RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000540109.5

PTPRD-214, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type D, humanhuman

APPRIS P1 TSL 5 BASIC

Gene PTPRD, Length 6,210 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRD-214ENST00000540109 AGBL2Q5U5Z8 902 aa6.46□□□□□ -1.37
PTPRD-214ENST00000540109 ZNF662Q6ZS27 426 aa6.46□□□□□ -1.37
PTPRD-214ENST00000540109 FRA10AC1Q70Z53 315 aa6.46□□□□□ -1.37
PTPRD-214ENST00000540109 MAEAQ7L5Y9 396 aa6.46□□□□□ -1.37
PTPRD-214ENST00000540109 P2RX5Q93086 422 aa6.46□□□□□ -1.37
PTPRD-214ENST00000540109 MTMR9Q96QG7 549 aa6.46□□□□□ -1.37
PTPRD-214ENST00000540109 CNPY3Q9BT09 278 aa6.46□□□□□ -1.37
PTPRD-214ENST00000540109 PSTPIP2Q9H939 334 aa6.46□□□□□ -1.37
PTPRD-214ENST00000540109 ETNK1Q9HBU6 452 aa6.46□□□□□ -1.37
PTPRD-214ENST00000540109 JAG2Q9Y219 1238 aa6.46□□□□□ -1.37
PTPRD-214ENST00000540109 ITM2BQ9Y287 266 aa6.46□□□□□ -1.37
PTPRD-214ENST00000540109 WTIPA6NIX2 430 aaPredicted RBP6.46□□□□□ -1.37
PTPRD-214ENST00000540109 LGALS16A8MUM7 142 aa6.46□□□□□ -1.37
PTPRD-214ENST00000540109 MFAP3LO75121 409 aa6.46□□□□□ -1.37
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PTPRD-214ENST00000540109 SLC1A4P43007 532 aa6.46□□□□□ -1.37
PTPRD-214ENST00000540109 TNNI2P48788 182 aa6.46□□□□□ -1.37
PTPRD-214ENST00000540109 MRPS15P82914 257 aaKnown RBP6.46□□□□□ -1.37
PTPRD-214ENST00000540109 ZNF827Q17R98 1081 aa6.46□□□□□ -1.37
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PTPRD-214ENST00000540109 GRIN1Q05586 938 aa6.46□□□□□ -1.38
PTPRD-214ENST00000540109 TBC1D8BQ0IIM8 1120 aa6.46□□□□□ -1.38
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PTPRD-214ENST00000540109 HIPK4Q8NE63 616 aa6.46□□□□□ -1.38
PTPRD-214ENST00000540109 AGBL3Q8NEM8 1001 aa6.46□□□□□ -1.38
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PTPRD-214ENST00000540109 FMR1Q06787 632 aaKnown RBP eCLIP6.46□□□□□ -1.38
PTPRD-214ENST00000540109 SLC15A2Q16348 729 aa6.46□□□□□ -1.38
PTPRD-214ENST00000540109 WDR93Q6P2C0 686 aa6.46□□□□□ -1.38
PTPRD-214ENST00000540109 PIAS4Q8N2W9 510 aaPredicted RBP6.46□□□□□ -1.38
PTPRD-214ENST00000540109 CHURC1Q8WUH1 139 aa6.46□□□□□ -1.38
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PTPRD-214ENST00000540109 DTX3LQ8TDB6 740 aa6.46□□□□□ -1.38
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PTPRD-214ENST00000540109 XPO1O14980 1071 aaKnown RBP6.45□□□□□ -1.38
PTPRD-214ENST00000540109 PPP1R37O75864 691 aa6.45□□□□□ -1.38
PTPRD-214ENST00000540109 FSBPO95073 299 aa6.45□□□□□ -1.38
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PTPRD-214ENST00000540109 TBCCQ15814 346 aa6.45□□□□□ -1.38
PTPRD-214ENST00000540109 GRIK5Q16478 980 aa6.45□□□□□ -1.38
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PTPRD-214ENST00000540109 PLCG1P19174 1290 aa6.45□□□□□ -1.38
PTPRD-214ENST00000540109 ATP4AP20648 1035 aa6.45□□□□□ -1.38
PTPRD-214ENST00000540109 C4BPBP20851 252 aa6.45□□□□□ -1.38
PTPRD-214ENST00000540109 PDE4DQ08499 809 aa6.45□□□□□ -1.38
PTPRD-214ENST00000540109 ITGB3BPQ13352 177 aaPredicted RBP6.45□□□□□ -1.38
PTPRD-214ENST00000540109 TUBA3CQ13748 450 aa6.45□□□□□ -1.38
PTPRD-214ENST00000540109 E4F1Q66K89 784 aaPredicted RBP6.45□□□□□ -1.38
PTPRD-214ENST00000540109 FAM83AQ86UY5 434 aa6.45□□□□□ -1.38
PTPRD-214ENST00000540109 ATP11CQ8NB49 1132 aa6.45□□□□□ -1.38
PTPRD-214ENST00000540109 FAM151AQ8WW52 585 aa6.45□□□□□ -1.38
PTPRD-214ENST00000540109 OMA1Q96E52 524 aa6.45□□□□□ -1.38
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