RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000495787.1

ECHDC3-204, Transcript of enoyl-CoA hydratase domain containing 3, humanhuman

TSL 3

Gene ECHDC3, Length 505 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ECHDC3-204ENST00000495787 CYBAP13498 195 aa11.71□□□□□ -0.53
ECHDC3-204ENST00000495787 KRT13P13646 458 aa11.71□□□□□ -0.53
ECHDC3-204ENST00000495787 KLRC1P26715 233 aa11.71□□□□□ -0.53
ECHDC3-204ENST00000495787 KCNJ6P48051 423 aa11.71□□□□□ -0.53
ECHDC3-204ENST00000495787 EFNA5P52803 228 aa11.71□□□□□ -0.53
ECHDC3-204ENST00000495787 MCCD1P59942 119 aaPredicted RBP11.71□□□□□ -0.53
ECHDC3-204ENST00000495787 PPFIA1Q13136 1202 aa11.71□□□□□ -0.53
ECHDC3-204ENST00000495787 DRP2Q13474 957 aa11.71□□□□□ -0.53
ECHDC3-204ENST00000495787 HSP90AA2PQ14568 343 aaPredicted RBP11.71□□□□□ -0.53
ECHDC3-204ENST00000495787 CDCA2Q69YH5 1023 aaPredicted RBP11.71□□□□□ -0.53
ECHDC3-204ENST00000495787 INTS8Q75QN2 995 aaKnown RBP11.71□□□□□ -0.53
ECHDC3-204ENST00000495787 ZBTB8OSQ8IWT0 167 aa11.71□□□□□ -0.53
ECHDC3-204ENST00000495787 LRRC71Q8N4P6 559 aa11.71□□□□□ -0.53
ECHDC3-204ENST00000495787 LINC01465Q8N7H1 131 aa11.71□□□□□ -0.53
ECHDC3-204ENST00000495787 MAFAQ8NHW3 353 aaPredicted RBP11.71□□□□□ -0.53
ECHDC3-204ENST00000495787 SLC35C1Q96A29 364 aa11.71□□□□□ -0.53
ECHDC3-204ENST00000495787 BICD1Q96G01 975 aa11.71□□□□□ -0.53
ECHDC3-204ENST00000495787 CDX2Q99626 313 aaPredicted RBP11.71□□□□□ -0.53
ECHDC3-204ENST00000495787 NAA15Q9BXJ9 866 aaKnown RBP11.71□□□□□ -0.53
ECHDC3-204ENST00000495787 EDEM3Q9BZQ6 932 aa11.71□□□□□ -0.53
ECHDC3-204ENST00000495787 TTYH3Q9C0H2 523 aa11.71□□□□□ -0.53
ECHDC3-204ENST00000495787 SENP6Q9GZR1 1112 aaPredicted RBP11.71□□□□□ -0.53
ECHDC3-204ENST00000495787 C2orf40Q9H1Z8 148 aa11.71□□□□□ -0.53
ECHDC3-204ENST00000495787 PCIF1Q9H4Z3 704 aa11.71□□□□□ -0.53
ECHDC3-204ENST00000495787 LUC7L2Q9Y383 392 aaKnown RBP11.71□□□□□ -0.53
ECHDC3-204ENST00000495787 TTC28Q96AY4 2481 aa11.71□□□□□ -0.53
ECHDC3-204ENST00000495787 EYSQ5T1H1 3165 aa11.71□□□□□ -0.54
ECHDC3-204ENST00000495787 TTC26A0AVF1 554 aa11.7□□□□□ -0.54
ECHDC3-204ENST00000495787 GTPBP10A4D1E9 387 aaKnown RBP11.7□□□□□ -0.54
ECHDC3-204ENST00000495787 HNRNPDLO14979 420 aaKnown RBP11.7□□□□□ -0.54
ECHDC3-204ENST00000495787 MSCO60682 206 aa11.7□□□□□ -0.54
ECHDC3-204ENST00000495787 DUSP11O75319 330 aaKnown RBP11.7□□□□□ -0.54
ECHDC3-204ENST00000495787 F2P00734 622 aa11.7□□□□□ -0.54
ECHDC3-204ENST00000495787 TRIM21P19474 475 aaKnown RBP11.7□□□□□ -0.54
ECHDC3-204ENST00000495787 FECHP22830 423 aa11.7□□□□□ -0.54
ECHDC3-204ENST00000495787 TMOD1P28289 359 aa11.7□□□□□ -0.54
ECHDC3-204ENST00000495787 ADSSP30520 456 aa11.7□□□□□ -0.54
ECHDC3-204ENST00000495787 KRT9P35527 623 aa11.7□□□□□ -0.54
ECHDC3-204ENST00000495787 KLK7P49862 253 aa11.7□□□□□ -0.54
ECHDC3-204ENST00000495787 LIG4P49917 911 aa11.7□□□□□ -0.54
ECHDC3-204ENST00000495787 IGBP1P78318 339 aa11.7□□□□□ -0.54
ECHDC3-204ENST00000495787 POU5F1BQ06416 359 aa11.7□□□□□ -0.54
ECHDC3-204ENST00000495787 KCNMA1Q12791 1236 aa11.7□□□□□ -0.54
ECHDC3-204ENST00000495787 BFSP1Q12934 665 aa11.7□□□□□ -0.54
ECHDC3-204ENST00000495787 GRIK4Q16099 956 aa11.7□□□□□ -0.54
ECHDC3-204ENST00000495787 DCAF17Q5H9S7 520 aaPredicted RBP11.7□□□□□ -0.54
ECHDC3-204ENST00000495787 TCERG1LQ5VWI1 586 aa11.7□□□□□ -0.54
ECHDC3-204ENST00000495787 SLFN12LQ6IEE8 588 aa11.7□□□□□ -0.54
ECHDC3-204ENST00000495787 SLC39A4Q6P5W5 647 aa11.7□□□□□ -0.54
ECHDC3-204ENST00000495787 MTHFD1LQ6UB35 978 aa11.7□□□□□ -0.54
ECHDC3-204ENST00000495787 TMEM139Q8IV31 216 aa11.7□□□□□ -0.54
ECHDC3-204ENST00000495787 METTL13Q8N6R0 699 aa11.7□□□□□ -0.54
ECHDC3-204ENST00000495787 TRPV1Q8NER1 839 aa11.7□□□□□ -0.54
ECHDC3-204ENST00000495787 NEK11Q8NG66 645 aa11.7□□□□□ -0.54
ECHDC3-204ENST00000495787 FBXL18Q96ME1 805 aa11.7□□□□□ -0.54
ECHDC3-204ENST00000495787 BAG1Q99933 345 aaPredicted RBP11.7□□□□□ -0.54
ECHDC3-204ENST00000495787 CCDC113Q9H0I3 377 aa11.7□□□□□ -0.54
ECHDC3-204ENST00000495787 MMRN2Q9H8L6 949 aa11.7□□□□□ -0.54
ECHDC3-204ENST00000495787 RRAGDQ9NQL2 400 aaPredicted RBP11.7□□□□□ -0.54
ECHDC3-204ENST00000495787 STYXL1Q9Y6J8 313 aa11.7□□□□□ -0.54
ECHDC3-204ENST00000495787 DNAH12Q6ZR08 3092 aa11.69□□□□□ -0.54
ECHDC3-204ENST00000495787 RNF225M0QZC1 329 aaPredicted RBP11.69□□□□□ -0.54
ECHDC3-204ENST00000495787 HAS3O00219 553 aa11.69□□□□□ -0.54
ECHDC3-204ENST00000495787 DNM1LO00429 736 aa11.69□□□□□ -0.54
ECHDC3-204ENST00000495787 ARHGAP6O43182 974 aa11.69□□□□□ -0.54
ECHDC3-204ENST00000495787 KPNA6O60684 536 aa11.69□□□□□ -0.54
ECHDC3-204ENST00000495787 MYL3P08590 195 aa11.69□□□□□ -0.54
ECHDC3-204ENST00000495787 SRGAP2CP0DJJ0 459 aa11.69□□□□□ -0.54
ECHDC3-204ENST00000495787 PSEN2P49810 448 aa11.69□□□□□ -0.54
ECHDC3-204ENST00000495787 CLCN3P51790 818 aa11.69□□□□□ -0.54
ECHDC3-204ENST00000495787 GJA9P57773 515 aa11.69□□□□□ -0.54
ECHDC3-204ENST00000495787 NKX3-2P78367 333 aa11.69□□□□□ -0.54
ECHDC3-204ENST00000495787 ZBED6P86452 979 aa11.69□□□□□ -0.54
ECHDC3-204ENST00000495787 ENPEPQ07075 957 aa11.69□□□□□ -0.54
ECHDC3-204ENST00000495787 ZPBP2Q6X784 338 aa11.69□□□□□ -0.54
ECHDC3-204ENST00000495787 GBP6Q6ZN66 633 aa11.69□□□□□ -0.54
ECHDC3-204ENST00000495787 RHPN2Q8IUC4 686 aa11.69□□□□□ -0.54
ECHDC3-204ENST00000495787 GPD1LQ8N335 351 aa11.69□□□□□ -0.54
ECHDC3-204ENST00000495787 CCDC155Q8N6L0 562 aa11.69□□□□□ -0.54
ECHDC3-204ENST00000495787 RNF149Q8NC42 400 aa11.69□□□□□ -0.54
ECHDC3-204ENST00000495787 ZNF397Q8NF99 534 aaPredicted RBP11.69□□□□□ -0.54
ECHDC3-204ENST00000495787 OR8K1Q8NGG5 319 aa11.69□□□□□ -0.54
ECHDC3-204ENST00000495787 POMGNT1Q8WZA1 660 aa11.69□□□□□ -0.54
ECHDC3-204ENST00000495787 KAT2BQ92831 832 aa11.69□□□□□ -0.54
ECHDC3-204ENST00000495787 LENG1Q96BZ8 264 aaPredicted RBP11.69□□□□□ -0.54
ECHDC3-204ENST00000495787 DNAJC7Q99615 494 aa11.69□□□□□ -0.54
ECHDC3-204ENST00000495787 KATNAL1Q9BW62 490 aa11.69□□□□□ -0.54
ECHDC3-204ENST00000495787 NFKBIZQ9BYH8 718 aa11.69□□□□□ -0.54
ECHDC3-204ENST00000495787 UPF3AQ9H1J1 476 aaKnown RBP11.69□□□□□ -0.54
ECHDC3-204ENST00000495787 KIAA1586Q9HCI6 787 aa11.69□□□□□ -0.54
ECHDC3-204ENST00000495787 KCND1Q9NSA2 647 aa11.69□□□□□ -0.54
ECHDC3-204ENST00000495787 ABHD10Q9NUJ1 306 aa11.69□□□□□ -0.54
ECHDC3-204ENST00000495787 DDX20Q9UHI6 824 aaKnown RBP11.69□□□□□ -0.54
ECHDC3-204ENST00000495787 NRCAMQ92823 1304 aa11.68□□□□□ -0.54
ECHDC3-204ENST00000495787 PRUNE2Q8WUY3 3088 aa11.68□□□□□ -0.54
ECHDC3-204ENST00000495787 GOLGA8IPA6NC78 632 aa11.68□□□□□ -0.54
ECHDC3-204ENST00000495787 GOLGA8JA6NMD2 632 aa11.68□□□□□ -0.54
ECHDC3-204ENST00000495787 SEPT4O43236 478 aa11.68□□□□□ -0.54
ECHDC3-204ENST00000495787 EXTL3O43909 919 aa11.68□□□□□ -0.54
ECHDC3-204ENST00000495787 N4BP1O75113 896 aaKnown RBP11.68□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 56.9 ms