	1043 aa	Predicted RBP	18.4	■□□□□ 0.54
TBCD-223	ENST00000576691	GART	P22102	1010 aa		18.4	■□□□□ 0.54
TBCD-223	ENST00000576691	RPL13	P26373	211 aa	Known RBP	18.4	■□□□□ 0.54
TBCD-223	ENST00000576691	CD52	P31358	61 aa		18.4	■□□□□ 0.54
TBCD-223	ENST00000576691	GPNMB	Q14956	572 aa		18.4	■□□□□ 0.54
TBCD-223	ENST00000576691	TMEM132A	Q24JP5	1023 aa		18.4	■□□□□ 0.54
TBCD-223	ENST00000576691	SLC9A9	Q8IVB4	645 aa		18.4	■□□□□ 0.54
TBCD-223	ENST00000576691	C7orf61	Q8IZ16	206 aa		18.4	■□□□□ 0.54
TBCD-223	ENST00000576691	NELFB	Q8WX92	580 aa		18.4	■□□□□ 0.54
TBCD-223	ENST00000576691	BPIFA3	Q9BQP9	254 aa		18.4	■□□□□ 0.54
TBCD-223	ENST00000576691	ADPGK	Q9BRR6	497 aa		18.4	■□□□□ 0.54
TBCD-223	ENST00000576691	TRAIP	Q9BWF2	469 aa		18.4	■□□□□ 0.54
TBCD-223	ENST00000576691	SEMA6B	Q9H3T3	888 aa		18.4	■□□□□ 0.54
TBCD-223	ENST00000576691	PTPRH	Q9HD43	1115 aa		18.4	■□□□□ 0.54
TBCD-223	ENST00000576691	CLDN3	O15551	220 aa		18.39	■□□□□ 0.53
TBCD-223	ENST00000576691	FGFR4	P22455	802 aa		18.39	■□□□□ 0.53
TBCD-223	ENST00000576691	PROZ	P22891	400 aa		18.39	■□□□□ 0.53
TBCD-223	ENST00000576691	KYAT1	Q16773	422 aa		18.39	■□□□□ 0.53
TBCD-223	ENST00000576691	ZCWPW2	Q504Y3	356 aa		18.39	■□□□□ 0.53
TBCD-223	ENST00000576691	KLHL10	Q6JEL2	608 aa		18.39	■□□□□ 0.53
TBCD-223	ENST00000576691	MPZL3	Q6UWV2	235 aa		18.39	■□□□□ 0.53
TBCD-223	ENST00000576691	SCLY	Q96I15	445 aa		18.39	■□□□□ 0.53
TBCD-223	ENST00000576691	TCHP	Q9BT92	498 aa		18.39	■□□□□ 0.53
TBCD-223	ENST00000576691	AGPAT3	Q9NRZ7	376 aa		18.39	■□□□□ 0.53
TBCD-223	ENST00000576691	ZMYM2	Q9UBW7	1377 aa		18.39	■□□□□ 0.53
TBCD-223	ENST00000576691		A0A0B4J269	797 aa		18.38	■□□□□ 0.53
TBCD-223	ENST00000576691		A0A1W2PPC1	479 aa		18.38	■□□□□ 0.53
TBCD-223	ENST00000576691	ANKRD63	C9JTQ0	380 aa		18.38	■□□□□ 0.53
TBCD-223	ENST00000576691	B4GALT5	O43286	388 aa		18.38	■□□□□ 0.53
TBCD-223	ENST00000576691	FGFR1OP	O95684	399 aa	Known RBP	18.38	■□□□□ 0.53
TBCD-223	ENST00000576691	MCF2	P10911	925 aa		18.38	■□□□□ 0.53
TBCD-223	ENST00000576691	SKI	P12755	728 aa		18.38	■□□□□ 0.53
TBCD-223	ENST00000576691	ITGB8	P26012	769 aa		18.38	■□□□□ 0.53
TBCD-223	ENST00000576691	FKBP3	Q00688	224 aa	Known RBP	18.38	■□□□□ 0.53
TBCD-223	ENST00000576691	MCL1	Q07820	350 aa		18.38	■□□□□ 0.53
TBCD-223	ENST00000576691	DSC3	Q14574	896 aa		18.38	■□□□□ 0.53
TBCD-223	ENST00000576691	DCAF4L1	Q3SXM0	396 aa		18.38	■□□□□ 0.53
TBCD-223	ENST00000576691	ANO6	Q4KMQ2	910 aa		18.38	■□□□□ 0.53
TBCD-223	ENST00000576691	ANKRD40	Q6AI12	368 aa		18.38	■□□□□ 0.53
TBCD-223	ENST00000576691	SLC27A1	Q6PCB7	646 aa		18.38	■□□□□ 0.53
TBCD-223	ENST00000576691	ENOX1	Q8TC92	643 aa	Known RBP	18.38	■□□□□ 0.53
TBCD-223	ENST00000576691	OSBPL7	Q9BZF2	842 aa		18.38	■□□□□ 0.53
TBCD-223	ENST00000576691	DNAJC25	Q9H1X3	360 aa		18.38	■□□□□ 0.53
TBCD-223	ENST00000576691	PDZD7	Q9H5P4	517 aa		18.38	■□□□□ 0.53
TBCD-223	ENST00000576691	KIAA1586	Q9HCI6	787 aa		18.38	■□□□□ 0.53
TBCD-223	ENST00000576691	PIN4	Q9Y237	131 aa	Known RBP	18.38	■□□□□ 0.53
TBCD-223	ENST00000576691	LAMA3	Q16787	3333 aa		18.38	■□□□□ 0.53
TBCD-223	ENST00000576691	TTLL13P	A6NNM8	815 aa		18.37	■□□□□ 0.53
TBCD-223	ENST00000576691	LDHA	P00338	332 aa	Known RBP	18.37	■□□□□ 0.53
TBCD-223	ENST00000576691	EDN1	P05305	212 aa		18.37	■□□□□ 0.53
TBCD-223	ENST00000576691	ADSS	P30520	456 aa		18.37	■□□□□ 0.53
TBCD-223	ENST00000576691	POU5F1	Q01860	360 aa	Known RBP	18.37	■□□□□ 0.53
TBCD-223	ENST00000576691	PPIG	Q13427	754 aa	Known RBP eCLIP	18.37	■□□□□ 0.53	4e-9	■■□□□ 14
TBCD-223	ENST00000576691	TTI2	Q6NXR4	508 aa		18.37	■□□□□ 0.53
TBCD-223	ENST00000576691	ARMCX5	Q6P1M9	558 aa		18.37	■□□□□ 0.53
TBCD-223	ENST00000576691	SLC39A4	Q6P5W5	647 aa		18.37	■□□□□ 0.53
TBCD-223	ENST00000576691	CNKSR3	Q6P9H4	555 aa		18.37	■□□□□ 0.53
TBCD-223	ENST00000576691	DBF4B	Q8NFT6	615 aa		18.37	■□□□□ 0.53
TBCD-223	ENST00000576691	POMGNT1	Q8WZA1	660 aa		18.37	■□□□□ 0.53
TBCD-223	ENST00000576691	CPB2	Q96IY4	423 aa		18.37	■□□□□ 0.53
TBCD-223	ENST00000576691	TMX1	Q9H3N1	280 aa		18.37	■□□□□ 0.53
TBCD-223	ENST00000576691	TSPY26P	Q9H489	355 aa		18.37	■□□□□ 0.53
TBCD-223	ENST00000576691	DMAC2	Q9NW81	257 aa		18.37	■□□□□ 0.53
TBCD-223	ENST00000576691	RNF216	Q9NWF9	866 aa	Predicted RBP	18.37	■□□□□ 0.53
TBCD-223	ENST00000576691	CTNND2	Q9UQB3	1225 aa		18.37	■□□□□ 0.53
TBCD-223	ENST00000576691	SI	P14410	1827 aa		18.37	■□□□□ 0.53
TBCD-223	ENST00000576691	LTBP2	Q14767	1821 aa		18.37	■□□□□ 0.53
TBCD-223	ENST00000576691	ABLIM1	O14639	778 aa		18.36	■□□□□ 0.53
TBCD-223	ENST00000576691	EFCAB14	O75071	495 aa		18.36	■□□□□ 0.53
TBCD-223	ENST00000576691	ZNF623	O75123	536 aa		18.36	■□□□□ 0.53
TBCD-223	ENST00000576691	NR3C1	P04150	777 aa		18.36	■□□□□ 0.53

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