RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000539490.1

DYRK4-208, Transcript of dual specificity tyrosine phosphorylation regulated kinase 4, human

TSL 2

Gene DYRK4, Length 447 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
DYRK4-208	ENST00000539490	SLC24A5	Q71RS6	500 aa		6.64	□□□□□ -1.35
DYRK4-208	ENST00000539490	NIPA1	Q7RTP0	329 aa		6.64	□□□□□ -1.35
DYRK4-208	ENST00000539490	SKAP1	Q86WV1	359 aa		6.64	□□□□□ -1.35
DYRK4-208	ENST00000539490	CCDC60	Q8IWA6	550 aa	Predicted RBP	6.64	□□□□□ -1.35
DYRK4-208	ENST00000539490	TEX2	Q8IWB9	1127 aa		6.64	□□□□□ -1.35
DYRK4-208	ENST00000539490	CKAP2L	Q8IYA6	745 aa		6.64	□□□□□ -1.35
DYRK4-208	ENST00000539490	TRIM22	Q8IYM9	498 aa		6.64	□□□□□ -1.35
DYRK4-208	ENST00000539490	EFHB	Q8N7U6	833 aa		6.64	□□□□□ -1.35
DYRK4-208	ENST00000539490	ATP8B4	Q8TF62	1192 aa		6.64	□□□□□ -1.35
DYRK4-208	ENST00000539490	TMEM40	Q8WWA1	233 aa		6.64	□□□□□ -1.35
DYRK4-208	ENST00000539490	MSLNL	Q96KJ4	702 aa		6.64	□□□□□ -1.35
DYRK4-208	ENST00000539490	FBXL18	Q96ME1	805 aa		6.64	□□□□□ -1.35
DYRK4-208	ENST00000539490	PPP1R16B	Q96T49	567 aa		6.64	□□□□□ -1.35
DYRK4-208	ENST00000539490	POP1	Q99575	1024 aa	Known RBP	6.64	□□□□□ -1.35
DYRK4-208	ENST00000539490	ADAM2	Q99965	735 aa		6.64	□□□□□ -1.35
DYRK4-208	ENST00000539490	GLT8D2	Q9H1C3	349 aa		6.64	□□□□□ -1.35
DYRK4-208	ENST00000539490	TLE6	Q9H808	572 aa		6.64	□□□□□ -1.35
DYRK4-208	ENST00000539490	ZNF302	Q9NR11	478 aa		6.64	□□□□□ -1.35
DYRK4-208	ENST00000539490	RGS18	Q9NS28	235 aa		6.64	□□□□□ -1.35
DYRK4-208	ENST00000539490	CLEC1B	Q9P126	229 aa		6.64	□□□□□ -1.35
DYRK4-208	ENST00000539490	MUTYH	Q9UIF7	546 aa		6.64	□□□□□ -1.35
DYRK4-208	ENST00000539490	NAP1L2	Q9ULW6	460 aa	Predicted RBP	6.64	□□□□□ -1.35
DYRK4-208	ENST00000539490	PCDHB12	Q9Y5F1	795 aa		6.64	□□□□□ -1.35
DYRK4-208	ENST00000539490	PCDHGC5	Q9Y5F6	944 aa		6.64	□□□□□ -1.35
DYRK4-208	ENST00000539490	TRIO	O75962	3097 aa		6.64	□□□□□ -1.35
DYRK4-208	ENST00000539490	IGLV3-22	A0A075B6J6	115 aa		6.63	□□□□□ -1.35
DYRK4-208	ENST00000539490	DENND3	A2RUS2	1198 aa		6.63	□□□□□ -1.35
DYRK4-208	ENST00000539490	TBKBP1	A7MCY6	615 aa		6.63	□□□□□ -1.35
DYRK4-208	ENST00000539490	ZBTB42	B2RXF5	422 aa		6.63	□□□□□ -1.35
DYRK4-208	ENST00000539490		C9IYK1	514 aa		6.63	□□□□□ -1.35
DYRK4-208	ENST00000539490	hCG_1984214	I3L0E3	225 aa		6.63	□□□□□ -1.35
DYRK4-208	ENST00000539490	IPO5	O00410	1097 aa	Known RBP	6.63	□□□□□ -1.35
DYRK4-208	ENST00000539490	ADAMTS3	O15072	1205 aa		6.63	□□□□□ -1.35
DYRK4-208	ENST00000539490	VTN	P04004	478 aa		6.63	□□□□□ -1.35
DYRK4-208	ENST00000539490	COL1A2	P08123	1366 aa		6.63	□□□□□ -1.35
DYRK4-208	ENST00000539490	CYP3A4	P08684	503 aa		6.63	□□□□□ -1.35
DYRK4-208	ENST00000539490	CRYBB1	P53674	252 aa	Predicted RBP	6.63	□□□□□ -1.35
DYRK4-208	ENST00000539490	ERVFC1	P60507	584 aa		6.63	□□□□□ -1.35
DYRK4-208	ENST00000539490	FAM189B	P81408	668 aa		6.63	□□□□□ -1.35
DYRK4-208	ENST00000539490	COASY	Q13057	564 aa		6.63	□□□□□ -1.35
DYRK4-208	ENST00000539490	ZNF211	Q13398	564 aa	Predicted RBP	6.63	□□□□□ -1.35
DYRK4-208	ENST00000539490	PFKFB3	Q16875	520 aa	Predicted RBP	6.63	□□□□□ -1.35
DYRK4-208	ENST00000539490	KIZ	Q2M2Z5	673 aa		6.63	□□□□□ -1.35
DYRK4-208	ENST00000539490	HERC4	Q5GLZ8	1057 aa	Predicted RBP	6.63	□□□□□ -1.35
DYRK4-208	ENST00000539490	FAM43B	Q6ZT52	329 aa	Predicted RBP	6.63	□□□□□ -1.35
DYRK4-208	ENST00000539490	NLRP8	Q86W28	1048 aa		6.63	□□□□□ -1.35
DYRK4-208	ENST00000539490	METTL13	Q8N6R0	699 aa		6.63	□□□□□ -1.35
DYRK4-208	ENST00000539490	ZNF713	Q8N859	430 aa	Predicted RBP	6.63	□□□□□ -1.35
DYRK4-208	ENST00000539490	HELQ	Q8TDG4	1101 aa		6.63	□□□□□ -1.35
DYRK4-208	ENST00000539490	CRYGN	Q8WXF5	182 aa		6.63	□□□□□ -1.35
DYRK4-208	ENST00000539490	EDA	Q92838	391 aa		6.63	□□□□□ -1.35
DYRK4-208	ENST00000539490	ZNF837	Q96EG3	531 aa	Predicted RBP	6.63	□□□□□ -1.35
DYRK4-208	ENST00000539490	SUSD3	Q96L08	255 aa		6.63	□□□□□ -1.35
DYRK4-208	ENST00000539490	OSMR	Q99650	979 aa		6.63	□□□□□ -1.35
DYRK4-208	ENST00000539490	ZNF577	Q9BSK1	485 aa		6.63	□□□□□ -1.35
DYRK4-208	ENST00000539490	ZMYND12	Q9H0C1	365 aa		6.63	□□□□□ -1.35
DYRK4-208	ENST00000539490	C1orf112	Q9NSG2	853 aa		6.63	□□□□□ -1.35
DYRK4-208	ENST00000539490	TYW1	Q9NV66	732 aa	Known RBP	6.63	□□□□□ -1.35
DYRK4-208	ENST00000539490	BARX2	Q9UMQ3	279 aa	Predicted RBP	6.63	□□□□□ -1.35
DYRK4-208	ENST00000539490	DNMT3A	Q9Y6K1	912 aa	Predicted RBP	6.63	□□□□□ -1.35
DYRK4-208	ENST00000539490	PIEZO1	Q92508	2521 aa		6.62	□□□□□ -1.35
DYRK4-208	ENST00000539490	CCDC196	A0A1B0GTZ2	297 aa		6.62	□□□□□ -1.35
DYRK4-208	ENST00000539490	LOC730098	B7Z3J9	87 aa		6.62	□□□□□ -1.35
DYRK4-208	ENST00000539490	MAGEB2	O15479	319 aa		6.62	□□□□□ -1.35
DYRK4-208	ENST00000539490	GPR32	O75388	356 aa		6.62	□□□□□ -1.35
DYRK4-208	ENST00000539490	FGF18	O76093	207 aa		6.62	□□□□□ -1.35
DYRK4-208	ENST00000539490	C22orf31	O95567	290 aa		6.62	□□□□□ -1.35
DYRK4-208	ENST00000539490	GLP2R	O95838	553 aa		6.62	□□□□□ -1.35
DYRK4-208	ENST00000539490	PSAP	P07602	524 aa		6.62	□□□□□ -1.35
DYRK4-208	ENST00000539490	HMGB1	P09429	215 aa	Known RBP	6.62	□□□□□ -1.35
DYRK4-208	ENST00000539490	FGFR1	P11362	822 aa		6.62	□□□□□ -1.35
DYRK4-208	ENST00000539490	CPA1	P15085	419 aa		6.62	□□□□□ -1.35
DYRK4-208	ENST00000539490	METAP2	P50579	478 aa	Known RBP eCLIP	6.62	□□□□□ -1.35
DYRK4-208	ENST00000539490	NLRP11	P59045	1033 aa	Known RBP	6.62	□□□□□ -1.35
DYRK4-208	ENST00000539490	FGD1	P98174	961 aa		6.62	□□□□□ -1.35
DYRK4-208	ENST00000539490	RBM10	P98175	930 aa	Known RBP	6.62	□□□□□ -1.35
DYRK4-208	ENST00000539490	NHLH1	Q02575	133 aa		6.62	□□□□□ -1.35
DYRK4-208	ENST00000539490	UBE3A	Q05086	875 aa		6.62	□□□□□ -1.35
DYRK4-208	ENST00000539490	APOBR	Q0VD83	1088 aa		6.62	□□□□□ -1.35
DYRK4-208	ENST00000539490	MTMR3	Q13615	1198 aa		6.62	□□□□□ -1.35
DYRK4-208	ENST00000539490	KRT32	Q14532	448 aa		6.62	□□□□□ -1.35
DYRK4-208	ENST00000539490	PKN1	Q16512	942 aa		6.62	□□□□□ -1.35
DYRK4-208	ENST00000539490	BMP2KL	Q5H9B9	411 aa		6.62	□□□□□ -1.35
DYRK4-208	ENST00000539490	ZNF746	Q6NUN9	644 aa	Predicted RBP	6.62	□□□□□ -1.35
DYRK4-208	ENST00000539490	EFCAB12	Q6NXP0	572 aa		6.62	□□□□□ -1.35
DYRK4-208	ENST00000539490	FIGNL1	Q6PIW4	674 aa		6.62	□□□□□ -1.35
DYRK4-208	ENST00000539490		Q6ZUG5	572 aa		6.62	□□□□□ -1.35
DYRK4-208	ENST00000539490	FAM228A	Q86W67	206 aa		6.62	□□□□□ -1.35
DYRK4-208	ENST00000539490	THNSL1	Q8IYQ7	743 aa		6.62	□□□□□ -1.35
DYRK4-208	ENST00000539490	VWA5B2	Q8N398	1253 aa		6.62	□□□□□ -1.35
DYRK4-208	ENST00000539490	COLGALT1	Q8NBJ5	622 aa		6.62	□□□□□ -1.35
DYRK4-208	ENST00000539490	SMRP1	Q8NCR6	262 aa		6.62	□□□□□ -1.35
DYRK4-208	ENST00000539490	GTPBP3	Q969Y2	492 aa	Known RBP	6.62	□□□□□ -1.35
DYRK4-208	ENST00000539490	MFSD14A	Q96MC6	490 aa		6.62	□□□□□ -1.35
DYRK4-208	ENST00000539490	KCNH6	Q9H252	994 aa		6.62	□□□□□ -1.35
DYRK4-208	ENST00000539490	CWH43	Q9H720	699 aa		6.62	□□□□□ -1.35
DYRK4-208	ENST00000539490	ELAC1	Q9H777	363 aa	Known RBP	6.62	□□□□□ -1.35
DYRK4-208	ENST00000539490	ATP6V0A4	Q9HBG4	840 aa		6.62	□□□□□ -1.35
DYRK4-208	ENST00000539490	C6orf50	Q9HD87	102 aa		6.62	□□□□□ -1.35
DYRK4-208	ENST00000539490	TLR9	Q9NR96	1032 aa		6.62	□□□□□ -1.35

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