RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000497210.5

CTPS1-211, Transcript of CTP synthase 1, humanhuman

TSL 3

Gene CTPS1, Length 463 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTPS1-211ENST00000497210 TMEM63BQ5T3F8 832 aa10.74□□□□□ -0.69
CTPS1-211ENST00000497210 C1orf53Q5VUE5 145 aa10.74□□□□□ -0.69
CTPS1-211ENST00000497210 PLA2G4FQ68DD2 849 aa10.74□□□□□ -0.69
CTPS1-211ENST00000497210 STXBP4Q6ZWJ1 553 aa10.74□□□□□ -0.69
CTPS1-211ENST00000497210 UNC13DQ70J99 1090 aa10.74□□□□□ -0.69
CTPS1-211ENST00000497210 ANO5Q75V66 913 aa10.74□□□□□ -0.69
CTPS1-211ENST00000497210 GLYCTKQ8IVS8 523 aa10.74□□□□□ -0.69
CTPS1-211ENST00000497210 SLC17A8Q8NDX2 589 aa10.74□□□□□ -0.69
CTPS1-211ENST00000497210 TCP11Q8WWU5 503 aa10.74□□□□□ -0.69
CTPS1-211ENST00000497210 KIFAP3Q92845 792 aa10.74□□□□□ -0.69
CTPS1-211ENST00000497210 ZNF333Q96JL9 665 aa10.74□□□□□ -0.69
CTPS1-211ENST00000497210 PCYT2Q99447 389 aa10.74□□□□□ -0.69
CTPS1-211ENST00000497210 C7orf25Q9BPX7 421 aa10.74□□□□□ -0.69
CTPS1-211ENST00000497210 C16orf70Q9BSU1 422 aa10.74□□□□□ -0.69
CTPS1-211ENST00000497210 SEZ6LQ9BYH1 1024 aa10.74□□□□□ -0.69
CTPS1-211ENST00000497210 RNF208Q9H0X6 261 aa10.74□□□□□ -0.69
CTPS1-211ENST00000497210 C17orf75Q9HAS0 396 aa10.74□□□□□ -0.69
CTPS1-211ENST00000497210 PARVGQ9HBI0 331 aa10.74□□□□□ -0.69
CTPS1-211ENST00000497210 ZDHHC3Q9NYG2 299 aa10.74□□□□□ -0.69
CTPS1-211ENST00000497210 SEL1LQ9UBV2 794 aa10.74□□□□□ -0.69
CTPS1-211ENST00000497210 KCNG1Q9UIX4 513 aa10.74□□□□□ -0.69
CTPS1-211ENST00000497210 DNMT3LQ9UJW3 386 aa10.74□□□□□ -0.69
CTPS1-211ENST00000497210 COL4A3BPQ9Y5P4 624 aa10.74□□□□□ -0.69
CTPS1-211ENST00000497210 PHLPP2Q6ZVD8 1323 aa10.74□□□□□ -0.69
CTPS1-211ENST00000497210 RRN3P2A6NIE6 340 aa10.73□□□□□ -0.69
CTPS1-211ENST00000497210 H0YCG3 227 aa10.73□□□□□ -0.69
CTPS1-211ENST00000497210 MAGEB2O15479 319 aa10.73□□□□□ -0.69
CTPS1-211ENST00000497210 KIF20AO95235 890 aa10.73□□□□□ -0.69
CTPS1-211ENST00000497210 RPN1P04843 607 aaKnown RBP10.73□□□□□ -0.69
CTPS1-211ENST00000497210 IDEP14735 1019 aa10.73□□□□□ -0.69
CTPS1-211ENST00000497210 NPR3P17342 541 aa10.73□□□□□ -0.69
CTPS1-211ENST00000497210 TMOD1P28289 359 aa10.73□□□□□ -0.69
CTPS1-211ENST00000497210 DNM2P50570 870 aa10.73□□□□□ -0.69
CTPS1-211ENST00000497210 PSMC6P62333 389 aa10.73□□□□□ -0.69
CTPS1-211ENST00000497210 BEX3Q00994 111 aa10.73□□□□□ -0.69
CTPS1-211ENST00000497210 DMP1Q13316 513 aaPredicted RBP10.73□□□□□ -0.69
CTPS1-211ENST00000497210 STIM1Q13586 685 aa10.73□□□□□ -0.69
CTPS1-211ENST00000497210 CUL4BQ13620 913 aa10.73□□□□□ -0.69
CTPS1-211ENST00000497210 KCNB1Q14721 858 aa10.73□□□□□ -0.69
CTPS1-211ENST00000497210 PPP2R5AQ15172 486 aa10.73□□□□□ -0.69
CTPS1-211ENST00000497210 LRRC41Q15345 812 aa10.73□□□□□ -0.69
CTPS1-211ENST00000497210 RINT1Q6NUQ1 792 aa10.73□□□□□ -0.69
CTPS1-211ENST00000497210 DYMQ7RTS9 669 aa10.73□□□□□ -0.69
CTPS1-211ENST00000497210 TRMT1LQ7Z2T5 733 aaKnown RBP10.73□□□□□ -0.69
CTPS1-211ENST00000497210 GRAMD1CQ8IYS0 662 aa10.73□□□□□ -0.69
CTPS1-211ENST00000497210 C7orf31Q8N865 590 aa10.73□□□□□ -0.69
CTPS1-211ENST00000497210 KLHDC9Q8NEP7 349 aa10.73□□□□□ -0.69
CTPS1-211ENST00000497210 GLT1D1Q96MS3 346 aa10.73□□□□□ -0.69
CTPS1-211ENST00000497210 REEP2Q9BRK0 252 aa10.73□□□□□ -0.69
CTPS1-211ENST00000497210 RUSC1Q9BVN2 902 aa10.73□□□□□ -0.69
CTPS1-211ENST00000497210 LARSQ9P2J5 1176 aaKnown RBP10.73□□□□□ -0.69
CTPS1-211ENST00000497210 TELO2Q9Y4R8 837 aa10.73□□□□□ -0.69
CTPS1-211ENST00000497210 NRCAMQ92823 1304 aa10.73□□□□□ -0.69
CTPS1-211ENST00000497210 SCN10AQ9Y5Y9 1956 aa10.72□□□□□ -0.69
CTPS1-211ENST00000497210 SYCE3A1L190 88 aa10.72□□□□□ -0.69
CTPS1-211ENST00000497210 MYADML2A6NDP7 307 aa10.72□□□□□ -0.69
CTPS1-211ENST00000497210 MYMKA6NI61 221 aa10.72□□□□□ -0.69
CTPS1-211ENST00000497210 FIGNL2A6NMB9 653 aa10.72□□□□□ -0.69
CTPS1-211ENST00000497210 CAVIN2O95810 425 aa10.72□□□□□ -0.69
CTPS1-211ENST00000497210 ASGR1P07306 291 aa10.72□□□□□ -0.69
CTPS1-211ENST00000497210 SMIM10L2AP0DMW4 78 aa10.72□□□□□ -0.69
CTPS1-211ENST00000497210 SMIM10L2BP0DMW5 78 aa10.72□□□□□ -0.69
CTPS1-211ENST00000497210 RHOQP17081 205 aa10.72□□□□□ -0.69
CTPS1-211ENST00000497210 PTGS1P23219 599 aa10.72□□□□□ -0.69
CTPS1-211ENST00000497210 RTP1P59025 263 aa10.72□□□□□ -0.69
CTPS1-211ENST00000497210 CHMP4BP1P59074 171 aa10.72□□□□□ -0.69
CTPS1-211ENST00000497210 PSMD2Q13200 908 aa10.72□□□□□ -0.69
CTPS1-211ENST00000497210 ALCAMQ13740 583 aa10.72□□□□□ -0.69
CTPS1-211ENST00000497210 GRIK4Q16099 956 aa10.72□□□□□ -0.69
CTPS1-211ENST00000497210 FAM102BQ5T8I3 360 aa10.72□□□□□ -0.69
CTPS1-211ENST00000497210 NT5DC1Q5TFE4 455 aa10.72□□□□□ -0.69
CTPS1-211ENST00000497210 LRRC15Q8TF66 581 aa10.72□□□□□ -0.69
CTPS1-211ENST00000497210 STAMQ92783 540 aa10.72□□□□□ -0.69
CTPS1-211ENST00000497210 IFT74Q96LB3 600 aa10.72□□□□□ -0.69
CTPS1-211ENST00000497210 DEFB118Q96PH6 123 aa10.72□□□□□ -0.69
CTPS1-211ENST00000497210 MAP7D2Q96T17 732 aa10.72□□□□□ -0.69
CTPS1-211ENST00000497210 NAT10Q9H0A0 1025 aaKnown RBP10.72□□□□□ -0.69
CTPS1-211ENST00000497210 BLZF1Q9H2G9 400 aa10.72□□□□□ -0.69
CTPS1-211ENST00000497210 ZHX3Q9H4I2 956 aa10.72□□□□□ -0.69
CTPS1-211ENST00000497210 DHX33Q9H6R0 707 aaKnown RBP10.72□□□□□ -0.69
CTPS1-211ENST00000497210 PANK4Q9NVE7 773 aa10.72□□□□□ -0.69
CTPS1-211ENST00000497210 ANO10Q9NW15 660 aa10.72□□□□□ -0.69
CTPS1-211ENST00000497210 TUBE1Q9UJT0 475 aa10.72□□□□□ -0.69
CTPS1-211ENST00000497210 UBE4BO95155 1302 aa10.72□□□□□ -0.69
CTPS1-211ENST00000497210 FRMD3A2A2Y4 597 aa10.71□□□□□ -0.69
CTPS1-211ENST00000497210 C17orf102A2RUQ5 167 aa10.71□□□□□ -0.69
CTPS1-211ENST00000497210 HAS3O00219 553 aa10.71□□□□□ -0.69
CTPS1-211ENST00000497210 HIP1RO75146 1068 aa10.71□□□□□ -0.69
CTPS1-211ENST00000497210 MAFO75444 373 aaPredicted RBP10.71□□□□□ -0.69
CTPS1-211ENST00000497210 RHOBTB3O94955 611 aa10.71□□□□□ -0.69
CTPS1-211ENST00000497210 ATP4AP20648 1035 aa10.71□□□□□ -0.69
CTPS1-211ENST00000497210 MYH11P35749 1972 aa10.71□□□□□ -0.69
CTPS1-211ENST00000497210 ACLYP53396 1101 aa10.71□□□□□ -0.69
CTPS1-211ENST00000497210 NPEPPSP55786 919 aa10.71□□□□□ -0.69
CTPS1-211ENST00000497210 IGBP1P78318 339 aa10.71□□□□□ -0.69
CTPS1-211ENST00000497210 PTPN11Q06124 597 aaPredicted RBP10.71□□□□□ -0.69
CTPS1-211ENST00000497210 COASYQ13057 564 aa10.71□□□□□ -0.69
CTPS1-211ENST00000497210 MXD4Q14582 209 aaPredicted RBP10.71□□□□□ -0.69
CTPS1-211ENST00000497210 TARBP2Q15633 366 aaKnown RBP10.71□□□□□ -0.69
CTPS1-211ENST00000497210 KCNA10Q16322 511 aa10.71□□□□□ -0.69
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 17.1 ms