RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000561112.1

RASGRF1-208, Transcript of Ras protein specific guanine nucleotide releasing factor 1, human

TSL 2

Gene RASGRF1, Length 265 nt, Biotype processed transcript.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RASGRF1-208	ENST00000561112	GIT2	Q14161	759 aa		12.82	□□□□□ -0.36
RASGRF1-208	ENST00000561112	PPP2R5A	Q15172	486 aa		12.82	□□□□□ -0.36
RASGRF1-208	ENST00000561112	MAPK6	Q16659	721 aa		12.82	□□□□□ -0.36
RASGRF1-208	ENST00000561112	PTPRO	Q16827	1216 aa		12.82	□□□□□ -0.36
RASGRF1-208	ENST00000561112	TCEAL5	Q5H9L2	206 aa		12.82	□□□□□ -0.36
RASGRF1-208	ENST00000561112	TMEM173	Q86WV6	379 aa	Predicted RBP	12.82	□□□□□ -0.36
RASGRF1-208	ENST00000561112	KRI1	Q8N9T8	703 aa	Known RBP	12.82	□□□□□ -0.36
RASGRF1-208	ENST00000561112	CCDC51	Q96ER9	411 aa		12.82	□□□□□ -0.36
RASGRF1-208	ENST00000561112	ZFP42	Q96MM3	310 aa		12.82	□□□□□ -0.36
RASGRF1-208	ENST00000561112	REEP2	Q9BRK0	252 aa		12.82	□□□□□ -0.36
RASGRF1-208	ENST00000561112	PANK2	Q9BZ23	570 aa		12.82	□□□□□ -0.36
RASGRF1-208	ENST00000561112	LMAN2L	Q9H0V9	348 aa		12.82	□□□□□ -0.36
RASGRF1-208	ENST00000561112	RSAD1	Q9HA92	442 aa		12.82	□□□□□ -0.36
RASGRF1-208	ENST00000561112	DAXX	Q9UER7	740 aa	Predicted RBP	12.82	□□□□□ -0.36
RASGRF1-208	ENST00000561112	PCDHB12	Q9Y5F1	795 aa		12.82	□□□□□ -0.36
RASGRF1-208	ENST00000561112	ARL5C	A6NH57	179 aa		12.81	□□□□□ -0.36
RASGRF1-208	ENST00000561112		K7ERI5	159 aa		12.81	□□□□□ -0.36
RASGRF1-208	ENST00000561112	SPTLC2	O15270	562 aa		12.81	□□□□□ -0.36
RASGRF1-208	ENST00000561112	INPPL1	O15357	1258 aa		12.81	□□□□□ -0.36
RASGRF1-208	ENST00000561112	SLC16A4	O15374	487 aa		12.81	□□□□□ -0.36
RASGRF1-208	ENST00000561112	PPP6R2	O75170	966 aa		12.81	□□□□□ -0.36
RASGRF1-208	ENST00000561112	BRD1	O95696	1058 aa		12.81	□□□□□ -0.36
RASGRF1-208	ENST00000561112	POMC	P01189	267 aa		12.81	□□□□□ -0.36
RASGRF1-208	ENST00000561112	GALT	P07902	379 aa		12.81	□□□□□ -0.36
RASGRF1-208	ENST00000561112	PDIA4	P13667	645 aa	Known RBP	12.81	□□□□□ -0.36
RASGRF1-208	ENST00000561112	PLS3	P13797	630 aa		12.81	□□□□□ -0.36
RASGRF1-208	ENST00000561112	LAG3	P18627	525 aa		12.81	□□□□□ -0.36
RASGRF1-208	ENST00000561112	GTF2F1	P35269	517 aa	Known RBP eCLIP	12.81	□□□□□ -0.36
RASGRF1-208	ENST00000561112	PLCB3	Q01970	1234 aa		12.81	□□□□□ -0.36
RASGRF1-208	ENST00000561112	DNM1	Q05193	864 aa	Known RBP	12.81	□□□□□ -0.36
RASGRF1-208	ENST00000561112	NCBP1	Q09161	790 aa	Known RBP	12.81	□□□□□ -0.36
RASGRF1-208	ENST00000561112	STK38	Q15208	465 aa		12.81	□□□□□ -0.36
RASGRF1-208	ENST00000561112	SKIV2L	Q15477	1246 aa	Known RBP	12.81	□□□□□ -0.36
RASGRF1-208	ENST00000561112	AXDND1	Q5T1B0	1012 aa	Predicted RBP	12.81	□□□□□ -0.36
RASGRF1-208	ENST00000561112	GLB1L	Q6UWU2	654 aa		12.81	□□□□□ -0.36
RASGRF1-208	ENST00000561112	ADGRD2	Q7Z7M1	963 aa		12.81	□□□□□ -0.36
RASGRF1-208	ENST00000561112	GPBP1	Q86WP2	473 aa		12.81	□□□□□ -0.36
RASGRF1-208	ENST00000561112	SLC39A11	Q8N1S5	342 aa		12.81	□□□□□ -0.36
RASGRF1-208	ENST00000561112	TMEM161B	Q8NDZ6	487 aa		12.81	□□□□□ -0.36
RASGRF1-208	ENST00000561112	CNNM3	Q8NE01	707 aa		12.81	□□□□□ -0.36
RASGRF1-208	ENST00000561112	BCL7C	Q8WUZ0	217 aa	Predicted RBP	12.81	□□□□□ -0.36
RASGRF1-208	ENST00000561112	SPIRE2	Q8WWL2	714 aa		12.81	□□□□□ -0.36
RASGRF1-208	ENST00000561112	LARP4B	Q92615	738 aa	Known RBP	12.81	□□□□□ -0.36
RASGRF1-208	ENST00000561112	DRC1	Q96MC2	740 aa		12.81	□□□□□ -0.36
RASGRF1-208	ENST00000561112	ZNF396	Q96N95	335 aa	Predicted RBP	12.81	□□□□□ -0.36
RASGRF1-208	ENST00000561112	ZNF558	Q96NG5	402 aa		12.81	□□□□□ -0.36
RASGRF1-208	ENST00000561112	FIZ1	Q96SL8	496 aa		12.81	□□□□□ -0.36
RASGRF1-208	ENST00000561112	GAD1	Q99259	594 aa		12.81	□□□□□ -0.36
RASGRF1-208	ENST00000561112	TIPIN	Q9BVW5	301 aa		12.81	□□□□□ -0.36
RASGRF1-208	ENST00000561112	APOL6	Q9BWW8	343 aa		12.81	□□□□□ -0.36
RASGRF1-208	ENST00000561112	NSUN3	Q9H649	340 aa	Known RBP	12.81	□□□□□ -0.36
RASGRF1-208	ENST00000561112	TMEM134	Q9H6X4	195 aa		12.81	□□□□□ -0.36
RASGRF1-208	ENST00000561112	C17orf75	Q9HAS0	396 aa		12.81	□□□□□ -0.36
RASGRF1-208	ENST00000561112	PTPRH	Q9HD43	1115 aa		12.81	□□□□□ -0.36
RASGRF1-208	ENST00000561112	KMT5A	Q9NQR1	393 aa		12.81	□□□□□ -0.36
RASGRF1-208	ENST00000561112	AAAS	Q9NRG9	546 aa		12.81	□□□□□ -0.36
RASGRF1-208	ENST00000561112	KCND2	Q9NZV8	630 aa		12.81	□□□□□ -0.36
RASGRF1-208	ENST00000561112	ABLIM1	O14639	778 aa		12.8	□□□□□ -0.36
RASGRF1-208	ENST00000561112	ZC3H11A	O75152	810 aa	Known RBP eCLIP	12.8	□□□□□ -0.36
RASGRF1-208	ENST00000561112	YEATS4	O95619	227 aa		12.8	□□□□□ -0.36
RASGRF1-208	ENST00000561112	MLH1	P40692	756 aa		12.8	□□□□□ -0.36
RASGRF1-208	ENST00000561112	SLC11A1	P49279	550 aa		12.8	□□□□□ -0.36
RASGRF1-208	ENST00000561112	SCNN1G	P51170	649 aa		12.8	□□□□□ -0.36
RASGRF1-208	ENST00000561112	EFNA5	P52803	228 aa		12.8	□□□□□ -0.36
RASGRF1-208	ENST00000561112	HYAL1	Q12794	435 aa		12.8	□□□□□ -0.36
RASGRF1-208	ENST00000561112	DMP1	Q13316	513 aa	Predicted RBP	12.8	□□□□□ -0.36
RASGRF1-208	ENST00000561112	COL19A1	Q14993	1142 aa		12.8	□□□□□ -0.36
RASGRF1-208	ENST00000561112	SHC4	Q6S5L8	630 aa		12.8	□□□□□ -0.36
RASGRF1-208	ENST00000561112	THNSL1	Q8IYQ7	743 aa		12.8	□□□□□ -0.36
RASGRF1-208	ENST00000561112	MRPS27	Q92552	414 aa	Known RBP	12.8	□□□□□ -0.36
RASGRF1-208	ENST00000561112	ZBTB45	Q96K62	511 aa	Predicted RBP	12.8	□□□□□ -0.36
RASGRF1-208	ENST00000561112	ACO2	Q99798	780 aa	Known RBP	12.8	□□□□□ -0.36
RASGRF1-208	ENST00000561112	MRPL9	Q9BYD2	267 aa	Known RBP	12.8	□□□□□ -0.36
RASGRF1-208	ENST00000561112	GBP3	Q9H0R5	595 aa		12.8	□□□□□ -0.36
RASGRF1-208	ENST00000561112	SNTG2	Q9NY99	539 aa		12.8	□□□□□ -0.36
RASGRF1-208	ENST00000561112	SPG21	Q9NZD8	308 aa		12.8	□□□□□ -0.36
RASGRF1-208	ENST00000561112	KLK14	Q9P0G3	267 aa		12.8	□□□□□ -0.36
RASGRF1-208	ENST00000561112	THEG	Q9P2T0	379 aa		12.8	□□□□□ -0.36
RASGRF1-208	ENST00000561112	GIT1	Q9Y2X7	761 aa		12.8	□□□□□ -0.36
RASGRF1-208	ENST00000561112	MYMK	A6NI61	221 aa		12.79	□□□□□ -0.36
RASGRF1-208	ENST00000561112	FSCN2	O14926	492 aa		12.79	□□□□□ -0.36
RASGRF1-208	ENST00000561112	N4BP3	O15049	544 aa		12.79	□□□□□ -0.36
RASGRF1-208	ENST00000561112	LINC01565	O15544	149 aa		12.79	□□□□□ -0.36
RASGRF1-208	ENST00000561112	MAPT	P10636	758 aa	Known RBP	12.79	□□□□□ -0.36
RASGRF1-208	ENST00000561112	LTBR	P36941	435 aa		12.79	□□□□□ -0.36
RASGRF1-208	ENST00000561112	ZNF131	P52739	623 aa		12.79	□□□□□ -0.36
RASGRF1-208	ENST00000561112	NCKAP1L	P55160	1127 aa		12.79	□□□□□ -0.36
RASGRF1-208	ENST00000561112	UBE3A	Q05086	875 aa		12.79	□□□□□ -0.36
RASGRF1-208	ENST00000561112	TIGD5	Q53EQ6	642 aa		12.79	□□□□□ -0.36
RASGRF1-208	ENST00000561112	ATF7IP2	Q5U623	682 aa		12.79	□□□□□ -0.36
RASGRF1-208	ENST00000561112	RRAGB	Q5VZM2	374 aa		12.79	□□□□□ -0.36
RASGRF1-208	ENST00000561112	CEP120	Q8N960	986 aa		12.79	□□□□□ -0.36
RASGRF1-208	ENST00000561112	RASSF8	Q8NHQ8	419 aa		12.79	□□□□□ -0.36
RASGRF1-208	ENST00000561112	ATXN2L	Q8WWM7	1075 aa	Known RBP	12.79	□□□□□ -0.36
RASGRF1-208	ENST00000561112	TARS2	Q9BW92	718 aa	Known RBP	12.79	□□□□□ -0.36
RASGRF1-208	ENST00000561112	VN1R3	Q9BXE9	311 aa		12.79	□□□□□ -0.36
RASGRF1-208	ENST00000561112	TRIM6	Q9C030	488 aa	Predicted RBP	12.79	□□□□□ -0.36
RASGRF1-208	ENST00000561112	HAPLN2	Q9GZV7	340 aa		12.79	□□□□□ -0.36
RASGRF1-208	ENST00000561112	UBN1	Q9NPG3	1134 aa		12.79	□□□□□ -0.36
RASGRF1-208	ENST00000561112	CCDC39	Q9UFE4	941 aa		12.79	□□□□□ -0.36

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