RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000568900.5

SPNS1-212, Transcript of sphingolipid transporter 1 (putative), humanhuman

TSL 2

Gene SPNS1, Length 2,253 nt, Biotype retained intron.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPNS1-212ENST00000568900 TMEM117Q9H0C3 514 aa22.69■■□□□ 1.22
SPNS1-212ENST00000568900 APEX2Q9UBZ4 518 aa22.69■■□□□ 1.22
SPNS1-212ENST00000568900 LRRIQ3A6PVS8 624 aaPredicted RBP22.68■■□□□ 1.22
SPNS1-212ENST00000568900 P4HA2O15460 535 aa22.68■■□□□ 1.22
SPNS1-212ENST00000568900 ADCY6O43306 1168 aa22.68■■□□□ 1.22
SPNS1-212ENST00000568900 PPFIA4O75335 1185 aa22.68■■□□□ 1.22
SPNS1-212ENST00000568900 LCA5LO95447 670 aa22.68■■□□□ 1.22
SPNS1-212ENST00000568900 GJB1P08034 283 aa22.68■■□□□ 1.22
SPNS1-212ENST00000568900 CLCN3P51790 818 aa22.68■■□□□ 1.22
SPNS1-212ENST00000568900 GRM1Q13255 1194 aa22.68■■□□□ 1.22
SPNS1-212ENST00000568900 LMO3Q8TAP4 145 aa22.68■■□□□ 1.22
SPNS1-212ENST00000568900 CCDC102AQ96A19 550 aa22.68■■□□□ 1.22
SPNS1-212ENST00000568900 IFIH1Q9BYX4 1025 aaKnown RBP22.68■■□□□ 1.22
SPNS1-212ENST00000568900 LACRTQ9GZZ8 138 aa22.68■■□□□ 1.22
SPNS1-212ENST00000568900 GPBP1L1Q9HC44 474 aaPredicted RBP22.68■■□□□ 1.22
SPNS1-212ENST00000568900 FLRT1Q9NZU1 646 aa22.68■■□□□ 1.22
SPNS1-212ENST00000568900 ANKFY1Q9P2R3 1169 aa22.68■■□□□ 1.22
SPNS1-212ENST00000568900 DNAJC12Q9UKB3 198 aa22.68■■□□□ 1.22
SPNS1-212ENST00000568900 PCDHA13Q9Y5I0 950 aa22.68■■□□□ 1.22
SPNS1-212ENST00000568900 STYXL1Q9Y6J8 313 aa22.68■■□□□ 1.22
SPNS1-212ENST00000568900 URI1O94763 535 aaPredicted RBP22.68■■□□□ 1.22
SPNS1-212ENST00000568900 MATR3P43243 847 aaKnown RBP eCLIP22.68■■□□□ 1.22
SPNS1-212ENST00000568900 VAV2P52735 878 aa22.68■■□□□ 1.22
SPNS1-212ENST00000568900 SREBF2Q12772 1141 aa22.68■■□□□ 1.22
SPNS1-212ENST00000568900 CRHR2Q13324 411 aa22.68■■□□□ 1.22
SPNS1-212ENST00000568900 ZNF484Q5JVG2 852 aa22.68■■□□□ 1.22
SPNS1-212ENST00000568900 IRF2BP2Q7Z5L9 587 aa22.68■■□□□ 1.22
SPNS1-212ENST00000568900 C16orf70Q9BSU1 422 aa22.68■■□□□ 1.22
SPNS1-212ENST00000568900 HAPLN2Q9GZV7 340 aa22.68■■□□□ 1.22
SPNS1-212ENST00000568900 AGO2Q9UKV8 859 aaKnown RBP22.68■■□□□ 1.22
SPNS1-212ENST00000568900 ZNF233A6NK53 670 aa22.67■■□□□ 1.22
SPNS1-212ENST00000568900 EXTL3O43909 919 aa22.67■■□□□ 1.22
SPNS1-212ENST00000568900 C22orf31O95567 290 aa22.67■■□□□ 1.22
SPNS1-212ENST00000568900 PNMA6AP0CW24 399 aaPredicted RBP22.67■■□□□ 1.22
SPNS1-212ENST00000568900 EFNA5P52803 228 aa22.67■■□□□ 1.22
SPNS1-212ENST00000568900 MAP2K1Q02750 393 aaPredicted RBP22.67■■□□□ 1.22
SPNS1-212ENST00000568900 TNFAIP2Q03169 654 aa22.67■■□□□ 1.22
SPNS1-212ENST00000568900 EPC2Q52LR7 807 aa22.67■■□□□ 1.22
SPNS1-212ENST00000568900 TMC2Q8TDI7 906 aa22.67■■□□□ 1.22
SPNS1-212ENST00000568900 ZNF668Q96K58 619 aaPredicted RBP22.67■■□□□ 1.22
SPNS1-212ENST00000568900 TOPORSQ9NS56 1045 aaPredicted RBP22.67■■□□□ 1.22
SPNS1-212ENST00000568900 KRT86O43790 486 aa22.66■■□□□ 1.22
SPNS1-212ENST00000568900 LRRN2O75325 713 aa22.66■■□□□ 1.22
SPNS1-212ENST00000568900 MMP3P08254 477 aa22.66■■□□□ 1.22
SPNS1-212ENST00000568900 DLATP10515 647 aaKnown RBP22.66■■□□□ 1.22
SPNS1-212ENST00000568900 CYP2B6P20813 491 aa22.66■■□□□ 1.22
SPNS1-212ENST00000568900 GTF2F1P35269 517 aaKnown RBP eCLIP22.66■■□□□ 1.22
SPNS1-212ENST00000568900 MCCD1P59942 119 aaPredicted RBP22.66■■□□□ 1.22
SPNS1-212ENST00000568900 CDCA2Q69YH5 1023 aaPredicted RBP22.66■■□□□ 1.22
SPNS1-212ENST00000568900 SLFN12LQ6IEE8 588 aa22.66■■□□□ 1.22
SPNS1-212ENST00000568900 ZNF662Q6ZS27 426 aa22.66■■□□□ 1.22
SPNS1-212ENST00000568900 ZBTB8OSQ8IWT0 167 aa22.66■■□□□ 1.22
SPNS1-212ENST00000568900 SLC35F6Q8N357 371 aa22.66■■□□□ 1.22
SPNS1-212ENST00000568900 NLRP4Q96MN2 994 aa22.66■■□□□ 1.22
SPNS1-212ENST00000568900 ZIC5Q96T25 663 aa22.66■■□□□ 1.22
SPNS1-212ENST00000568900 ZNF215Q9UL58 517 aaPredicted RBP22.66■■□□□ 1.22
SPNS1-212ENST00000568900 H3BRB1 525 aa22.66■■□□□ 1.22
SPNS1-212ENST00000568900 NLRP11P59045 1033 aaKnown RBP22.66■■□□□ 1.22
SPNS1-212ENST00000568900 CCL14Q16627 93 aa22.66■■□□□ 1.22
SPNS1-212ENST00000568900 PHLDB3Q6NSJ2 640 aa22.66■■□□□ 1.22
SPNS1-212ENST00000568900 USP37Q86T82 979 aa22.66■■□□□ 1.22
SPNS1-212ENST00000568900 HNRNPUL1Q9BUJ2 856 aaKnown RBP eCLIP22.66■■□□□ 1.22
SPNS1-212ENST00000568900 MSTO1Q9BUK6 570 aa22.66■■□□□ 1.22
SPNS1-212ENST00000568900 STK33Q9BYT3 514 aa22.66■■□□□ 1.22
SPNS1-212ENST00000568900 TUT1Q9H6E5 874 aaKnown RBP22.66■■□□□ 1.22
SPNS1-212ENST00000568900 KIAA1586Q9HCI6 787 aa22.66■■□□□ 1.22
SPNS1-212ENST00000568900 PCNTO95613 3336 aa22.66■■□□□ 1.22
SPNS1-212ENST00000568900 TTLL13PA6NNM8 815 aa22.65■■□□□ 1.22
SPNS1-212ENST00000568900 HOXC6P09630 235 aa22.65■■□□□ 1.22
SPNS1-212ENST00000568900 STAT1P42224 750 aa22.65■■□□□ 1.22
SPNS1-212ENST00000568900 ACOT2P49753 483 aa22.65■■□□□ 1.22
SPNS1-212ENST00000568900 KIF5AQ12840 1032 aa22.65■■□□□ 1.22
SPNS1-212ENST00000568900 DRAP1Q14919 205 aaPredicted RBP22.65■■□□□ 1.22
SPNS1-212ENST00000568900 CCDC113Q9H0I3 377 aa22.65■■□□□ 1.22
SPNS1-212ENST00000568900 L2HGDHQ9H9P8 463 aa22.65■■□□□ 1.22
SPNS1-212ENST00000568900 MYO1AQ9UBC5 1043 aa22.65■■□□□ 1.22
SPNS1-212ENST00000568900 F8VZ95 297 aa22.65■■□□□ 1.22
SPNS1-212ENST00000568900 GFPT2O94808 682 aa22.65■■□□□ 1.22
SPNS1-212ENST00000568900 KLRC1P26715 233 aa22.65■■□□□ 1.22
SPNS1-212ENST00000568900 CYP2C19P33261 490 aa22.65■■□□□ 1.22
SPNS1-212ENST00000568900 MAGEA1P43355 309 aa22.65■■□□□ 1.22
SPNS1-212ENST00000568900 PTK2Q05397 1052 aa22.65■■□□□ 1.22
SPNS1-212ENST00000568900 KRT39Q6A163 491 aa22.65■■□□□ 1.22
SPNS1-212ENST00000568900 PAXIP1Q6ZW49 1069 aaPredicted RBP22.65■■□□□ 1.22
SPNS1-212ENST00000568900 USP6NLQ92738 828 aa22.65■■□□□ 1.22
SPNS1-212ENST00000568900 TMEM8AQ9HCN3 771 aa22.65■■□□□ 1.22
SPNS1-212ENST00000568900 DUSP10Q9Y6W6 482 aa22.65■■□□□ 1.22
SPNS1-212ENST00000568900 KIAA0391O15091 583 aaKnown RBP22.64■■□□□ 1.22
SPNS1-212ENST00000568900 PMM2O15305 246 aa22.64■■□□□ 1.22
SPNS1-212ENST00000568900 MSCO60682 206 aa22.64■■□□□ 1.22
SPNS1-212ENST00000568900 PRKCBP05771 671 aa22.64■■□□□ 1.22
SPNS1-212ENST00000568900 HARSP12081 509 aaKnown RBP22.64■■□□□ 1.22
SPNS1-212ENST00000568900 TFDP1Q14186 410 aa22.64■■□□□ 1.22
SPNS1-212ENST00000568900 DGKDQ16760 1214 aa22.64■■□□□ 1.22
SPNS1-212ENST00000568900 ARHGAP44Q17R89 818 aa22.64■■□□□ 1.22
SPNS1-212ENST00000568900 MRPL4Q9BYD3 311 aaKnown RBP22.64■■□□□ 1.22
SPNS1-212ENST00000568900 C2orf40Q9H1Z8 148 aa22.64■■□□□ 1.22
SPNS1-212ENST00000568900 UTP3Q9NQZ2 479 aaKnown RBP eCLIP22.64■■□□□ 1.22
SPNS1-212ENST00000568900 BZW2Q9Y6E2 419 aaKnown RBP22.64■■□□□ 1.22
SPNS1-212ENST00000568900 A0A0B4J269 797 aa22.64■■□□□ 1.21
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