RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000469733.5

FAAP20-211, Transcript of FA core complex associated protein 20, humanhuman

TSL 2

Gene FAAP20, Length 2,280 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAAP20-211ENST00000469733 CTNNBL1Q8WYA6 563 aaPredicted RBP18.58■□□□□ 0.56
FAAP20-211ENST00000469733 LRRC1Q9BTT6 524 aa18.58■□□□□ 0.56
FAAP20-211ENST00000469733 IGKV6D-21A0A0A0MT36 114 aa18.57■□□□□ 0.56
FAAP20-211ENST00000469733 SPDYE5A6NIY4 337 aa18.57■□□□□ 0.56
FAAP20-211ENST00000469733 ZMYND10O75800 440 aa18.57■□□□□ 0.56
FAAP20-211ENST00000469733 CYP24A1Q07973 514 aa18.57■□□□□ 0.56
FAAP20-211ENST00000469733 GPS2Q13227 327 aa18.57■□□□□ 0.56
FAAP20-211ENST00000469733 TAS1R3Q7RTX0 852 aa18.57■□□□□ 0.56
FAAP20-211ENST00000469733 CDCA5Q96FF9 252 aa18.57■□□□□ 0.56
FAAP20-211ENST00000469733 RBM12Q9NTZ6 932 aaKnown RBP18.57■□□□□ 0.56
FAAP20-211ENST00000469733 FARP2O94887 1054 aaPredicted RBP18.57■□□□□ 0.56
FAAP20-211ENST00000469733 SCP2P22307 547 aa18.57■□□□□ 0.56
FAAP20-211ENST00000469733 GTF2H1P32780 548 aa18.57■□□□□ 0.56
FAAP20-211ENST00000469733 ENPEPQ07075 957 aa18.57■□□□□ 0.56
FAAP20-211ENST00000469733 TTLL12Q14166 644 aaPredicted RBP18.57■□□□□ 0.56
FAAP20-211ENST00000469733 NEDD9Q14511 834 aa18.57■□□□□ 0.56
FAAP20-211ENST00000469733 SLFN11Q7Z7L1 901 aa18.57■□□□□ 0.56
FAAP20-211ENST00000469733 RFFLQ8WZ73 363 aa18.57■□□□□ 0.56
FAAP20-211ENST00000469733 NIFKQ9BYG3 293 aaKnown RBP18.57■□□□□ 0.56
FAAP20-211ENST00000469733 DHX33Q9H6R0 707 aaKnown RBP18.57■□□□□ 0.56
FAAP20-211ENST00000469733 COQ4Q9Y3A0 265 aa18.57■□□□□ 0.56
FAAP20-211ENST00000469733 KCNK3O14649 394 aa18.56■□□□□ 0.56
FAAP20-211ENST00000469733 SLC25A27O95847 323 aa18.56■□□□□ 0.56
FAAP20-211ENST00000469733 C9orf131Q5VYM1 1079 aa18.56■□□□□ 0.56
FAAP20-211ENST00000469733 CCNI2Q6ZMN8 369 aaPredicted RBP18.56■□□□□ 0.56
FAAP20-211ENST00000469733 PEX26Q7Z412 305 aa18.56■□□□□ 0.56
FAAP20-211ENST00000469733 SLC7A3Q8WY07 619 aa18.56■□□□□ 0.56
FAAP20-211ENST00000469733 TMEM143Q96AN5 459 aa18.56■□□□□ 0.56
FAAP20-211ENST00000469733 PBKQ96KB5 322 aa18.56■□□□□ 0.56
FAAP20-211ENST00000469733 POP1Q99575 1024 aaKnown RBP18.56■□□□□ 0.56
FAAP20-211ENST00000469733 PORCNQ9H237 461 aa18.56■□□□□ 0.56
FAAP20-211ENST00000469733 GOLPH3Q9H4A6 298 aa18.56■□□□□ 0.56
FAAP20-211ENST00000469733 AGTPBP1Q9UPW5 1226 aa18.56■□□□□ 0.56
FAAP20-211ENST00000469733 CNMDO75829 334 aa18.56■□□□□ 0.56
FAAP20-211ENST00000469733 OAS2P29728 719 aaKnown RBP18.56■□□□□ 0.56
FAAP20-211ENST00000469733 USP8P40818 1118 aa18.56■□□□□ 0.56
FAAP20-211ENST00000469733 LIG4P49917 911 aa18.56■□□□□ 0.56
FAAP20-211ENST00000469733 MFAP3P55082 362 aa18.56■□□□□ 0.56
FAAP20-211ENST00000469733 STRN3Q13033 797 aa18.56■□□□□ 0.56
FAAP20-211ENST00000469733 GLE1Q53GS7 698 aaKnown RBP18.56■□□□□ 0.56
FAAP20-211ENST00000469733 C8orf74Q6P047 294 aa18.56■□□□□ 0.56
FAAP20-211ENST00000469733 PPM1KQ8N3J5 372 aa18.56■□□□□ 0.56
FAAP20-211ENST00000469733 SLC20A1Q8WUM9 679 aa18.56■□□□□ 0.56
FAAP20-211ENST00000469733 SEMA4DQ92854 862 aa18.56■□□□□ 0.56
FAAP20-211ENST00000469733 MPHOSPH6Q99547 160 aaKnown RBP18.56■□□□□ 0.56
FAAP20-211ENST00000469733 KCNH4Q9UQ05 1017 aa18.56■□□□□ 0.56
FAAP20-211ENST00000469733 LRRC37A2A6NM11 1700 aa18.55■□□□□ 0.56
FAAP20-211ENST00000469733 GSTTP1A0A1W2PQM5 241 aa18.55■□□□□ 0.56
FAAP20-211ENST00000469733 TGFB3P10600 412 aa18.55■□□□□ 0.56
FAAP20-211ENST00000469733 ABCB4P21439 1286 aa18.55■□□□□ 0.56
FAAP20-211ENST00000469733 GPC3P51654 580 aa18.55■□□□□ 0.56
FAAP20-211ENST00000469733 PPIL2Q13356 520 aa18.55■□□□□ 0.56
FAAP20-211ENST00000469733 FAM160B1Q5W0V3 765 aa18.55■□□□□ 0.56
FAAP20-211ENST00000469733 MOB2Q70IA6 237 aa18.55■□□□□ 0.56
FAAP20-211ENST00000469733 DAAM2Q86T65 1068 aa18.55■□□□□ 0.56
FAAP20-211ENST00000469733 FBXL13Q8NEE6 735 aa18.55■□□□□ 0.56
FAAP20-211ENST00000469733 KAT5Q92993 513 aa18.55■□□□□ 0.56
FAAP20-211ENST00000469733 FAM213AQ9BRX8 229 aa18.55■□□□□ 0.56
FAAP20-211ENST00000469733 TOPORSQ9NS56 1045 aaPredicted RBP18.55■□□□□ 0.56
FAAP20-211ENST00000469733 NRBP2Q9NSY0 501 aa18.55■□□□□ 0.56
FAAP20-211ENST00000469733 ANKRD62A6NC57 917 aa18.54■□□□□ 0.56
FAAP20-211ENST00000469733 ZNF233A6NK53 670 aa18.54■□□□□ 0.56
FAAP20-211ENST00000469733 RFC5P40937 340 aa18.54■□□□□ 0.56
FAAP20-211ENST00000469733 NAMPTP43490 491 aa18.54■□□□□ 0.56
FAAP20-211ENST00000469733 TNNT3P45378 269 aaPredicted RBP18.54■□□□□ 0.56
FAAP20-211ENST00000469733 USP50Q70EL3 339 aaPredicted RBP18.54■□□□□ 0.56
FAAP20-211ENST00000469733 FAM71AQ8IYT1 594 aa18.54■□□□□ 0.56
FAAP20-211ENST00000469733 DEPTORQ8TB45 409 aa18.54■□□□□ 0.56
FAAP20-211ENST00000469733 SLC35G2Q8TBE7 412 aa18.54■□□□□ 0.56
FAAP20-211ENST00000469733 ASAP3Q8TDY4 903 aa18.54■□□□□ 0.56
FAAP20-211ENST00000469733 HDAC7Q8WUI4 952 aa18.54■□□□□ 0.56
FAAP20-211ENST00000469733 KCNN1Q92952 543 aa18.54■□□□□ 0.56
FAAP20-211ENST00000469733 KREMEN1Q96MU8 473 aa18.54■□□□□ 0.56
FAAP20-211ENST00000469733 SELENOOQ9BVL4 669 aa18.54■□□□□ 0.56
FAAP20-211ENST00000469733 ACBD3Q9H3P7 528 aa18.54■□□□□ 0.56
FAAP20-211ENST00000469733 KIAA1586Q9HCI6 787 aa18.54■□□□□ 0.56
FAAP20-211ENST00000469733 UTP3Q9NQZ2 479 aaKnown RBP eCLIP18.54■□□□□ 0.565e-11■■■■■ 129.8
FAAP20-211ENST00000469733 TAS2R14Q9NYV8 317 aa18.54■□□□□ 0.56
FAAP20-211ENST00000469733 SUCLA2Q9P2R7 463 aaPredicted RBP18.54■□□□□ 0.56
FAAP20-211ENST00000469733 DMGDHQ9UI17 866 aaKnown RBP18.54■□□□□ 0.56
FAAP20-211ENST00000469733 EXTL3O43909 919 aa18.54■□□□□ 0.56
FAAP20-211ENST00000469733 DLATP10515 647 aaKnown RBP18.54■□□□□ 0.56
FAAP20-211ENST00000469733 GLRA2P23416 452 aa18.54■□□□□ 0.56
FAAP20-211ENST00000469733 COPB2P35606 906 aa18.54■□□□□ 0.56
FAAP20-211ENST00000469733 ARL2P36404 184 aa18.54■□□□□ 0.56
FAAP20-211ENST00000469733 PALB2Q86YC2 1186 aa18.54■□□□□ 0.56
FAAP20-211ENST00000469733 TAS1R2Q8TE23 839 aa18.54■□□□□ 0.56
FAAP20-211ENST00000469733 NT5C1BQ96P26 610 aa18.54■□□□□ 0.56
FAAP20-211ENST00000469733 PCYT2Q99447 389 aa18.54■□□□□ 0.56
FAAP20-211ENST00000469733 PDE11AQ9HCR9 933 aa18.54■□□□□ 0.56
FAAP20-211ENST00000469733 RAB20Q9NX57 234 aa18.54■□□□□ 0.56
FAAP20-211ENST00000469733 STIM2Q9P246 746 aa18.54■□□□□ 0.56
FAAP20-211ENST00000469733 STXBP5LQ9Y2K9 1186 aa18.54■□□□□ 0.56
FAAP20-211ENST00000469733 LRRIQ4A6NIV6 560 aa18.53■□□□□ 0.56
FAAP20-211ENST00000469733 GGPS1O95749 300 aa18.53■□□□□ 0.56
FAAP20-211ENST00000469733 STAT5BP51692 787 aa18.53■□□□□ 0.56
FAAP20-211ENST00000469733 METTL7BQ6UX53 244 aa18.53■□□□□ 0.56
FAAP20-211ENST00000469733 RPUSD2Q8IZ73 545 aaKnown RBP18.53■□□□□ 0.56
FAAP20-211ENST00000469733 USP38Q8NB14 1042 aa18.53■□□□□ 0.56
FAAP20-211ENST00000469733 SHC3Q92529 594 aa18.53■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 23.9 ms