RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000539589.5

PACSIN3-211, Transcript of protein kinase C and casein kinase substrate in neurons 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 2 BASIC

Gene PACSIN3, Length 2,009 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PACSIN3-211ENST00000539589 NOA1Q8NC60 698 aaKnown RBP22.01■■□□□ 1.11
PACSIN3-211ENST00000539589 USP6NLQ92738 828 aa22.01■■□□□ 1.11
PACSIN3-211ENST00000539589 RHOXF2Q9BQY4 288 aa22.01■■□□□ 1.11
PACSIN3-211ENST00000539589 DHX33Q9H6R0 707 aaKnown RBP22.01■■□□□ 1.11
PACSIN3-211ENST00000539589 FLRT1Q9NZU1 646 aa22.01■■□□□ 1.11
PACSIN3-211ENST00000539589 TRIM49P0CI25 452 aa22■■□□□ 1.11
PACSIN3-211ENST00000539589 TRIM49CP0CI26 452 aa22■■□□□ 1.11
PACSIN3-211ENST00000539589 NPTX2P47972 431 aa22■■□□□ 1.11
PACSIN3-211ENST00000539589 MYL7Q01449 175 aa22■■□□□ 1.11
PACSIN3-211ENST00000539589 CBWD6Q4V339 395 aa22■■□□□ 1.11
PACSIN3-211ENST00000539589 CBWD3Q5JTY5 395 aa22■■□□□ 1.11
PACSIN3-211ENST00000539589 CBWD5Q5RIA9 395 aa22■■□□□ 1.11
PACSIN3-211ENST00000539589 FMNL3Q8IVF7 1028 aa22■■□□□ 1.11
PACSIN3-211ENST00000539589 KIFC3Q9BVG8 833 aa22■■□□□ 1.11
PACSIN3-211ENST00000539589 STK33Q9BYT3 514 aa22■■□□□ 1.11
PACSIN3-211ENST00000539589 PCIF1Q9H4Z3 704 aa22■■□□□ 1.11
PACSIN3-211ENST00000539589 ATP6V0A4Q9HBG4 840 aa22■■□□□ 1.11
PACSIN3-211ENST00000539589 EXOC7Q9UPT5 735 aa22■■□□□ 1.11
PACSIN3-211ENST00000539589 BUB1O43683 1085 aa21.99■■□□□ 1.11
PACSIN3-211ENST00000539589 SEC31AO94979 1220 aaKnown RBP21.99■■□□□ 1.11
PACSIN3-211ENST00000539589 TCP1P17987 556 aaKnown RBP21.99■■□□□ 1.11
PACSIN3-211ENST00000539589 MARK3P27448 753 aa21.99■■□□□ 1.11
PACSIN3-211ENST00000539589 DMP1Q13316 513 aaPredicted RBP21.99■■□□□ 1.11
PACSIN3-211ENST00000539589 EMC2Q15006 297 aa21.99■■□□□ 1.11
PACSIN3-211ENST00000539589 GJB7Q6PEY0 223 aa21.99■■□□□ 1.11
PACSIN3-211ENST00000539589 XXYLT1Q8NBI6 393 aa21.99■■□□□ 1.11
PACSIN3-211ENST00000539589 MCPH1Q8NEM0 835 aa21.99■■□□□ 1.11
PACSIN3-211ENST00000539589 HNRNPLLQ8WVV9 542 aaKnown RBP21.99■■□□□ 1.11
PACSIN3-211ENST00000539589 KIFAP3Q92845 792 aa21.99■■□□□ 1.11
PACSIN3-211ENST00000539589 TSKSQ9UJT2 592 aa21.99■■□□□ 1.11
PACSIN3-211ENST00000539589 AJAP1Q9UKB5 411 aaPredicted RBP21.99■■□□□ 1.11
PACSIN3-211ENST00000539589 HYOU1Q9Y4L1 999 aa21.99■■□□□ 1.11
PACSIN3-211ENST00000539589 CENPFP49454 3210 aa21.99■■□□□ 1.11
PACSIN3-211ENST00000539589 EMSYQ7Z589 1322 aa21.99■■□□□ 1.11
PACSIN3-211ENST00000539589 ADGRA3Q8IWK6 1321 aa21.99■■□□□ 1.11
PACSIN3-211ENST00000539589 MAPK13O15264 365 aa21.99■■□□□ 1.11
PACSIN3-211ENST00000539589 ADCY6O43306 1168 aa21.99■■□□□ 1.11
PACSIN3-211ENST00000539589 ACVR2BQ13705 512 aa21.99■■□□□ 1.11
PACSIN3-211ENST00000539589 PAXIP1Q6ZW49 1069 aaPredicted RBP21.99■■□□□ 1.11
PACSIN3-211ENST00000539589 PLPPR4Q7Z2D5 763 aa21.99■■□□□ 1.11
PACSIN3-211ENST00000539589 TMEM161BQ8NDZ6 487 aa21.99■■□□□ 1.11
PACSIN3-211ENST00000539589 GLG1Q92896 1179 aa21.99■■□□□ 1.11
PACSIN3-211ENST00000539589 HVCN1Q96D96 273 aa21.99■■□□□ 1.11
PACSIN3-211ENST00000539589 PNKPQ96T60 521 aa21.99■■□□□ 1.11
PACSIN3-211ENST00000539589 CBWD1Q9BRT8 395 aa21.99■■□□□ 1.11
PACSIN3-211ENST00000539589 INTS2Q9H0H0 1204 aaKnown RBP21.99■■□□□ 1.11
PACSIN3-211ENST00000539589 AZI2Q9H6S1 392 aa21.99■■□□□ 1.11
PACSIN3-211ENST00000539589 C17orf75Q9HAS0 396 aa21.99■■□□□ 1.11
PACSIN3-211ENST00000539589 NRBP2Q9NSY0 501 aa21.99■■□□□ 1.11
PACSIN3-211ENST00000539589 GJD2Q9UKL4 321 aa21.99■■□□□ 1.11
PACSIN3-211ENST00000539589 EVPLQ92817 2033 aa21.98■■□□□ 1.11
PACSIN3-211ENST00000539589 CCDC169A6NNP5 214 aa21.98■■□□□ 1.11
PACSIN3-211ENST00000539589 TISP43B9A030 160 aa21.98■■□□□ 1.11
PACSIN3-211ENST00000539589 ZNF185O15231 689 aa21.98■■□□□ 1.11
PACSIN3-211ENST00000539589 N4BP1O75113 896 aaKnown RBP21.98■■□□□ 1.11
PACSIN3-211ENST00000539589 ERLIN1O75477 346 aa21.98■■□□□ 1.11
PACSIN3-211ENST00000539589 KLRC1P26715 233 aa21.98■■□□□ 1.11
PACSIN3-211ENST00000539589 CETN1Q12798 172 aa21.98■■□□□ 1.11
PACSIN3-211ENST00000539589 PLCB4Q15147 1175 aa21.98■■□□□ 1.11
PACSIN3-211ENST00000539589 NTPCRQ9BSD7 190 aaKnown RBP21.98■■□□□ 1.11
PACSIN3-211ENST00000539589 POLR3FQ9H1D9 316 aaPredicted RBP21.98■■□□□ 1.11
PACSIN3-211ENST00000539589 ABHD16BQ9H3Z7 469 aa21.98■■□□□ 1.11
PACSIN3-211ENST00000539589 HSPBP1Q9NZL4 362 aa21.98■■□□□ 1.11
PACSIN3-211ENST00000539589 DNAJC12Q9UKB3 198 aa21.98■■□□□ 1.11
PACSIN3-211ENST00000539589 BTNL10A8MVZ5 291 aa21.97■■□□□ 1.11
PACSIN3-211ENST00000539589 ZBTB42B2RXF5 422 aa21.97■■□□□ 1.11
PACSIN3-211ENST00000539589 GH1P01241 217 aa21.97■■□□□ 1.11
PACSIN3-211ENST00000539589 HOXC6P09630 235 aa21.97■■□□□ 1.11
PACSIN3-211ENST00000539589 SMPD1P17405 629 aa21.97■■□□□ 1.11
PACSIN3-211ENST00000539589 SOX5P35711 763 aa21.97■■□□□ 1.11
PACSIN3-211ENST00000539589 VAMP7P51809 220 aa21.97■■□□□ 1.11
PACSIN3-211ENST00000539589 POLGP54098 1239 aaPredicted RBP21.97■■□□□ 1.11
PACSIN3-211ENST00000539589 LAMC2Q13753 1193 aa21.97■■□□□ 1.11
PACSIN3-211ENST00000539589 CCL14Q16627 93 aa21.97■■□□□ 1.11
PACSIN3-211ENST00000539589 PRAMEF19Q5SWL8 479 aa21.97■■□□□ 1.11
PACSIN3-211ENST00000539589 SPIRE2Q8WWL2 714 aa21.97■■□□□ 1.11
PACSIN3-211ENST00000539589 TMEM143Q96AN5 459 aa21.97■■□□□ 1.11
PACSIN3-211ENST00000539589 OSBPL9Q96SU4 736 aa21.97■■□□□ 1.11
PACSIN3-211ENST00000539589 APEX2Q9UBZ4 518 aa21.97■■□□□ 1.11
PACSIN3-211ENST00000539589 NAGPAQ9UK23 515 aa21.97■■□□□ 1.11
PACSIN3-211ENST00000539589 F8VZ95 297 aa21.97■■□□□ 1.11
PACSIN3-211ENST00000539589 P4HA2O15460 535 aa21.97■■□□□ 1.11
PACSIN3-211ENST00000539589 CA12O43570 354 aa21.97■■□□□ 1.11
PACSIN3-211ENST00000539589 RFX1P22670 979 aa21.97■■□□□ 1.11
PACSIN3-211ENST00000539589 ALKBH5Q6P6C2 394 aaKnown RBP21.97■■□□□ 1.11
PACSIN3-211ENST00000539589 CREG2Q8IUH2 290 aa21.97■■□□□ 1.11
PACSIN3-211ENST00000539589 ZHX1Q9UKY1 873 aaPredicted RBP21.97■■□□□ 1.11
PACSIN3-211ENST00000539589 TBX20Q9UMR3 447 aa21.97■■□□□ 1.11
PACSIN3-211ENST00000539589 AOC2O75106 756 aa21.96■■□□□ 1.11
PACSIN3-211ENST00000539589 GFPT2O94808 682 aa21.96■■□□□ 1.11
PACSIN3-211ENST00000539589 CCDC172P0C7W6 258 aa21.96■■□□□ 1.11
PACSIN3-211ENST00000539589 RTP1P59025 263 aa21.96■■□□□ 1.11
PACSIN3-211ENST00000539589 DRAP1Q14919 205 aaPredicted RBP21.96■■□□□ 1.11
PACSIN3-211ENST00000539589 MSL3Q8N5Y2 521 aaKnown RBP21.96■■□□□ 1.11
PACSIN3-211ENST00000539589 AFG1LQ8WV93 481 aa21.96■■□□□ 1.11
PACSIN3-211ENST00000539589 EMID1Q96A84 441 aaPredicted RBP21.96■■□□□ 1.11
PACSIN3-211ENST00000539589 PACSIN1Q9BY11 444 aa21.96■■□□□ 1.11
PACSIN3-211ENST00000539589 KMT5AQ9NQR1 393 aa21.96■■□□□ 1.11
PACSIN3-211ENST00000539589 SLC5A4Q9NY91 659 aa21.96■■□□□ 1.11
PACSIN3-211ENST00000539589 ATP8B3O60423 1300 aa21.96■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 26.8 ms