RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000556288.5

ATXN3-238, Transcript of ataxin 3, human

TSL 1 (best)

Gene ATXN3, Length 901 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
ATXN3-238	ENST00000556288	TTLL1	O95922	423 aa		5.44	□□□□□ -1.54
ATXN3-238	ENST00000556288	EPHX1	P07099	455 aa		5.44	□□□□□ -1.54
ATXN3-238	ENST00000556288	SYP	P08247	313 aa		5.44	□□□□□ -1.54
ATXN3-238	ENST00000556288	ITGA4	P13612	1032 aa		5.44	□□□□□ -1.54
ATXN3-238	ENST00000556288	MCC	P23508	829 aa		5.44	□□□□□ -1.54
ATXN3-238	ENST00000556288	GCLC	P48506	637 aa	Predicted RBP	5.44	□□□□□ -1.54
ATXN3-238	ENST00000556288	PCBP3	P57721	371 aa	Known RBP	5.44	□□□□□ -1.54
ATXN3-238	ENST00000556288	ZNF445	P59923	1031 aa		5.44	□□□□□ -1.54
ATXN3-238	ENST00000556288	HERVK_113	P62684	666 aa		5.44	□□□□□ -1.54
ATXN3-238	ENST00000556288	LACTB	P83111	547 aa	Predicted RBP	5.44	□□□□□ -1.54
ATXN3-238	ENST00000556288	KLRC3	Q07444	240 aa		5.44	□□□□□ -1.54
ATXN3-238	ENST00000556288	MOGS	Q13724	837 aa		5.44	□□□□□ -1.54
ATXN3-238	ENST00000556288	COG2	Q14746	738 aa		5.44	□□□□□ -1.54
ATXN3-238	ENST00000556288	NCAPH	Q15003	741 aa		5.44	□□□□□ -1.54
ATXN3-238	ENST00000556288	CCDC96	Q2M329	555 aa		5.44	□□□□□ -1.54
ATXN3-238	ENST00000556288	FAM83B	Q5T0W9	1011 aa		5.44	□□□□□ -1.54
ATXN3-238	ENST00000556288	AKNAD1	Q5T1N1	836 aa		5.44	□□□□□ -1.54
ATXN3-238	ENST00000556288	SLFN13	Q68D06	897 aa		5.44	□□□□□ -1.54
ATXN3-238	ENST00000556288	C17orf99	Q6UX52	265 aa		5.44	□□□□□ -1.54
ATXN3-238	ENST00000556288	C6orf15	Q6UXA7	325 aa	Predicted RBP	5.44	□□□□□ -1.54
ATXN3-238	ENST00000556288	RNF111	Q6ZNA4	994 aa		5.44	□□□□□ -1.54
ATXN3-238	ENST00000556288	CATSPERG	Q6ZRH7	1159 aa		5.44	□□□□□ -1.54
ATXN3-238	ENST00000556288	CHST3	Q7LGC8	479 aa		5.44	□□□□□ -1.54
ATXN3-238	ENST00000556288	CPXCR1	Q8N123	301 aa		5.44	□□□□□ -1.54
ATXN3-238	ENST00000556288	LRRC47	Q8N1G4	583 aa	Known RBP	5.44	□□□□□ -1.54
ATXN3-238	ENST00000556288	GPRC5A	Q8NFJ5	357 aa		5.44	□□□□□ -1.54
ATXN3-238	ENST00000556288	HNRNPLL	Q8WVV9	542 aa	Known RBP	5.44	□□□□□ -1.54
ATXN3-238	ENST00000556288	CEP95	Q96GE4	821 aa		5.44	□□□□□ -1.54
ATXN3-238	ENST00000556288	ABHD8	Q96I13	439 aa		5.44	□□□□□ -1.54
ATXN3-238	ENST00000556288	FGD4	Q96M96	766 aa		5.44	□□□□□ -1.54
ATXN3-238	ENST00000556288	ALPK1	Q96QP1	1244 aa		5.44	□□□□□ -1.54
ATXN3-238	ENST00000556288	FOXP3	Q9BZS1	431 aa		5.44	□□□□□ -1.54
ATXN3-238	ENST00000556288	KIAA1683	Q9H0B3	1180 aa		5.44	□□□□□ -1.54
ATXN3-238	ENST00000556288	GBP3	Q9H0R5	595 aa		5.44	□□□□□ -1.54
ATXN3-238	ENST00000556288	ADAMTS10	Q9H324	1103 aa		5.44	□□□□□ -1.54
ATXN3-238	ENST00000556288	RNF41	Q9H4P4	317 aa	Predicted RBP	5.44	□□□□□ -1.54
ATXN3-238	ENST00000556288	VAT1L	Q9HCJ6	419 aa		5.44	□□□□□ -1.54
ATXN3-238	ENST00000556288	ZCCHC17	Q9NP64	241 aa	Known RBP	5.44	□□□□□ -1.54
ATXN3-238	ENST00000556288	WHRN	Q9P202	907 aa		5.44	□□□□□ -1.54
ATXN3-238	ENST00000556288	ADGRE2	Q9UHX3	823 aa		5.44	□□□□□ -1.54
ATXN3-238	ENST00000556288	TCFL5	Q9UL49	500 aa		5.44	□□□□□ -1.54
ATXN3-238	ENST00000556288	NAP1L2	Q9ULW6	460 aa	Predicted RBP	5.44	□□□□□ -1.54
ATXN3-238	ENST00000556288	TMX2	Q9Y320	296 aa		5.44	□□□□□ -1.54
ATXN3-238	ENST00000556288	DNAJC25-GNG10	A0A024R161	153 aa		5.43	□□□□□ -1.54
ATXN3-238	ENST00000556288	ERICH2	A1L162	156 aa		5.43	□□□□□ -1.54
ATXN3-238	ENST00000556288	TMEM232	C9JQI7	657 aa		5.43	□□□□□ -1.54
ATXN3-238	ENST00000556288	CBFA2T2	O43439	604 aa		5.43	□□□□□ -1.54
ATXN3-238	ENST00000556288	DHX16	O60231	1041 aa	Known RBP	5.43	□□□□□ -1.54
ATXN3-238	ENST00000556288	ZBED4	O75132	1171 aa		5.43	□□□□□ -1.54
ATXN3-238	ENST00000556288	CDC45	O75419	566 aa		5.43	□□□□□ -1.54
ATXN3-238	ENST00000556288	VCAM1	P19320	739 aa		5.43	□□□□□ -1.54
ATXN3-238	ENST00000556288	CYP2B6	P20813	491 aa		5.43	□□□□□ -1.54
ATXN3-238	ENST00000556288	RPL10	P27635	214 aa	Known RBP	5.43	□□□□□ -1.54
ATXN3-238	ENST00000556288	HOXA7	P31268	230 aa	Predicted RBP	5.43	□□□□□ -1.54
ATXN3-238	ENST00000556288	SNAP25	P60880	206 aa		5.43	□□□□□ -1.54
ATXN3-238	ENST00000556288	CCNA1	P78396	465 aa		5.43	□□□□□ -1.54
ATXN3-238	ENST00000556288	PPP2R5D	Q14738	602 aa		5.43	□□□□□ -1.54
ATXN3-238	ENST00000556288	PKN2	Q16513	984 aa	Known RBP	5.43	□□□□□ -1.54
ATXN3-238	ENST00000556288	SLC9C1	Q4G0N8	1177 aa		5.43	□□□□□ -1.54
ATXN3-238	ENST00000556288	RALGPS1	Q5JS13	557 aa		5.43	□□□□□ -1.54
ATXN3-238	ENST00000556288	KIAA1755	Q5JYT7	1200 aa		5.43	□□□□□ -1.54
ATXN3-238	ENST00000556288	ERICH6B	Q5W0A0	696 aa		5.43	□□□□□ -1.54
ATXN3-238	ENST00000556288	CWF19L1	Q69YN2	538 aa	Known RBP	5.43	□□□□□ -1.54
ATXN3-238	ENST00000556288	KCTD1	Q719H9	257 aa		5.43	□□□□□ -1.54
ATXN3-238	ENST00000556288	OTOP1	Q7RTM1	612 aa		5.43	□□□□□ -1.54
ATXN3-238	ENST00000556288	RALYL	Q86SE5	291 aa	Known RBP	5.43	□□□□□ -1.54
ATXN3-238	ENST00000556288	IQCA1	Q86XH1	822 aa		5.43	□□□□□ -1.54
ATXN3-238	ENST00000556288	TICAM2	Q86XR7	235 aa		5.43	□□□□□ -1.54
ATXN3-238	ENST00000556288	SIAH1	Q8IUQ4	282 aa		5.43	□□□□□ -1.54
ATXN3-238	ENST00000556288	FAM178B	Q8IXR5	827 aa		5.43	□□□□□ -1.54
ATXN3-238	ENST00000556288	CKAP2L	Q8IYA6	745 aa		5.43	□□□□□ -1.54
ATXN3-238	ENST00000556288	FIBCD1	Q8N539	461 aa		5.43	□□□□□ -1.54
ATXN3-238	ENST00000556288	LRRN4CL	Q8ND94	238 aa		5.43	□□□□□ -1.54
ATXN3-238	ENST00000556288	ADCY4	Q8NFM4	1077 aa		5.43	□□□□□ -1.54
ATXN3-238	ENST00000556288	MICAL1	Q8TDZ2	1067 aa		5.43	□□□□□ -1.54
ATXN3-238	ENST00000556288	DHX38	Q92620	1227 aa	Known RBP	5.43	□□□□□ -1.54
ATXN3-238	ENST00000556288	ESR2	Q92731	530 aa		5.43	□□□□□ -1.54
ATXN3-238	ENST00000556288	CCDC120	Q96HB5	630 aa		5.43	□□□□□ -1.54
ATXN3-238	ENST00000556288	APBA2	Q99767	749 aa		5.43	□□□□□ -1.54
ATXN3-238	ENST00000556288	UBAC1	Q9BSL1	405 aa		5.43	□□□□□ -1.54
ATXN3-238	ENST00000556288	KRT23	Q9C075	422 aa		5.43	□□□□□ -1.54
ATXN3-238	ENST00000556288	KLHL25	Q9H0H3	589 aa		5.43	□□□□□ -1.54
ATXN3-238	ENST00000556288	NOL6	Q9H6R4	1146 aa	Known RBP	5.43	□□□□□ -1.54
ATXN3-238	ENST00000556288	VCPKMT	Q9H867	229 aa		5.43	□□□□□ -1.54
ATXN3-238	ENST00000556288	KAT14	Q9H8E8	782 aa		5.43	□□□□□ -1.54
ATXN3-238	ENST00000556288	ST7	Q9NRC1	585 aa		5.43	□□□□□ -1.54
ATXN3-238	ENST00000556288	FBXO28	Q9NVF7	368 aa		5.43	□□□□□ -1.54
ATXN3-238	ENST00000556288	MTMR4	Q9NYA4	1195 aa		5.43	□□□□□ -1.54
ATXN3-238	ENST00000556288	NYAP2	Q9P242	653 aa		5.43	□□□□□ -1.54
ATXN3-238	ENST00000556288	RBPJL	Q9UBG7	517 aa		5.43	□□□□□ -1.54
ATXN3-238	ENST00000556288	GABRQ	Q9UN88	632 aa		5.43	□□□□□ -1.54
ATXN3-238	ENST00000556288	PTPN22	Q9Y2R2	807 aa		5.43	□□□□□ -1.54
ATXN3-238	ENST00000556288	SLC45A1	Q9Y2W3	748 aa		5.43	□□□□□ -1.54
ATXN3-238	ENST00000556288	RBM8A	Q9Y5S9	174 aa	Known RBP	5.43	□□□□□ -1.54
ATXN3-238	ENST00000556288	FHOD1	Q9Y613	1164 aa		5.43	□□□□□ -1.54
ATXN3-238	ENST00000556288	FRMPD2	Q68DX3	1309 aa	Predicted RBP	5.43	□□□□□ -1.54
ATXN3-238	ENST00000556288	MYPN	Q86TC9	1320 aa		5.43	□□□□□ -1.54
ATXN3-238	ENST00000556288	KIAA0100	Q14667	2235 aa	Known RBP	5.43	□□□□□ -1.54
ATXN3-238	ENST00000556288	ANKRD34B	A5PLL1	514 aa		5.42	□□□□□ -1.54
ATXN3-238	ENST00000556288		B2RBV5	119 aa		5.42	□□□□□ -1.54

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