RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000531466.1

PTPRK-220, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type K, humanhuman

TSL 5

Gene PTPRK, Length 311 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRK-220ENST00000531466 ELL2O00472 640 aaPredicted RBP6.77□□□□□ -1.33
PTPRK-220ENST00000531466 JMJD7P0C870 316 aa6.77□□□□□ -1.33
PTPRK-220ENST00000531466 PLA2G5P39877 138 aa6.77□□□□□ -1.33
PTPRK-220ENST00000531466 KRTAP10-11P60412 298 aa6.77□□□□□ -1.33
PTPRK-220ENST00000531466 NHLH2Q02577 135 aa6.77□□□□□ -1.33
PTPRK-220ENST00000531466 BEAN1Q3B7T3 259 aa6.77□□□□□ -1.33
PTPRK-220ENST00000531466 FNDC3BQ53EP0 1204 aaKnown RBP6.77□□□□□ -1.33
PTPRK-220ENST00000531466 CDCA2Q69YH5 1023 aaPredicted RBP6.77□□□□□ -1.33
PTPRK-220ENST00000531466 USP18Q9UMW8 372 aa6.77□□□□□ -1.33
PTPRK-220ENST00000531466 ZSCAN20P17040 1043 aaPredicted RBP6.76□□□□□ -1.33
PTPRK-220ENST00000531466 SEC24CP53992 1094 aa6.76□□□□□ -1.33
PTPRK-220ENST00000531466 RBL2Q08999 1139 aa6.76□□□□□ -1.33
PTPRK-220ENST00000531466 FOXI1Q12951 378 aa6.76□□□□□ -1.33
PTPRK-220ENST00000531466 UBE2R2Q712K3 238 aaPredicted RBP6.76□□□□□ -1.33
PTPRK-220ENST00000531466 GPRIN1Q7Z2K8 1008 aa6.76□□□□□ -1.33
PTPRK-220ENST00000531466 PLXDC1Q8IUK5 500 aa6.76□□□□□ -1.33
PTPRK-220ENST00000531466 SYT12Q8IV01 421 aa6.76□□□□□ -1.33
PTPRK-220ENST00000531466 ZZZ3Q8IYH5 903 aa6.76□□□□□ -1.33
PTPRK-220ENST00000531466 CDYL2Q8N8U2 506 aa6.76□□□□□ -1.33
PTPRK-220ENST00000531466 CPEB3Q8NE35 698 aaKnown RBP6.76□□□□□ -1.33
PTPRK-220ENST00000531466 LINC00476Q8WZB0 136 aa6.76□□□□□ -1.33
PTPRK-220ENST00000531466 FDXACB1Q9BRP7 624 aaPredicted RBP6.76□□□□□ -1.33
PTPRK-220ENST00000531466 DKK2Q9UBU2 259 aa6.76□□□□□ -1.33
PTPRK-220ENST00000531466 INSL6Q9Y581 213 aa6.76□□□□□ -1.33
PTPRK-220ENST00000531466 HKR1P10072 659 aa6.75□□□□□ -1.33
PTPRK-220ENST00000531466 HSP90B1P14625 803 aaKnown RBP6.75□□□□□ -1.33
PTPRK-220ENST00000531466 ATP2A2P16615 1042 aaKnown RBP6.75□□□□□ -1.33
PTPRK-220ENST00000531466 SDSP20132 328 aa6.75□□□□□ -1.33
PTPRK-220ENST00000531466 FLT3P36888 993 aa6.75□□□□□ -1.33
PTPRK-220ENST00000531466 GUCY1B3Q02153 619 aa6.75□□□□□ -1.33
PTPRK-220ENST00000531466 PRR16Q569H4 304 aa6.75□□□□□ -1.33
PTPRK-220ENST00000531466 TAS1R1Q7RTX1 841 aa6.75□□□□□ -1.33
PTPRK-220ENST00000531466 OR10H5Q8NGA6 315 aa6.75□□□□□ -1.33
PTPRK-220ENST00000531466 MKL1Q969V6 931 aa6.75□□□□□ -1.33
PTPRK-220ENST00000531466 FERMT2Q96AC1 680 aa6.75□□□□□ -1.33
PTPRK-220ENST00000531466 USP36Q9P275 1121 aaKnown RBP6.75□□□□□ -1.33
PTPRK-220ENST00000531466 ZNF185O15231 689 aa6.74□□□□□ -1.33
PTPRK-220ENST00000531466 CDK4P11802 303 aa6.74□□□□□ -1.33
PTPRK-220ENST00000531466 CXCR5P32302 372 aa6.74□□□□□ -1.33
PTPRK-220ENST00000531466 BMPR1AP36894 532 aa6.74□□□□□ -1.33
PTPRK-220ENST00000531466 TP53BP2Q13625 1128 aa6.74□□□□□ -1.33
PTPRK-220ENST00000531466 CFAP100Q494V2 611 aa6.74□□□□□ -1.33
PTPRK-220ENST00000531466 PDCD4Q53EL6 469 aaKnown RBP6.74□□□□□ -1.33
PTPRK-220ENST00000531466 ZBTB41Q5SVQ8 909 aa6.74□□□□□ -1.33
PTPRK-220ENST00000531466 BTNL9Q6UXG8 535 aa6.74□□□□□ -1.33
PTPRK-220ENST00000531466 ARMC5Q96C12 935 aa6.74□□□□□ -1.33
PTPRK-220ENST00000531466 COQ10AQ96MF6 247 aa6.74□□□□□ -1.33
PTPRK-220ENST00000531466 ST20-MTHFSA0A0A6YYL1 179 aa6.73□□□□□ -1.33
PTPRK-220ENST00000531466 PIPSLA2A3N6 862 aa6.73□□□□□ -1.33
PTPRK-220ENST00000531466 INO80B-WBP1J3KQ70 363 aa6.73□□□□□ -1.33
PTPRK-220ENST00000531466 SEC24DO94855 1032 aaPredicted RBP6.73□□□□□ -1.33
PTPRK-220ENST00000531466 CD40P25942 277 aa6.73□□□□□ -1.33
PTPRK-220ENST00000531466 MGAT5Q09328 741 aa6.73□□□□□ -1.33
PTPRK-220ENST00000531466 ERCC6LQ2NKX8 1250 aa6.73□□□□□ -1.33
PTPRK-220ENST00000531466 ANKS6Q68DC2 871 aa6.73□□□□□ -1.33
PTPRK-220ENST00000531466 SIMC1Q8NDZ2 872 aa6.73□□□□□ -1.33
PTPRK-220ENST00000531466 PMFBP1Q8TBY8 1022 aa6.73□□□□□ -1.33
PTPRK-220ENST00000531466 ASB10Q8WXI3 467 aa6.73□□□□□ -1.33
PTPRK-220ENST00000531466 INO80BQ9C086 356 aaPredicted RBP6.73□□□□□ -1.33
PTPRK-220ENST00000531466 CLCA2Q9UQC9 943 aa6.73□□□□□ -1.33
PTPRK-220ENST00000531466 MAP3K2Q9Y2U5 619 aa6.73□□□□□ -1.33
PTPRK-220ENST00000531466 DDX6P26196 483 aaKnown RBP eCLIP6.72□□□□□ -1.33
PTPRK-220ENST00000531466 ESPNLQ6ZVH7 1005 aa6.72□□□□□ -1.33
PTPRK-220ENST00000531466 BOLLQ8N9W6 283 aaKnown RBP6.72□□□□□ -1.33
PTPRK-220ENST00000531466 RNF169Q8NCN4 708 aa6.72□□□□□ -1.33
PTPRK-220ENST00000531466 GAB3Q8WWW8 586 aa6.72□□□□□ -1.33
PTPRK-220ENST00000531466 ZNF496Q96IT1 587 aaPredicted RBP6.72□□□□□ -1.33
PTPRK-220ENST00000531466 ADAM2Q99965 735 aa6.72□□□□□ -1.33
PTPRK-220ENST00000531466 MSRAQ9UJ68 235 aa6.72□□□□□ -1.33
PTPRK-220ENST00000531466 ZKSCAN5Q9Y2L8 839 aa6.72□□□□□ -1.33
PTPRK-220ENST00000531466 ZMYM3Q14202 1370 aa6.71□□□□□ -1.33
PTPRK-220ENST00000531466 A0A1W2PR48 441 aa6.71□□□□□ -1.34
PTPRK-220ENST00000531466 PFKMP08237 780 aa6.71□□□□□ -1.34
PTPRK-220ENST00000531466 XPAP23025 273 aaPredicted RBP6.71□□□□□ -1.34
PTPRK-220ENST00000531466 UBE3CQ15386 1083 aa6.71□□□□□ -1.34
PTPRK-220ENST00000531466 SP5Q6BEB4 398 aaPredicted RBP6.71□□□□□ -1.34
PTPRK-220ENST00000531466 LMBR1LQ6UX01 489 aa6.71□□□□□ -1.34
PTPRK-220ENST00000531466 POGKQ9P215 609 aa6.71□□□□□ -1.34
PTPRK-220ENST00000531466 DIRC3C9JPN6 131 aa6.7□□□□□ -1.34
PTPRK-220ENST00000531466 PPP1R12AO14974 1030 aaPredicted RBP6.7□□□□□ -1.34
PTPRK-220ENST00000531466 SPDEFO95238 335 aa6.7□□□□□ -1.34
PTPRK-220ENST00000531466 APBA1Q02410 837 aa6.7□□□□□ -1.34
PTPRK-220ENST00000531466 LRRC32Q14392 662 aa6.7□□□□□ -1.34
PTPRK-220ENST00000531466 PAPD7Q5XG87 772 aaKnown RBP6.7□□□□□ -1.34
PTPRK-220ENST00000531466 DRICH1Q6PGQ1 229 aaPredicted RBP6.7□□□□□ -1.34
PTPRK-220ENST00000531466 NXPE1Q8N323 547 aa6.7□□□□□ -1.34
PTPRK-220ENST00000531466 IFT57Q9NWB7 429 aa6.7□□□□□ -1.34
PTPRK-220ENST00000531466 USP15Q9Y4E8 981 aaPredicted RBP6.7□□□□□ -1.34
PTPRK-220ENST00000531466 LCHNA4D1U4 455 aa6.69□□□□□ -1.34
PTPRK-220ENST00000531466 NRP2O60462 931 aa6.69□□□□□ -1.34
PTPRK-220ENST00000531466 HLA-DOAP06340 250 aa6.69□□□□□ -1.34
PTPRK-220ENST00000531466 CLEC2LP0C7M8 214 aa6.69□□□□□ -1.34
PTPRK-220ENST00000531466 SPATA31D3P0C874 917 aa6.69□□□□□ -1.34
PTPRK-220ENST00000531466 NRG3P56975 720 aa6.69□□□□□ -1.34
PTPRK-220ENST00000531466 PPARAQ07869 468 aa6.69□□□□□ -1.34
PTPRK-220ENST00000531466 SQSTM1Q13501 440 aa6.69□□□□□ -1.34
PTPRK-220ENST00000531466 ABHD17BQ5VST6 288 aa6.69□□□□□ -1.34
PTPRK-220ENST00000531466 EFCAB12Q6NXP0 572 aa6.69□□□□□ -1.34
PTPRK-220ENST00000531466 SPATA31D4Q6ZUB0 917 aa6.69□□□□□ -1.34
PTPRK-220ENST00000531466 SLC44A3Q8N4M1 653 aa6.69□□□□□ -1.34
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