RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000515712.1

ACTBP2-201, Transcript of actin, beta pseudogene 2, humanhuman

BASIC

Gene ACTBP2, Length 1,123 nt, Biotype processed pseudogene.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTBP2-201ENST00000515712 SF3A1Q15459 793 aaKnown RBP12.31□□□□□ -0.44
ACTBP2-201ENST00000515712 FAM187BQ17R55 369 aa12.31□□□□□ -0.44
ACTBP2-201ENST00000515712 DCAF4L1Q3SXM0 396 aa12.31□□□□□ -0.44
ACTBP2-201ENST00000515712 ELMSAN1Q6PJG2 1045 aa12.31□□□□□ -0.44
ACTBP2-201ENST00000515712 AGMOQ6ZNB7 445 aa12.31□□□□□ -0.44
ACTBP2-201ENST00000515712 LRRC55Q6ZSA7 311 aa12.31□□□□□ -0.44
ACTBP2-201ENST00000515712 SLC39A11Q8N1S5 342 aa12.31□□□□□ -0.44
ACTBP2-201ENST00000515712 EIF2AQ9BY44 585 aaKnown RBP12.31□□□□□ -0.44
ACTBP2-201ENST00000515712 KMT5AQ9NQR1 393 aa12.31□□□□□ -0.44
ACTBP2-201ENST00000515712 FOXD4L1Q9NU39 408 aa12.31□□□□□ -0.44
ACTBP2-201ENST00000515712 HCSTQ9UBK5 93 aa12.31□□□□□ -0.44
ACTBP2-201ENST00000515712 CCDC39Q9UFE4 941 aa12.31□□□□□ -0.44
ACTBP2-201ENST00000515712 CD207Q9UJ71 328 aa12.31□□□□□ -0.44
ACTBP2-201ENST00000515712 SSX2IPQ9Y2D8 614 aa12.31□□□□□ -0.44
ACTBP2-201ENST00000515712 FAN1Q9Y2M0 1017 aa12.31□□□□□ -0.44
ACTBP2-201ENST00000515712 ZMYM2Q9UBW7 1377 aa12.3□□□□□ -0.44
ACTBP2-201ENST00000515712 A0A1B0GUA9 196 aa12.3□□□□□ -0.44
ACTBP2-201ENST00000515712 NT5C1B-RDH14C9J2C7 533 aa12.3□□□□□ -0.44
ACTBP2-201ENST00000515712 POMCP01189 267 aa12.3□□□□□ -0.44
ACTBP2-201ENST00000515712 SYT1P21579 422 aa12.3□□□□□ -0.44
ACTBP2-201ENST00000515712 SCP2P22307 547 aa12.3□□□□□ -0.44
ACTBP2-201ENST00000515712 DNAJB1P25685 340 aa12.3□□□□□ -0.44
ACTBP2-201ENST00000515712 CDC25AP30304 524 aa12.3□□□□□ -0.44
ACTBP2-201ENST00000515712 ABCD1P33897 745 aa12.3□□□□□ -0.44
ACTBP2-201ENST00000515712 IRS1P35568 1242 aa12.3□□□□□ -0.44
ACTBP2-201ENST00000515712 PBX3P40426 434 aa12.3□□□□□ -0.44
ACTBP2-201ENST00000515712 OR1G1P47890 313 aa12.3□□□□□ -0.44
ACTBP2-201ENST00000515712 PEX3P56589 373 aa12.3□□□□□ -0.44
ACTBP2-201ENST00000515712 ECM1Q16610 540 aa12.3□□□□□ -0.44
ACTBP2-201ENST00000515712 UBXN11Q5T124 520 aa12.3□□□□□ -0.44
ACTBP2-201ENST00000515712 VPS52Q8N1B4 723 aa12.3□□□□□ -0.44
ACTBP2-201ENST00000515712 SNX21Q969T3 373 aa12.3□□□□□ -0.44
ACTBP2-201ENST00000515712 TCHPQ9BT92 498 aa12.3□□□□□ -0.44
ACTBP2-201ENST00000515712 FZD8Q9H461 694 aa12.3□□□□□ -0.44
ACTBP2-201ENST00000515712 NRDE2Q9H7Z3 1164 aa12.3□□□□□ -0.44
ACTBP2-201ENST00000515712 LARSQ9P2J5 1176 aaKnown RBP12.3□□□□□ -0.44
ACTBP2-201ENST00000515712 KIAA1671Q9BY89 1806 aa12.3□□□□□ -0.44
ACTBP2-201ENST00000515712 ZC3H11BA0A1B0GUI2 810 aaPredicted RBP12.29□□□□□ -0.44
ACTBP2-201ENST00000515712 ARL5CA6NH57 179 aa12.29□□□□□ -0.44
ACTBP2-201ENST00000515712 B4GALT5O43286 388 aa12.29□□□□□ -0.44
ACTBP2-201ENST00000515712 STX6O43752 255 aa12.29□□□□□ -0.44
ACTBP2-201ENST00000515712 HIP1RO75146 1068 aa12.29□□□□□ -0.44
ACTBP2-201ENST00000515712 CXCL14O95715 111 aa12.29□□□□□ -0.44
ACTBP2-201ENST00000515712 URODP06132 367 aa12.29□□□□□ -0.44
ACTBP2-201ENST00000515712 GALTP07902 379 aa12.29□□□□□ -0.44
ACTBP2-201ENST00000515712 PLA2G4BP0C869 781 aa12.29□□□□□ -0.44
ACTBP2-201ENST00000515712 GUCY2CP25092 1073 aa12.29□□□□□ -0.44
ACTBP2-201ENST00000515712 YARSP54577 528 aaKnown RBP12.29□□□□□ -0.44
ACTBP2-201ENST00000515712 ERVFC1P60507 584 aa12.29□□□□□ -0.44
ACTBP2-201ENST00000515712 GRIK3Q13003 919 aa12.29□□□□□ -0.44
ACTBP2-201ENST00000515712 ADAM15Q13444 863 aa12.29□□□□□ -0.44
ACTBP2-201ENST00000515712 SMAD4Q13485 552 aaKnown RBP12.29□□□□□ -0.44
ACTBP2-201ENST00000515712 CAMK1Q14012 370 aa12.29□□□□□ -0.44
ACTBP2-201ENST00000515712 IL17AQ16552 155 aa12.29□□□□□ -0.44
ACTBP2-201ENST00000515712 AMHR2Q16671 573 aa12.29□□□□□ -0.44
ACTBP2-201ENST00000515712 HYIQ5T013 277 aa12.29□□□□□ -0.44
ACTBP2-201ENST00000515712 ATF7IP2Q5U623 682 aa12.29□□□□□ -0.44
ACTBP2-201ENST00000515712 KIAA1841Q6NSI8 718 aa12.29□□□□□ -0.44
ACTBP2-201ENST00000515712 RINT1Q6NUQ1 792 aa12.29□□□□□ -0.44
ACTBP2-201ENST00000515712 DDX53Q86TM3 631 aaKnown RBP12.29□□□□□ -0.44
ACTBP2-201ENST00000515712 SYT2Q8N9I0 419 aaPredicted RBP12.29□□□□□ -0.44
ACTBP2-201ENST00000515712 SMG8Q8ND04 991 aaKnown RBP12.29□□□□□ -0.44
ACTBP2-201ENST00000515712 IGSF21Q96ID5 467 aa12.29□□□□□ -0.44
ACTBP2-201ENST00000515712 ZNF396Q96N95 335 aaPredicted RBP12.29□□□□□ -0.44
ACTBP2-201ENST00000515712 GAD1Q99259 594 aa12.29□□□□□ -0.44
ACTBP2-201ENST00000515712 PLIN2Q99541 437 aa12.29□□□□□ -0.44
ACTBP2-201ENST00000515712 COLEC11Q9BWP8 271 aa12.29□□□□□ -0.44
ACTBP2-201ENST00000515712 EMILIN2Q9BXX0 1053 aa12.29□□□□□ -0.44
ACTBP2-201ENST00000515712 MRPL4Q9BYD3 311 aaKnown RBP12.29□□□□□ -0.44
ACTBP2-201ENST00000515712 NXF3Q9H4D5 531 aaKnown RBP12.29□□□□□ -0.44
ACTBP2-201ENST00000515712 TOPORSQ9NS56 1045 aaPredicted RBP12.29□□□□□ -0.44
ACTBP2-201ENST00000515712 PRKAG3Q9UGI9 489 aa12.29□□□□□ -0.44
ACTBP2-201ENST00000515712 GRXCR2A6NFK2 248 aa12.28□□□□□ -0.44
ACTBP2-201ENST00000515712 MEIS3P2A8K0S8 358 aa12.28□□□□□ -0.44
ACTBP2-201ENST00000515712 FSCN2O14926 492 aa12.28□□□□□ -0.44
ACTBP2-201ENST00000515712 PER2O15055 1255 aa12.28□□□□□ -0.44
ACTBP2-201ENST00000515712 TBCAO75347 108 aaKnown RBP12.28□□□□□ -0.44
ACTBP2-201ENST00000515712 FAM13AO94988 1023 aa12.28□□□□□ -0.44
ACTBP2-201ENST00000515712 AKAP5P24588 427 aa12.28□□□□□ -0.44
ACTBP2-201ENST00000515712 MATR3P43243 847 aaKnown RBP eCLIP12.28□□□□□ -0.44
ACTBP2-201ENST00000515712 NPTX2P47972 431 aa12.28□□□□□ -0.44
ACTBP2-201ENST00000515712 SLC11A1P49279 550 aa12.28□□□□□ -0.44
ACTBP2-201ENST00000515712 SCNN1GP51170 649 aa12.28□□□□□ -0.44
ACTBP2-201ENST00000515712 COL19A1Q14993 1142 aa12.28□□□□□ -0.44
ACTBP2-201ENST00000515712 CLUL1Q15846 466 aa12.28□□□□□ -0.44
ACTBP2-201ENST00000515712 DUSP6Q16828 381 aa12.28□□□□□ -0.44
ACTBP2-201ENST00000515712 CTC1Q2NKJ3 1217 aa12.28□□□□□ -0.44
ACTBP2-201ENST00000515712 TPRNQ4KMQ1 711 aa12.28□□□□□ -0.44
ACTBP2-201ENST00000515712 ADGRD2Q7Z7M1 963 aa12.28□□□□□ -0.44
ACTBP2-201ENST00000515712 PPFIBP1Q86W92 1011 aa12.28□□□□□ -0.44
ACTBP2-201ENST00000515712 CDR2LQ86X02 465 aaPredicted RBP12.28□□□□□ -0.44
ACTBP2-201ENST00000515712 GADD45GIP1Q8TAE8 222 aaPredicted RBP12.28□□□□□ -0.44
ACTBP2-201ENST00000515712 CASP10Q92851 521 aa12.28□□□□□ -0.44
ACTBP2-201ENST00000515712 BICD1Q96G01 975 aa12.28□□□□□ -0.44
ACTBP2-201ENST00000515712 RUSC1Q9BVN2 902 aa12.28□□□□□ -0.44
ACTBP2-201ENST00000515712 CCDC94Q9BW85 323 aaPredicted RBP12.28□□□□□ -0.44
ACTBP2-201ENST00000515712 PDZD7Q9H5P4 517 aa12.28□□□□□ -0.44
ACTBP2-201ENST00000515712 TMEM134Q9H6X4 195 aa12.28□□□□□ -0.44
ACTBP2-201ENST00000515712 MRPL17Q9NRX2 175 aaKnown RBP12.28□□□□□ -0.44
ACTBP2-201ENST00000515712 DPP7Q9UHL4 492 aa12.28□□□□□ -0.44
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 64.1 ms