RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000527644.1

TSPAN4-217, Transcript of tetraspanin 4, humanhuman

TSL 2

Gene TSPAN4, Length 968 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSPAN4-217ENST00000527644 CTC1Q2NKJ3 1217 aa29.08■■■□□ 2.25
TSPAN4-217ENST00000527644 CDR2LQ86X02 465 aaPredicted RBP29.08■■■□□ 2.25
TSPAN4-217ENST00000527644 KIFC3Q9BVG8 833 aa29.08■■■□□ 2.25
TSPAN4-217ENST00000527644 CLDND1Q9NY35 253 aa29.08■■■□□ 2.25
TSPAN4-217ENST00000527644 GIT1Q9Y2X7 761 aa29.08■■■□□ 2.25
TSPAN4-217ENST00000527644 FSCN2O14926 492 aa29.07■■■□□ 2.24
TSPAN4-217ENST00000527644 N4BP3O15049 544 aa29.07■■■□□ 2.24
TSPAN4-217ENST00000527644 INPPL1O15357 1258 aa29.07■■■□□ 2.24
TSPAN4-217ENST00000527644 HSP90AA1P07900 732 aaKnown RBP29.07■■■□□ 2.24
TSPAN4-217ENST00000527644 PDIA4P13667 645 aaKnown RBP29.07■■■□□ 2.24
TSPAN4-217ENST00000527644 AFF1P51825 1210 aaKnown RBP29.07■■■□□ 2.24
TSPAN4-217ENST00000527644 SLC12A3P55017 1021 aa29.07■■■□□ 2.24
TSPAN4-217ENST00000527644 PEX3P56589 373 aa29.07■■■□□ 2.24
TSPAN4-217ENST00000527644 DMP1Q13316 513 aaPredicted RBP29.07■■■□□ 2.24
TSPAN4-217ENST00000527644 TMEM132AQ24JP5 1023 aa29.07■■■□□ 2.24
TSPAN4-217ENST00000527644 EP400NLQ6ZTU2 488 aa29.07■■■□□ 2.24
TSPAN4-217ENST00000527644 ADAMTS19Q8TE59 1207 aa29.07■■■□□ 2.24
TSPAN4-217ENST00000527644 FAM193BQ96PV7 902 aaPredicted RBP29.07■■■□□ 2.24
TSPAN4-217ENST00000527644 NXF3Q9H4D5 531 aaKnown RBP29.07■■■□□ 2.24
TSPAN4-217ENST00000527644 IGFLR1Q9H665 355 aa29.07■■■□□ 2.24
TSPAN4-217ENST00000527644 CCDC169A6NNP5 214 aa29.06■■■□□ 2.24
TSPAN4-217ENST00000527644 NT5C1B-RDH14C9J2C7 533 aa29.06■■■□□ 2.24
TSPAN4-217ENST00000527644 K7ERI5 159 aa29.06■■■□□ 2.24
TSPAN4-217ENST00000527644 GALTP07902 379 aa29.06■■■□□ 2.24
TSPAN4-217ENST00000527644 LIG1P18858 919 aa29.06■■■□□ 2.24
TSPAN4-217ENST00000527644 NPTX2P47972 431 aa29.06■■■□□ 2.24
TSPAN4-217ENST00000527644 MAPK7Q13164 816 aa29.06■■■□□ 2.24
TSPAN4-217ENST00000527644 ADGRD2Q7Z7M1 963 aa29.06■■■□□ 2.24
TSPAN4-217ENST00000527644 ZNF280BQ86YH2 543 aa29.06■■■□□ 2.24
TSPAN4-217ENST00000527644 TMEM169Q96HH4 297 aa29.06■■■□□ 2.24
TSPAN4-217ENST00000527644 GAD1Q99259 594 aa29.06■■■□□ 2.24
TSPAN4-217ENST00000527644 GBP3Q9H0R5 595 aa29.06■■■□□ 2.24
TSPAN4-217ENST00000527644 PDZD7Q9H5P4 517 aa29.06■■■□□ 2.24
TSPAN4-217ENST00000527644 NGRNQ9NPE2 291 aaKnown RBP29.06■■■□□ 2.24
TSPAN4-217ENST00000527644 KCNG1Q9UIX4 513 aa29.06■■■□□ 2.24
TSPAN4-217ENST00000527644 PCDHGC5Q9Y5F6 944 aa29.06■■■□□ 2.24
TSPAN4-217ENST00000527644 SRPRBQ9Y5M8 271 aaKnown RBP29.06■■■□□ 2.24
TSPAN4-217ENST00000527644 PHLPP2Q6ZVD8 1323 aa29.05■■■□□ 2.24
TSPAN4-217ENST00000527644 ARL5CA6NH57 179 aa29.05■■■□□ 2.24
TSPAN4-217ENST00000527644 TTLL13PA6NNM8 815 aa29.05■■■□□ 2.24
TSPAN4-217ENST00000527644 POMCP01189 267 aa29.05■■■□□ 2.24
TSPAN4-217ENST00000527644 MARCKSP29966 332 aaPredicted RBP29.05■■■□□ 2.24
TSPAN4-217ENST00000527644 GTF2F1P35269 517 aaKnown RBP eCLIP29.05■■■□□ 2.246e-7■■■■■ 38.6
TSPAN4-217ENST00000527644 RASSF8Q8NHQ8 419 aa29.05■■■□□ 2.24
TSPAN4-217ENST00000527644 TCF25Q9BQ70 676 aa29.05■■■□□ 2.24
TSPAN4-217ENST00000527644 TMEM175Q9BSA9 504 aa29.05■■■□□ 2.24
TSPAN4-217ENST00000527644 APOL6Q9BWW8 343 aa29.05■■■□□ 2.24
TSPAN4-217ENST00000527644 CCSER1Q9C0I3 900 aa29.05■■■□□ 2.24
TSPAN4-217ENST00000527644 TMEM134Q9H6X4 195 aa29.05■■■□□ 2.24
TSPAN4-217ENST00000527644 DNAJB4Q9UDY4 337 aa29.05■■■□□ 2.24
TSPAN4-217ENST00000527644 RBM19Q9Y4C8 960 aaKnown RBP29.05■■■□□ 2.24
TSPAN4-217ENST00000527644 MORC2Q9Y6X9 1032 aaPredicted RBP29.05■■■□□ 2.24
TSPAN4-217ENST00000527644 DDHD2O94830 711 aa29.04■■■□□ 2.24
TSPAN4-217ENST00000527644 MLH1P40692 756 aa29.04■■■□□ 2.24
TSPAN4-217ENST00000527644 NRIP1P48552 1158 aa29.04■■■□□ 2.24
TSPAN4-217ENST00000527644 CEBPZQ03701 1054 aaKnown RBP29.04■■■□□ 2.24
TSPAN4-217ENST00000527644 ADAM15Q13444 863 aa29.04■■■□□ 2.24
TSPAN4-217ENST00000527644 EFHBQ8N7U6 833 aa29.04■■■□□ 2.24
TSPAN4-217ENST00000527644 IGSF21Q96ID5 467 aa29.04■■■□□ 2.24
TSPAN4-217ENST00000527644 ADPGKQ9BRR6 497 aa29.04■■■□□ 2.24
TSPAN4-217ENST00000527644 TLE6Q9H808 572 aa29.04■■■□□ 2.24
TSPAN4-217ENST00000527644 KMT5AQ9NQR1 393 aa29.04■■■□□ 2.24
TSPAN4-217ENST00000527644 ENTPD7Q9NQZ7 604 aa29.04■■■□□ 2.24
TSPAN4-217ENST00000527644 FBXO2Q9UK22 296 aaPredicted RBP29.04■■■□□ 2.24
TSPAN4-217ENST00000527644 ZMYM2Q9UBW7 1377 aa29.03■■■□□ 2.24
TSPAN4-217ENST00000527644 H3BQ06 376 aaPredicted RBP29.03■■■□□ 2.24
TSPAN4-217ENST00000527644 ALDH2P05091 517 aa29.03■■■□□ 2.24
TSPAN4-217ENST00000527644 EDN1P05305 212 aa29.03■■■□□ 2.24
TSPAN4-217ENST00000527644 AKAP5P24588 427 aa29.03■■■□□ 2.24
TSPAN4-217ENST00000527644 LTBRP36941 435 aa29.03■■■□□ 2.24
TSPAN4-217ENST00000527644 SLC11A1P49279 550 aa29.03■■■□□ 2.24
TSPAN4-217ENST00000527644 KARSQ15046 597 aaKnown RBP29.03■■■□□ 2.24
TSPAN4-217ENST00000527644 PUS10Q3MIT2 529 aaKnown RBP29.03■■■□□ 2.24
TSPAN4-217ENST00000527644 PLPP4Q5VZY2 271 aa29.03■■■□□ 2.24
TSPAN4-217ENST00000527644 TMC7Q7Z402 723 aa29.03■■■□□ 2.24
TSPAN4-217ENST00000527644 RBM23Q86U06 439 aaKnown RBP29.03■■■□□ 2.24
TSPAN4-217ENST00000527644 GADD45GIP1Q8TAE8 222 aaPredicted RBP29.03■■■□□ 2.24
TSPAN4-217ENST00000527644 USP28Q96RU2 1077 aa29.03■■■□□ 2.24
TSPAN4-217ENST00000527644 UHRF1Q96T88 793 aaPredicted RBP29.03■■■□□ 2.24
TSPAN4-217ENST00000527644 CDCA3Q99618 268 aaPredicted RBP29.03■■■□□ 2.24
TSPAN4-217ENST00000527644 NTPCRQ9BSD7 190 aaKnown RBP29.03■■■□□ 2.24
TSPAN4-217ENST00000527644 ARHGAP28Q9P2N2 729 aa29.03■■■□□ 2.24
TSPAN4-217ENST00000527644 FSD2A1L4K1 749 aa29.02■■■□□ 2.24
TSPAN4-217ENST00000527644 SFI1A8K8P3 1242 aa29.02■■■□□ 2.24
TSPAN4-217ENST00000527644 B4GALT3O60512 393 aa29.02■■■□□ 2.24
TSPAN4-217ENST00000527644 PLS3P13797 630 aa29.02■■■□□ 2.24
TSPAN4-217ENST00000527644 PLCG1P19174 1290 aa29.02■■■□□ 2.24
TSPAN4-217ENST00000527644 RAD51AP2Q09MP3 1159 aa29.02■■■□□ 2.24
TSPAN4-217ENST00000527644 BMS1Q14692 1282 aaKnown RBP29.02■■■□□ 2.24
TSPAN4-217ENST00000527644 SLC39A14Q15043 492 aa29.02■■■□□ 2.24
TSPAN4-217ENST00000527644 NT5DC1Q5TFE4 455 aa29.02■■■□□ 2.24
TSPAN4-217ENST00000527644 TMEM173Q86WV6 379 aaPredicted RBP29.02■■■□□ 2.24
TSPAN4-217ENST00000527644 SPIRE2Q8WWL2 714 aa29.02■■■□□ 2.24
TSPAN4-217ENST00000527644 ZFP42Q96MM3 310 aa29.02■■■□□ 2.24
TSPAN4-217ENST00000527644 BLOC1S4Q9NUP1 217 aa29.02■■■□□ 2.24
TSPAN4-217ENST00000527644 PARP2Q9UGN5 583 aa29.02■■■□□ 2.24
TSPAN4-217ENST00000527644 USP20Q9Y2K6 914 aa29.02■■■□□ 2.24
TSPAN4-217ENST00000527644 FAN1Q9Y2M0 1017 aa29.02■■■□□ 2.24
TSPAN4-217ENST00000527644 TCF20Q9UGU0 1960 aaKnown RBP29.01■■■□□ 2.23
TSPAN4-217ENST00000527644 SCNN1GP51170 649 aa29.01■■■□□ 2.23
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 21.7 ms