RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000568227.5

SNAP23-215, Transcript of synaptosome associated protein 23, human

TSL 4

Gene SNAP23, Length 599 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SNAP23-215	ENST00000568227	DRICH1	Q6PGQ1	229 aa	Predicted RBP	3.58	□□□□□ -1.84
SNAP23-215	ENST00000568227	CXorf67	Q86X51	503 aa	Predicted RBP	3.58	□□□□□ -1.84
SNAP23-215	ENST00000568227	OR14C36	Q8NHC7	312 aa		3.58	□□□□□ -1.84
SNAP23-215	ENST00000568227	PROKR1	Q8TCW9	393 aa		3.58	□□□□□ -1.84
SNAP23-215	ENST00000568227	PGBD4	Q96DM1	585 aa		3.58	□□□□□ -1.84
SNAP23-215	ENST00000568227	MFSD3	Q96ES6	412 aa		3.58	□□□□□ -1.84
SNAP23-215	ENST00000568227	MYEOV	Q96EZ4	313 aa		3.58	□□□□□ -1.84
SNAP23-215	ENST00000568227	FDXACB1	Q9BRP7	624 aa	Predicted RBP	3.58	□□□□□ -1.84
SNAP23-215	ENST00000568227	SLC46A2	Q9BY10	475 aa		3.58	□□□□□ -1.84
SNAP23-215	ENST00000568227	KCNH6	Q9H252	994 aa		3.58	□□□□□ -1.84
SNAP23-215	ENST00000568227	PIF1	Q9H611	641 aa		3.58	□□□□□ -1.84
SNAP23-215	ENST00000568227	PACSIN3	Q9UKS6	424 aa		3.58	□□□□□ -1.84
SNAP23-215	ENST00000568227	USP18	Q9UMW8	372 aa		3.58	□□□□□ -1.84
SNAP23-215	ENST00000568227	WDR3	Q9UNX4	943 aa	Known RBP eCLIP	3.58	□□□□□ -1.84
SNAP23-215	ENST00000568227	SORCS3	Q9UPU3	1222 aa		3.58	□□□□□ -1.84
SNAP23-215	ENST00000568227	HDAC5	Q9UQL6	1122 aa		3.58	□□□□□ -1.84
SNAP23-215	ENST00000568227	HS3ST4	Q9Y661	456 aa		3.58	□□□□□ -1.84
SNAP23-215	ENST00000568227	PRSS38	A1L453	326 aa		3.57	□□□□□ -1.84
SNAP23-215	ENST00000568227	RAB11FIP3	O75154	756 aa		3.57	□□□□□ -1.84
SNAP23-215	ENST00000568227	SCAF4	O95104	1147 aa	Known RBP	3.57	□□□□□ -1.84
SNAP23-215	ENST00000568227	FKBP9	O95302	570 aa		3.57	□□□□□ -1.84
SNAP23-215	ENST00000568227	GAST	P01350	101 aa		3.57	□□□□□ -1.84
SNAP23-215	ENST00000568227	LTA4H	P09960	611 aa	Known RBP	3.57	□□□□□ -1.84
SNAP23-215	ENST00000568227	HSP90B1	P14625	803 aa	Known RBP	3.57	□□□□□ -1.84
SNAP23-215	ENST00000568227	HK1	P19367	917 aa		3.57	□□□□□ -1.84
SNAP23-215	ENST00000568227	CASR	P41180	1078 aa		3.57	□□□□□ -1.84
SNAP23-215	ENST00000568227	MANF	P55145	182 aa	Known RBP	3.57	□□□□□ -1.84
SNAP23-215	ENST00000568227	IL2	P60568	153 aa		3.57	□□□□□ -1.84
SNAP23-215	ENST00000568227	PCBP1	Q15365	356 aa	Known RBP eCLIP	3.57	□□□□□ -1.84
SNAP23-215	ENST00000568227	TKFC	Q3LXA3	575 aa		3.57	□□□□□ -1.84
SNAP23-215	ENST00000568227	TIGD2	Q4W5G0	525 aa		3.57	□□□□□ -1.84
SNAP23-215	ENST00000568227	TAF7L	Q5H9L4	462 aa		3.57	□□□□□ -1.84
SNAP23-215	ENST00000568227	KCNV1	Q6PIU1	500 aa		3.57	□□□□□ -1.84
SNAP23-215	ENST00000568227	FKBP9P1	Q75LS8	142 aa		3.57	□□□□□ -1.84
SNAP23-215	ENST00000568227	GPRIN1	Q7Z2K8	1008 aa		3.57	□□□□□ -1.84
SNAP23-215	ENST00000568227	CPT1C	Q8TCG5	803 aa		3.57	□□□□□ -1.84
SNAP23-215	ENST00000568227	GPR101	Q96P66	508 aa	Predicted RBP	3.57	□□□□□ -1.84
SNAP23-215	ENST00000568227	CRAMP1	Q96RY5	1269 aa		3.57	□□□□□ -1.84
SNAP23-215	ENST00000568227	NDC1	Q9BTX1	674 aa		3.57	□□□□□ -1.84
SNAP23-215	ENST00000568227	EIF2B4	Q9UI10	523 aa	Known RBP	3.57	□□□□□ -1.84
SNAP23-215	ENST00000568227	PRSS50	Q9UI38	385 aa		3.57	□□□□□ -1.84
SNAP23-215	ENST00000568227	PRR5-ARHGAP8	B1AHC4	643 aa		3.56	□□□□□ -1.84
SNAP23-215	ENST00000568227		B5MCH6	92 aa		3.56	□□□□□ -1.84
SNAP23-215	ENST00000568227	RNASET2	O00584	256 aa	Known RBP	3.56	□□□□□ -1.84
SNAP23-215	ENST00000568227	B3GALT2	O43825	422 aa		3.56	□□□□□ -1.84
SNAP23-215	ENST00000568227	NR4A1	P22736	598 aa		3.56	□□□□□ -1.84
SNAP23-215	ENST00000568227	MGAT1	P26572	445 aa		3.56	□□□□□ -1.84
SNAP23-215	ENST00000568227	ADRA1B	P35368	520 aa		3.56	□□□□□ -1.84
SNAP23-215	ENST00000568227	COL10A1	Q03692	680 aa		3.56	□□□□□ -1.84
SNAP23-215	ENST00000568227	MGAT5	Q09328	741 aa		3.56	□□□□□ -1.84
SNAP23-215	ENST00000568227	FAM214A	Q32MH5	1076 aa		3.56	□□□□□ -1.84
SNAP23-215	ENST00000568227	DALRD3	Q5D0E6	543 aa	Known RBP	3.56	□□□□□ -1.84
SNAP23-215	ENST00000568227	MBNL2	Q5VZF2	373 aa	Known RBP	3.56	□□□□□ -1.84
SNAP23-215	ENST00000568227	PDZD4	Q76G19	769 aa	Predicted RBP	3.56	□□□□□ -1.84
SNAP23-215	ENST00000568227	KIAA0907	Q7Z7F0	614 aa	Predicted RBP	3.56	□□□□□ -1.84
SNAP23-215	ENST00000568227	RASSF3	Q86WH2	238 aa		3.56	□□□□□ -1.84
SNAP23-215	ENST00000568227	CDC5L	Q99459	802 aa	Known RBP	3.56	□□□□□ -1.84
SNAP23-215	ENST00000568227	TARS2	Q9BW92	718 aa	Known RBP	3.56	□□□□□ -1.84
SNAP23-215	ENST00000568227	LSM14B	Q9BX40	385 aa	Known RBP	3.56	□□□□□ -1.84
SNAP23-215	ENST00000568227	TOR3A	Q9H497	397 aa		3.56	□□□□□ -1.84
SNAP23-215	ENST00000568227	SPTLC3	Q9NUV7	552 aa		3.56	□□□□□ -1.84
SNAP23-215	ENST00000568227	TMPRSS11E	Q9UL52	423 aa		3.56	□□□□□ -1.84
SNAP23-215	ENST00000568227	MAPRE3	Q9UPY8	281 aa		3.56	□□□□□ -1.84
SNAP23-215	ENST00000568227	PPP2R3B	Q9Y5P8	575 aa		3.56	□□□□□ -1.84
SNAP23-215	ENST00000568227	TMEM200C	A6NKL6	621 aa		3.55	□□□□□ -1.84
SNAP23-215	ENST00000568227	KDM1A	O60341	852 aa		3.55	□□□□□ -1.84
SNAP23-215	ENST00000568227	LMNA	P02545	664 aa	Known RBP	3.55	□□□□□ -1.84
SNAP23-215	ENST00000568227	SPATA31D3	P0C874	917 aa		3.55	□□□□□ -1.84
SNAP23-215	ENST00000568227	ADCYAP1R1	P41586	468 aa		3.55	□□□□□ -1.84
SNAP23-215	ENST00000568227	APBA1	Q02410	837 aa		3.55	□□□□□ -1.84
SNAP23-215	ENST00000568227	PPARA	Q07869	468 aa		3.55	□□□□□ -1.84
SNAP23-215	ENST00000568227	UBE3C	Q15386	1083 aa		3.55	□□□□□ -1.84
SNAP23-215	ENST00000568227	DHCR24	Q15392	516 aa		3.55	□□□□□ -1.84
SNAP23-215	ENST00000568227	SEPT7	Q16181	437 aa	Known RBP	3.55	□□□□□ -1.84
SNAP23-215	ENST00000568227	DDB1	Q16531	1140 aa		3.55	□□□□□ -1.84
SNAP23-215	ENST00000568227	C21orf62-AS1	Q17RA5	79 aa		3.55	□□□□□ -1.84
SNAP23-215	ENST00000568227	SPATA31D4	Q6ZUB0	917 aa		3.55	□□□□□ -1.84
SNAP23-215	ENST00000568227	GDF7	Q7Z4P5	450 aa		3.55	□□□□□ -1.84
SNAP23-215	ENST00000568227	PLXDC1	Q8IUK5	500 aa		3.55	□□□□□ -1.84
SNAP23-215	ENST00000568227	LYSMD2	Q8IV50	215 aa		3.55	□□□□□ -1.84
SNAP23-215	ENST00000568227	SLC41A1	Q8IVJ1	513 aa		3.55	□□□□□ -1.84
SNAP23-215	ENST00000568227	DHX37	Q8IY37	1157 aa	Known RBP	3.55	□□□□□ -1.84
SNAP23-215	ENST00000568227	SNX33	Q8WV41	574 aa		3.55	□□□□□ -1.84
SNAP23-215	ENST00000568227	SLC5A5	Q92911	643 aa		3.55	□□□□□ -1.84
SNAP23-215	ENST00000568227	MLST8	Q9BVC4	326 aa		3.55	□□□□□ -1.84
SNAP23-215	ENST00000568227	CPEB1	Q9BZB8	566 aa	Known RBP	3.55	□□□□□ -1.84
SNAP23-215	ENST00000568227	EMC7	Q9NPA0	242 aa		3.55	□□□□□ -1.84
SNAP23-215	ENST00000568227	EVL	Q9UI08	416 aa	Predicted RBP	3.55	□□□□□ -1.84
SNAP23-215	ENST00000568227	NOC2L	Q9Y3T9	749 aa	Known RBP	3.55	□□□□□ -1.84
SNAP23-215	ENST00000568227	GRID2IP	A4D2P6	1211 aa		3.54	□□□□□ -1.84
SNAP23-215	ENST00000568227	GSG1L2	A8MUP6	293 aa		3.54	□□□□□ -1.84
SNAP23-215	ENST00000568227	AHRR	A9YTQ3	701 aa		3.54	□□□□□ -1.84
SNAP23-215	ENST00000568227	ENPP3	O14638	875 aa		3.54	□□□□□ -1.84
SNAP23-215	ENST00000568227	ZEB2	O60315	1214 aa		3.54	□□□□□ -1.84
SNAP23-215	ENST00000568227	PHF2	O75151	1096 aa		3.54	□□□□□ -1.84
SNAP23-215	ENST00000568227	ULK1	O75385	1050 aa		3.54	□□□□□ -1.84
SNAP23-215	ENST00000568227	CFB	P00751	764 aa		3.54	□□□□□ -1.84
SNAP23-215	ENST00000568227	HLA-DOA	P06340	250 aa		3.54	□□□□□ -1.84
SNAP23-215	ENST00000568227	CLEC2L	P0C7M8	214 aa		3.54	□□□□□ -1.84
SNAP23-215	ENST00000568227	RBP3	P10745	1247 aa		3.54	□□□□□ -1.84

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