RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000552440.5

USP44-208, Transcript of ubiquitin specific peptidase 44, human

TSL 5 BASIC

Gene USP44, Length 1,818 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
USP44-208	ENST00000552440	PRIM2	P49643	509 aa		4.81	□□□□□ -1.64
USP44-208	ENST00000552440	ICA1	Q05084	483 aa		4.81	□□□□□ -1.64
USP44-208	ENST00000552440	SCRN1	Q12765	414 aa		4.81	□□□□□ -1.64
USP44-208	ENST00000552440	PPP2R5C	Q13362	524 aa		4.81	□□□□□ -1.64
USP44-208	ENST00000552440	FKBP15	Q5T1M5	1219 aa		4.81	□□□□□ -1.64
USP44-208	ENST00000552440	CCDC30	Q5VVM6	783 aa		4.81	□□□□□ -1.64
USP44-208	ENST00000552440	NEK10	Q6ZWH5	1172 aa		4.81	□□□□□ -1.64
USP44-208	ENST00000552440	PCYOX1L	Q8NBM8	494 aa		4.81	□□□□□ -1.64
USP44-208	ENST00000552440	CLRN3	Q8NCR9	226 aa		4.81	□□□□□ -1.64
USP44-208	ENST00000552440	CENPI	Q92674	756 aa	Predicted RBP	4.81	□□□□□ -1.64
USP44-208	ENST00000552440	COPS5	Q92905	334 aa		4.81	□□□□□ -1.64
USP44-208	ENST00000552440	TEPSIN	Q96N21	525 aa		4.81	□□□□□ -1.64
USP44-208	ENST00000552440	MCMBP	Q9BTE3	642 aa		4.81	□□□□□ -1.64
USP44-208	ENST00000552440	BHMT2	Q9H2M3	363 aa		4.81	□□□□□ -1.64
USP44-208	ENST00000552440	TSPY26P	Q9H489	355 aa		4.81	□□□□□ -1.64
USP44-208	ENST00000552440	BRD9	Q9H8M2	597 aa		4.81	□□□□□ -1.64
USP44-208	ENST00000552440	CERS4	Q9HA82	394 aa		4.81	□□□□□ -1.64
USP44-208	ENST00000552440	ACSL6	Q9UKU0	697 aa		4.81	□□□□□ -1.64
USP44-208	ENST00000552440	SF3B6	Q9Y3B4	125 aa	Known RBP	4.81	□□□□□ -1.64
USP44-208	ENST00000552440	NPFFR2	Q9Y5X5	522 aa		4.81	□□□□□ -1.64
USP44-208	ENST00000552440		A0A0G2JLL6	359 aa	Predicted RBP	4.81	□□□□□ -1.64
USP44-208	ENST00000552440	ZC3H11B	A0A1B0GUI2	810 aa	Predicted RBP	4.81	□□□□□ -1.64
USP44-208	ENST00000552440	RBAK-RBAKDN	I3L0D1	243 aa		4.81	□□□□□ -1.64
USP44-208	ENST00000552440	TRAF5	O00463	557 aa		4.81	□□□□□ -1.64
USP44-208	ENST00000552440	FRS3	O43559	492 aa		4.81	□□□□□ -1.64
USP44-208	ENST00000552440	GAS7	O60861	476 aa		4.81	□□□□□ -1.64
USP44-208	ENST00000552440	FKTN	O75072	461 aa		4.81	□□□□□ -1.64
USP44-208	ENST00000552440	BAG2	O95816	211 aa		4.81	□□□□□ -1.64
USP44-208	ENST00000552440	KCNA2	P16389	499 aa		4.81	□□□□□ -1.64
USP44-208	ENST00000552440	NOP2	P46087	812 aa	Known RBP	4.81	□□□□□ -1.64
USP44-208	ENST00000552440	SESN3	P58005	492 aa		4.81	□□□□□ -1.64
USP44-208	ENST00000552440	RAB3GAP1	Q15042	981 aa		4.81	□□□□□ -1.64
USP44-208	ENST00000552440	TAF12	Q16514	161 aa		4.81	□□□□□ -1.64
USP44-208	ENST00000552440	DPY19L1	Q2PZI1	675 aa		4.81	□□□□□ -1.64
USP44-208	ENST00000552440	HSF5	Q4G112	596 aa	Predicted RBP	4.81	□□□□□ -1.64
USP44-208	ENST00000552440	HLA-DQA1	Q5Y7H0	255 aa		4.81	□□□□□ -1.64
USP44-208	ENST00000552440	CWF19L1	Q69YN2	538 aa	Known RBP	4.81	□□□□□ -1.64
USP44-208	ENST00000552440	DARS2	Q6PI48	645 aa	Known RBP	4.81	□□□□□ -1.64
USP44-208	ENST00000552440	RSPO2	Q6UXX9	243 aa	Predicted RBP	4.81	□□□□□ -1.64
USP44-208	ENST00000552440	DSTYK	Q6XUX3	929 aa		4.81	□□□□□ -1.64
USP44-208	ENST00000552440	ENOSF1	Q7L5Y1	443 aa		4.81	□□□□□ -1.64
USP44-208	ENST00000552440	TMC3	Q7Z5M5	1100 aa		4.81	□□□□□ -1.64
USP44-208	ENST00000552440	MTDH	Q86UE4	582 aa	Known RBP	4.81	□□□□□ -1.64
USP44-208	ENST00000552440	PPIL6	Q8IXY8	311 aa		4.81	□□□□□ -1.64
USP44-208	ENST00000552440	KRT78	Q8N1N4	520 aa		4.81	□□□□□ -1.64
USP44-208	ENST00000552440	TEX9	Q8N6V9	391 aa		4.81	□□□□□ -1.64
USP44-208	ENST00000552440	C7orf31	Q8N865	590 aa		4.81	□□□□□ -1.64
USP44-208	ENST00000552440	IGSF22	Q8N9C0	903 aa		4.81	□□□□□ -1.64
USP44-208	ENST00000552440	LINC01356	Q8N9X3	169 aa		4.81	□□□□□ -1.64
USP44-208	ENST00000552440	ZFPM2	Q8WW38	1151 aa		4.81	□□□□□ -1.64
USP44-208	ENST00000552440	SNX21	Q969T3	373 aa		4.81	□□□□□ -1.64
USP44-208	ENST00000552440	TEKT5	Q96M29	485 aa		4.81	□□□□□ -1.64
USP44-208	ENST00000552440	ZFYVE21	Q9BQ24	234 aa		4.81	□□□□□ -1.64
USP44-208	ENST00000552440	PHF20	Q9BVI0	1012 aa		4.81	□□□□□ -1.64
USP44-208	ENST00000552440	XYLT2	Q9H1B5	865 aa		4.81	□□□□□ -1.64
USP44-208	ENST00000552440	UBN1	Q9NPG3	1134 aa		4.81	□□□□□ -1.64
USP44-208	ENST00000552440	ITM2C	Q9NQX7	267 aa		4.81	□□□□□ -1.64
USP44-208	ENST00000552440	VPS45	Q9NRW7	570 aa		4.81	□□□□□ -1.64
USP44-208	ENST00000552440	ATP8A2	Q9NTI2	1148 aa		4.81	□□□□□ -1.64
USP44-208	ENST00000552440	ZNF112	Q9UJU3	913 aa		4.81	□□□□□ -1.64
USP44-208	ENST00000552440	CNOT11	Q9UKZ1	510 aa	Known RBP	4.81	□□□□□ -1.64
USP44-208	ENST00000552440	FSD2	A1L4K1	749 aa		4.8	□□□□□ -1.64
USP44-208	ENST00000552440		H0Y8X5	98 aa		4.8	□□□□□ -1.64
USP44-208	ENST00000552440	ARNTL	O00327	626 aa		4.8	□□□□□ -1.64
USP44-208	ENST00000552440	TMEM127	O75204	238 aa		4.8	□□□□□ -1.64
USP44-208	ENST00000552440	ZNF205	O95201	554 aa		4.8	□□□□□ -1.64
USP44-208	ENST00000552440	TBX18	O95935	607 aa		4.8	□□□□□ -1.64
USP44-208	ENST00000552440	SOD2	P04179	222 aa		4.8	□□□□□ -1.64
USP44-208	ENST00000552440	THBD	P07204	575 aa		4.8	□□□□□ -1.64
USP44-208	ENST00000552440	TPM2	P07951	284 aa		4.8	□□□□□ -1.64
USP44-208	ENST00000552440	PRKCA	P17252	672 aa		4.8	□□□□□ -1.64
USP44-208	ENST00000552440	TNFSF4	P23510	183 aa		4.8	□□□□□ -1.64
USP44-208	ENST00000552440	KIF5B	P33176	963 aa		4.8	□□□□□ -1.64
USP44-208	ENST00000552440	STAT1	P42224	750 aa		4.8	□□□□□ -1.64
USP44-208	ENST00000552440	CLNS1A	P54105	237 aa	Known RBP	4.8	□□□□□ -1.64
USP44-208	ENST00000552440	ATXN1	P54253	815 aa	Known RBP	4.8	□□□□□ -1.64
USP44-208	ENST00000552440	MTA1	Q13330	715 aa		4.8	□□□□□ -1.64
USP44-208	ENST00000552440	LRRC32	Q14392	662 aa		4.8	□□□□□ -1.64
USP44-208	ENST00000552440	TESK1	Q15569	626 aa		4.8	□□□□□ -1.64
USP44-208	ENST00000552440	MEA1	Q16626	185 aa		4.8	□□□□□ -1.64
USP44-208	ENST00000552440	ANO4	Q32M45	955 aa		4.8	□□□□□ -1.64
USP44-208	ENST00000552440	HECTD3	Q5T447	861 aa		4.8	□□□□□ -1.64
USP44-208	ENST00000552440	MFSD4B	Q5TF39	518 aa		4.8	□□□□□ -1.64
USP44-208	ENST00000552440	CPLX2	Q6PUV4	134 aa	Known RBP	4.8	□□□□□ -1.64
USP44-208	ENST00000552440	RTL10	Q7L3V2	364 aa		4.8	□□□□□ -1.64
USP44-208	ENST00000552440	FRMD5	Q7Z6J6	570 aa		4.8	□□□□□ -1.64
USP44-208	ENST00000552440	TTC30A	Q86WT1	665 aa		4.8	□□□□□ -1.64
USP44-208	ENST00000552440	LDHD	Q86WU2	507 aa		4.8	□□□□□ -1.64
USP44-208	ENST00000552440	NRSN1	Q8IZ57	195 aa		4.8	□□□□□ -1.64
USP44-208	ENST00000552440	ESX1	Q8N693	406 aa		4.8	□□□□□ -1.64
USP44-208	ENST00000552440	NPLOC4	Q8TAT6	608 aa		4.8	□□□□□ -1.64
USP44-208	ENST00000552440	HPS3	Q969F9	1004 aa		4.8	□□□□□ -1.64
USP44-208	ENST00000552440	ARL8A	Q96BM9	186 aa		4.8	□□□□□ -1.64
USP44-208	ENST00000552440	ZSCAN31	Q96LW9	406 aa	Predicted RBP	4.8	□□□□□ -1.64
USP44-208	ENST00000552440	IWS1	Q96ST2	819 aa		4.8	□□□□□ -1.64
USP44-208	ENST00000552440	MAP3K14	Q99558	947 aa		4.8	□□□□□ -1.64
USP44-208	ENST00000552440	DSCC1	Q9BVC3	393 aa		4.8	□□□□□ -1.64
USP44-208	ENST00000552440	CDADC1	Q9BWV3	514 aa		4.8	□□□□□ -1.64
USP44-208	ENST00000552440	ABCG4	Q9H172	646 aa		4.8	□□□□□ -1.64
USP44-208	ENST00000552440	TMEM60	Q9H2L4	133 aa		4.8	□□□□□ -1.64

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