RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000505941.5

SH3BP2-210, Transcript of SH3 domain binding protein 2, humanhuman

TSL 2

Gene SH3BP2, Length 917 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP2-210ENST00000505941 KARSQ15046 597 aaKnown RBP23.23■■□□□ 1.31
SH3BP2-210ENST00000505941 FOXD4L5Q5VV16 416 aaPredicted RBP23.23■■□□□ 1.31
SH3BP2-210ENST00000505941 KRI1Q8N9T8 703 aaKnown RBP23.23■■□□□ 1.31
SH3BP2-210ENST00000505941 SMG8Q8ND04 991 aaKnown RBP23.23■■□□□ 1.31
SH3BP2-210ENST00000505941 FOXD4L4Q8WXT5 416 aaPredicted RBP23.23■■□□□ 1.31
SH3BP2-210ENST00000505941 TMEM169Q96HH4 297 aa23.23■■□□□ 1.31
SH3BP2-210ENST00000505941 USP28Q96RU2 1077 aa23.23■■□□□ 1.31
SH3BP2-210ENST00000505941 LARSQ9P2J5 1176 aaKnown RBP23.23■■□□□ 1.31
SH3BP2-210ENST00000505941 PARP2Q9UGN5 583 aa23.23■■□□□ 1.31
SH3BP2-210ENST00000505941 MEIS3P2A8K0S8 358 aa23.22■■□□□ 1.31
SH3BP2-210ENST00000505941 H0YCG3 227 aa23.22■■□□□ 1.31
SH3BP2-210ENST00000505941 ZSCAN22P10073 491 aaPredicted RBP23.22■■□□□ 1.31
SH3BP2-210ENST00000505941 PLCG1P19174 1290 aa23.22■■□□□ 1.31
SH3BP2-210ENST00000505941 GRIN1Q05586 938 aa23.22■■□□□ 1.31
SH3BP2-210ENST00000505941 STRN3Q13033 797 aa23.22■■□□□ 1.31
SH3BP2-210ENST00000505941 CDR2LQ86X02 465 aaPredicted RBP23.22■■□□□ 1.31
SH3BP2-210ENST00000505941 KIFC3Q9BVG8 833 aa23.22■■□□□ 1.31
SH3BP2-210ENST00000505941 CCDC113Q9H0I3 377 aa23.22■■□□□ 1.31
SH3BP2-210ENST00000505941 IGFLR1Q9H665 355 aa23.22■■□□□ 1.31
SH3BP2-210ENST00000505941 TMEM134Q9H6X4 195 aa23.22■■□□□ 1.31
SH3BP2-210ENST00000505941 FBXO2Q9UK22 296 aaPredicted RBP23.22■■□□□ 1.31
SH3BP2-210ENST00000505941 KIAA1671Q9BY89 1806 aa23.22■■□□□ 1.31
SH3BP2-210ENST00000505941 PRUNE2Q8WUY3 3088 aa23.21■■□□□ 1.31
SH3BP2-210ENST00000505941 SFI1A8K8P3 1242 aa23.21■■□□□ 1.31
SH3BP2-210ENST00000505941 DLL1O00548 723 aa23.21■■□□□ 1.31
SH3BP2-210ENST00000505941 POMCP01189 267 aa23.21■■□□□ 1.31
SH3BP2-210ENST00000505941 PLS3P13797 630 aa23.21■■□□□ 1.31
SH3BP2-210ENST00000505941 DNAJB1P25685 340 aa23.21■■□□□ 1.31
SH3BP2-210ENST00000505941 DDIT3P35638 169 aa23.21■■□□□ 1.31
SH3BP2-210ENST00000505941 RRAGBQ5VZM2 374 aa23.21■■□□□ 1.31
SH3BP2-210ENST00000505941 GPBP1Q86WP2 473 aa23.21■■□□□ 1.31
SH3BP2-210ENST00000505941 RAD54LQ92698 747 aa23.21■■□□□ 1.31
SH3BP2-210ENST00000505941 EPSTI1Q96J88 318 aa23.21■■□□□ 1.31
SH3BP2-210ENST00000505941 NRDE2Q9H7Z3 1164 aa23.21■■□□□ 1.31
SH3BP2-210ENST00000505941 UBE2ZQ9H832 354 aaPredicted RBP23.21■■□□□ 1.31
SH3BP2-210ENST00000505941 NGRNQ9NPE2 291 aaKnown RBP23.21■■□□□ 1.31
SH3BP2-210ENST00000505941 ENTPD7Q9NQZ7 604 aa23.21■■□□□ 1.31
SH3BP2-210ENST00000505941 STK39Q9UEW8 545 aa23.21■■□□□ 1.31
SH3BP2-210ENST00000505941 ODF2LQ9ULJ1 636 aa23.21■■□□□ 1.31
SH3BP2-210ENST00000505941 HES2Q9Y543 173 aa23.21■■□□□ 1.31
SH3BP2-210ENST00000505941 MORC2Q9Y6X9 1032 aaPredicted RBP23.21■■□□□ 1.31
SH3BP2-210ENST00000505941 FSD2A1L4K1 749 aa23.2■■□□□ 1.3
SH3BP2-210ENST00000505941 ARL5CA6NH57 179 aa23.2■■□□□ 1.3
SH3BP2-210ENST00000505941 PBX3P40426 434 aa23.2■■□□□ 1.3
SH3BP2-210ENST00000505941 TFF2Q03403 129 aa23.2■■□□□ 1.3
SH3BP2-210ENST00000505941 CAMK1Q14012 370 aa23.2■■□□□ 1.3
SH3BP2-210ENST00000505941 BECN1Q14457 450 aa23.2■■□□□ 1.3
SH3BP2-210ENST00000505941 DCAF4L1Q3SXM0 396 aa23.2■■□□□ 1.3
SH3BP2-210ENST00000505941 SPECC1Q5M775 1068 aa23.2■■□□□ 1.3
SH3BP2-210ENST00000505941 ATF7IP2Q5U623 682 aa23.2■■□□□ 1.3
SH3BP2-210ENST00000505941 TMC7Q7Z402 723 aa23.2■■□□□ 1.3
SH3BP2-210ENST00000505941 DAW1Q8N136 415 aa23.2■■□□□ 1.3
SH3BP2-210ENST00000505941 SLC39A11Q8N1S5 342 aa23.2■■□□□ 1.3
SH3BP2-210ENST00000505941 TMEM87AQ8NBN3 555 aa23.2■■□□□ 1.3
SH3BP2-210ENST00000505941 SPIRE2Q8WWL2 714 aa23.2■■□□□ 1.3
SH3BP2-210ENST00000505941 LARP4BQ92615 738 aaKnown RBP23.2■■□□□ 1.3
SH3BP2-210ENST00000505941 PABPC5Q96DU9 382 aaKnown RBP23.2■■□□□ 1.3
SH3BP2-210ENST00000505941 CLIC6Q96NY7 704 aa23.2■■□□□ 1.3
SH3BP2-210ENST00000505941 RPS6KC1Q96S38 1066 aa23.2■■□□□ 1.3
SH3BP2-210ENST00000505941 GAD1Q99259 594 aa23.2■■□□□ 1.3
SH3BP2-210ENST00000505941 TMEM175Q9BSA9 504 aa23.2■■□□□ 1.3
SH3BP2-210ENST00000505941 NTPCRQ9BSD7 190 aaKnown RBP23.2■■□□□ 1.3
SH3BP2-210ENST00000505941 MRPL4Q9BYD3 311 aaKnown RBP23.2■■□□□ 1.3
SH3BP2-210ENST00000505941 RNF39Q9H2S5 420 aa23.2■■□□□ 1.3
SH3BP2-210ENST00000505941 TLE6Q9H808 572 aa23.2■■□□□ 1.3
SH3BP2-210ENST00000505941 CLDND1Q9NY35 253 aa23.2■■□□□ 1.3
SH3BP2-210ENST00000505941 TFIP11Q9UBB9 837 aaKnown RBP23.2■■□□□ 1.3
SH3BP2-210ENST00000505941 FAN1Q9Y2M0 1017 aa23.2■■□□□ 1.3
SH3BP2-210ENST00000505941 PPAN-P2RY11A0A0B4J1V8 794 aaPredicted RBP23.19■■□□□ 1.3
SH3BP2-210ENST00000505941 NT5C1B-RDH14C9J2C7 533 aa23.19■■□□□ 1.3
SH3BP2-210ENST00000505941 SPTLC2O15270 562 aa23.19■■□□□ 1.3
SH3BP2-210ENST00000505941 SLC16A4O15374 487 aa23.19■■□□□ 1.3
SH3BP2-210ENST00000505941 FAM13AO94988 1023 aa23.19■■□□□ 1.3
SH3BP2-210ENST00000505941 KCNA5P22460 613 aa23.19■■□□□ 1.3
SH3BP2-210ENST00000505941 AKAP5P24588 427 aa23.19■■□□□ 1.3
SH3BP2-210ENST00000505941 MLH1P40692 756 aa23.19■■□□□ 1.3
SH3BP2-210ENST00000505941 NASPP49321 788 aaPredicted RBP23.19■■□□□ 1.3
SH3BP2-210ENST00000505941 MCM6Q14566 821 aa23.19■■□□□ 1.3
SH3BP2-210ENST00000505941 CCDC73Q6ZRK6 1079 aa23.19■■□□□ 1.3
SH3BP2-210ENST00000505941 TCF25Q9BQ70 676 aa23.19■■□□□ 1.3
SH3BP2-210ENST00000505941 TCHPQ9BT92 498 aa23.19■■□□□ 1.3
SH3BP2-210ENST00000505941 NXF3Q9H4D5 531 aaKnown RBP23.19■■□□□ 1.3
SH3BP2-210ENST00000505941 PDZD7Q9H5P4 517 aa23.19■■□□□ 1.3
SH3BP2-210ENST00000505941 STK17AQ9UEE5 414 aa23.19■■□□□ 1.3
SH3BP2-210ENST00000505941 CFAP45Q9UL16 551 aa23.19■■□□□ 1.3
SH3BP2-210ENST00000505941 TBCAO75347 108 aaKnown RBP23.18■■□□□ 1.3
SH3BP2-210ENST00000505941 F13A1P00488 732 aa23.18■■□□□ 1.3
SH3BP2-210ENST00000505941 GALTP07902 379 aa23.18■■□□□ 1.3
SH3BP2-210ENST00000505941 SCP2P22307 547 aa23.18■■□□□ 1.3
SH3BP2-210ENST00000505941 CA8P35219 290 aa23.18■■□□□ 1.3
SH3BP2-210ENST00000505941 IRS1P35568 1242 aa23.18■■□□□ 1.3
SH3BP2-210ENST00000505941 MAPK7Q13164 816 aa23.18■■□□□ 1.3
SH3BP2-210ENST00000505941 ATL3Q6DD88 541 aa23.18■■□□□ 1.3
SH3BP2-210ENST00000505941 LINC00301Q8NCQ3 95 aa23.18■■□□□ 1.3
SH3BP2-210ENST00000505941 ZHX3Q9H4I2 956 aa23.18■■□□□ 1.3
SH3BP2-210ENST00000505941 PPP6R2O75170 966 aa23.17■■□□□ 1.3
SH3BP2-210ENST00000505941 YEATS4O95619 227 aa23.17■■□□□ 1.3
SH3BP2-210ENST00000505941 ERVFC1P60507 584 aa23.17■■□□□ 1.3
SH3BP2-210ENST00000505941 HYAL1Q12794 435 aa23.17■■□□□ 1.3
SH3BP2-210ENST00000505941 PUS10Q3MIT2 529 aaKnown RBP23.17■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 25.6 ms