RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000546694.1

USP15-205, Transcript of ubiquitin specific peptidase 15, humanhuman

TSL 5

Gene USP15, Length 799 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP15-205ENST00000546694 SPTLC3Q9NUV7 552 aa6.71□□□□□ -1.34
USP15-205ENST00000546694 RGPD5Q99666 1765 aa6.71□□□□□ -1.34
USP15-205ENST00000546694 TTC21BQ7Z4L5 1316 aa6.71□□□□□ -1.34
USP15-205ENST00000546694 RAB3GAP2Q9H2M9 1393 aa6.7□□□□□ -1.34
USP15-205ENST00000546694 NSD3Q9BZ95 1437 aa6.7□□□□□ -1.34
USP15-205ENST00000546694 ZC3H11BA0A1B0GUI2 810 aaPredicted RBP6.7□□□□□ -1.34
USP15-205ENST00000546694 NEMP1O14524 444 aa6.7□□□□□ -1.34
USP15-205ENST00000546694 MAFGO15525 162 aa6.7□□□□□ -1.34
USP15-205ENST00000546694 EPHA7Q15375 998 aa6.7□□□□□ -1.34
USP15-205ENST00000546694 SKIDA1Q1XH10 827 aa6.7□□□□□ -1.34
USP15-205ENST00000546694 CATSPEREQ5SY80 951 aa6.7□□□□□ -1.34
USP15-205ENST00000546694 GPR158Q5T848 1215 aa6.7□□□□□ -1.34
USP15-205ENST00000546694 NT5DC1Q5TFE4 455 aa6.7□□□□□ -1.34
USP15-205ENST00000546694 IQSEC1Q6DN90 963 aa6.7□□□□□ -1.34
USP15-205ENST00000546694 FSTL4Q6MZW2 842 aa6.7□□□□□ -1.34
USP15-205ENST00000546694 TIGD7Q6NT04 549 aaPredicted RBP6.7□□□□□ -1.34
USP15-205ENST00000546694 DTX3Q8N9I9 347 aa6.7□□□□□ -1.34
USP15-205ENST00000546694 SLC39A2Q9NP94 309 aa6.7□□□□□ -1.34
USP15-205ENST00000546694 INCENPQ9NQS7 918 aa6.7□□□□□ -1.34
USP15-205ENST00000546694 GALNT8Q9NY28 637 aa6.7□□□□□ -1.34
USP15-205ENST00000546694 H2AFY2Q9P0M6 372 aaPredicted RBP6.7□□□□□ -1.34
USP15-205ENST00000546694 KCNG1Q9UIX4 513 aa6.7□□□□□ -1.34
USP15-205ENST00000546694 CNOT11Q9UKZ1 510 aaKnown RBP6.7□□□□□ -1.34
USP15-205ENST00000546694 EVC2Q86UK5 1308 aa6.7□□□□□ -1.34
USP15-205ENST00000546694 UBA6A0AVT1 1052 aaPredicted RBP6.69□□□□□ -1.34
USP15-205ENST00000546694 PRAMEF22A3QJZ6 481 aa6.69□□□□□ -1.34
USP15-205ENST00000546694 ALG1L2C9J202 215 aa6.69□□□□□ -1.34
USP15-205ENST00000546694 GOLGA6L22H0YM25 854 aa6.69□□□□□ -1.34
USP15-205ENST00000546694 DVL2O14641 736 aa6.69□□□□□ -1.34
USP15-205ENST00000546694 SESN3P58005 492 aa6.69□□□□□ -1.34
USP15-205ENST00000546694 AMPD3Q01432 767 aa6.69□□□□□ -1.34
USP15-205ENST00000546694 SMAD4Q13485 552 aaKnown RBP6.69□□□□□ -1.34
USP15-205ENST00000546694 LRRC32Q14392 662 aa6.69□□□□□ -1.34
USP15-205ENST00000546694 STAT4Q14765 748 aa6.69□□□□□ -1.34
USP15-205ENST00000546694 TTC38Q5R3I4 469 aa6.69□□□□□ -1.34
USP15-205ENST00000546694 PRAMEF18Q5VWM3 479 aa6.69□□□□□ -1.34
USP15-205ENST00000546694 CREB3L3Q68CJ9 461 aa6.69□□□□□ -1.34
USP15-205ENST00000546694 STK32CQ86UX6 486 aa6.69□□□□□ -1.34
USP15-205ENST00000546694 PROSER1Q86XN7 944 aa6.69□□□□□ -1.34
USP15-205ENST00000546694 DDX42Q86XP3 938 aaKnown RBP eCLIP6.69□□□□□ -1.34
USP15-205ENST00000546694 SPATS2Q86XZ4 545 aaKnown RBP6.69□□□□□ -1.34
USP15-205ENST00000546694 C7orf31Q8N865 590 aa6.69□□□□□ -1.34
USP15-205ENST00000546694 SLC5A5Q92911 643 aa6.69□□□□□ -1.34
USP15-205ENST00000546694 UCKL1Q9NWZ5 548 aa6.69□□□□□ -1.34
USP15-205ENST00000546694 TFCP2L1Q9NZI6 479 aa6.69□□□□□ -1.34
USP15-205ENST00000546694 NTMQ9P121 344 aa6.69□□□□□ -1.34
USP15-205ENST00000546694 USP36Q9P275 1121 aaKnown RBP6.69□□□□□ -1.34
USP15-205ENST00000546694 CROTQ9UKG9 612 aa6.69□□□□□ -1.34
USP15-205ENST00000546694 DUSP10Q9Y6W6 482 aa6.69□□□□□ -1.34
USP15-205ENST00000546694 DOT1LQ8TEK3 1739 aa6.69□□□□□ -1.34
USP15-205ENST00000546694 NSD2O96028 1365 aa6.69□□□□□ -1.34
USP15-205ENST00000546694 LTN1O94822 1766 aa6.68□□□□□ -1.34
USP15-205ENST00000546694 NOBOXO60393 691 aa6.68□□□□□ -1.34
USP15-205ENST00000546694 EYA4O95677 639 aa6.68□□□□□ -1.34
USP15-205ENST00000546694 CHGBP05060 677 aa6.68□□□□□ -1.34
USP15-205ENST00000546694 CDK11BP21127 795 aaKnown RBP6.68□□□□□ -1.34
USP15-205ENST00000546694 PHC1P78364 1004 aa6.68□□□□□ -1.34
USP15-205ENST00000546694 TMPRSS15P98073 1019 aa6.68□□□□□ -1.34
USP15-205ENST00000546694 ROM1Q03395 351 aa6.68□□□□□ -1.34
USP15-205ENST00000546694 ADAM9Q13443 819 aa6.68□□□□□ -1.34
USP15-205ENST00000546694 ZXDCQ2QGD7 858 aaPredicted RBP6.68□□□□□ -1.34
USP15-205ENST00000546694 HDGFL2Q7Z4V5 671 aaPredicted RBP6.68□□□□□ -1.34
USP15-205ENST00000546694 FERMT3Q86UX7 667 aa6.68□□□□□ -1.34
USP15-205ENST00000546694 PHYKPLQ8IUZ5 450 aa6.68□□□□□ -1.34
USP15-205ENST00000546694 ZNF610Q8N9Z0 462 aa6.68□□□□□ -1.34
USP15-205ENST00000546694 NOX5Q96PH1 765 aa6.68□□□□□ -1.34
USP15-205ENST00000546694 TUBGCP5Q96RT8 1024 aa6.68□□□□□ -1.34
USP15-205ENST00000546694 BTBD7Q9P203 1132 aa6.68□□□□□ -1.34
USP15-205ENST00000546694 NOC2LQ9Y3T9 749 aaKnown RBP6.68□□□□□ -1.34
USP15-205ENST00000546694 C5P01031 1676 aa6.68□□□□□ -1.34
USP15-205ENST00000546694 C10orf71Q711Q0 1435 aa6.67□□□□□ -1.34
USP15-205ENST00000546694 GOLGB1Q14789 3259 aaKnown RBP6.67□□□□□ -1.34
USP15-205ENST00000546694 GPR39O43194 453 aa6.67□□□□□ -1.34
USP15-205ENST00000546694 PTX3P26022 381 aaPredicted RBP6.67□□□□□ -1.34
USP15-205ENST00000546694 THBS2P35442 1172 aa6.67□□□□□ -1.34
USP15-205ENST00000546694 ECE1P42892 770 aa6.67□□□□□ -1.34
USP15-205ENST00000546694 GLRBP48167 497 aa6.67□□□□□ -1.34
USP15-205ENST00000546694 SMAD3P84022 425 aaKnown RBP6.67□□□□□ -1.34
USP15-205ENST00000546694 SMAD2Q15796 467 aaKnown RBP6.67□□□□□ -1.34
USP15-205ENST00000546694 FRMD7Q6ZUT3 714 aa6.67□□□□□ -1.34
USP15-205ENST00000546694 CXXC5Q7LFL8 322 aaKnown RBP6.67□□□□□ -1.34
USP15-205ENST00000546694 NECAB2Q7Z6G3 386 aa6.67□□□□□ -1.34
USP15-205ENST00000546694 C16orf92Q96LL3 132 aa6.67□□□□□ -1.34
USP15-205ENST00000546694 ZSWIM3Q96MP5 696 aa6.67□□□□□ -1.34
USP15-205ENST00000546694 FOXB1Q99853 325 aa6.67□□□□□ -1.34
USP15-205ENST00000546694 BTBD2Q9BX70 525 aa6.67□□□□□ -1.34
USP15-205ENST00000546694 SPATA6Q9NWH7 488 aaPredicted RBP6.67□□□□□ -1.34
USP15-205ENST00000546694 RBPJLQ9UBG7 517 aa6.67□□□□□ -1.34
USP15-205ENST00000546694 ZFP69BQ9UJL9 534 aa6.67□□□□□ -1.34
USP15-205ENST00000546694 KTN1Q86UP2 1357 aaKnown RBP6.67□□□□□ -1.34
USP15-205ENST00000546694 RASSF10A6NK89 507 aa6.66□□□□□ -1.34
USP15-205ENST00000546694 TGM5O43548 720 aa6.66□□□□□ -1.34
USP15-205ENST00000546694 TOMM70O94826 608 aa6.66□□□□□ -1.34
USP15-205ENST00000546694 ID4P47928 161 aa6.66□□□□□ -1.34
USP15-205ENST00000546694 ALDH6A1Q02252 535 aaKnown RBP6.66□□□□□ -1.34
USP15-205ENST00000546694 TERF2Q15554 542 aa6.66□□□□□ -1.34
USP15-205ENST00000546694 BROXQ5VW32 411 aa6.66□□□□□ -1.34
USP15-205ENST00000546694 RASSF3Q86WH2 238 aa6.66□□□□□ -1.34
USP15-205ENST00000546694 ANKRD13AQ8IZ07 590 aa6.66□□□□□ -1.34
USP15-205ENST00000546694 CARFQ8N187 725 aa6.66□□□□□ -1.34
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 45.9 ms