RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000470271.5

CTPS1-206, Transcript of CTP synthase 1, humanhuman

TSL 3

Gene CTPS1, Length 801 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTPS1-206ENST00000470271 CSPG5O95196 566 aa21.93■■□□□ 1.1
CTPS1-206ENST00000470271 NPTXRO95502 500 aa21.93■■□□□ 1.1
CTPS1-206ENST00000470271 MYH11P35749 1972 aa21.93■■□□□ 1.1
CTPS1-206ENST00000470271 PPM1AP35813 382 aa21.93■■□□□ 1.1
CTPS1-206ENST00000470271 PBX3P40426 434 aa21.93■■□□□ 1.1
CTPS1-206ENST00000470271 RNASELQ05823 741 aaKnown RBP21.93■■□□□ 1.1
CTPS1-206ENST00000470271 DHX8Q14562 1220 aaKnown RBP21.93■■□□□ 1.1
CTPS1-206ENST00000470271 MCM6Q14566 821 aa21.93■■□□□ 1.1
CTPS1-206ENST00000470271 ARSHQ5FYA8 562 aa21.93■■□□□ 1.1
CTPS1-206ENST00000470271 GPBP1Q86WP2 473 aa21.93■■□□□ 1.1
CTPS1-206ENST00000470271 RNF39Q9H2S5 420 aa21.93■■□□□ 1.1
CTPS1-206ENST00000470271 NXF3Q9H4D5 531 aaKnown RBP21.93■■□□□ 1.1
CTPS1-206ENST00000470271 PDZD7Q9H5P4 517 aa21.93■■□□□ 1.1
CTPS1-206ENST00000470271 PLXNA4Q9HCM2 1894 aa21.93■■□□□ 1.1
CTPS1-206ENST00000470271 ARHGAP28Q9P2N2 729 aa21.93■■□□□ 1.1
CTPS1-206ENST00000470271 KANSL3Q9P2N6 904 aa21.93■■□□□ 1.1
CTPS1-206ENST00000470271 RBM19Q9Y4C8 960 aaKnown RBP21.93■■□□□ 1.1
CTPS1-206ENST00000470271 BRWD1Q9NSI6 2320 aa21.92■■□□□ 1.1
CTPS1-206ENST00000470271 PHLPP2Q6ZVD8 1323 aa21.92■■□□□ 1.1
CTPS1-206ENST00000470271 NPHP3-ACAD11A0A0J9YXS1 232 aa21.92■■□□□ 1.1
CTPS1-206ENST00000470271 SPTLC2O15270 562 aa21.92■■□□□ 1.1
CTPS1-206ENST00000470271 YEATS4O95619 227 aa21.92■■□□□ 1.1
CTPS1-206ENST00000470271 PLS3P13797 630 aa21.92■■□□□ 1.1
CTPS1-206ENST00000470271 ALDH7A1P49419 539 aaKnown RBP21.92■■□□□ 1.1
CTPS1-206ENST00000470271 BCAR1P56945 870 aa21.92■■□□□ 1.1
CTPS1-206ENST00000470271 PLCB3Q01970 1234 aa21.92■■□□□ 1.1
CTPS1-206ENST00000470271 FOXD4L6Q3SYB3 417 aaPredicted RBP21.92■■□□□ 1.1
CTPS1-206ENST00000470271 TCEAL5Q5H9L2 206 aa21.92■■□□□ 1.1
CTPS1-206ENST00000470271 FOXD4L3Q6VB84 417 aaPredicted RBP21.92■■□□□ 1.1
CTPS1-206ENST00000470271 ATXN2LQ8WWM7 1075 aaKnown RBP21.92■■□□□ 1.1
CTPS1-206ENST00000470271 LARP4BQ92615 738 aaKnown RBP21.92■■□□□ 1.1
CTPS1-206ENST00000470271 NTPCRQ9BSD7 190 aaKnown RBP21.92■■□□□ 1.1
CTPS1-206ENST00000470271 APOL6Q9BWW8 343 aa21.92■■□□□ 1.1
CTPS1-206ENST00000470271 TMEM134Q9H6X4 195 aa21.92■■□□□ 1.1
CTPS1-206ENST00000470271 SPG21Q9NZD8 308 aa21.92■■□□□ 1.1
CTPS1-206ENST00000470271 COG5Q9UP83 839 aa21.92■■□□□ 1.1
CTPS1-206ENST00000470271 USP20Q9Y2K6 914 aa21.92■■□□□ 1.1
CTPS1-206ENST00000470271 ATG2AQ2TAZ0 1938 aa21.92■■□□□ 1.1
CTPS1-206ENST00000470271 ZC3H11AO75152 810 aaKnown RBP eCLIP21.91■■□□□ 1.1
CTPS1-206ENST00000470271 PPP6R2O75170 966 aa21.91■■□□□ 1.1
CTPS1-206ENST00000470271 EDN1P05305 212 aa21.91■■□□□ 1.1
CTPS1-206ENST00000470271 DDIT3P35638 169 aa21.91■■□□□ 1.1
CTPS1-206ENST00000470271 AFF1P51825 1210 aaKnown RBP21.91■■□□□ 1.1
CTPS1-206ENST00000470271 CACNB1Q02641 598 aaPredicted RBP21.91■■□□□ 1.1
CTPS1-206ENST00000470271 SPIRE2Q8WWL2 714 aa21.91■■□□□ 1.1
CTPS1-206ENST00000470271 HLA-CQ95604 372 aa21.91■■□□□ 1.1
CTPS1-206ENST00000470271 ADPGKQ9BRR6 497 aa21.91■■□□□ 1.1
CTPS1-206ENST00000470271 NRDE2Q9H7Z3 1164 aa21.91■■□□□ 1.1
CTPS1-206ENST00000470271 STK17AQ9UEE5 414 aa21.91■■□□□ 1.1
CTPS1-206ENST00000470271 PUF60Q9UHX1 559 aaKnown RBP21.91■■□□□ 1.1
CTPS1-206ENST00000470271 ODF2LQ9ULJ1 636 aa21.91■■□□□ 1.1
CTPS1-206ENST00000470271 LZTS1Q9Y250 596 aa21.91■■□□□ 1.1
CTPS1-206ENST00000470271 GIT1Q9Y2X7 761 aa21.91■■□□□ 1.1
CTPS1-206ENST00000470271 CARNS1A5YM72 827 aa21.9■■□□□ 1.1
CTPS1-206ENST00000470271 ARL5CA6NH57 179 aa21.9■■□□□ 1.1
CTPS1-206ENST00000470271 SLC16A4O15374 487 aa21.9■■□□□ 1.1
CTPS1-206ENST00000470271 POMCP01189 267 aa21.9■■□□□ 1.1
CTPS1-206ENST00000470271 AKAP5P24588 427 aa21.9■■□□□ 1.1
CTPS1-206ENST00000470271 IRS1P35568 1242 aa21.9■■□□□ 1.1
CTPS1-206ENST00000470271 MLH1P40692 756 aa21.9■■□□□ 1.1
CTPS1-206ENST00000470271 SMTNP53814 917 aa21.9■■□□□ 1.1
CTPS1-206ENST00000470271 KRT17Q04695 432 aa21.9■■□□□ 1.1
CTPS1-206ENST00000470271 BECN1Q14457 450 aa21.9■■□□□ 1.1
CTPS1-206ENST00000470271 NT5DC1Q5TFE4 455 aa21.9■■□□□ 1.1
CTPS1-206ENST00000470271 ATF7IP2Q5U623 682 aa21.9■■□□□ 1.1
CTPS1-206ENST00000470271 RRAGBQ5VZM2 374 aa21.9■■□□□ 1.1
CTPS1-206ENST00000470271 SLC39A11Q8N1S5 342 aa21.9■■□□□ 1.1
CTPS1-206ENST00000470271 MRPS27Q92552 414 aaKnown RBP21.9■■□□□ 1.1
CTPS1-206ENST00000470271 FAM193BQ96PV7 902 aaPredicted RBP21.9■■□□□ 1.1
CTPS1-206ENST00000470271 GAD1Q99259 594 aa21.9■■□□□ 1.1
CTPS1-206ENST00000470271 REEP2Q9BRK0 252 aa21.9■■□□□ 1.1
CTPS1-206ENST00000470271 GBP3Q9H0R5 595 aa21.9■■□□□ 1.1
CTPS1-206ENST00000470271 TLR9Q9NR96 1032 aa21.9■■□□□ 1.1
CTPS1-206ENST00000470271 LARSQ9P2J5 1176 aaKnown RBP21.9■■□□□ 1.1
CTPS1-206ENST00000470271 DAXXQ9UER7 740 aaPredicted RBP21.9■■□□□ 1.1
CTPS1-206ENST00000470271 INPPL1O15357 1258 aa21.89■■□□□ 1.09
CTPS1-206ENST00000470271 KRT18P05783 430 aaKnown RBP21.89■■□□□ 1.09
CTPS1-206ENST00000470271 MRPS5P82675 430 aaKnown RBP21.89■■□□□ 1.09
CTPS1-206ENST00000470271 EEF1DP3Q658K8 133 aa21.89■■□□□ 1.09
CTPS1-206ENST00000470271 ATL3Q6DD88 541 aa21.89■■□□□ 1.09
CTPS1-206ENST00000470271 CCDC73Q6ZRK6 1079 aa21.89■■□□□ 1.09
CTPS1-206ENST00000470271 TAS1R3Q7RTX0 852 aa21.89■■□□□ 1.09
CTPS1-206ENST00000470271 ZNF280BQ86YH2 543 aa21.89■■□□□ 1.09
CTPS1-206ENST00000470271 PPP2R3CQ969Q6 453 aa21.89■■□□□ 1.09
CTPS1-206ENST00000470271 ZFP42Q96MM3 310 aa21.89■■□□□ 1.09
CTPS1-206ENST00000470271 MRPL4Q9BYD3 311 aaKnown RBP21.89■■□□□ 1.09
CTPS1-206ENST00000470271 PARP2Q9UGN5 583 aa21.89■■□□□ 1.09
CTPS1-206ENST00000470271 NT5C1B-RDH14C9J2C7 533 aa21.88■■□□□ 1.09
CTPS1-206ENST00000470271 DDHD2O94830 711 aa21.88■■□□□ 1.09
CTPS1-206ENST00000470271 FAM13AO94988 1023 aa21.88■■□□□ 1.09
CTPS1-206ENST00000470271 GALTP07902 379 aa21.88■■□□□ 1.09
CTPS1-206ENST00000470271 TFF2Q03403 129 aa21.88■■□□□ 1.09
CTPS1-206ENST00000470271 GIT2Q14161 759 aa21.88■■□□□ 1.09
CTPS1-206ENST00000470271 AAK1Q2M2I8 961 aa21.88■■□□□ 1.09
CTPS1-206ENST00000470271 DCAF4L1Q3SXM0 396 aa21.88■■□□□ 1.09
CTPS1-206ENST00000470271 APBB1IPQ7Z5R6 666 aaPredicted RBP21.88■■□□□ 1.09
CTPS1-206ENST00000470271 TMEM161BQ8NDZ6 487 aa21.88■■□□□ 1.09
CTPS1-206ENST00000470271 MICAL1Q8TDZ2 1067 aa21.88■■□□□ 1.09
CTPS1-206ENST00000470271 TMEM169Q96HH4 297 aa21.88■■□□□ 1.09
CTPS1-206ENST00000470271 ASB2Q96Q27 587 aa21.88■■□□□ 1.09
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