RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000545346.1

QKI-216, Transcript of QKI, KH domain containing RNA binding, human

TSL 5

Gene QKI, Length 457 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
QKI-216	ENST00000545346	SMAD5	Q99717	465 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
QKI-216	ENST00000545346	EPB41L4B	Q9H329	900 aa		4.89	□□□□□ -1.63
QKI-216	ENST00000545346	POFUT1	Q9H488	388 aa		4.89	□□□□□ -1.63
QKI-216	ENST00000545346	METTL14	Q9HCE5	456 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
QKI-216	ENST00000545346	DCP1A	Q9NPI6	582 aa	Predicted RBP	4.89	□□□□□ -1.63
QKI-216	ENST00000545346	PPP2R3B	Q9Y5P8	575 aa		4.89	□□□□□ -1.63
QKI-216	ENST00000545346	SOS1	Q07889	1333 aa	Predicted RBP	4.89	□□□□□ -1.63
QKI-216	ENST00000545346	SPATA31A5	Q5VU36	1347 aa		4.89	□□□□□ -1.63
QKI-216	ENST00000545346	SPATA31A7	Q8IWB4	1347 aa		4.89	□□□□□ -1.63
QKI-216	ENST00000545346	CIC	Q96RK0	1608 aa	Predicted RBP	4.89	□□□□□ -1.63
QKI-216	ENST00000545346	MAP3K5	Q99683	1374 aa		4.89	□□□□□ -1.63
QKI-216	ENST00000545346	ATRN	O75882	1429 aa		4.89	□□□□□ -1.63
QKI-216	ENST00000545346	TNS2	Q63HR2	1409 aa		4.89	□□□□□ -1.63
QKI-216	ENST00000545346	SIPA1L3	O60292	1781 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
QKI-216	ENST00000545346	VIRMA	Q69YN4	1812 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
QKI-216	ENST00000545346	MEGF6	O75095	1541 aa		4.88	□□□□□ -1.63
QKI-216	ENST00000545346	CACNA1F	O60840	1977 aa		4.88	□□□□□ -1.63
QKI-216	ENST00000545346	N4BP3	O15049	544 aa		4.88	□□□□□ -1.63
QKI-216	ENST00000545346	AKAP10	O43572	662 aa		4.88	□□□□□ -1.63
QKI-216	ENST00000545346	HSP90AB1	P08238	724 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
QKI-216	ENST00000545346	ENO2	P09104	434 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
QKI-216	ENST00000545346	CT47B1	P0C2W7	299 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
QKI-216	ENST00000545346	RBP3	P10745	1247 aa		4.88	□□□□□ -1.63
QKI-216	ENST00000545346	SCAND1	P57086	179 aa		4.88	□□□□□ -1.63
QKI-216	ENST00000545346	NKX3-2	P78367	333 aa		4.88	□□□□□ -1.63
QKI-216	ENST00000545346	LRRC41	Q15345	812 aa		4.88	□□□□□ -1.63
QKI-216	ENST00000545346	STIL	Q15468	1287 aa		4.88	□□□□□ -1.63
QKI-216	ENST00000545346	SKIDA1	Q1XH10	827 aa		4.88	□□□□□ -1.63
QKI-216	ENST00000545346	PLEKHO1	Q53GL0	409 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
QKI-216	ENST00000545346	PHF19	Q5T6S3	580 aa		4.88	□□□□□ -1.63
QKI-216	ENST00000545346	SULT6B1	Q6IMI4	303 aa		4.88	□□□□□ -1.63
QKI-216	ENST00000545346	STK32C	Q86UX6	486 aa		4.88	□□□□□ -1.63
QKI-216	ENST00000545346	UNC5CL	Q8IV45	518 aa		4.88	□□□□□ -1.63
QKI-216	ENST00000545346	LINC00482	Q8N8I6	264 aa		4.88	□□□□□ -1.63
QKI-216	ENST00000545346	IGDCC4	Q8TDY8	1250 aa		4.88	□□□□□ -1.63
QKI-216	ENST00000545346	JDP2	Q8WYK2	163 aa		4.88	□□□□□ -1.63
QKI-216	ENST00000545346	RAPGEF4	Q8WZA2	1011 aa		4.88	□□□□□ -1.63
QKI-216	ENST00000545346	ERCC4	Q92889	916 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
QKI-216	ENST00000545346	FUBP3	Q96I24	572 aa	Known RBP eCLIP	4.88	□□□□□ -1.63
QKI-216	ENST00000545346	FAXDC2	Q96IV6	333 aa		4.88	□□□□□ -1.63
QKI-216	ENST00000545346	FOXB1	Q99853	325 aa		4.88	□□□□□ -1.63
QKI-216	ENST00000545346	MYL10	Q9BUA6	226 aa		4.88	□□□□□ -1.63
QKI-216	ENST00000545346	RTFDC1	Q9BY42	306 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
QKI-216	ENST00000545346	INCENP	Q9NQS7	918 aa		4.88	□□□□□ -1.63
QKI-216	ENST00000545346	SIRT5	Q9NXA8	310 aa		4.88	□□□□□ -1.63
QKI-216	ENST00000545346	GALNT8	Q9NY28	637 aa		4.88	□□□□□ -1.63
QKI-216	ENST00000545346	FAM53C	Q9NYF3	392 aa		4.88	□□□□□ -1.63
QKI-216	ENST00000545346	USP36	Q9P275	1121 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
QKI-216	ENST00000545346	NOC2L	Q9Y3T9	749 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
QKI-216	ENST00000545346	SPATA31A1	Q5TZJ5	1347 aa		4.88	□□□□□ -1.63
QKI-216	ENST00000545346	ZNF831	Q5JPB2	1677 aa		4.87	□□□□□ -1.63
QKI-216	ENST00000545346	UBA6	A0AVT1	1052 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
QKI-216	ENST00000545346	PRSS38	A1L453	326 aa		4.87	□□□□□ -1.63
QKI-216	ENST00000545346	LRRC10B	A6NIK2	292 aa		4.87	□□□□□ -1.63
QKI-216	ENST00000545346	GOLGA8A	A7E2F4	631 aa		4.87	□□□□□ -1.63
QKI-216	ENST00000545346	GOLGA8B	A8MQT2	603 aa		4.87	□□□□□ -1.63
QKI-216	ENST00000545346	APAF1	O14727	1248 aa		4.87	□□□□□ -1.63
QKI-216	ENST00000545346	PRPF6	O94906	941 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
QKI-216	ENST00000545346	ABLIM3	O94929	683 aa		4.87	□□□□□ -1.63
QKI-216	ENST00000545346	MT-CO1	P00395	513 aa		4.87	□□□□□ -1.63
QKI-216	ENST00000545346	PLA2G1B	P04054	148 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
QKI-216	ENST00000545346	CLEC2L	P0C7M8	214 aa		4.87	□□□□□ -1.63
QKI-216	ENST00000545346	COL6A1	P12109	1028 aa		4.87	□□□□□ -1.63
QKI-216	ENST00000545346	IL2RB	P14784	551 aa		4.87	□□□□□ -1.63
QKI-216	ENST00000545346	HTRA3	P83110	453 aa		4.87	□□□□□ -1.63
QKI-216	ENST00000545346	FOXO4	P98177	505 aa		4.87	□□□□□ -1.63
QKI-216	ENST00000545346	SLC6A3	Q01959	620 aa		4.87	□□□□□ -1.63
QKI-216	ENST00000545346	DLX2	Q07687	328 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
QKI-216	ENST00000545346	ADCY1	Q08828	1119 aa		4.87	□□□□□ -1.63
QKI-216	ENST00000545346	FSCN1	Q16658	493 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
QKI-216	ENST00000545346	CT83	Q5H943	113 aa		4.87	□□□□□ -1.63
QKI-216	ENST00000545346	PITRM1	Q5JRX3	1037 aa		4.87	□□□□□ -1.63
QKI-216	ENST00000545346	PRR31	Q5SQ13	230 aa		4.87	□□□□□ -1.63
QKI-216	ENST00000545346	KANK2	Q63ZY3	851 aa		4.87	□□□□□ -1.63
QKI-216	ENST00000545346	OLFML2B	Q68BL8	750 aa		4.87	□□□□□ -1.63
QKI-216	ENST00000545346	KCNK18	Q7Z418	384 aa		4.87	□□□□□ -1.63
QKI-216	ENST00000545346	PHYKPL	Q8IUZ5	450 aa		4.87	□□□□□ -1.63
QKI-216	ENST00000545346	TRMT2A	Q8IZ69	625 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
QKI-216	ENST00000545346	BCL6B	Q8N143	479 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
QKI-216	ENST00000545346	HOOK2	Q96ED9	719 aa		4.87	□□□□□ -1.63
QKI-216	ENST00000545346	C11orf84	Q9BUA3	381 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
QKI-216	ENST00000545346	CHMP4A	Q9BY43	222 aa		4.87	□□□□□ -1.63
QKI-216	ENST00000545346	SLC13A1	Q9BZW2	595 aa		4.87	□□□□□ -1.63
QKI-216	ENST00000545346	DLL4	Q9NR61	685 aa		4.87	□□□□□ -1.63
QKI-216	ENST00000545346	KCND1	Q9NSA2	647 aa		4.87	□□□□□ -1.63
QKI-216	ENST00000545346	SPEF1	Q9Y4P9	236 aa		4.87	□□□□□ -1.63
QKI-216	ENST00000545346	PCDH11X	Q9BZA7	1347 aa		4.87	□□□□□ -1.63
QKI-216	ENST00000545346	PCDH11Y	Q9BZA8	1340 aa		4.87	□□□□□ -1.63
QKI-216	ENST00000545346	GLI3	P10071	1580 aa		4.87	□□□□□ -1.63
QKI-216	ENST00000545346	PAPPA	Q13219	1627 aa		4.86	□□□□□ -1.63
QKI-216	ENST00000545346	KDM3B	Q7LBC6	1761 aa		4.86	□□□□□ -1.63
QKI-216	ENST00000545346	SHTN1	A0MZ66	631 aa		4.86	□□□□□ -1.63
QKI-216	ENST00000545346	MARCH6	O60337	910 aa		4.86	□□□□□ -1.63
QKI-216	ENST00000545346	SEMA7A	O75326	666 aa		4.86	□□□□□ -1.63
QKI-216	ENST00000545346	CENPB	P07199	599 aa	Predicted RBP	4.86	□□□□□ -1.63
QKI-216	ENST00000545346	CELA3B	P08861	270 aa		4.86	□□□□□ -1.63
QKI-216	ENST00000545346	HMOX1	P09601	288 aa		4.86	□□□□□ -1.63
QKI-216	ENST00000545346	ZNF853	P0CG23	659 aa		4.86	□□□□□ -1.63
QKI-216	ENST00000545346	MYBL2	P10244	700 aa		4.86	□□□□□ -1.63
QKI-216	ENST00000545346	CYP2C8	P10632	490 aa		4.86	□□□□□ -1.63

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