RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000486667.5

SRSF11-215, Transcript of serine and arginine rich splicing factor 11, human

TSL 5

Gene SRSF11, Length 662 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SRSF11-215	ENST00000486667	GAN	Q9H2C0	597 aa		11.18	□□□□□ -0.62
SRSF11-215	ENST00000486667	RNF186	Q9NXI6	227 aa		11.18	□□□□□ -0.62
SRSF11-215	ENST00000486667	GABRQ	Q9UN88	632 aa		11.18	□□□□□ -0.62
SRSF11-215	ENST00000486667	SCN10A	Q9Y5Y9	1956 aa		11.17	□□□□□ -0.62
SRSF11-215	ENST00000486667	MBLAC1	A4D2B0	266 aa	Predicted RBP	11.17	□□□□□ -0.62
SRSF11-215	ENST00000486667	GOLGA6L9	A6NEM1	432 aa		11.17	□□□□□ -0.62
SRSF11-215	ENST00000486667	KIF2A	O00139	706 aa	Predicted RBP	11.17	□□□□□ -0.62
SRSF11-215	ENST00000486667	EPHB6	O15197	1021 aa		11.17	□□□□□ -0.62
SRSF11-215	ENST00000486667	SEPT4	O43236	478 aa		11.17	□□□□□ -0.62
SRSF11-215	ENST00000486667	OFD1	O75665	1012 aa		11.17	□□□□□ -0.62
SRSF11-215	ENST00000486667	TOM1L1	O75674	476 aa		11.17	□□□□□ -0.62
SRSF11-215	ENST00000486667	TBC1D8	O95759	1140 aa		11.17	□□□□□ -0.62
SRSF11-215	ENST00000486667	PRKCB	P05771	671 aa		11.17	□□□□□ -0.62
SRSF11-215	ENST00000486667	ADRB2	P07550	413 aa		11.17	□□□□□ -0.62
SRSF11-215	ENST00000486667	SRGAP2C	P0DJJ0	459 aa		11.17	□□□□□ -0.62
SRSF11-215	ENST00000486667	HSPA1A	P0DMV8	641 aa	Known RBP	11.17	□□□□□ -0.62
SRSF11-215	ENST00000486667	HSPA1B	P0DMV9	641 aa	Known RBP	11.17	□□□□□ -0.62
SRSF11-215	ENST00000486667	RFX1	P22670	979 aa		11.17	□□□□□ -0.62
SRSF11-215	ENST00000486667	PHKA2	P46019	1235 aa		11.17	□□□□□ -0.62
SRSF11-215	ENST00000486667	CLCN3	P51790	818 aa		11.17	□□□□□ -0.62
SRSF11-215	ENST00000486667	ADAM17	P78536	824 aa		11.17	□□□□□ -0.62
SRSF11-215	ENST00000486667	CYP24A1	Q07973	514 aa		11.17	□□□□□ -0.62
SRSF11-215	ENST00000486667	FSCN1	Q16658	493 aa	Known RBP	11.17	□□□□□ -0.62
SRSF11-215	ENST00000486667	C1orf220	Q5T0J3	134 aa		11.17	□□□□□ -0.62
SRSF11-215	ENST00000486667	MARCH8	Q5T0T0	291 aa		11.17	□□□□□ -0.62
SRSF11-215	ENST00000486667	PDXDC1	Q6P996	788 aa		11.17	□□□□□ -0.62
SRSF11-215	ENST00000486667	TSHZ1	Q6ZSZ6	1077 aa		11.17	□□□□□ -0.62
SRSF11-215	ENST00000486667	CACNA2D4	Q7Z3S7	1137 aa		11.17	□□□□□ -0.62
SRSF11-215	ENST00000486667	ZNF410	Q86VK4	478 aa		11.17	□□□□□ -0.62
SRSF11-215	ENST00000486667	RHPN2	Q8IUC4	686 aa		11.17	□□□□□ -0.62
SRSF11-215	ENST00000486667	FMNL3	Q8IVF7	1028 aa		11.17	□□□□□ -0.62
SRSF11-215	ENST00000486667	C17orf53	Q8N3J3	647 aa	Predicted RBP	11.17	□□□□□ -0.62
SRSF11-215	ENST00000486667	RDH13	Q8NBN7	331 aa		11.17	□□□□□ -0.62
SRSF11-215	ENST00000486667	TRPV1	Q8NER1	839 aa		11.17	□□□□□ -0.62
SRSF11-215	ENST00000486667	VTI1A	Q96AJ9	217 aa		11.17	□□□□□ -0.62
SRSF11-215	ENST00000486667	ACO2	Q99798	780 aa	Known RBP	11.17	□□□□□ -0.62
SRSF11-215	ENST00000486667	CRACR2A	Q9BSW2	395 aa		11.17	□□□□□ -0.62
SRSF11-215	ENST00000486667	TARS2	Q9BW92	718 aa	Known RBP	11.17	□□□□□ -0.62
SRSF11-215	ENST00000486667	PRMT7	Q9NVM4	692 aa	Predicted RBP	11.17	□□□□□ -0.62
SRSF11-215	ENST00000486667	AIPL1	Q9NZN9	384 aa		11.17	□□□□□ -0.62
SRSF11-215	ENST00000486667	GCNT4	Q9P109	453 aa		11.17	□□□□□ -0.62
SRSF11-215	ENST00000486667	SRRD	Q9UH36	339 aa		11.17	□□□□□ -0.62
SRSF11-215	ENST00000486667	AGO2	Q9UKV8	859 aa	Known RBP	11.17	□□□□□ -0.62
SRSF11-215	ENST00000486667	PPP2R2C	Q9Y2T4	447 aa		11.17	□□□□□ -0.62
SRSF11-215	ENST00000486667	COQ4	Q9Y3A0	265 aa		11.17	□□□□□ -0.62
SRSF11-215	ENST00000486667	SMIM35	A0A1B0GVV1	85 aa		11.16	□□□□□ -0.62
SRSF11-215	ENST00000486667	CLDN3	O15551	220 aa		11.16	□□□□□ -0.62
SRSF11-215	ENST00000486667	ECM2	O94769	699 aa	Predicted RBP	11.16	□□□□□ -0.62
SRSF11-215	ENST00000486667	TRIM49	P0CI25	452 aa		11.16	□□□□□ -0.62
SRSF11-215	ENST00000486667	TRIM49C	P0CI26	452 aa		11.16	□□□□□ -0.62
SRSF11-215	ENST00000486667	SMIM10L2A	P0DMW4	78 aa		11.16	□□□□□ -0.62
SRSF11-215	ENST00000486667	SMIM10L2B	P0DMW5	78 aa		11.16	□□□□□ -0.62
SRSF11-215	ENST00000486667	UCHL3	P15374	230 aa		11.16	□□□□□ -0.62
SRSF11-215	ENST00000486667	SLC9A1	P19634	815 aa		11.16	□□□□□ -0.62
SRSF11-215	ENST00000486667	PROZ	P22891	400 aa		11.16	□□□□□ -0.62
SRSF11-215	ENST00000486667	HOXC8	P31273	242 aa		11.16	□□□□□ -0.62
SRSF11-215	ENST00000486667	PSEN2	P49810	448 aa		11.16	□□□□□ -0.62
SRSF11-215	ENST00000486667	IGBP1	P78318	339 aa		11.16	□□□□□ -0.62
SRSF11-215	ENST00000486667	MYL7	Q01449	175 aa		11.16	□□□□□ -0.62
SRSF11-215	ENST00000486667	POU5F1	Q01860	360 aa	Known RBP	11.16	□□□□□ -0.62
SRSF11-215	ENST00000486667	PRKCZ	Q05513	592 aa		11.16	□□□□□ -0.62
SRSF11-215	ENST00000486667	MBTD1	Q05BQ5	628 aa		11.16	□□□□□ -0.62
SRSF11-215	ENST00000486667	MCL1	Q07820	350 aa		11.16	□□□□□ -0.62
SRSF11-215	ENST00000486667	MFSD10	Q14728	455 aa		11.16	□□□□□ -0.62
SRSF11-215	ENST00000486667	PSMD6	Q15008	389 aa		11.16	□□□□□ -0.62
SRSF11-215	ENST00000486667	ARHGEF6	Q15052	776 aa		11.16	□□□□□ -0.62
SRSF11-215	ENST00000486667	PCBP1	Q15365	356 aa	Known RBP eCLIP	11.16	□□□□□ -0.62
SRSF11-215	ENST00000486667	KIAA0753	Q2KHM9	967 aa		11.16	□□□□□ -0.62
SRSF11-215	ENST00000486667	CBWD6	Q4V339	395 aa		11.16	□□□□□ -0.62
SRSF11-215	ENST00000486667	EPC2	Q52LR7	807 aa		11.16	□□□□□ -0.62
SRSF11-215	ENST00000486667	CBWD3	Q5JTY5	395 aa		11.16	□□□□□ -0.62
SRSF11-215	ENST00000486667	CBWD5	Q5RIA9	395 aa		11.16	□□□□□ -0.62
SRSF11-215	ENST00000486667	TRIM65	Q6PJ69	517 aa		11.16	□□□□□ -0.62
SRSF11-215	ENST00000486667	RAD9B	Q6WBX8	426 aa		11.16	□□□□□ -0.62
SRSF11-215	ENST00000486667	NYAP1	Q6ZVC0	841 aa		11.16	□□□□□ -0.62
SRSF11-215	ENST00000486667	RRAGA	Q7L523	313 aa		11.16	□□□□□ -0.62
SRSF11-215	ENST00000486667	SRGAP1	Q7Z6B7	1085 aa		11.16	□□□□□ -0.62
SRSF11-215	ENST00000486667	CBWD2	Q8IUF1	395 aa		11.16	□□□□□ -0.62
SRSF11-215	ENST00000486667	KIAA0319L	Q8IZA0	1049 aa		11.16	□□□□□ -0.62
SRSF11-215	ENST00000486667	EHBP1	Q8NDI1	1231 aa		11.16	□□□□□ -0.62
SRSF11-215	ENST00000486667	ZSWIM2	Q8NEG5	633 aa		11.16	□□□□□ -0.62
SRSF11-215	ENST00000486667	PRIMPOL	Q96LW4	560 aa		11.16	□□□□□ -0.62
SRSF11-215	ENST00000486667	MAP7D2	Q96T17	732 aa		11.16	□□□□□ -0.62
SRSF11-215	ENST00000486667	CHP1	Q99653	195 aa		11.16	□□□□□ -0.62
SRSF11-215	ENST00000486667	IFT122	Q9HBG6	1241 aa		11.16	□□□□□ -0.62
SRSF11-215	ENST00000486667	SPC25	Q9HBM1	224 aa		11.16	□□□□□ -0.62
SRSF11-215	ENST00000486667	SIX2	Q9NPC8	291 aa		11.16	□□□□□ -0.62
SRSF11-215	ENST00000486667	ADGRG1	Q9Y653	693 aa		11.16	□□□□□ -0.62
SRSF11-215	ENST00000486667	EPN1	Q9Y6I3	576 aa	Predicted RBP	11.16	□□□□□ -0.62
SRSF11-215	ENST00000486667	ANK1	P16157	1881 aa		11.16	□□□□□ -0.62
SRSF11-215	ENST00000486667	SSU72P8	A0A1W2PR75	194 aa		11.15	□□□□□ -0.62
SRSF11-215	ENST00000486667	GOLGA8IP	A6NC78	632 aa		11.15	□□□□□ -0.62
SRSF11-215	ENST00000486667	SOWAHD	A6NJG2	315 aa		11.15	□□□□□ -0.62
SRSF11-215	ENST00000486667	LRRC53	A6NM62	1247 aa		11.15	□□□□□ -0.62
SRSF11-215	ENST00000486667	GOLGA8J	A6NMD2	632 aa		11.15	□□□□□ -0.62
SRSF11-215	ENST00000486667	ABLIM1	O14639	778 aa		11.15	□□□□□ -0.62
SRSF11-215	ENST00000486667	OGT	O15294	1046 aa		11.15	□□□□□ -0.62
SRSF11-215	ENST00000486667	ZEB2	O60315	1214 aa		11.15	□□□□□ -0.62
SRSF11-215	ENST00000486667	TRPA1	O75762	1119 aa		11.15	□□□□□ -0.62
SRSF11-215	ENST00000486667	EDN1	P05305	212 aa		11.15	□□□□□ -0.62

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 43.9 ms