RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000532751.1

PTPRK-222, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type K, humanhuman

TSL 4

Gene PTPRK, Length 563 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRK-222ENST00000532751 CSPP1Q1MSJ5 1256 aa24.17■■□□□ 1.46
PTPRK-222ENST00000532751 AGMOQ6ZNB7 445 aa24.17■■□□□ 1.46
PTPRK-222ENST00000532751 APBB1IPQ7Z5R6 666 aaPredicted RBP24.17■■□□□ 1.46
PTPRK-222ENST00000532751 CDR2LQ86X02 465 aaPredicted RBP24.17■■□□□ 1.46
PTPRK-222ENST00000532751 MICALL1Q8N3F8 863 aa24.17■■□□□ 1.46
PTPRK-222ENST00000532751 PDILTQ8N807 584 aa24.17■■□□□ 1.46
PTPRK-222ENST00000532751 SMG8Q8ND04 991 aaKnown RBP24.17■■□□□ 1.46
PTPRK-222ENST00000532751 URGCPQ8TCY9 931 aa24.17■■□□□ 1.46
PTPRK-222ENST00000532751 CWH43Q9H720 699 aa24.17■■□□□ 1.46
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PTPRK-222ENST00000532751 PCDHA7Q9UN72 937 aa24.17■■□□□ 1.46
PTPRK-222ENST00000532751 INPP5FQ9Y2H2 1132 aa24.17■■□□□ 1.46
PTPRK-222ENST00000532751 MEIS3P2A8K0S8 358 aa24.16■■□□□ 1.46
PTPRK-222ENST00000532751 OFD1O75665 1012 aa24.16■■□□□ 1.46
PTPRK-222ENST00000532751 STRN3Q13033 797 aa24.16■■□□□ 1.46
PTPRK-222ENST00000532751 NOMO2Q5JPE7 1267 aa24.16■■□□□ 1.46
PTPRK-222ENST00000532751 AXDND1Q5T1B0 1012 aaPredicted RBP24.16■■□□□ 1.46
PTPRK-222ENST00000532751 MYCT1Q8N699 235 aa24.16■■□□□ 1.46
PTPRK-222ENST00000532751 PPM1EQ8WY54 764 aa24.16■■□□□ 1.46
PTPRK-222ENST00000532751 SPATA32Q96LK8 384 aa24.16■■□□□ 1.46
PTPRK-222ENST00000532751 LMAN2LQ9H0V9 348 aa24.16■■□□□ 1.46
PTPRK-222ENST00000532751 ZHX3Q9H4I2 956 aa24.16■■□□□ 1.46
PTPRK-222ENST00000532751 PDZD7Q9H5P4 517 aa24.16■■□□□ 1.46
PTPRK-222ENST00000532751 FAM13BQ9NYF5 915 aa24.16■■□□□ 1.46
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PTPRK-222ENST00000532751 ATF7IP2Q5U623 682 aa24.15■■□□□ 1.46
PTPRK-222ENST00000532751 SHC4Q6S5L8 630 aa24.15■■□□□ 1.46
PTPRK-222ENST00000532751 LRRC55Q6ZSA7 311 aa24.15■■□□□ 1.46
PTPRK-222ENST00000532751 COLGALT1Q8NBJ5 622 aa24.15■■□□□ 1.46
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PTPRK-222ENST00000532751 MRPL4Q9BYD3 311 aaKnown RBP24.15■■□□□ 1.46
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PTPRK-222ENST00000532751 HCSTQ9UBK5 93 aa24.15■■□□□ 1.46
PTPRK-222ENST00000532751 A0A087X0B3 334 aa24.14■■□□□ 1.45
PTPRK-222ENST00000532751 CARNS1A5YM72 827 aa24.14■■□□□ 1.45
PTPRK-222ENST00000532751 TTLL13PA6NNM8 815 aa24.14■■□□□ 1.45
PTPRK-222ENST00000532751 EDN1P05305 212 aa24.14■■□□□ 1.45
PTPRK-222ENST00000532751 SCP2P22307 547 aa24.14■■□□□ 1.45
PTPRK-222ENST00000532751 ZNF131P52739 623 aa24.14■■□□□ 1.45
PTPRK-222ENST00000532751 NCKAP1LP55160 1127 aa24.14■■□□□ 1.45
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PTPRK-222ENST00000532751 THNSL1Q8IYQ7 743 aa24.14■■□□□ 1.45
PTPRK-222ENST00000532751 KLHL23Q8NBE8 558 aa24.14■■□□□ 1.45
PTPRK-222ENST00000532751 TMEM161BQ8NDZ6 487 aa24.14■■□□□ 1.45
PTPRK-222ENST00000532751 ZNF558Q96NG5 402 aa24.14■■□□□ 1.45
PTPRK-222ENST00000532751 LRRC27Q9C0I9 530 aa24.14■■□□□ 1.45
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PTPRK-222ENST00000532751 PLXNA4Q9HCM2 1894 aa24.14■■□□□ 1.45
PTPRK-222ENST00000532751 GIT1Q9Y2X7 761 aa24.14■■□□□ 1.45
PTPRK-222ENST00000532751 HES2Q9Y543 173 aa24.14■■□□□ 1.45
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PTPRK-222ENST00000532751 KCNT2Q6UVM3 1135 aa24.13■■□□□ 1.45
PTPRK-222ENST00000532751 DYMQ7RTS9 669 aa24.13■■□□□ 1.45
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PTPRK-222ENST00000532751 FAM193BQ96PV7 902 aaPredicted RBP24.13■■□□□ 1.45
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PTPRK-222ENST00000532751 ALG13Q9NP73 1137 aaKnown RBP24.13■■□□□ 1.45
PTPRK-222ENST00000532751 TBC1D13Q9NVG8 400 aa24.13■■□□□ 1.45
PTPRK-222ENST00000532751 PARP2Q9UGN5 583 aa24.13■■□□□ 1.45
PTPRK-222ENST00000532751 PLAGL2Q9UPG8 496 aa24.13■■□□□ 1.45
PTPRK-222ENST00000532751 TNFSF13BQ9Y275 285 aa24.13■■□□□ 1.45
PTPRK-222ENST00000532751 USP20Q9Y2K6 914 aa24.13■■□□□ 1.45
PTPRK-222ENST00000532751 K7ENM7 598 aa24.12■■□□□ 1.45
PTPRK-222ENST00000532751 ITGB1P05556 798 aa24.12■■□□□ 1.45
PTPRK-222ENST00000532751 MAPTP10636 758 aaKnown RBP24.12■■□□□ 1.45
PTPRK-222ENST00000532751 ABCD1P33897 745 aa24.12■■□□□ 1.45
PTPRK-222ENST00000532751 PPM1AP35813 382 aa24.12■■□□□ 1.45
PTPRK-222ENST00000532751 TIGD5Q53EQ6 642 aa24.12■■□□□ 1.45
PTPRK-222ENST00000532751 RESP18Q5W5W9 173 aa24.12■■□□□ 1.45
PTPRK-222ENST00000532751 TAS1R3Q7RTX0 852 aa24.12■■□□□ 1.45
PTPRK-222ENST00000532751 HAUS6Q7Z4H7 955 aa24.12■■□□□ 1.45
PTPRK-222ENST00000532751 FAM178BQ8IXR5 827 aa24.12■■□□□ 1.45
PTPRK-222ENST00000532751 SLC17A8Q8NDX2 589 aa24.12■■□□□ 1.45
PTPRK-222ENST00000532751 DHX58Q96C10 678 aa24.12■■□□□ 1.45
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PTPRK-222ENST00000532751 RNF39Q9H2S5 420 aa24.12■■□□□ 1.45
PTPRK-222ENST00000532751 ZMYM2Q9UBW7 1377 aa24.12■■□□□ 1.45
PTPRK-222ENST00000532751 MYMKA6NI61 221 aa24.11■■□□□ 1.45
PTPRK-222ENST00000532751 GRM6O15303 877 aa24.11■■□□□ 1.45
PTPRK-222ENST00000532751 ALDH7A1P49419 539 aaKnown RBP24.11■■□□□ 1.45
PTPRK-222ENST00000532751 UBE3AQ05086 875 aa24.11■■□□□ 1.45
PTPRK-222ENST00000532751 EEF1DP3Q658K8 133 aa24.11■■□□□ 1.45
PTPRK-222ENST00000532751 SPPL3Q8TCT6 385 aa24.11■■□□□ 1.45
PTPRK-222ENST00000532751 GAD1Q99259 594 aa24.11■■□□□ 1.45
PTPRK-222ENST00000532751 TNMDQ9H2S6 317 aa24.11■■□□□ 1.45
PTPRK-222ENST00000532751 TRANK1O15050 2925 aa24.11■■□□□ 1.45
PTPRK-222ENST00000532751 ATG2AQ2TAZ0 1938 aa24.1■■□□□ 1.45
PTPRK-222ENST00000532751 ARL5CA6NH57 179 aa24.1■■□□□ 1.45
PTPRK-222ENST00000532751 ZC3H11AO75152 810 aaKnown RBP eCLIP24.1■■□□□ 1.45
PTPRK-222ENST00000532751 FGF18O76093 207 aa24.1■■□□□ 1.45
PTPRK-222ENST00000532751 AKAP5P24588 427 aa24.1■■□□□ 1.45
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