RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000489442.5

CCL28-202, Transcript of C-C motif chemokine ligand 28, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene CCL28, Length 1,342 nt, Biotype nonsense mediated decay.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCL28-202ENST00000489442 KRT17Q04695 432 aa14.75□□□□□ -0.05
CCL28-202ENST00000489442 BECN1Q14457 450 aa14.75□□□□□ -0.05
CCL28-202ENST00000489442 FAM187BQ17R55 369 aa14.75□□□□□ -0.05
CCL28-202ENST00000489442 AGMOQ6ZNB7 445 aa14.75□□□□□ -0.05
CCL28-202ENST00000489442 EP400NLQ6ZTU2 488 aa14.75□□□□□ -0.05
CCL28-202ENST00000489442 GPBP1Q86WP2 473 aa14.75□□□□□ -0.05
CCL28-202ENST00000489442 HLA-CQ95604 372 aa14.75□□□□□ -0.05
CCL28-202ENST00000489442 PPP2R3CQ969Q6 453 aa14.75□□□□□ -0.05
CCL28-202ENST00000489442 EPSTI1Q96J88 318 aa14.75□□□□□ -0.05
CCL28-202ENST00000489442 CCSER1Q9C0I3 900 aa14.75□□□□□ -0.05
CCL28-202ENST00000489442 NSUN3Q9H649 340 aaKnown RBP14.75□□□□□ -0.05
CCL28-202ENST00000489442 SPG21Q9NZD8 308 aa14.75□□□□□ -0.05
CCL28-202ENST00000489442 KANSL3Q9P2N6 904 aa14.75□□□□□ -0.05
CCL28-202ENST00000489442 DAXXQ9UER7 740 aaPredicted RBP14.75□□□□□ -0.05
CCL28-202ENST00000489442 COG5Q9UP83 839 aa14.75□□□□□ -0.05
CCL28-202ENST00000489442 RBM19Q9Y4C8 960 aaKnown RBP14.75□□□□□ -0.05
CCL28-202ENST00000489442 HES2Q9Y543 173 aa14.75□□□□□ -0.05
CCL28-202ENST00000489442 NCOR1O75376 2440 aa14.75□□□□□ -0.05
CCL28-202ENST00000489442 CARNS1A5YM72 827 aa14.74□□□□□ -0.05
CCL28-202ENST00000489442 SPTLC2O15270 562 aa14.74□□□□□ -0.05
CCL28-202ENST00000489442 F13A1P00488 732 aa14.74□□□□□ -0.05
CCL28-202ENST00000489442 PBX3P40426 434 aa14.74□□□□□ -0.05
CCL28-202ENST00000489442 NASPP49321 788 aaPredicted RBP14.74□□□□□ -0.05
CCL28-202ENST00000489442 UBE3AQ05086 875 aa14.74□□□□□ -0.05
CCL28-202ENST00000489442 MCM6Q14566 821 aa14.74□□□□□ -0.05
CCL28-202ENST00000489442 AAK1Q2M2I8 961 aa14.74□□□□□ -0.05
CCL28-202ENST00000489442 RRAGBQ5VZM2 374 aa14.74□□□□□ -0.05
CCL28-202ENST00000489442 APBB1IPQ7Z5R6 666 aaPredicted RBP14.74□□□□□ -0.05
CCL28-202ENST00000489442 DAW1Q8N136 415 aa14.74□□□□□ -0.05
CCL28-202ENST00000489442 SMG8Q8ND04 991 aaKnown RBP14.74□□□□□ -0.05
CCL28-202ENST00000489442 ATXN2LQ8WWM7 1075 aaKnown RBP14.74□□□□□ -0.05
CCL28-202ENST00000489442 LARP4BQ92615 738 aaKnown RBP14.74□□□□□ -0.05
CCL28-202ENST00000489442 RAD54LQ92698 747 aa14.74□□□□□ -0.05
CCL28-202ENST00000489442 SYMPKQ92797 1274 aaKnown RBP14.74□□□□□ -0.05
CCL28-202ENST00000489442 TBC1D13Q9NVG8 400 aa14.74□□□□□ -0.05
CCL28-202ENST00000489442 LARSQ9P2J5 1176 aaKnown RBP14.74□□□□□ -0.05
CCL28-202ENST00000489442 PARP2Q9UGN5 583 aa14.74□□□□□ -0.05
CCL28-202ENST00000489442 PHLPP2Q6ZVD8 1323 aa14.74□□□□□ -0.05
CCL28-202ENST00000489442 ATG2AQ2TAZ0 1938 aa14.74□□□□□ -0.05
CCL28-202ENST00000489442 NPHP3-ACAD11A0A0J9YXS1 232 aa14.73□□□□□ -0.05
CCL28-202ENST00000489442 SLC16A4O15374 487 aa14.73□□□□□ -0.05
CCL28-202ENST00000489442 POMCP01189 267 aa14.73□□□□□ -0.05
CCL28-202ENST00000489442 PLS3P13797 630 aa14.73□□□□□ -0.05
CCL28-202ENST00000489442 DDIT3P35638 169 aa14.73□□□□□ -0.05
CCL28-202ENST00000489442 BCAR1P56945 870 aa14.73□□□□□ -0.05
CCL28-202ENST00000489442 MRPS5P82675 430 aaKnown RBP14.73□□□□□ -0.05
CCL28-202ENST00000489442 MAPK7Q13164 816 aa14.73□□□□□ -0.05
CCL28-202ENST00000489442 TCEAL5Q5H9L2 206 aa14.73□□□□□ -0.05
CCL28-202ENST00000489442 USP49Q70CQ1 688 aa14.73□□□□□ -0.05
CCL28-202ENST00000489442 LINC00301Q8NCQ3 95 aa14.73□□□□□ -0.05
CCL28-202ENST00000489442 TMEM169Q96HH4 297 aa14.73□□□□□ -0.05
CCL28-202ENST00000489442 CCDC113Q9H0I3 377 aa14.73□□□□□ -0.05
CCL28-202ENST00000489442 NXF3Q9H4D5 531 aaKnown RBP14.73□□□□□ -0.05
CCL28-202ENST00000489442 ZHX3Q9H4I2 956 aa14.73□□□□□ -0.05
CCL28-202ENST00000489442 PDZD7Q9H5P4 517 aa14.73□□□□□ -0.05
CCL28-202ENST00000489442 TLR9Q9NR96 1032 aa14.73□□□□□ -0.05
CCL28-202ENST00000489442 USP20Q9Y2K6 914 aa14.73□□□□□ -0.05
CCL28-202ENST00000489442 GIT1Q9Y2X7 761 aa14.73□□□□□ -0.05
CCL28-202ENST00000489442 SPTBN5Q9NRC6 3674 aaKnown RBP14.73□□□□□ -0.05
CCL28-202ENST00000489442 XIRP2A4UGR9 3374 aa14.72□□□□□ -0.05
CCL28-202ENST00000489442 ARL5CA6NH57 179 aa14.72□□□□□ -0.05
CCL28-202ENST00000489442 NT5C1B-RDH14C9J2C7 533 aa14.72□□□□□ -0.05
CCL28-202ENST00000489442 NCK2O43639 380 aa14.72□□□□□ -0.05
CCL28-202ENST00000489442 TBCAO75347 108 aaKnown RBP14.72□□□□□ -0.05
CCL28-202ENST00000489442 FAM13AO94988 1023 aa14.72□□□□□ -0.05
CCL28-202ENST00000489442 YEATS4O95619 227 aa14.72□□□□□ -0.05
CCL28-202ENST00000489442 AKAP5P24588 427 aa14.72□□□□□ -0.05
CCL28-202ENST00000489442 DNAJB1P25685 340 aa14.72□□□□□ -0.05
CCL28-202ENST00000489442 STRN3Q13033 797 aa14.72□□□□□ -0.05
CCL28-202ENST00000489442 PKP1Q13835 747 aa14.72□□□□□ -0.05
CCL28-202ENST00000489442 BMS1Q14692 1282 aaKnown RBP14.72□□□□□ -0.05
CCL28-202ENST00000489442 ARSHQ5FYA8 562 aa14.72□□□□□ -0.05
CCL28-202ENST00000489442 ATF7IP2Q5U623 682 aa14.72□□□□□ -0.05
CCL28-202ENST00000489442 CCDC73Q6ZRK6 1079 aa14.72□□□□□ -0.05
CCL28-202ENST00000489442 MRPS27Q92552 414 aaKnown RBP14.72□□□□□ -0.05
CCL28-202ENST00000489442 TTC28Q96AY4 2481 aa14.72□□□□□ -0.05
CCL28-202ENST00000489442 GAD1Q99259 594 aa14.72□□□□□ -0.05
CCL28-202ENST00000489442 TCHPQ9BT92 498 aa14.72□□□□□ -0.05
CCL28-202ENST00000489442 PANK2Q9BZ23 570 aa14.72□□□□□ -0.05
CCL28-202ENST00000489442 IGFLR1Q9H665 355 aa14.72□□□□□ -0.05
CCL28-202ENST00000489442 TMEM134Q9H6X4 195 aa14.72□□□□□ -0.05
CCL28-202ENST00000489442 NRDE2Q9H7Z3 1164 aa14.72□□□□□ -0.05
CCL28-202ENST00000489442 BLOC1S4Q9NUP1 217 aa14.72□□□□□ -0.05
CCL28-202ENST00000489442 STK17AQ9UEE5 414 aa14.72□□□□□ -0.05
CCL28-202ENST00000489442 CFAP45Q9UL16 551 aa14.72□□□□□ -0.05
CCL28-202ENST00000489442 ODF2LQ9ULJ1 636 aa14.72□□□□□ -0.05
CCL28-202ENST00000489442 MORC2Q9Y6X9 1032 aaPredicted RBP14.72□□□□□ -0.05
CCL28-202ENST00000489442 TRIP11Q15643 1979 aa14.72□□□□□ -0.05
CCL28-202ENST00000489442 TCF20Q9UGU0 1960 aaKnown RBP14.72□□□□□ -0.05
CCL28-202ENST00000489442 TTLL13PA6NNM8 815 aa14.71□□□□□ -0.05
CCL28-202ENST00000489442 H0YCG3 227 aa14.71□□□□□ -0.05
CCL28-202ENST00000489442 PPP6R2O75170 966 aa14.71□□□□□ -0.05
CCL28-202ENST00000489442 NR1I2O75469 434 aa14.71□□□□□ -0.05
CCL28-202ENST00000489442 ALDH2P05091 517 aa14.71□□□□□ -0.05
CCL28-202ENST00000489442 CA8P35219 290 aa14.71□□□□□ -0.05
CCL28-202ENST00000489442 MLH1P40692 756 aa14.71□□□□□ -0.05
CCL28-202ENST00000489442 STAT6P42226 847 aa14.71□□□□□ -0.05
CCL28-202ENST00000489442 PLCB3Q01970 1234 aa14.71□□□□□ -0.05
CCL28-202ENST00000489442 TFF2Q03403 129 aa14.71□□□□□ -0.05
CCL28-202ENST00000489442 CAMK1Q14012 370 aa14.71□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 59.9 ms