RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000534200.1

DDX20-205, Transcript of DEAD-box helicase 20, human

TSL 2

Gene DDX20, Length 562 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
DDX20-205	ENST00000534200	AP5M1	Q9H0R1	490 aa		4.93	□□□□□ -1.62
DDX20-205	ENST00000534200	TAF1D	Q9H5J8	278 aa	Predicted RBP	4.93	□□□□□ -1.62
DDX20-205	ENST00000534200	GPRC5D	Q9NZD1	345 aa		4.93	□□□□□ -1.62
DDX20-205	ENST00000534200	POLL	Q9UGP5	575 aa		4.93	□□□□□ -1.62
DDX20-205	ENST00000534200	HACL1	Q9UJ83	578 aa		4.93	□□□□□ -1.62
DDX20-205	ENST00000534200	NOB1	Q9ULX3	412 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
DDX20-205	ENST00000534200		X6R8D5	127 aa		4.93	□□□□□ -1.62
DDX20-205	ENST00000534200	LOC285556	D6RIA3	1793 aa		4.93	□□□□□ -1.62
DDX20-205	ENST00000534200	ZNF804B	A4D1E1	1349 aa		4.93	□□□□□ -1.62
DDX20-205	ENST00000534200	SH3D21	A4FU49	640 aa		4.92	□□□□□ -1.62
DDX20-205	ENST00000534200	MYO1B	O43795	1136 aa		4.92	□□□□□ -1.62
DDX20-205	ENST00000534200	EPHX2	P34913	555 aa		4.92	□□□□□ -1.62
DDX20-205	ENST00000534200	LTBR	P36941	435 aa		4.92	□□□□□ -1.62
DDX20-205	ENST00000534200	STAT5A	P42229	794 aa		4.92	□□□□□ -1.62
DDX20-205	ENST00000534200	RFX5	P48382	616 aa	Predicted RBP	4.92	□□□□□ -1.62
DDX20-205	ENST00000534200	CTCF	P49711	727 aa	Predicted RBP	4.92	□□□□□ -1.62
DDX20-205	ENST00000534200	CXCL9	Q07325	125 aa		4.92	□□□□□ -1.62
DDX20-205	ENST00000534200	TESK1	Q15569	626 aa		4.92	□□□□□ -1.62
DDX20-205	ENST00000534200	TAF7L	Q5H9L4	462 aa		4.92	□□□□□ -1.62
DDX20-205	ENST00000534200	EPHA10	Q5JZY3	1008 aa		4.92	□□□□□ -1.62
DDX20-205	ENST00000534200	STRIP1	Q5VSL9	837 aa		4.92	□□□□□ -1.62
DDX20-205	ENST00000534200	CD300LD	Q6UXZ3	194 aa		4.92	□□□□□ -1.62
DDX20-205	ENST00000534200	ETV3L	Q6ZN32	361 aa		4.92	□□□□□ -1.62
DDX20-205	ENST00000534200	ZNF804A	Q7Z570	1209 aa		4.92	□□□□□ -1.62
DDX20-205	ENST00000534200	FERMT3	Q86UX7	667 aa		4.92	□□□□□ -1.62
DDX20-205	ENST00000534200	SEC14L1	Q92503	715 aa		4.92	□□□□□ -1.62
DDX20-205	ENST00000534200	MEIS3	Q99687	375 aa		4.92	□□□□□ -1.62
DDX20-205	ENST00000534200	IER2	Q9BTL4	223 aa		4.92	□□□□□ -1.62
DDX20-205	ENST00000534200	EPN3	Q9H201	632 aa		4.92	□□□□□ -1.62
DDX20-205	ENST00000534200	CHMP4B	Q9H444	224 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
DDX20-205	ENST00000534200	ADARB2	Q9NS39	739 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
DDX20-205	ENST00000534200	COL2A1	P02458	1487 aa	Predicted RBP	4.92	□□□□□ -1.62
DDX20-205	ENST00000534200	PASK	Q96RG2	1323 aa		4.92	□□□□□ -1.62
DDX20-205	ENST00000534200	RBBP6	Q7Z6E9	1792 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
DDX20-205	ENST00000534200	AGRP	O00253	132 aa		4.91	□□□□□ -1.62
DDX20-205	ENST00000534200	PSMD14	O00487	310 aa		4.91	□□□□□ -1.62
DDX20-205	ENST00000534200	DLX3	O60479	287 aa		4.91	□□□□□ -1.62
DDX20-205	ENST00000534200	MSC	O60682	206 aa		4.91	□□□□□ -1.62
DDX20-205	ENST00000534200	IGSF3	O75054	1194 aa		4.91	□□□□□ -1.62
DDX20-205	ENST00000534200	BCAR3	O75815	825 aa		4.91	□□□□□ -1.62
DDX20-205	ENST00000534200	DDN	O94850	711 aa	Predicted RBP	4.91	□□□□□ -1.62
DDX20-205	ENST00000534200	GNAI2	P04899	355 aa		4.91	□□□□□ -1.62
DDX20-205	ENST00000534200	VIL1	P09327	827 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
DDX20-205	ENST00000534200	CYP2C8	P10632	490 aa		4.91	□□□□□ -1.62
DDX20-205	ENST00000534200	IL1R1	P14778	569 aa		4.91	□□□□□ -1.62
DDX20-205	ENST00000534200	IL15	P40933	162 aa	Predicted RBP	4.91	□□□□□ -1.62
DDX20-205	ENST00000534200	KCNJ4	P48050	445 aa		4.91	□□□□□ -1.62
DDX20-205	ENST00000534200	SLC6A11	P48066	632 aa		4.91	□□□□□ -1.62
DDX20-205	ENST00000534200	GTF2A2	P52657	109 aa		4.91	□□□□□ -1.62
DDX20-205	ENST00000534200	HMGA2	P52926	109 aa		4.91	□□□□□ -1.62
DDX20-205	ENST00000534200	ZNF280A	P59817	542 aa	Predicted RBP	4.91	□□□□□ -1.62
DDX20-205	ENST00000534200	LSAMP	Q13449	338 aa		4.91	□□□□□ -1.62
DDX20-205	ENST00000534200	PUM3	Q15397	648 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
DDX20-205	ENST00000534200	NT5DC1	Q5TFE4	455 aa		4.91	□□□□□ -1.62
DDX20-205	ENST00000534200	MROH9	Q5TGP6	573 aa		4.91	□□□□□ -1.62
DDX20-205	ENST00000534200	LDHAL6A	Q6ZMR3	332 aa		4.91	□□□□□ -1.62
DDX20-205	ENST00000534200	MIB1	Q86YT6	1006 aa		4.91	□□□□□ -1.62
DDX20-205	ENST00000534200	RIOX2	Q8IUF8	465 aa		4.91	□□□□□ -1.62
DDX20-205	ENST00000534200	CARF	Q8N187	725 aa		4.91	□□□□□ -1.62
DDX20-205	ENST00000534200	GOLGA6L2	Q8N9W4	650 aa	Predicted RBP	4.91	□□□□□ -1.62
DDX20-205	ENST00000534200	SORCS2	Q96PQ0	1159 aa		4.91	□□□□□ -1.62
DDX20-205	ENST00000534200	CNNM1	Q9NRU3	951 aa		4.91	□□□□□ -1.62
DDX20-205	ENST00000534200	SMPD4	Q9NXE4	827 aa		4.91	□□□□□ -1.62
DDX20-205	ENST00000534200	CLDND1	Q9NY35	253 aa		4.91	□□□□□ -1.62
DDX20-205	ENST00000534200	PPARGC1A	Q9UBK2	798 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
DDX20-205	ENST00000534200	RCAN3	Q9UKA8	241 aa		4.91	□□□□□ -1.62
DDX20-205	ENST00000534200	DDX19B	Q9UMR2	479 aa		4.91	□□□□□ -1.62
DDX20-205	ENST00000534200	RIPOR2	Q9Y4F9	1068 aa		4.91	□□□□□ -1.62
DDX20-205	ENST00000534200	LRRFIP2	Q9Y608	721 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
DDX20-205	ENST00000534200	BAZ2A	Q9UIF9	1905 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
DDX20-205	ENST00000534200	MAST3	O60307	1309 aa		4.91	□□□□□ -1.62
DDX20-205	ENST00000534200	FAM205A	Q6ZU69	1335 aa		4.91	□□□□□ -1.62
DDX20-205	ENST00000534200	RFX7	Q2KHR2	1363 aa		4.91	□□□□□ -1.62
DDX20-205	ENST00000534200	PARP14	Q460N5	1801 aa		4.9	□□□□□ -1.62
DDX20-205	ENST00000534200	MGAM	O43451	1857 aa		4.9	□□□□□ -1.62
DDX20-205	ENST00000534200	GREB1L	Q9C091	1923 aa	Predicted RBP	4.9	□□□□□ -1.62
DDX20-205	ENST00000534200	EYA2	O00167	538 aa		4.9	□□□□□ -1.63
DDX20-205	ENST00000534200	MATN3	O15232	486 aa		4.9	□□□□□ -1.63
DDX20-205	ENST00000534200	PDE8B	O95263	885 aa		4.9	□□□□□ -1.63
DDX20-205	ENST00000534200	SLC5A1	P13866	664 aa		4.9	□□□□□ -1.63
DDX20-205	ENST00000534200	FGFR2	P21802	821 aa		4.9	□□□□□ -1.63
DDX20-205	ENST00000534200	GMPS	P49915	693 aa	Predicted RBP	4.9	□□□□□ -1.63
DDX20-205	ENST00000534200	ADAM17	P78536	824 aa		4.9	□□□□□ -1.63
DDX20-205	ENST00000534200	MAP4K2	Q12851	820 aa		4.9	□□□□□ -1.63
DDX20-205	ENST00000534200	MVP	Q14764	893 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
DDX20-205	ENST00000534200	METTL24	Q5JXM2	366 aa		4.9	□□□□□ -1.63
DDX20-205	ENST00000534200	DACT2	Q5SW24	774 aa		4.9	□□□□□ -1.63
DDX20-205	ENST00000534200	USP53	Q70EK8	1073 aa		4.9	□□□□□ -1.63
DDX20-205	ENST00000534200	TMEM57	Q8N5G2	664 aa		4.9	□□□□□ -1.63
DDX20-205	ENST00000534200	LINC00482	Q8N8I6	264 aa		4.9	□□□□□ -1.63
DDX20-205	ENST00000534200	ARRDC4	Q8NCT1	418 aa		4.9	□□□□□ -1.63
DDX20-205	ENST00000534200	SSH3	Q8TE77	659 aa		4.9	□□□□□ -1.63
DDX20-205	ENST00000534200	C11orf84	Q9BUA3	381 aa	Predicted RBP	4.9	□□□□□ -1.63
DDX20-205	ENST00000534200	DBNDD1	Q9H9R9	158 aa		4.9	□□□□□ -1.63
DDX20-205	ENST00000534200	ARHGEF4	Q9NR80	690 aa		4.9	□□□□□ -1.63
DDX20-205	ENST00000534200	PGAP2	Q9UHJ9	254 aa		4.9	□□□□□ -1.63
DDX20-205	ENST00000534200	COA3	Q9Y2R0	106 aa	Predicted RBP	4.9	□□□□□ -1.63
DDX20-205	ENST00000534200	NPFFR2	Q9Y5X5	522 aa		4.9	□□□□□ -1.63
DDX20-205	ENST00000534200	CASP8AP2	Q9UKL3	1982 aa		4.9	□□□□□ -1.63
DDX20-205	ENST00000534200	SALL1	Q9NSC2	1324 aa		4.9	□□□□□ -1.63

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