RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000576084.5

COX11-208, Transcript of cytochrome c oxidase copper chaperone COX11, human

TSL 3

Gene COX11, Length 652 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
COX11-208	ENST00000576084	KLRG2	A4D1S0	409 aa	Predicted RBP	4.74	□□□□□ -1.65
COX11-208	ENST00000576084	GOLGA8A	A7E2F4	631 aa		4.74	□□□□□ -1.65
COX11-208	ENST00000576084	CAPN14	A8MX76	684 aa		4.74	□□□□□ -1.65
COX11-208	ENST00000576084	HOXA3	O43365	443 aa	Predicted RBP	4.74	□□□□□ -1.65
COX11-208	ENST00000576084	LTA4H	P09960	611 aa	Known RBP	4.74	□□□□□ -1.65
COX11-208	ENST00000576084	CTSS	P25774	331 aa		4.74	□□□□□ -1.65
COX11-208	ENST00000576084	CNGA1	P29973	690 aa		4.74	□□□□□ -1.65
COX11-208	ENST00000576084	CASR	P41180	1078 aa		4.74	□□□□□ -1.65
COX11-208	ENST00000576084	NRG3	P56975	720 aa		4.74	□□□□□ -1.65
COX11-208	ENST00000576084	SCAND1	P57086	179 aa		4.74	□□□□□ -1.65
COX11-208	ENST00000576084	MRPS9	P82933	396 aa	Known RBP	4.74	□□□□□ -1.65
COX11-208	ENST00000576084	FOXE3	Q13461	319 aa		4.74	□□□□□ -1.65
COX11-208	ENST00000576084	RRP1B	Q14684	758 aa	Known RBP	4.74	□□□□□ -1.65
COX11-208	ENST00000576084	FAM214A	Q32MH5	1076 aa		4.74	□□□□□ -1.65
COX11-208	ENST00000576084	C19orf54	Q5BKX5	351 aa		4.74	□□□□□ -1.65
COX11-208	ENST00000576084	MIIP	Q5JXC2	388 aa		4.74	□□□□□ -1.65
COX11-208	ENST00000576084	RNF219	Q5W0B1	726 aa	Predicted RBP	4.74	□□□□□ -1.65
COX11-208	ENST00000576084	IGFL4	Q6B9Z1	124 aa		4.74	□□□□□ -1.65
COX11-208	ENST00000576084	IQSEC1	Q6DN90	963 aa		4.74	□□□□□ -1.65
COX11-208	ENST00000576084	LMBR1L	Q6UX01	489 aa		4.74	□□□□□ -1.65
COX11-208	ENST00000576084	SPATS2	Q86XZ4	545 aa	Known RBP	4.74	□□□□□ -1.65
COX11-208	ENST00000576084	GLB1L2	Q8IW92	636 aa		4.74	□□□□□ -1.65
COX11-208	ENST00000576084	TGFBRAP1	Q8WUH2	860 aa		4.74	□□□□□ -1.65
COX11-208	ENST00000576084	MIEF2	Q96C03	454 aa		4.74	□□□□□ -1.65
COX11-208	ENST00000576084	RAX2	Q96IS3	184 aa		4.74	□□□□□ -1.65
COX11-208	ENST00000576084	SPC25	Q9HBM1	224 aa		4.74	□□□□□ -1.65
COX11-208	ENST00000576084	C14orf119	Q9NWQ9	140 aa		4.74	□□□□□ -1.65
COX11-208	ENST00000576084	NCDN	Q9UBB6	729 aa		4.74	□□□□□ -1.65
COX11-208	ENST00000576084	DPP7	Q9UHL4	492 aa		4.74	□□□□□ -1.65
COX11-208	ENST00000576084	RCAN3	Q9UKA8	241 aa		4.74	□□□□□ -1.65
COX11-208	ENST00000576084	WDR3	Q9UNX4	943 aa	Known RBP eCLIP	4.74	□□□□□ -1.65
COX11-208	ENST00000576084	CFTR	P13569	1480 aa		4.74	□□□□□ -1.65
COX11-208	ENST00000576084	DNAJC6	O75061	913 aa		4.73	□□□□□ -1.65
COX11-208	ENST00000576084	C1S	P09871	688 aa		4.73	□□□□□ -1.65
COX11-208	ENST00000576084	XPA	P23025	273 aa	Predicted RBP	4.73	□□□□□ -1.65
COX11-208	ENST00000576084	NPEPPS	P55786	919 aa		4.73	□□□□□ -1.65
COX11-208	ENST00000576084	WNT3A	P56704	352 aa		4.73	□□□□□ -1.65
COX11-208	ENST00000576084	DGCR2	P98153	550 aa		4.73	□□□□□ -1.65
COX11-208	ENST00000576084	ZXDA	P98168	799 aa		4.73	□□□□□ -1.65
COX11-208	ENST00000576084	AMPD3	Q01432	767 aa		4.73	□□□□□ -1.65
COX11-208	ENST00000576084	MEF2A	Q02078	507 aa	Predicted RBP	4.73	□□□□□ -1.65
COX11-208	ENST00000576084	FAP	Q12884	760 aa		4.73	□□□□□ -1.65
COX11-208	ENST00000576084	MRPL49	Q13405	166 aa	Known RBP	4.73	□□□□□ -1.65
COX11-208	ENST00000576084	ELAVL1	Q15717	326 aa	Known RBP	4.73	□□□□□ -1.65
COX11-208	ENST00000576084	CSRP2	Q16527	193 aa		4.73	□□□□□ -1.65
COX11-208	ENST00000576084	MUM1	Q2TAK8	710 aa		4.73	□□□□□ -1.65
COX11-208	ENST00000576084	INAVA	Q3KP66	663 aa		4.73	□□□□□ -1.65
COX11-208	ENST00000576084	TMPRSS6	Q8IU80	811 aa		4.73	□□□□□ -1.65
COX11-208	ENST00000576084	ELOA2	Q8IYF1	753 aa	Predicted RBP	4.73	□□□□□ -1.65
COX11-208	ENST00000576084	ANKRD35	Q8N283	1001 aa		4.73	□□□□□ -1.65
COX11-208	ENST00000576084	MDGA1	Q8NFP4	955 aa		4.73	□□□□□ -1.65
COX11-208	ENST00000576084	CACTIN	Q8WUQ7	758 aa	Known RBP	4.73	□□□□□ -1.65
COX11-208	ENST00000576084	SNX33	Q8WV41	574 aa		4.73	□□□□□ -1.65
COX11-208	ENST00000576084	AHCYL2	Q96HN2	611 aa	Known RBP	4.73	□□□□□ -1.65
COX11-208	ENST00000576084	LSM14B	Q9BX40	385 aa	Known RBP	4.73	□□□□□ -1.65
COX11-208	ENST00000576084	QRSL1	Q9H0R6	528 aa	Known RBP	4.73	□□□□□ -1.65
COX11-208	ENST00000576084	GIT1	Q9Y2X7	761 aa		4.73	□□□□□ -1.65
COX11-208	ENST00000576084	GRXCR1	A8MXD5	290 aa		4.72	□□□□□ -1.65
COX11-208	ENST00000576084	WNT10B	O00744	389 aa		4.72	□□□□□ -1.65
COX11-208	ENST00000576084	NRP1	O14786	923 aa		4.72	□□□□□ -1.65
COX11-208	ENST00000576084	CPE	P16870	476 aa		4.72	□□□□□ -1.65
COX11-208	ENST00000576084	CANX	P27824	592 aa	Known RBP	4.72	□□□□□ -1.65
COX11-208	ENST00000576084	MTNR1B	P49286	362 aa		4.72	□□□□□ -1.65
COX11-208	ENST00000576084	PTTG1IP	P53801	180 aa		4.72	□□□□□ -1.65
COX11-208	ENST00000576084	SLC25A3	Q00325	362 aa		4.72	□□□□□ -1.65
COX11-208	ENST00000576084	CDK17	Q00537	523 aa		4.72	□□□□□ -1.65
COX11-208	ENST00000576084	HHEX	Q03014	270 aa		4.72	□□□□□ -1.65
COX11-208	ENST00000576084	NRN1L	Q496H8	165 aa		4.72	□□□□□ -1.65
COX11-208	ENST00000576084	GPRIN1	Q7Z2K8	1008 aa		4.72	□□□□□ -1.65
COX11-208	ENST00000576084	C1orf210	Q8IVY1	113 aa		4.72	□□□□□ -1.65
COX11-208	ENST00000576084	THEMIS	Q8N1K5	641 aa	Predicted RBP	4.72	□□□□□ -1.65
COX11-208	ENST00000576084	CBARP	Q8N350	705 aa	Predicted RBP	4.72	□□□□□ -1.65
COX11-208	ENST00000576084	ATL2	Q8NHH9	583 aa		4.72	□□□□□ -1.65
COX11-208	ENST00000576084	CPEB1	Q9BZB8	566 aa	Known RBP	4.72	□□□□□ -1.65
COX11-208	ENST00000576084	VPS11	Q9H270	941 aa		4.72	□□□□□ -1.65
COX11-208	ENST00000576084	ATP8A1	Q9Y2Q0	1164 aa		4.72	□□□□□ -1.65
COX11-208	ENST00000576084	ABCC10	Q5T3U5	1492 aa		4.72	□□□□□ -1.65
COX11-208	ENST00000576084	XDH	P47989	1333 aa		4.72	□□□□□ -1.65
COX11-208	ENST00000576084	SNAPC4	Q5SXM2	1469 aa		4.71	□□□□□ -1.66
COX11-208	ENST00000576084	ZMYM3	Q14202	1370 aa		4.71	□□□□□ -1.66
COX11-208	ENST00000576084	TACR2	P21452	398 aa		4.71	□□□□□ -1.66
COX11-208	ENST00000576084	ACVRL1	P37023	503 aa		4.71	□□□□□ -1.66
COX11-208	ENST00000576084	CDKN1C	P49918	316 aa	Predicted RBP	4.71	□□□□□ -1.66
COX11-208	ENST00000576084	SRSF2	Q01130	221 aa	Known RBP	4.71	□□□□□ -1.66
COX11-208	ENST00000576084	PPP3CA	Q08209	521 aa		4.71	□□□□□ -1.66
COX11-208	ENST00000576084	TOB2	Q14106	344 aa	Predicted RBP	4.71	□□□□□ -1.66
COX11-208	ENST00000576084	ADRM1	Q16186	407 aa		4.71	□□□□□ -1.66
COX11-208	ENST00000576084	TOR2A	Q5JU69	321 aa		4.71	□□□□□ -1.66
COX11-208	ENST00000576084	FNDC7	Q5VTL7	733 aa		4.71	□□□□□ -1.66
COX11-208	ENST00000576084	NAIF1	Q69YI7	327 aa	Predicted RBP	4.71	□□□□□ -1.66
COX11-208	ENST00000576084	MFSD5	Q6N075	450 aa		4.71	□□□□□ -1.66
COX11-208	ENST00000576084	BTNL9	Q6UXG8	535 aa		4.71	□□□□□ -1.66
COX11-208	ENST00000576084		Q6ZVL8	140 aa		4.71	□□□□□ -1.66
COX11-208	ENST00000576084	APBB1IP	Q7Z5R6	666 aa	Predicted RBP	4.71	□□□□□ -1.66
COX11-208	ENST00000576084	FAM177A1	Q8N128	213 aa	Predicted RBP	4.71	□□□□□ -1.66
COX11-208	ENST00000576084	GLB1L3	Q8NCI6	653 aa	Predicted RBP	4.71	□□□□□ -1.66
COX11-208	ENST00000576084	OR5M3	Q8NGP4	307 aa		4.71	□□□□□ -1.66
COX11-208	ENST00000576084	AUTS2	Q8WXX7	1259 aa		4.71	□□□□□ -1.66
COX11-208	ENST00000576084	HOXB13	Q92826	284 aa	Predicted RBP	4.71	□□□□□ -1.66
COX11-208	ENST00000576084	IFT122	Q9HBG6	1241 aa		4.71	□□□□□ -1.66

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