RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000513595.1

FOXD1-201, Transcript of forkhead box D1, humanhuman

TSL 3

Gene FOXD1, Length 406 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXD1-201ENST00000513595 ANKEF1Q9NU02 776 aa14.7□□□□□ -0.06
FOXD1-201ENST00000513595 EXOC1Q9NV70 894 aa14.7□□□□□ -0.06
FOXD1-201ENST00000513595 LOXHD1Q8IVV2 1947 aa14.7□□□□□ -0.06
FOXD1-201ENST00000513595 FRYLO94915 3013 aa14.69□□□□□ -0.06
FOXD1-201ENST00000513595 C5orf67F2Z3F1 127 aa14.69□□□□□ -0.06
FOXD1-201ENST00000513595 KLRC4O43908 158 aa14.69□□□□□ -0.06
FOXD1-201ENST00000513595 CSPG5O95196 566 aa14.69□□□□□ -0.06
FOXD1-201ENST00000513595 ARIH2O95376 493 aa14.69□□□□□ -0.06
FOXD1-201ENST00000513595 GH1P01241 217 aa14.69□□□□□ -0.06
FOXD1-201ENST00000513595 CASP1P29466 404 aa14.69□□□□□ -0.06
FOXD1-201ENST00000513595 PPP1R2P41236 205 aa14.69□□□□□ -0.06
FOXD1-201ENST00000513595 ZNF165P49910 485 aa14.69□□□□□ -0.06
FOXD1-201ENST00000513595 CHMP4BP1P59074 171 aa14.69□□□□□ -0.06
FOXD1-201ENST00000513595 LAMC2Q13753 1193 aa14.69□□□□□ -0.06
FOXD1-201ENST00000513595 DSG2Q14126 1118 aa14.69□□□□□ -0.06
FOXD1-201ENST00000513595 MBTPS1Q14703 1052 aa14.69□□□□□ -0.06
FOXD1-201ENST00000513595 LY6KQ17RY6 165 aa14.69□□□□□ -0.06
FOXD1-201ENST00000513595 UVSSAQ2YD98 709 aa14.69□□□□□ -0.06
FOXD1-201ENST00000513595 DPCR1Q3MIW9 517 aa14.69□□□□□ -0.06
FOXD1-201ENST00000513595 ZNF658Q5TYW1 1059 aaPredicted RBP14.69□□□□□ -0.06
FOXD1-201ENST00000513595 FAM160B1Q5W0V3 765 aa14.69□□□□□ -0.06
FOXD1-201ENST00000513595 OTUD6AQ7L8S5 288 aa14.69□□□□□ -0.06
FOXD1-201ENST00000513595 CCDC65Q8IXS2 484 aa14.69□□□□□ -0.06
FOXD1-201ENST00000513595 DHX37Q8IY37 1157 aaKnown RBP14.69□□□□□ -0.06
FOXD1-201ENST00000513595 TOP1MTQ969P6 601 aa14.69□□□□□ -0.06
FOXD1-201ENST00000513595 RBSNQ9H1K0 784 aa14.69□□□□□ -0.06
FOXD1-201ENST00000513595 DNAJC25Q9H1X3 360 aa14.69□□□□□ -0.06
FOXD1-201ENST00000513595 BHMT2Q9H2M3 363 aa14.69□□□□□ -0.06
FOXD1-201ENST00000513595 GRPEL1Q9HAV7 217 aa14.69□□□□□ -0.06
FOXD1-201ENST00000513595 GABBR1Q9UBS5 961 aa14.69□□□□□ -0.06
FOXD1-201ENST00000513595 IGSF9BQ9UPX0 1349 aa14.68□□□□□ -0.06
FOXD1-201ENST00000513595 IGKV6D-21A0A0A0MT36 114 aa14.68□□□□□ -0.06
FOXD1-201ENST00000513595 ARHGEF35A5YM69 484 aa14.68□□□□□ -0.06
FOXD1-201ENST00000513595 NOP56O00567 594 aaKnown RBP14.68□□□□□ -0.06
FOXD1-201ENST00000513595 BACH1O14867 736 aa14.68□□□□□ -0.06
FOXD1-201ENST00000513595 LINC01565O15544 149 aa14.68□□□□□ -0.06
FOXD1-201ENST00000513595 RB1P06400 928 aa14.68□□□□□ -0.06
FOXD1-201ENST00000513595 YWHABP31946 246 aaKnown RBP14.68□□□□□ -0.06
FOXD1-201ENST00000513595 GTF2F1P35269 517 aaKnown RBP eCLIP14.68□□□□□ -0.06
FOXD1-201ENST00000513595 PSMD2Q13200 908 aa14.68□□□□□ -0.06
FOXD1-201ENST00000513595 TRIM71Q2Q1W2 868 aaKnown RBP14.68□□□□□ -0.06
FOXD1-201ENST00000513595 KMT5BQ4FZB7 885 aa14.68□□□□□ -0.06
FOXD1-201ENST00000513595 C11orf57Q6ZUT1 292 aaPredicted RBP14.68□□□□□ -0.06
FOXD1-201ENST00000513595 ZBTB33Q86T24 672 aa14.68□□□□□ -0.06
FOXD1-201ENST00000513595 TMEM105Q8N8V8 129 aa14.68□□□□□ -0.06
FOXD1-201ENST00000513595 DBF4BQ8NFT6 615 aa14.68□□□□□ -0.06
FOXD1-201ENST00000513595 PIGOQ8TEQ8 1089 aa14.68□□□□□ -0.06
FOXD1-201ENST00000513595 EMID1Q96A84 441 aaPredicted RBP14.68□□□□□ -0.06
FOXD1-201ENST00000513595 RPGRIP1Q96KN7 1286 aa14.68□□□□□ -0.06
FOXD1-201ENST00000513595 RIPOR3Q96MK2 946 aa14.68□□□□□ -0.06
FOXD1-201ENST00000513595 CCDC43Q96MW1 224 aaKnown RBP14.68□□□□□ -0.06
FOXD1-201ENST00000513595 TIPINQ9BVW5 301 aa14.68□□□□□ -0.06
FOXD1-201ENST00000513595 ZNF302Q9NR11 478 aa14.68□□□□□ -0.06
FOXD1-201ENST00000513595 WRAP73Q9P2S5 460 aaPredicted RBP14.68□□□□□ -0.06
FOXD1-201ENST00000513595 GSTTP1A0A1W2PQM5 241 aa14.67□□□□□ -0.06
FOXD1-201ENST00000513595 GRM6O15303 877 aa14.67□□□□□ -0.06
FOXD1-201ENST00000513595 KRT18P05783 430 aaKnown RBP14.67□□□□□ -0.06
FOXD1-201ENST00000513595 NDUFV1P49821 464 aa14.67□□□□□ -0.06
FOXD1-201ENST00000513595 SP4Q02446 784 aa14.67□□□□□ -0.06
FOXD1-201ENST00000513595 COASYQ13057 564 aa14.67□□□□□ -0.06
FOXD1-201ENST00000513595 PTK7Q13308 1070 aa14.67□□□□□ -0.06
FOXD1-201ENST00000513595 UGCGQ16739 394 aa14.67□□□□□ -0.06
FOXD1-201ENST00000513595 XKR3Q5GH77 459 aa14.67□□□□□ -0.06
FOXD1-201ENST00000513595 ZNF618Q5T7W0 954 aa14.67□□□□□ -0.06
FOXD1-201ENST00000513595 SWSAP1Q6NVH7 229 aa14.67□□□□□ -0.06
FOXD1-201ENST00000513595 DYMQ7RTS9 669 aa14.67□□□□□ -0.06
FOXD1-201ENST00000513595 CCDC60Q8IWA6 550 aaPredicted RBP14.67□□□□□ -0.06
FOXD1-201ENST00000513595 SMRP1Q8NCR6 262 aa14.67□□□□□ -0.06
FOXD1-201ENST00000513595 COPS5Q92905 334 aa14.67□□□□□ -0.06
FOXD1-201ENST00000513595 DNAJC19Q96DA6 116 aa14.67□□□□□ -0.06
FOXD1-201ENST00000513595 SPATA33Q96N06 139 aa14.67□□□□□ -0.06
FOXD1-201ENST00000513595 GPR20Q99678 358 aa14.67□□□□□ -0.06
FOXD1-201ENST00000513595 HINFPQ9BQA5 517 aa14.67□□□□□ -0.06
FOXD1-201ENST00000513595 C11orf84Q9BUA3 381 aaPredicted RBP14.67□□□□□ -0.06
FOXD1-201ENST00000513595 PHF7Q9BWX1 381 aaPredicted RBP14.67□□□□□ -0.06
FOXD1-201ENST00000513595 BCAS3Q9H6U6 928 aa14.67□□□□□ -0.06
FOXD1-201ENST00000513595 CBX8Q9HC52 389 aa14.67□□□□□ -0.06
FOXD1-201ENST00000513595 GTF2IRD1Q9UHL9 959 aa14.67□□□□□ -0.06
FOXD1-201ENST00000513595 PPME1Q9Y570 386 aa14.67□□□□□ -0.06
FOXD1-201ENST00000513595 MAFBQ9Y5Q3 323 aaPredicted RBP14.67□□□□□ -0.06
FOXD1-201ENST00000513595 EMSYQ7Z589 1322 aa14.66□□□□□ -0.06
FOXD1-201ENST00000513595 TRIP12Q14669 1992 aaPredicted RBP14.66□□□□□ -0.06
FOXD1-201ENST00000513595 FRMD3A2A2Y4 597 aa14.66□□□□□ -0.06
FOXD1-201ENST00000513595 SMTNL1A8MU46 457 aa14.66□□□□□ -0.06
FOXD1-201ENST00000513595 IDEP14735 1019 aa14.66□□□□□ -0.06
FOXD1-201ENST00000513595 GAP43P17677 238 aa14.66□□□□□ -0.06
FOXD1-201ENST00000513595 BMP6P22004 513 aa14.66□□□□□ -0.06
FOXD1-201ENST00000513595 GUCY2CP25092 1073 aa14.66□□□□□ -0.06
FOXD1-201ENST00000513595 ERCC5P28715 1186 aaPredicted RBP14.66□□□□□ -0.06
FOXD1-201ENST00000513595 RARRES1P49788 294 aa14.66□□□□□ -0.06
FOXD1-201ENST00000513595 SLC26A2P50443 739 aa14.66□□□□□ -0.06
FOXD1-201ENST00000513595 PRKCEQ02156 737 aa14.66□□□□□ -0.06
FOXD1-201ENST00000513595 ARHGAP1Q07960 439 aa14.66□□□□□ -0.06
FOXD1-201ENST00000513595 STIM1Q13586 685 aa14.66□□□□□ -0.06
FOXD1-201ENST00000513595 PTPN21Q16825 1174 aa14.66□□□□□ -0.06
FOXD1-201ENST00000513595 COBLL1Q53SF7 1204 aa14.66□□□□□ -0.06
FOXD1-201ENST00000513595 ISM2Q6H9L7 571 aa14.66□□□□□ -0.06
FOXD1-201ENST00000513595 RINT1Q6NUQ1 792 aa14.66□□□□□ -0.06
FOXD1-201ENST00000513595 C1orf186Q6ZWK4 172 aa14.66□□□□□ -0.06
FOXD1-201ENST00000513595 RNF214Q8ND24 703 aa14.66□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 26 ms