RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000504450.1

SH3BP2-209, Transcript of SH3 domain binding protein 2, humanhuman

TSL 5

Gene SH3BP2, Length 844 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP2-209ENST00000504450 ZBTB48P10074 688 aaPredicted RBP11.72□□□□□ -0.53
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SH3BP2-209ENST00000504450 SNX12Q9UMY4 172 aa11.72□□□□□ -0.53
SH3BP2-209ENST00000504450 ARID2Q68CP9 1835 aa11.72□□□□□ -0.53
SH3BP2-209ENST00000504450 LRRC37A2A6NM11 1700 aa11.72□□□□□ -0.53
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SH3BP2-209ENST00000504450 GOLGA8JA6NMD2 632 aa11.71□□□□□ -0.53
SH3BP2-209ENST00000504450 PDE2AO00408 941 aaPredicted RBP11.71□□□□□ -0.53
SH3BP2-209ENST00000504450 EVI5O60447 810 aa11.71□□□□□ -0.53
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SH3BP2-209ENST00000504450 GCLMP48507 274 aa11.71□□□□□ -0.53
SH3BP2-209ENST00000504450 STAT5BP51692 787 aa11.71□□□□□ -0.53
SH3BP2-209ENST00000504450 INHBEP58166 350 aa11.71□□□□□ -0.53
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SH3BP2-209ENST00000504450 CELF3Q5SZQ8 465 aaKnown RBP11.71□□□□□ -0.53
SH3BP2-209ENST00000504450 FAM160B1Q5W0V3 765 aa11.71□□□□□ -0.53
SH3BP2-209ENST00000504450 CREG2Q8IUH2 290 aa11.71□□□□□ -0.53
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SH3BP2-209ENST00000504450 ARHGEF19Q8IW93 802 aa11.71□□□□□ -0.53
SH3BP2-209ENST00000504450 ANKRD13CQ8N6S4 541 aa11.71□□□□□ -0.53
SH3BP2-209ENST00000504450 LNX1Q8TBB1 728 aaPredicted RBP11.71□□□□□ -0.53
SH3BP2-209ENST00000504450 MMS19Q96T76 1030 aa11.71□□□□□ -0.53
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SH3BP2-209ENST00000504450 TMEM134Q9H6X4 195 aa11.7□□□□□ -0.54
SH3BP2-209ENST00000504450 TMEM8AQ9HCN3 771 aa11.7□□□□□ -0.54
SH3BP2-209ENST00000504450 A0A0A6YYK5 440 aaPredicted RBP11.69□□□□□ -0.54
SH3BP2-209ENST00000504450 IGKV6-21A0A0C4DH24 114 aa11.69□□□□□ -0.54
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SH3BP2-209ENST00000504450 EXTL3O43909 919 aa11.69□□□□□ -0.54
SH3BP2-209ENST00000504450 MYCP01106 439 aaPredicted RBP11.69□□□□□ -0.54
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