RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000546248.5

TRDN-205, Transcript of triadin, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene TRDN, Length 1,179 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRDN-205ENST00000546248 KRTAP3-1Q9BYR8 98 aa6.41□□□□□ -1.38
TRDN-205ENST00000546248 PDRG1Q9NUG6 133 aa6.41□□□□□ -1.38
TRDN-205ENST00000546248 TMEM260Q9NX78 707 aa6.41□□□□□ -1.38
TRDN-205ENST00000546248 SMPD4Q9NXE4 827 aa6.41□□□□□ -1.38
TRDN-205ENST00000546248 MARCH2Q9P0N8 246 aa6.41□□□□□ -1.38
TRDN-205ENST00000546248 NIP7Q9Y221 180 aaKnown RBP eCLIP6.41□□□□□ -1.38
TRDN-205ENST00000546248 PLCH1Q4KWH8 1693 aa6.41□□□□□ -1.38
TRDN-205ENST00000546248 SH3TC1Q8TE82 1336 aa6.41□□□□□ -1.38
TRDN-205ENST00000546248 NRAPQ86VF7 1730 aa6.41□□□□□ -1.38
TRDN-205ENST00000546248 ZNF609O15014 1411 aa6.41□□□□□ -1.38
TRDN-205ENST00000546248 LARGE1O95461 756 aa6.4□□□□□ -1.38
TRDN-205ENST00000546248 CASTP20810 708 aaKnown RBP6.4□□□□□ -1.38
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TRDN-205ENST00000546248 ST3GAL1Q11201 340 aa6.4□□□□□ -1.38
TRDN-205ENST00000546248 SF3B3Q15393 1217 aaKnown RBP6.4□□□□□ -1.38
TRDN-205ENST00000546248 INF2Q27J81 1249 aa6.4□□□□□ -1.38
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TRDN-205ENST00000546248 STK32CQ86UX6 486 aa6.4□□□□□ -1.38
TRDN-205ENST00000546248 HOMER1Q86YM7 354 aa6.4□□□□□ -1.38
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TRDN-205ENST00000546248 CNNM1Q9NRU3 951 aa6.4□□□□□ -1.38
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TRDN-205ENST00000546248 MRPS23Q9Y3D9 190 aaKnown RBP6.4□□□□□ -1.38
TRDN-205ENST00000546248 ARFGEF2Q9Y6D5 1785 aa6.39□□□□□ -1.39
TRDN-205ENST00000546248 M0R2C6 588 aa6.39□□□□□ -1.39
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TRDN-205ENST00000546248 PPP1R12AO14974 1030 aaPredicted RBP6.39□□□□□ -1.39
TRDN-205ENST00000546248 CYP21A2P08686 494 aa6.39□□□□□ -1.39
TRDN-205ENST00000546248 ZKSCAN1P17029 563 aaPredicted RBP6.39□□□□□ -1.39
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TRDN-205ENST00000546248 MAP4K2Q12851 820 aa6.39□□□□□ -1.39
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TRDN-205ENST00000546248 ME3Q16798 604 aa6.39□□□□□ -1.39
TRDN-205ENST00000546248 TBC1D10BQ4KMP7 808 aaPredicted RBP6.39□□□□□ -1.39
TRDN-205ENST00000546248 SLC35F1Q5T1Q4 408 aa6.39□□□□□ -1.39
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TRDN-205ENST00000546248 ETV3LQ6ZN32 361 aa6.39□□□□□ -1.39
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TRDN-205ENST00000546248 MROH5Q6ZUA9 1318 aa6.39□□□□□ -1.39
TRDN-205ENST00000546248 RPAP1Q9BWH6 1393 aaPredicted RBP6.39□□□□□ -1.39
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TRDN-205ENST00000546248 NUP188Q5SRE5 1749 aa6.39□□□□□ -1.39
TRDN-205ENST00000546248 A0A0G2JLW4 131 aa6.38□□□□□ -1.39
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TRDN-205ENST00000546248 ASMTLO95671 621 aa6.38□□□□□ -1.39
TRDN-205ENST00000546248 HSPD1P10809 573 aaKnown RBP6.38□□□□□ -1.39
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TRDN-205ENST00000546248 NTRK3Q16288 839 aa6.38□□□□□ -1.39
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TRDN-205ENST00000546248 MAST3O60307 1309 aa6.38□□□□□ -1.39
TRDN-205ENST00000546248 RTL9Q8NET4 1388 aa6.38□□□□□ -1.39
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TRDN-205ENST00000546248 ATRNO75882 1429 aa6.37□□□□□ -1.39
TRDN-205ENST00000546248 ABCC12Q96J65 1359 aa6.37□□□□□ -1.39
TRDN-205ENST00000546248 CCDC163A0A0D9SF12 145 aa6.37□□□□□ -1.39
TRDN-205ENST00000546248 C22orf46C9J442 243 aa6.37□□□□□ -1.39
TRDN-205ENST00000546248 ENPP3O14638 875 aa6.37□□□□□ -1.39
TRDN-205ENST00000546248 MEFVO15553 781 aaPredicted RBP6.37□□□□□ -1.39
TRDN-205ENST00000546248 DTNBO60941 627 aa6.37□□□□□ -1.39
TRDN-205ENST00000546248 PLATP00750 562 aa6.37□□□□□ -1.39
TRDN-205ENST00000546248 ZFYP08048 801 aaPredicted RBP6.37□□□□□ -1.39
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