RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000571722.3

SNORD3B-2-202, Transcript of small nucleolar RNA, C/D box 3B-2, humanhuman

BASIC

Gene SNORD3B-2, Length 791 nt, Biotype snoRNA, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNORD3B-2-202ENST00000571722 ZNF131P52739 623 aa16.04■□□□□ 0.16
SNORD3B-2-202ENST00000571722 PTPROQ16827 1216 aa16.04■□□□□ 0.16
SNORD3B-2-202ENST00000571722 NOMO2Q5JPE7 1267 aa16.04■□□□□ 0.16
SNORD3B-2-202ENST00000571722 SPOUT1Q5T280 376 aaKnown RBP16.04■□□□□ 0.16
SNORD3B-2-202ENST00000571722 SHC4Q6S5L8 630 aa16.04■□□□□ 0.16
SNORD3B-2-202ENST00000571722 CCDC73Q6ZRK6 1079 aa16.04■□□□□ 0.16
SNORD3B-2-202ENST00000571722 COLGALT1Q8NBJ5 622 aa16.04■□□□□ 0.16
SNORD3B-2-202ENST00000571722 TMEM161BQ8NDZ6 487 aa16.04■□□□□ 0.16
SNORD3B-2-202ENST00000571722 MRPL9Q9BYD2 267 aaKnown RBP16.04■□□□□ 0.16
SNORD3B-2-202ENST00000571722 PDZD7Q9H5P4 517 aa16.04■□□□□ 0.16
SNORD3B-2-202ENST00000571722 RSAD1Q9HA92 442 aa16.04■□□□□ 0.16
SNORD3B-2-202ENST00000571722 TBC1D13Q9NVG8 400 aa16.04■□□□□ 0.16
SNORD3B-2-202ENST00000571722 PCDHA7Q9UN72 937 aa16.04■□□□□ 0.16
SNORD3B-2-202ENST00000571722 HES2Q9Y543 173 aa16.04■□□□□ 0.16
SNORD3B-2-202ENST00000571722 PHLPP2Q6ZVD8 1323 aa16.03■□□□□ 0.16
SNORD3B-2-202ENST00000571722 N4BP3O15049 544 aa16.03■□□□□ 0.16
SNORD3B-2-202ENST00000571722 SLC16A4O15374 487 aa16.03■□□□□ 0.16
SNORD3B-2-202ENST00000571722 NPTXRO95502 500 aa16.03■□□□□ 0.16
SNORD3B-2-202ENST00000571722 LAG3P18627 525 aa16.03■□□□□ 0.16
SNORD3B-2-202ENST00000571722 LIG1P18858 919 aa16.03■□□□□ 0.16
SNORD3B-2-202ENST00000571722 DNAJB1P25685 340 aa16.03■□□□□ 0.16
SNORD3B-2-202ENST00000571722 SMTNP53814 917 aa16.03■□□□□ 0.16
SNORD3B-2-202ENST00000571722 PLCB3Q01970 1234 aa16.03■□□□□ 0.16
SNORD3B-2-202ENST00000571722 CSPP1Q1MSJ5 1256 aa16.03■□□□□ 0.16
SNORD3B-2-202ENST00000571722 EEF1DP3Q658K8 133 aa16.03■□□□□ 0.16
SNORD3B-2-202ENST00000571722 KCNT2Q6UVM3 1135 aa16.03■□□□□ 0.16
SNORD3B-2-202ENST00000571722 SV2BQ7L1I2 683 aa16.03■□□□□ 0.16
SNORD3B-2-202ENST00000571722 ACO2Q99798 780 aaKnown RBP16.03■□□□□ 0.16
SNORD3B-2-202ENST00000571722 TRIM6Q9C030 488 aaPredicted RBP16.03■□□□□ 0.16
SNORD3B-2-202ENST00000571722 NRDE2Q9H7Z3 1164 aa16.03■□□□□ 0.16
SNORD3B-2-202ENST00000571722 PTPRHQ9HD43 1115 aa16.03■□□□□ 0.16
SNORD3B-2-202ENST00000571722 MIOSQ9NXC5 875 aa16.03■□□□□ 0.16
SNORD3B-2-202ENST00000571722 LARSQ9P2J5 1176 aaKnown RBP16.03■□□□□ 0.16
SNORD3B-2-202ENST00000571722 KANSL3Q9P2N6 904 aa16.03■□□□□ 0.16
SNORD3B-2-202ENST00000571722 GIT1Q9Y2X7 761 aa16.03■□□□□ 0.16
SNORD3B-2-202ENST00000571722 MYMKA6NI61 221 aa16.02■□□□□ 0.16
SNORD3B-2-202ENST00000571722 FGF18O76093 207 aa16.02■□□□□ 0.16
SNORD3B-2-202ENST00000571722 MAPTP10636 758 aaKnown RBP16.02■□□□□ 0.16
SNORD3B-2-202ENST00000571722 NCKAP1LP55160 1127 aa16.02■□□□□ 0.16
SNORD3B-2-202ENST00000571722 E2F4Q16254 413 aa16.02■□□□□ 0.16
SNORD3B-2-202ENST00000571722 ATF7IP2Q5U623 682 aa16.02■□□□□ 0.16
SNORD3B-2-202ENST00000571722 ZNF280BQ86YH2 543 aa16.02■□□□□ 0.16
SNORD3B-2-202ENST00000571722 MICALL1Q8N3F8 863 aa16.02■□□□□ 0.16
SNORD3B-2-202ENST00000571722 GSTCDQ8NEC7 633 aa16.02■□□□□ 0.16
SNORD3B-2-202ENST00000571722 POF1BQ8WVV4 589 aa16.02■□□□□ 0.16
SNORD3B-2-202ENST00000571722 CHAMP1Q96JM3 812 aa16.02■□□□□ 0.16
SNORD3B-2-202ENST00000571722 FIZ1Q96SL8 496 aa16.02■□□□□ 0.16
SNORD3B-2-202ENST00000571722 GAD1Q99259 594 aa16.02■□□□□ 0.16
SNORD3B-2-202ENST00000571722 NXF3Q9H4D5 531 aaKnown RBP16.02■□□□□ 0.16
SNORD3B-2-202ENST00000571722 PARVGQ9HBI0 331 aa16.02■□□□□ 0.16
SNORD3B-2-202ENST00000571722 PRDM6Q9NQX0 595 aa16.02■□□□□ 0.16
SNORD3B-2-202ENST00000571722 TNFSF13BQ9Y275 285 aa16.02■□□□□ 0.16
SNORD3B-2-202ENST00000571722 INPP5FQ9Y2H2 1132 aa16.02■□□□□ 0.16
SNORD3B-2-202ENST00000571722 ARL5CA6NH57 179 aa16.01■□□□□ 0.15
SNORD3B-2-202ENST00000571722 DDHD2O94830 711 aa16.01■□□□□ 0.15
SNORD3B-2-202ENST00000571722 FAM13AO94988 1023 aa16.01■□□□□ 0.15
SNORD3B-2-202ENST00000571722 KRT18P05783 430 aaKnown RBP16.01■□□□□ 0.15
SNORD3B-2-202ENST00000571722 GALTP07902 379 aa16.01■□□□□ 0.15
SNORD3B-2-202ENST00000571722 AKAP5P24588 427 aa16.01■□□□□ 0.15
SNORD3B-2-202ENST00000571722 BCAR1P56945 870 aa16.01■□□□□ 0.15
SNORD3B-2-202ENST00000571722 UBE3AQ05086 875 aa16.01■□□□□ 0.15
SNORD3B-2-202ENST00000571722 HACE1Q8IYU2 909 aa16.01■□□□□ 0.15
SNORD3B-2-202ENST00000571722 MYCT1Q8N699 235 aa16.01■□□□□ 0.15
SNORD3B-2-202ENST00000571722 PDILTQ8N807 584 aa16.01■□□□□ 0.15
SNORD3B-2-202ENST00000571722 DDX12PQ92771 950 aa16.01■□□□□ 0.15
SNORD3B-2-202ENST00000571722 DNAJC19Q96DA6 116 aa16.01■□□□□ 0.15
SNORD3B-2-202ENST00000571722 ZNF558Q96NG5 402 aa16.01■□□□□ 0.15
SNORD3B-2-202ENST00000571722 TARS2Q9BW92 718 aaKnown RBP16.01■□□□□ 0.15
SNORD3B-2-202ENST00000571722 MRPL4Q9BYD3 311 aaKnown RBP16.01■□□□□ 0.15
SNORD3B-2-202ENST00000571722 RALGAPA2Q2PPJ7 1873 aa16.01■□□□□ 0.15
SNORD3B-2-202ENST00000571722 ABLIM1O14639 778 aa16■□□□□ 0.15
SNORD3B-2-202ENST00000571722 TRAK2O60296 914 aa16■□□□□ 0.15
SNORD3B-2-202ENST00000571722 B4GALT3O60512 393 aa16■□□□□ 0.15
SNORD3B-2-202ENST00000571722 POMCP01189 267 aa16■□□□□ 0.15
SNORD3B-2-202ENST00000571722 PROZP22891 400 aa16■□□□□ 0.15
SNORD3B-2-202ENST00000571722 PBX3P40426 434 aa16■□□□□ 0.15
SNORD3B-2-202ENST00000571722 STAT6P42226 847 aa16■□□□□ 0.15
SNORD3B-2-202ENST00000571722 ME1P48163 572 aa16■□□□□ 0.15
SNORD3B-2-202ENST00000571722 ALDH7A1P49419 539 aaKnown RBP16■□□□□ 0.15
SNORD3B-2-202ENST00000571722 RESP18Q5W5W9 173 aa16■□□□□ 0.15
SNORD3B-2-202ENST00000571722 HAUS6Q7Z4H7 955 aa16■□□□□ 0.15
SNORD3B-2-202ENST00000571722 THNSL1Q8IYQ7 743 aa16■□□□□ 0.15
SNORD3B-2-202ENST00000571722 SLC39A11Q8N1S5 342 aa16■□□□□ 0.15
SNORD3B-2-202ENST00000571722 URGCPQ8TCY9 931 aa16■□□□□ 0.15
SNORD3B-2-202ENST00000571722 LEO1Q8WVC0 666 aaPredicted RBP16■□□□□ 0.15
SNORD3B-2-202ENST00000571722 ADPGKQ9BRR6 497 aa16■□□□□ 0.15
SNORD3B-2-202ENST00000571722 APOL6Q9BWW8 343 aa16■□□□□ 0.15
SNORD3B-2-202ENST00000571722 SNTG2Q9NY99 539 aa16■□□□□ 0.15
SNORD3B-2-202ENST00000571722 SPG21Q9NZD8 308 aa16■□□□□ 0.15
SNORD3B-2-202ENST00000571722 LZTS1Q9Y250 596 aa16■□□□□ 0.15
SNORD3B-2-202ENST00000571722 ATP6V1DQ9Y5K8 247 aa16■□□□□ 0.15
SNORD3B-2-202ENST00000571722 PRRC2BQ5JSZ5 2229 aaKnown RBP16■□□□□ 0.15
SNORD3B-2-202ENST00000571722 NLRC5Q86WI3 1866 aa15.99■□□□□ 0.15
SNORD3B-2-202ENST00000571722 COL4A4P53420 1690 aaPredicted RBP15.99■□□□□ 0.15
SNORD3B-2-202ENST00000571722 NT5C1B-RDH14C9J2C7 533 aa15.99■□□□□ 0.15
SNORD3B-2-202ENST00000571722 H0YCG3 227 aa15.99■□□□□ 0.15
SNORD3B-2-202ENST00000571722 ALDH2P05091 517 aa15.99■□□□□ 0.15
SNORD3B-2-202ENST00000571722 SCP2P22307 547 aa15.99■□□□□ 0.15
SNORD3B-2-202ENST00000571722 IRS1P35568 1242 aa15.99■□□□□ 0.15
SNORD3B-2-202ENST00000571722 PPM1AP35813 382 aa15.99■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 23.8 ms