RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000490425.1

NISCH-214, Transcript of nischarin, humanhuman

TSL 5

Gene NISCH, Length 559 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NISCH-214ENST00000490425 ZNF280BQ86YH2 543 aa13.26□□□□□ -0.29
NISCH-214ENST00000490425 RASSF8Q8NHQ8 419 aa13.26□□□□□ -0.29
NISCH-214ENST00000490425 URGCPQ8TCY9 931 aa13.26□□□□□ -0.29
NISCH-214ENST00000490425 MICAL1Q8TDZ2 1067 aa13.26□□□□□ -0.29
NISCH-214ENST00000490425 CALML4Q96GE6 196 aa13.26□□□□□ -0.29
NISCH-214ENST00000490425 EPSTI1Q96J88 318 aa13.26□□□□□ -0.29
NISCH-214ENST00000490425 PRIMPOLQ96LW4 560 aa13.26□□□□□ -0.29
NISCH-214ENST00000490425 GAD1Q99259 594 aa13.26□□□□□ -0.29
NISCH-214ENST00000490425 ZSCAN16Q9H4T2 348 aaPredicted RBP13.26□□□□□ -0.29
NISCH-214ENST00000490425 PDZD7Q9H5P4 517 aa13.26□□□□□ -0.29
NISCH-214ENST00000490425 IGFLR1Q9H665 355 aa13.26□□□□□ -0.29
NISCH-214ENST00000490425 NRDE2Q9H7Z3 1164 aa13.26□□□□□ -0.29
NISCH-214ENST00000490425 SPG21Q9NZD8 308 aa13.26□□□□□ -0.29
NISCH-214ENST00000490425 DNAJB4Q9UDY4 337 aa13.26□□□□□ -0.29
NISCH-214ENST00000490425 CNTNAP2Q9UHC6 1331 aa13.26□□□□□ -0.29
NISCH-214ENST00000490425 FBXO2Q9UK22 296 aaPredicted RBP13.26□□□□□ -0.29
NISCH-214ENST00000490425 ACKR2O00590 384 aa13.25□□□□□ -0.29
NISCH-214ENST00000490425 AKAP5P24588 427 aa13.25□□□□□ -0.29
NISCH-214ENST00000490425 GUCY2CP25092 1073 aa13.25□□□□□ -0.29
NISCH-214ENST00000490425 EFNA5P52803 228 aa13.25□□□□□ -0.29
NISCH-214ENST00000490425 PLCB3Q01970 1234 aa13.25□□□□□ -0.29
NISCH-214ENST00000490425 CACNB1Q02641 598 aaPredicted RBP13.25□□□□□ -0.29
NISCH-214ENST00000490425 UBE3AQ05086 875 aa13.25□□□□□ -0.29
NISCH-214ENST00000490425 FOXD4L6Q3SYB3 417 aaPredicted RBP13.25□□□□□ -0.29
NISCH-214ENST00000490425 ARSHQ5FYA8 562 aa13.25□□□□□ -0.29
NISCH-214ENST00000490425 EEF1DP3Q658K8 133 aa13.25□□□□□ -0.29
NISCH-214ENST00000490425 FOXD4L3Q6VB84 417 aaPredicted RBP13.25□□□□□ -0.29
NISCH-214ENST00000490425 RBM23Q86U06 439 aaKnown RBP13.25□□□□□ -0.29
NISCH-214ENST00000490425 TMEM173Q86WV6 379 aaPredicted RBP13.25□□□□□ -0.29
NISCH-214ENST00000490425 SLC39A11Q8N1S5 342 aa13.25□□□□□ -0.29
NISCH-214ENST00000490425 CNNM3Q8NE01 707 aa13.25□□□□□ -0.29
NISCH-214ENST00000490425 MRPS27Q92552 414 aaKnown RBP13.25□□□□□ -0.29
NISCH-214ENST00000490425 DRC1Q96MC2 740 aa13.25□□□□□ -0.29
NISCH-214ENST00000490425 ZFP42Q96MM3 310 aa13.25□□□□□ -0.29
NISCH-214ENST00000490425 KMT5AQ9NQR1 393 aa13.25□□□□□ -0.29
NISCH-214ENST00000490425 TLR9Q9NR96 1032 aa13.25□□□□□ -0.29
NISCH-214ENST00000490425 BLOC1S4Q9NUP1 217 aa13.25□□□□□ -0.29
NISCH-214ENST00000490425 CLDND1Q9NY35 253 aa13.25□□□□□ -0.29
NISCH-214ENST00000490425 TFIP11Q9UBB9 837 aaKnown RBP13.25□□□□□ -0.29
NISCH-214ENST00000490425 SRPRBQ9Y5M8 271 aaKnown RBP13.25□□□□□ -0.29
NISCH-214ENST00000490425 TCF20Q9UGU0 1960 aaKnown RBP13.24□□□□□ -0.29
NISCH-214ENST00000490425 PPAN-P2RY11A0A0B4J1V8 794 aaPredicted RBP13.24□□□□□ -0.29
NISCH-214ENST00000490425 ARL5CA6NH57 179 aa13.24□□□□□ -0.29
NISCH-214ENST00000490425 H3BQ06 376 aaPredicted RBP13.24□□□□□ -0.29
NISCH-214ENST00000490425 N4BP3O15049 544 aa13.24□□□□□ -0.29
NISCH-214ENST00000490425 SLC16A4O15374 487 aa13.24□□□□□ -0.29
NISCH-214ENST00000490425 LINC01565O15544 149 aa13.24□□□□□ -0.29
NISCH-214ENST00000490425 SLC26A4O43511 780 aa13.24□□□□□ -0.29
NISCH-214ENST00000490425 DDHD2O94830 711 aa13.24□□□□□ -0.29
NISCH-214ENST00000490425 GALTP07902 379 aa13.24□□□□□ -0.29
NISCH-214ENST00000490425 PPM1AP35813 382 aa13.24□□□□□ -0.29
NISCH-214ENST00000490425 MLH1P40692 756 aa13.24□□□□□ -0.29
NISCH-214ENST00000490425 SLC11A1P49279 550 aa13.24□□□□□ -0.29
NISCH-214ENST00000490425 ALDH7A1P49419 539 aaKnown RBP13.24□□□□□ -0.29
NISCH-214ENST00000490425 SCNN1GP51170 649 aa13.24□□□□□ -0.29
NISCH-214ENST00000490425 KRT17Q04695 432 aa13.24□□□□□ -0.29
NISCH-214ENST00000490425 DMP1Q13316 513 aaPredicted RBP13.24□□□□□ -0.29
NISCH-214ENST00000490425 PKP1Q13835 747 aa13.24□□□□□ -0.29
NISCH-214ENST00000490425 MCM6Q14566 821 aa13.24□□□□□ -0.29
NISCH-214ENST00000490425 AAK1Q2M2I8 961 aa13.24□□□□□ -0.29
NISCH-214ENST00000490425 NT5DC1Q5TFE4 455 aa13.24□□□□□ -0.29
NISCH-214ENST00000490425 PLPP4Q5VZY2 271 aa13.24□□□□□ -0.29
NISCH-214ENST00000490425 GPBP1Q86WP2 473 aa13.24□□□□□ -0.29
NISCH-214ENST00000490425 KCTD17Q8N5Z5 321 aa13.24□□□□□ -0.29
NISCH-214ENST00000490425 BCL7CQ8WUZ0 217 aaPredicted RBP13.24□□□□□ -0.29
NISCH-214ENST00000490425 RAD54LQ92698 747 aa13.24□□□□□ -0.29
NISCH-214ENST00000490425 SYMPKQ92797 1274 aaKnown RBP13.24□□□□□ -0.29
NISCH-214ENST00000490425 PABPC5Q96DU9 382 aaKnown RBP13.24□□□□□ -0.29
NISCH-214ENST00000490425 UBN1Q9NPG3 1134 aa13.24□□□□□ -0.29
NISCH-214ENST00000490425 MIOSQ9NXC5 875 aa13.24□□□□□ -0.29
NISCH-214ENST00000490425 KLK14Q9P0G3 267 aa13.24□□□□□ -0.29
NISCH-214ENST00000490425 PARP2Q9UGN5 583 aa13.24□□□□□ -0.29
NISCH-214ENST00000490425 K7ERI5 159 aa13.23□□□□□ -0.29
NISCH-214ENST00000490425 FSCN2O14926 492 aa13.23□□□□□ -0.29
NISCH-214ENST00000490425 PER2O15055 1255 aa13.23□□□□□ -0.29
NISCH-214ENST00000490425 ZSCAN22P10073 491 aaPredicted RBP13.23□□□□□ -0.29
NISCH-214ENST00000490425 BMP1P13497 986 aa13.23□□□□□ -0.29
NISCH-214ENST00000490425 NRIP1P48552 1158 aa13.23□□□□□ -0.29
NISCH-214ENST00000490425 DLX2Q07687 328 aaPredicted RBP13.23□□□□□ -0.29
NISCH-214ENST00000490425 COL19A1Q14993 1142 aa13.23□□□□□ -0.29
NISCH-214ENST00000490425 SLC39A14Q15043 492 aa13.23□□□□□ -0.29
NISCH-214ENST00000490425 STK38Q15208 465 aa13.23□□□□□ -0.29
NISCH-214ENST00000490425 TAS1R3Q7RTX0 852 aa13.23□□□□□ -0.29
NISCH-214ENST00000490425 HACE1Q8IYU2 909 aa13.23□□□□□ -0.29
NISCH-214ENST00000490425 ADAMTS19Q8TE59 1207 aa13.23□□□□□ -0.29
NISCH-214ENST00000490425 RSPH1Q8WYR4 309 aa13.23□□□□□ -0.29
NISCH-214ENST00000490425 TMEM169Q96HH4 297 aa13.23□□□□□ -0.29
NISCH-214ENST00000490425 NECAB3Q96P71 396 aaPredicted RBP13.23□□□□□ -0.29
NISCH-214ENST00000490425 FAM193BQ96PV7 902 aaPredicted RBP13.23□□□□□ -0.29
NISCH-214ENST00000490425 TCF25Q9BQ70 676 aa13.23□□□□□ -0.29
NISCH-214ENST00000490425 TIPINQ9BVW5 301 aa13.23□□□□□ -0.29
NISCH-214ENST00000490425 CCSER1Q9C0I3 900 aa13.23□□□□□ -0.29
NISCH-214ENST00000490425 TLE6Q9H808 572 aa13.23□□□□□ -0.29
NISCH-214ENST00000490425 ENTPD7Q9NQZ7 604 aa13.23□□□□□ -0.29
NISCH-214ENST00000490425 SNTG2Q9NY99 539 aa13.23□□□□□ -0.29
NISCH-214ENST00000490425 ARHGAP28Q9P2N2 729 aa13.23□□□□□ -0.29
NISCH-214ENST00000490425 PUF60Q9UHX1 559 aaKnown RBP13.23□□□□□ -0.29
NISCH-214ENST00000490425 LZTS1Q9Y250 596 aa13.23□□□□□ -0.29
NISCH-214ENST00000490425 GIT1Q9Y2X7 761 aa13.23□□□□□ -0.29
NISCH-214ENST00000490425 HIDE1A8MVS5 230 aa13.22□□□□□ -0.29
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 47.8 ms