RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000540101.2

C16orf62-211, Transcript of UPF0505 protein C16orf62, humanhuman

TSL 3

Gene C16orf62, Length 461 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C16orf62-211ENST00000540101 PRMT7Q9NVM4 692 aaPredicted RBP8.59□□□□□ -1.03
C16orf62-211ENST00000540101 RWDD2AQ9UIY3 292 aa8.59□□□□□ -1.03
C16orf62-211ENST00000540101 NOD1Q9Y239 953 aa8.59□□□□□ -1.03
C16orf62-211ENST00000540101 USP20Q9Y2K6 914 aa8.59□□□□□ -1.03
C16orf62-211ENST00000540101 NOC2LQ9Y3T9 749 aaKnown RBP8.59□□□□□ -1.03
C16orf62-211ENST00000540101 SQORQ9Y6N5 450 aa8.59□□□□□ -1.03
C16orf62-211ENST00000540101 A0A0B4J269 797 aa8.58□□□□□ -1.04
C16orf62-211ENST00000540101 A0A1B0GUA9 196 aa8.58□□□□□ -1.04
C16orf62-211ENST00000540101 DCDC2CA8MYV0 355 aa8.58□□□□□ -1.04
C16orf62-211ENST00000540101 ANKRD63C9JTQ0 380 aa8.58□□□□□ -1.04
C16orf62-211ENST00000540101 INO80B-WBP1J3KQ70 363 aa8.58□□□□□ -1.04
C16orf62-211ENST00000540101 K7ERI5 159 aa8.58□□□□□ -1.04
C16orf62-211ENST00000540101 KIAA0355O15063 1070 aa8.58□□□□□ -1.04
C16orf62-211ENST00000540101 TLR3O15455 904 aaKnown RBP8.58□□□□□ -1.04
C16orf62-211ENST00000540101 NBNO60934 754 aa8.58□□□□□ -1.04
C16orf62-211ENST00000540101 KIF20AO95235 890 aa8.58□□□□□ -1.04
C16orf62-211ENST00000540101 PRKCBP05771 671 aa8.58□□□□□ -1.04
C16orf62-211ENST00000540101 CLTBP09497 229 aa8.58□□□□□ -1.04
C16orf62-211ENST00000540101 ARF4P18085 180 aaPredicted RBP8.58□□□□□ -1.04
C16orf62-211ENST00000540101 ZNF165P49910 485 aa8.58□□□□□ -1.04
C16orf62-211ENST00000540101 MCCD1P59942 119 aaPredicted RBP8.58□□□□□ -1.04
C16orf62-211ENST00000540101 SNRPFP62306 86 aaKnown RBP8.58□□□□□ -1.04
C16orf62-211ENST00000540101 LRRC63Q05C16 580 aa8.58□□□□□ -1.04
C16orf62-211ENST00000540101 MAPK6Q16659 721 aa8.58□□□□□ -1.04
C16orf62-211ENST00000540101 ZNF697Q5TEC3 545 aa8.58□□□□□ -1.04
C16orf62-211ENST00000540101 CDKAL1Q5VV42 579 aa8.58□□□□□ -1.04
C16orf62-211ENST00000540101 EEF1DP3Q658K8 133 aa8.58□□□□□ -1.04
C16orf62-211ENST00000540101 ANKRD40Q6AI12 368 aa8.58□□□□□ -1.04
C16orf62-211ENST00000540101 TSHZ1Q6ZSZ6 1077 aa8.58□□□□□ -1.04
C16orf62-211ENST00000540101 STXBP4Q6ZWJ1 553 aa8.58□□□□□ -1.04
C16orf62-211ENST00000540101 LRRC8DQ7L1W4 858 aa8.58□□□□□ -1.04
C16orf62-211ENST00000540101 IRF2BP1Q8IU81 584 aa8.58□□□□□ -1.04
C16orf62-211ENST00000540101 SLC9A9Q8IVB4 645 aa8.58□□□□□ -1.04
C16orf62-211ENST00000540101 ZBTB8OSQ8IWT0 167 aa8.58□□□□□ -1.04
C16orf62-211ENST00000540101 NELFCDQ8IXH7 590 aa8.58□□□□□ -1.04
C16orf62-211ENST00000540101 ENOX1Q8TC92 643 aaKnown RBP8.58□□□□□ -1.04
C16orf62-211ENST00000540101 FAM200AQ8TCP9 573 aa8.58□□□□□ -1.04
C16orf62-211ENST00000540101 ACCSQ96QU6 501 aa8.58□□□□□ -1.04
C16orf62-211ENST00000540101 ACO2Q99798 780 aaKnown RBP8.58□□□□□ -1.04
C16orf62-211ENST00000540101 CBWD1Q9BRT8 395 aa8.58□□□□□ -1.04
C16orf62-211ENST00000540101 TARS2Q9BW92 718 aaKnown RBP8.58□□□□□ -1.04
C16orf62-211ENST00000540101 INO80BQ9C086 356 aaPredicted RBP8.58□□□□□ -1.04
C16orf62-211ENST00000540101 GBP3Q9H0R5 595 aa8.58□□□□□ -1.04
C16orf62-211ENST00000540101 TSPY26PQ9H489 355 aa8.58□□□□□ -1.04
C16orf62-211ENST00000540101 PDZD7Q9H5P4 517 aa8.58□□□□□ -1.04
C16orf62-211ENST00000540101 ERVK-5Q9HDB9 667 aa8.58□□□□□ -1.04
C16orf62-211ENST00000540101 AGPAT5Q9NUQ2 364 aa8.58□□□□□ -1.04
C16orf62-211ENST00000540101 DMAC2Q9NW81 257 aa8.58□□□□□ -1.04
C16orf62-211ENST00000540101 CTNND2Q9UQB3 1225 aa8.58□□□□□ -1.04
C16orf62-211ENST00000540101 TNFSF13BQ9Y275 285 aa8.58□□□□□ -1.04
C16orf62-211ENST00000540101 PRUNE2Q8WUY3 3088 aa8.57□□□□□ -1.04
C16orf62-211ENST00000540101 WDR81Q562E7 1941 aa8.57□□□□□ -1.04
C16orf62-211ENST00000540101 LOXHD1Q8IVV2 1947 aa8.57□□□□□ -1.04
C16orf62-211ENST00000540101 IKBKBO14920 756 aa8.57□□□□□ -1.04
C16orf62-211ENST00000540101 HNRNPDLO14979 420 aaKnown RBP8.57□□□□□ -1.04
C16orf62-211ENST00000540101 MEFVO15553 781 aaPredicted RBP8.57□□□□□ -1.04
C16orf62-211ENST00000540101 TOM1L1O75674 476 aa8.57□□□□□ -1.04
C16orf62-211ENST00000540101 CXCL10P02778 98 aa8.57□□□□□ -1.04
C16orf62-211ENST00000540101 NR3C1P04150 777 aa8.57□□□□□ -1.04
C16orf62-211ENST00000540101 GHRP10912 638 aa8.57□□□□□ -1.04
C16orf62-211ENST00000540101 RAG1P15918 1043 aa8.57□□□□□ -1.04
C16orf62-211ENST00000540101 ZNF18P17022 549 aa8.57□□□□□ -1.04
C16orf62-211ENST00000540101 FGFR4P22455 802 aa8.57□□□□□ -1.04
C16orf62-211ENST00000540101 SFPQP23246 707 aaKnown RBP eCLIP8.57□□□□□ -1.04
C16orf62-211ENST00000540101 MYL5Q02045 173 aa8.57□□□□□ -1.04
C16orf62-211ENST00000540101 MCL1Q07820 350 aa8.57□□□□□ -1.04
C16orf62-211ENST00000540101 BFSP2Q13515 415 aa8.57□□□□□ -1.04
C16orf62-211ENST00000540101 PRPF4BQ13523 1007 aaKnown RBP8.57□□□□□ -1.04
C16orf62-211ENST00000540101 STIM1Q13586 685 aa8.57□□□□□ -1.04
C16orf62-211ENST00000540101 MYBPC2Q14324 1141 aa8.57□□□□□ -1.04
C16orf62-211ENST00000540101 DSC3Q14574 896 aa8.57□□□□□ -1.04
C16orf62-211ENST00000540101 TCTN1Q2MV58 587 aa8.57□□□□□ -1.04
C16orf62-211ENST00000540101 UBXN11Q5T124 520 aa8.57□□□□□ -1.04
C16orf62-211ENST00000540101 KLHL10Q6JEL2 608 aa8.57□□□□□ -1.04
C16orf62-211ENST00000540101 PHF6Q8IWS0 365 aaKnown RBP eCLIP8.57□□□□□ -1.04
C16orf62-211ENST00000540101 CCDC155Q8N6L0 562 aa8.57□□□□□ -1.04
C16orf62-211ENST00000540101 USP38Q8NB14 1042 aa8.57□□□□□ -1.04
C16orf62-211ENST00000540101 FBXL18Q96ME1 805 aa8.57□□□□□ -1.04
C16orf62-211ENST00000540101 CDX2Q99626 313 aaPredicted RBP8.57□□□□□ -1.04
C16orf62-211ENST00000540101 ANP32EQ9BTT0 268 aa8.57□□□□□ -1.04
C16orf62-211ENST00000540101 TRAIPQ9BWF2 469 aa8.57□□□□□ -1.04
C16orf62-211ENST00000540101 MRPL4Q9BYD3 311 aaKnown RBP8.57□□□□□ -1.04
C16orf62-211ENST00000540101 RBSNQ9H1K0 784 aa8.57□□□□□ -1.04
C16orf62-211ENST00000540101 TTYH1Q9H313 450 aaPredicted RBP8.57□□□□□ -1.04
C16orf62-211ENST00000540101 TMX1Q9H3N1 280 aa8.57□□□□□ -1.04
C16orf62-211ENST00000540101 HIPK3Q9H422 1215 aa8.57□□□□□ -1.04
C16orf62-211ENST00000540101 CBX8Q9HC52 389 aa8.57□□□□□ -1.04
C16orf62-211ENST00000540101 TMEM39AQ9NV64 488 aa8.57□□□□□ -1.04
C16orf62-211ENST00000540101 CGNQ9P2M7 1197 aaKnown RBP8.57□□□□□ -1.04
C16orf62-211ENST00000540101 DACH1Q9UI36 760 aa8.57□□□□□ -1.04
C16orf62-211ENST00000540101 EXOC7Q9UPT5 735 aa8.57□□□□□ -1.04
C16orf62-211ENST00000540101 GINS2Q9Y248 185 aa8.57□□□□□ -1.04
C16orf62-211ENST00000540101 BICDL2A1A5D9 508 aa8.56□□□□□ -1.04
C16orf62-211ENST00000540101 FSD2A1L4K1 749 aa8.56□□□□□ -1.04
C16orf62-211ENST00000540101 M0QZ92 97 aa8.56□□□□□ -1.04
C16orf62-211ENST00000540101 MGEA5O60502 916 aa8.56□□□□□ -1.04
C16orf62-211ENST00000540101 AKAP3O75969 853 aa8.56□□□□□ -1.04
C16orf62-211ENST00000540101 GARTP22102 1010 aa8.56□□□□□ -1.04
C16orf62-211ENST00000540101 CD52P31358 61 aa8.56□□□□□ -1.04
C16orf62-211ENST00000540101 CYP2C18P33260 490 aa8.56□□□□□ -1.04
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 47.3 ms