RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000484841.5

ACTB-212, Transcript of actin beta, humanhuman

TSL 5

Gene ACTB, Length 1,032 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cell leading edge, Cytoplasm, Cytosol, Exosome, Lamellipodium, Mitochondria, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTB-212ENST00000484841 CABP7Q86V35 215 aa22.37■■□□□ 1.17
ACTB-212ENST00000484841 IFNLR1Q8IU57 520 aaPredicted RBP22.37■■□□□ 1.17
ACTB-212ENST00000484841 ASAP3Q8TDY4 903 aa22.37■■□□□ 1.17
ACTB-212ENST00000484841 ZSCAN31Q96LW9 406 aaPredicted RBP22.37■■□□□ 1.17
ACTB-212ENST00000484841 DBR1Q9UK59 544 aaKnown RBP22.37■■□□□ 1.17
ACTB-212ENST00000484841 LRRIQ4A6NIV6 560 aa22.36■■□□□ 1.17
ACTB-212ENST00000484841 NRP1O14786 923 aa22.36■■□□□ 1.17
ACTB-212ENST00000484841 SEC24BO95487 1268 aa22.36■■□□□ 1.17
ACTB-212ENST00000484841 HMGN5P82970 282 aaKnown RBP22.36■■□□□ 1.17
ACTB-212ENST00000484841 MBTD1Q05BQ5 628 aa22.36■■□□□ 1.17
ACTB-212ENST00000484841 SIGLEC14Q08ET2 396 aa22.36■■□□□ 1.17
ACTB-212ENST00000484841 PTPN21Q16825 1174 aa22.36■■□□□ 1.17
ACTB-212ENST00000484841 ELMSAN1Q6PJG2 1045 aa22.36■■□□□ 1.17
ACTB-212ENST00000484841 BMP8AQ7Z5Y6 402 aa22.36■■□□□ 1.17
ACTB-212ENST00000484841 ZBTB8OSQ8IWT0 167 aa22.36■■□□□ 1.17
ACTB-212ENST00000484841 SMG8Q8ND04 991 aaKnown RBP22.36■■□□□ 1.17
ACTB-212ENST00000484841 MCPH1Q8NEM0 835 aa22.36■■□□□ 1.17
ACTB-212ENST00000484841 BCL7CQ8WUZ0 217 aaPredicted RBP22.36■■□□□ 1.17
ACTB-212ENST00000484841 NACC1Q96RE7 527 aa22.36■■□□□ 1.17
ACTB-212ENST00000484841 GAD1Q99259 594 aa22.36■■□□□ 1.17
ACTB-212ENST00000484841 EIF2AQ9BY44 585 aaKnown RBP22.36■■□□□ 1.17
ACTB-212ENST00000484841 NFKBIZQ9BYH8 718 aa22.36■■□□□ 1.17
ACTB-212ENST00000484841 NOL7Q9UMY1 257 aaKnown RBP22.36■■□□□ 1.17
ACTB-212ENST00000484841 ARL5CA6NH57 179 aa22.35■■□□□ 1.17
ACTB-212ENST00000484841 URODP06132 367 aa22.35■■□□□ 1.17
ACTB-212ENST00000484841 OR52Z1P0C646 297 aa22.35■■□□□ 1.17
ACTB-212ENST00000484841 EPCAMP16422 314 aa22.35■■□□□ 1.17
ACTB-212ENST00000484841 GLRA2P23416 452 aa22.35■■□□□ 1.17
ACTB-212ENST00000484841 MLH1P40692 756 aa22.35■■□□□ 1.17
ACTB-212ENST00000484841 AFF1P51825 1210 aaKnown RBP22.35■■□□□ 1.17
ACTB-212ENST00000484841 ORC2Q13416 577 aaPredicted RBP22.35■■□□□ 1.17
ACTB-212ENST00000484841 PTPN14Q15678 1187 aa22.35■■□□□ 1.17
ACTB-212ENST00000484841 TMEM60Q9H2L4 133 aa22.35■■□□□ 1.17
ACTB-212ENST00000484841 FOXP1Q9H334 677 aaPredicted RBP22.35■■□□□ 1.17
ACTB-212ENST00000484841 POMKQ9H5K3 350 aa22.35■■□□□ 1.17
ACTB-212ENST00000484841 GIT1Q9Y2X7 761 aa22.35■■□□□ 1.17
ACTB-212ENST00000484841 PRG3Q9Y2Y8 225 aaPredicted RBP22.35■■□□□ 1.17
ACTB-212ENST00000484841 A0A087WWV3 80 aa22.34■■□□□ 1.17
ACTB-212ENST00000484841 WNT7AO00755 349 aa22.34■■□□□ 1.17
ACTB-212ENST00000484841 CENPBP07199 599 aaPredicted RBP22.34■■□□□ 1.17
ACTB-212ENST00000484841 ARF4P18085 180 aaPredicted RBP22.34■■□□□ 1.17
ACTB-212ENST00000484841 RBM25P49756 843 aaKnown RBP22.34■■□□□ 1.17
ACTB-212ENST00000484841 ZNF174Q15697 407 aa22.34■■□□□ 1.17
ACTB-212ENST00000484841 KIAA1841Q6NSI8 718 aa22.34■■□□□ 1.17
ACTB-212ENST00000484841 SLC27A1Q6PCB7 646 aa22.34■■□□□ 1.17
ACTB-212ENST00000484841 CATSPER3Q86XQ3 398 aa22.34■■□□□ 1.17
ACTB-212ENST00000484841 C12orf76Q8N812 135 aaPredicted RBP22.34■■□□□ 1.17
ACTB-212ENST00000484841 SLC22A17Q8WUG5 538 aa22.34■■□□□ 1.17
ACTB-212ENST00000484841 COLEC11Q9BWP8 271 aa22.34■■□□□ 1.17
ACTB-212ENST00000484841 SFXN1Q9H9B4 322 aa22.34■■□□□ 1.17
ACTB-212ENST00000484841 SH2B1Q9NRF2 756 aaPredicted RBP22.34■■□□□ 1.17
ACTB-212ENST00000484841 DPP7Q9UHL4 492 aa22.34■■□□□ 1.17
ACTB-212ENST00000484841 HES2Q9Y543 173 aa22.34■■□□□ 1.17
ACTB-212ENST00000484841 C5orf42Q9H799 3197 aa22.33■■□□□ 1.17
ACTB-212ENST00000484841 C2CD2LO14523 706 aa22.33■■□□□ 1.17
ACTB-212ENST00000484841 NPTXRO95502 500 aa22.33■■□□□ 1.17
ACTB-212ENST00000484841 HOXD11P31277 338 aaPredicted RBP22.33■■□□□ 1.17
ACTB-212ENST00000484841 TTC38Q5R3I4 469 aa22.33■■□□□ 1.17
ACTB-212ENST00000484841 HAUS3Q68CZ6 603 aa22.33■■□□□ 1.17
ACTB-212ENST00000484841 TDRD5Q8NAT2 981 aaKnown RBP22.33■■□□□ 1.17
ACTB-212ENST00000484841 FBXL18Q96ME1 805 aa22.33■■□□□ 1.17
ACTB-212ENST00000484841 KLHL5Q96PQ7 755 aa22.33■■□□□ 1.17
ACTB-212ENST00000484841 RPS6KC1Q96S38 1066 aa22.33■■□□□ 1.17
ACTB-212ENST00000484841 POLR3CQ9BUI4 534 aaPredicted RBP22.33■■□□□ 1.17
ACTB-212ENST00000484841 C2orf40Q9H1Z8 148 aa22.33■■□□□ 1.17
ACTB-212ENST00000484841 PRMT7Q9NVM4 692 aaPredicted RBP22.33■■□□□ 1.17
ACTB-212ENST00000484841 PARP2Q9UGN5 583 aa22.33■■□□□ 1.17
ACTB-212ENST00000484841 ARHGEF35A5YM69 484 aa22.32■■□□□ 1.16
ACTB-212ENST00000484841 B4GALT3O60512 393 aa22.32■■□□□ 1.16
ACTB-212ENST00000484841 SOD2P04179 222 aa22.32■■□□□ 1.16
ACTB-212ENST00000484841 WEE2P0C1S8 567 aa22.32■■□□□ 1.16
ACTB-212ENST00000484841 SCNN1GP51170 649 aa22.32■■□□□ 1.16
ACTB-212ENST00000484841 ST3GAL1Q11201 340 aa22.32■■□□□ 1.16
ACTB-212ENST00000484841 MTMR3Q13615 1198 aa22.32■■□□□ 1.16
ACTB-212ENST00000484841 TMC5Q6UXY8 1006 aa22.32■■□□□ 1.16
ACTB-212ENST00000484841 COLGALT2Q8IYK4 626 aa22.32■■□□□ 1.16
ACTB-212ENST00000484841 PLCD3Q8N3E9 789 aa22.32■■□□□ 1.16
ACTB-212ENST00000484841 PRIMPOLQ96LW4 560 aa22.32■■□□□ 1.16
ACTB-212ENST00000484841 PRRX2Q99811 253 aa22.32■■□□□ 1.16
ACTB-212ENST00000484841 HERC2P3Q9BVR0 1158 aa22.32■■□□□ 1.16
ACTB-212ENST00000484841 VN1R3Q9BXE9 311 aa22.32■■□□□ 1.16
ACTB-212ENST00000484841 RNF39Q9H2S5 420 aa22.32■■□□□ 1.16
ACTB-212ENST00000484841 CDH22Q9UJ99 828 aa22.32■■□□□ 1.16
ACTB-212ENST00000484841 MED24O75448 989 aa22.31■■□□□ 1.16
ACTB-212ENST00000484841 ADH1AP07327 375 aa22.31■■□□□ 1.16
ACTB-212ENST00000484841 CNPP09543 421 aaKnown RBP22.31■■□□□ 1.16
ACTB-212ENST00000484841 SPATA31C1P0DKV0 1188 aa22.31■■□□□ 1.16
ACTB-212ENST00000484841 RPA1P27694 616 aa22.31■■□□□ 1.16
ACTB-212ENST00000484841 GLUD2P49448 558 aa22.31■■□□□ 1.16
ACTB-212ENST00000484841 FBXL6Q8N531 539 aa22.31■■□□□ 1.16
ACTB-212ENST00000484841 ZFP42Q96MM3 310 aa22.31■■□□□ 1.16
ACTB-212ENST00000484841 NXF3Q9H4D5 531 aaKnown RBP22.31■■□□□ 1.16
ACTB-212ENST00000484841 GPRC5CQ9NQ84 441 aa22.31■■□□□ 1.16
ACTB-212ENST00000484841 SORCS3Q9UPU3 1222 aa22.31■■□□□ 1.16
ACTB-212ENST00000484841 A0A1B0GUA9 196 aa22.3■■□□□ 1.16
ACTB-212ENST00000484841 C2CD4DB7Z1M9 353 aa22.3■■□□□ 1.16
ACTB-212ENST00000484841 INPPL1O15357 1258 aa22.3■■□□□ 1.16
ACTB-212ENST00000484841 B4GALT5O43286 388 aa22.3■■□□□ 1.16
ACTB-212ENST00000484841 AKAP5P24588 427 aa22.3■■□□□ 1.16
ACTB-212ENST00000484841 TRAPPC10P48553 1259 aa22.3■■□□□ 1.16
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