RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000490669.1

JMJD1C-208, Transcript of jumonji domain containing 1C, humanhuman

TSL 2

Gene JMJD1C, Length 518 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
JMJD1C-208ENST00000490669 TANGO6Q9C0B7 1094 aa6.91□□□□□ -1.3
JMJD1C-208ENST00000490669 KATNBL1Q9H079 304 aa6.91□□□□□ -1.3
JMJD1C-208ENST00000490669 MROH8Q9H579 483 aa6.91□□□□□ -1.3
JMJD1C-208ENST00000490669 IL17RBQ9NRM6 502 aa6.91□□□□□ -1.3
JMJD1C-208ENST00000490669 HOXC10Q9NYD6 342 aa6.91□□□□□ -1.3
JMJD1C-208ENST00000490669 DONSONQ9NYP3 566 aa6.91□□□□□ -1.3
JMJD1C-208ENST00000490669 DDX20Q9UHI6 824 aaKnown RBP6.91□□□□□ -1.3
JMJD1C-208ENST00000490669 ZMYND8Q9ULU4 1186 aaPredicted RBP6.91□□□□□ -1.3
JMJD1C-208ENST00000490669 ASTN1O14525 1302 aa6.91□□□□□ -1.3
JMJD1C-208ENST00000490669 ZNF536O15090 1300 aa6.91□□□□□ -1.3
JMJD1C-208ENST00000490669 DOCK5Q9H7D0 1870 aa6.91□□□□□ -1.3
JMJD1C-208ENST00000490669 REV3LO60673 3130 aa6.91□□□□□ -1.3
JMJD1C-208ENST00000490669 SPTBN5Q9NRC6 3674 aaKnown RBP6.9□□□□□ -1.3
JMJD1C-208ENST00000490669 MYH7BA7E2Y1 1941 aa6.9□□□□□ -1.3
JMJD1C-208ENST00000490669 A0A0D9SFI3 127 aa6.9□□□□□ -1.3
JMJD1C-208ENST00000490669 DCDC2CA8MYV0 355 aa6.9□□□□□ -1.3
JMJD1C-208ENST00000490669 F5H6K3 240 aa6.9□□□□□ -1.3
JMJD1C-208ENST00000490669 DNM1LO00429 736 aa6.9□□□□□ -1.3
JMJD1C-208ENST00000490669 ENC1O14682 589 aa6.9□□□□□ -1.3
JMJD1C-208ENST00000490669 SEPT4O43236 478 aa6.9□□□□□ -1.3
JMJD1C-208ENST00000490669 STRNO43815 780 aa6.9□□□□□ -1.3
JMJD1C-208ENST00000490669 PRDM1O75626 825 aa6.9□□□□□ -1.3
JMJD1C-208ENST00000490669 ZFYP08048 801 aaPredicted RBP6.9□□□□□ -1.3
JMJD1C-208ENST00000490669 ZNF865P0CJ78 1059 aaPredicted RBP6.9□□□□□ -1.3
JMJD1C-208ENST00000490669 SYN1P17600 705 aa6.9□□□□□ -1.3
JMJD1C-208ENST00000490669 CD53P19397 219 aa6.9□□□□□ -1.3
JMJD1C-208ENST00000490669 MX1P20591 662 aa6.9□□□□□ -1.3
JMJD1C-208ENST00000490669 GNA15P30679 374 aa6.9□□□□□ -1.3
JMJD1C-208ENST00000490669 ATICP31939 592 aa6.9□□□□□ -1.3
JMJD1C-208ENST00000490669 TERF1P54274 439 aa6.9□□□□□ -1.3
JMJD1C-208ENST00000490669 NAP1L1P55209 391 aaKnown RBP6.9□□□□□ -1.3
JMJD1C-208ENST00000490669 ZP2Q05996 745 aa6.9□□□□□ -1.3
JMJD1C-208ENST00000490669 KLRC3Q07444 240 aa6.9□□□□□ -1.3
JMJD1C-208ENST00000490669 RAD51AP2Q09MP3 1159 aa6.9□□□□□ -1.3
JMJD1C-208ENST00000490669 FAM47AQ5JRC9 791 aa6.9□□□□□ -1.3
JMJD1C-208ENST00000490669 PRAMEF19Q5SWL8 479 aa6.9□□□□□ -1.3
JMJD1C-208ENST00000490669 SDE2Q6IQ49 451 aa6.9□□□□□ -1.3
JMJD1C-208ENST00000490669 CCDC73Q6ZRK6 1079 aa6.9□□□□□ -1.3
JMJD1C-208ENST00000490669 CCDC129Q6ZRS4 1044 aa6.9□□□□□ -1.3
JMJD1C-208ENST00000490669 UBE3DQ7Z6J8 389 aa6.9□□□□□ -1.3
JMJD1C-208ENST00000490669 ZSWIM9Q86XI8 627 aa6.9□□□□□ -1.3
JMJD1C-208ENST00000490669 FBF1Q8TES7 1133 aa6.9□□□□□ -1.3
JMJD1C-208ENST00000490669 AGAP3Q96P47 875 aa6.9□□□□□ -1.3
JMJD1C-208ENST00000490669 POLR3CQ9BUI4 534 aaPredicted RBP6.9□□□□□ -1.3
JMJD1C-208ENST00000490669 CEP44Q9C0F1 390 aa6.9□□□□□ -1.3
JMJD1C-208ENST00000490669 SH2D4AQ9H788 454 aa6.9□□□□□ -1.3
JMJD1C-208ENST00000490669 INCENPQ9NQS7 918 aa6.9□□□□□ -1.3
JMJD1C-208ENST00000490669 MTMR4Q9NYA4 1195 aa6.9□□□□□ -1.3
JMJD1C-208ENST00000490669 SAMM50Q9Y512 469 aa6.9□□□□□ -1.3
JMJD1C-208ENST00000490669 NR2E3Q9Y5X4 410 aa6.9□□□□□ -1.3
JMJD1C-208ENST00000490669 PRUNE2Q8WUY3 3088 aa6.9□□□□□ -1.3
JMJD1C-208ENST00000490669 ZMYM6O95789 1325 aa6.9□□□□□ -1.3
JMJD1C-208ENST00000490669 TRANK1O15050 2925 aa6.89□□□□□ -1.31
JMJD1C-208ENST00000490669 LRRC10BA6NIK2 292 aa6.89□□□□□ -1.31
JMJD1C-208ENST00000490669 FANCGO15287 622 aa6.89□□□□□ -1.31
JMJD1C-208ENST00000490669 SORBS3O60504 671 aa6.89□□□□□ -1.31
JMJD1C-208ENST00000490669 GLRX3O76003 335 aaKnown RBP6.89□□□□□ -1.31
JMJD1C-208ENST00000490669 SNAI1O95863 264 aaPredicted RBP6.89□□□□□ -1.31
JMJD1C-208ENST00000490669 PGK2P07205 417 aa6.89□□□□□ -1.31
JMJD1C-208ENST00000490669 KCNA2P16389 499 aa6.89□□□□□ -1.31
JMJD1C-208ENST00000490669 IBSPP21815 317 aaPredicted RBP6.89□□□□□ -1.31
JMJD1C-208ENST00000490669 BMP6P22004 513 aa6.89□□□□□ -1.31
JMJD1C-208ENST00000490669 GSTT1P30711 240 aa6.89□□□□□ -1.31
JMJD1C-208ENST00000490669 TRPC1P48995 793 aa6.89□□□□□ -1.31
JMJD1C-208ENST00000490669 PDE1AP54750 535 aa6.89□□□□□ -1.31
JMJD1C-208ENST00000490669 ATP2B2Q01814 1243 aa6.89□□□□□ -1.31
JMJD1C-208ENST00000490669 RING1Q06587 406 aa6.89□□□□□ -1.31
JMJD1C-208ENST00000490669 PPARAQ07869 468 aa6.89□□□□□ -1.31
JMJD1C-208ENST00000490669 NKPD1Q17RQ9 610 aa6.89□□□□□ -1.31
JMJD1C-208ENST00000490669 PLEKHG6Q3KR16 790 aa6.89□□□□□ -1.31
JMJD1C-208ENST00000490669 LRIT3Q3SXY7 679 aa6.89□□□□□ -1.31
JMJD1C-208ENST00000490669 ANO1Q5XXA6 986 aa6.89□□□□□ -1.31
JMJD1C-208ENST00000490669 CCSAPQ6IQ19 270 aaPredicted RBP6.89□□□□□ -1.31
JMJD1C-208ENST00000490669 MAMDC4Q6UXC1 1216 aa6.89□□□□□ -1.31
JMJD1C-208ENST00000490669 ZNF589Q86UQ0 364 aaPredicted RBP6.89□□□□□ -1.31
JMJD1C-208ENST00000490669 C12orf40Q86WS4 652 aa6.89□□□□□ -1.31
JMJD1C-208ENST00000490669 NT5DC4Q86YG4 428 aa6.89□□□□□ -1.31
JMJD1C-208ENST00000490669 LRRC47Q8N1G4 583 aaKnown RBP6.89□□□□□ -1.31
JMJD1C-208ENST00000490669 SAMD3Q8N6K7 520 aa6.89□□□□□ -1.31
JMJD1C-208ENST00000490669 GMCL1P1Q8NEA9 526 aa6.89□□□□□ -1.31
JMJD1C-208ENST00000490669 SVIPQ8NHG7 77 aa6.89□□□□□ -1.31
JMJD1C-208ENST00000490669 CCDC47Q96A33 483 aaKnown RBP6.89□□□□□ -1.31
JMJD1C-208ENST00000490669 NAP1L4Q99733 375 aaKnown RBP6.89□□□□□ -1.31
JMJD1C-208ENST00000490669 SLF1Q9BQI6 1058 aa6.89□□□□□ -1.31
JMJD1C-208ENST00000490669 TINF2Q9BSI4 451 aa6.89□□□□□ -1.31
JMJD1C-208ENST00000490669 OSBPL7Q9BZF2 842 aa6.89□□□□□ -1.31
JMJD1C-208ENST00000490669 LNPKQ9C0E8 428 aa6.89□□□□□ -1.31
JMJD1C-208ENST00000490669 LRRC27Q9C0I9 530 aa6.89□□□□□ -1.31
JMJD1C-208ENST00000490669 SPC25Q9HBM1 224 aa6.89□□□□□ -1.31
JMJD1C-208ENST00000490669 SLC38A10Q9HBR0 1119 aa6.89□□□□□ -1.31
JMJD1C-208ENST00000490669 NOL7Q9UMY1 257 aaKnown RBP6.89□□□□□ -1.31
JMJD1C-208ENST00000490669 DIS3Q9Y2L1 958 aaKnown RBP6.89□□□□□ -1.31
JMJD1C-208ENST00000490669 PAXBP1Q9Y5B6 917 aa6.89□□□□□ -1.31
JMJD1C-208ENST00000490669 AK5Q9Y6K8 562 aa6.89□□□□□ -1.31
JMJD1C-208ENST00000490669 SIP14410 1827 aa6.89□□□□□ -1.31
JMJD1C-208ENST00000490669 CHD7Q9P2D1 2997 aa6.88□□□□□ -1.31
JMJD1C-208ENST00000490669 ATG2AQ2TAZ0 1938 aa6.88□□□□□ -1.31
JMJD1C-208ENST00000490669 MINDY4BA8MYZ0 360 aa6.88□□□□□ -1.31
JMJD1C-208ENST00000490669 NMT2O60551 498 aa6.88□□□□□ -1.31
JMJD1C-208ENST00000490669 MSCO60682 206 aa6.88□□□□□ -1.31
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 34.1 ms