RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000466245.1

TTLL3-223, Transcript of tubulin tyrosine ligase like 3, human

TSL 3

Gene TTLL3, Length 616 nt, Biotype processed transcript.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
TTLL3-223	ENST00000466245	RARRES1	P49788	294 aa		11.18	□□□□□ -0.62
TTLL3-223	ENST00000466245	CLCN3	P51790	818 aa		11.18	□□□□□ -0.62
TTLL3-223	ENST00000466245	POLG	P54098	1239 aa	Predicted RBP	11.18	□□□□□ -0.62
TTLL3-223	ENST00000466245	NLRP11	P59045	1033 aa	Known RBP	11.18	□□□□□ -0.62
TTLL3-223	ENST00000466245	DSC3	Q14574	896 aa		11.18	□□□□□ -0.62
TTLL3-223	ENST00000466245	ANGPT1	Q15389	498 aa		11.18	□□□□□ -0.62
TTLL3-223	ENST00000466245	RARS2	Q5T160	578 aa	Known RBP	11.18	□□□□□ -0.62
TTLL3-223	ENST00000466245	ELMSAN1	Q6PJG2	1045 aa		11.18	□□□□□ -0.62
TTLL3-223	ENST00000466245	DTHD1	Q6ZMT9	781 aa		11.18	□□□□□ -0.62
TTLL3-223	ENST00000466245	CCDC149	Q6ZUS6	474 aa		11.18	□□□□□ -0.62
TTLL3-223	ENST00000466245	OTOP3	Q7RTS5	596 aa		11.18	□□□□□ -0.62
TTLL3-223	ENST00000466245	PPFIBP1	Q86W92	1011 aa		11.18	□□□□□ -0.62
TTLL3-223	ENST00000466245	IFNLR1	Q8IU57	520 aa	Predicted RBP	11.18	□□□□□ -0.62
TTLL3-223	ENST00000466245	HSCB	Q8IWL3	235 aa		11.18	□□□□□ -0.62
TTLL3-223	ENST00000466245	TPH2	Q8IWU9	490 aa		11.18	□□□□□ -0.62
TTLL3-223	ENST00000466245	CCDC105	Q8IYK2	499 aa		11.18	□□□□□ -0.62
TTLL3-223	ENST00000466245	TMEM169	Q96HH4	297 aa		11.18	□□□□□ -0.62
TTLL3-223	ENST00000466245	CEP170P1	Q96L14	293 aa		11.18	□□□□□ -0.62
TTLL3-223	ENST00000466245	AK8	Q96MA6	479 aa		11.18	□□□□□ -0.62
TTLL3-223	ENST00000466245	NFKBIZ	Q9BYH8	718 aa		11.18	□□□□□ -0.62
TTLL3-223	ENST00000466245	ZSCAN16	Q9H4T2	348 aa	Predicted RBP	11.18	□□□□□ -0.62
TTLL3-223	ENST00000466245	CWH43	Q9H720	699 aa		11.18	□□□□□ -0.62
TTLL3-223	ENST00000466245	CHST12	Q9NRB3	414 aa		11.18	□□□□□ -0.62
TTLL3-223	ENST00000466245	LRWD1	Q9UFC0	647 aa		11.18	□□□□□ -0.62
TTLL3-223	ENST00000466245	LIMD1	Q9UGP4	676 aa		11.18	□□□□□ -0.62
TTLL3-223	ENST00000466245	AKT3	Q9Y243	479 aa		11.18	□□□□□ -0.62
TTLL3-223	ENST00000466245	NOC2L	Q9Y3T9	749 aa	Known RBP	11.18	□□□□□ -0.62
TTLL3-223	ENST00000466245	MGEA5	O60502	916 aa		11.17	□□□□□ -0.62
TTLL3-223	ENST00000466245	VTN	P04004	478 aa		11.17	□□□□□ -0.62
TTLL3-223	ENST00000466245	ASGR2	P07307	311 aa		11.17	□□□□□ -0.62
TTLL3-223	ENST00000466245	FGFR1	P11362	822 aa		11.17	□□□□□ -0.62
TTLL3-223	ENST00000466245	ALDH7A1	P49419	539 aa	Known RBP	11.17	□□□□□ -0.62
TTLL3-223	ENST00000466245	NPEPPS	P55786	919 aa		11.17	□□□□□ -0.62
TTLL3-223	ENST00000466245	CYP4A11	Q02928	519 aa		11.17	□□□□□ -0.62
TTLL3-223	ENST00000466245	REST	Q13127	1097 aa		11.17	□□□□□ -0.62
TTLL3-223	ENST00000466245	CTTN	Q14247	550 aa	Known RBP	11.17	□□□□□ -0.62
TTLL3-223	ENST00000466245	MXD4	Q14582	209 aa	Predicted RBP	11.17	□□□□□ -0.62
TTLL3-223	ENST00000466245	EMC2	Q15006	297 aa		11.17	□□□□□ -0.62
TTLL3-223	ENST00000466245	KIZ	Q2M2Z5	673 aa		11.17	□□□□□ -0.62
TTLL3-223	ENST00000466245	XKR9	Q5GH70	373 aa		11.17	□□□□□ -0.62
TTLL3-223	ENST00000466245	HYI	Q5T013	277 aa		11.17	□□□□□ -0.62
TTLL3-223	ENST00000466245	PLA2G4F	Q68DD2	849 aa		11.17	□□□□□ -0.62
TTLL3-223	ENST00000466245	FAM228A	Q86W67	206 aa		11.17	□□□□□ -0.62
TTLL3-223	ENST00000466245	LRRC71	Q8N4P6	559 aa		11.17	□□□□□ -0.62
TTLL3-223	ENST00000466245	MRPL43	Q8N983	215 aa	Known RBP	11.17	□□□□□ -0.62
TTLL3-223	ENST00000466245	MCPH1	Q8NEM0	835 aa		11.17	□□□□□ -0.62
TTLL3-223	ENST00000466245	PSPC1	Q8WXF1	523 aa	Known RBP	11.17	□□□□□ -0.62
TTLL3-223	ENST00000466245	MYH11	P35749	1972 aa		11.16	□□□□□ -0.62
TTLL3-223	ENST00000466245	ZC3H11B	A0A1B0GUI2	810 aa	Predicted RBP	11.16	□□□□□ -0.62
TTLL3-223	ENST00000466245	TMEM150B	A6NC51	233 aa		11.16	□□□□□ -0.62
TTLL3-223	ENST00000466245	STX6	O43752	255 aa		11.16	□□□□□ -0.62
TTLL3-223	ENST00000466245	MED24	O75448	989 aa		11.16	□□□□□ -0.62
TTLL3-223	ENST00000466245	EOMES	O95936	686 aa		11.16	□□□□□ -0.62
TTLL3-223	ENST00000466245	SFPQ	P23246	707 aa	Known RBP eCLIP	11.16	□□□□□ -0.62
TTLL3-223	ENST00000466245	DRP2	Q13474	957 aa		11.16	□□□□□ -0.62
TTLL3-223	ENST00000466245	TDG	Q13569	410 aa		11.16	□□□□□ -0.62
TTLL3-223	ENST00000466245	NBR1	Q14596	966 aa		11.16	□□□□□ -0.62
TTLL3-223	ENST00000466245	PUM1	Q14671	1186 aa	Known RBP eCLIP	11.16	□□□□□ -0.62	6e-6	■■□□□ 13.7
TTLL3-223	ENST00000466245	SRGAP1	Q7Z6B7	1085 aa		11.16	□□□□□ -0.62
TTLL3-223	ENST00000466245	CABP7	Q86V35	215 aa		11.16	□□□□□ -0.62
TTLL3-223	ENST00000466245	DTWD2	Q8NBA8	298 aa		11.16	□□□□□ -0.62
TTLL3-223	ENST00000466245	RNF169	Q8NCN4	708 aa		11.16	□□□□□ -0.62
TTLL3-223	ENST00000466245	SCLT1	Q96NL6	688 aa		11.16	□□□□□ -0.62
TTLL3-223	ENST00000466245	OSMR	Q99650	979 aa		11.16	□□□□□ -0.62
TTLL3-223	ENST00000466245	MTR	Q99707	1265 aa		11.16	□□□□□ -0.62
TTLL3-223	ENST00000466245	GCOM2	Q9BZD3	368 aa	Predicted RBP	11.16	□□□□□ -0.62
TTLL3-223	ENST00000466245	NT5C3A	Q9H0P0	336 aa		11.16	□□□□□ -0.62
TTLL3-223	ENST00000466245	SFXN1	Q9H9B4	322 aa		11.16	□□□□□ -0.62
TTLL3-223	ENST00000466245	IFT122	Q9HBG6	1241 aa		11.16	□□□□□ -0.62
TTLL3-223	ENST00000466245	XPNPEP1	Q9NQW7	623 aa		11.16	□□□□□ -0.62
TTLL3-223	ENST00000466245	SUCLA2	Q9P2R7	463 aa	Predicted RBP	11.16	□□□□□ -0.62
TTLL3-223	ENST00000466245	STK39	Q9UEW8	545 aa		11.16	□□□□□ -0.62
TTLL3-223	ENST00000466245	MTMR6	Q9Y217	621 aa		11.16	□□□□□ -0.62
TTLL3-223	ENST00000466245	COL4A3BP	Q9Y5P4	624 aa		11.16	□□□□□ -0.62
TTLL3-223	ENST00000466245	DENND4A	Q7Z401	1863 aa		11.16	□□□□□ -0.62
TTLL3-223	ENST00000466245	VPS37C	A5D8V6	355 aa	Predicted RBP	11.15	□□□□□ -0.62
TTLL3-223	ENST00000466245	C2orf71	A6NGG8	1288 aa		11.15	□□□□□ -0.62
TTLL3-223	ENST00000466245	CLASP2	O75122	1294 aa	Known RBP	11.15	□□□□□ -0.62
TTLL3-223	ENST00000466245	CXCL14	O95715	111 aa		11.15	□□□□□ -0.62
TTLL3-223	ENST00000466245	ARL2	P36404	184 aa		11.15	□□□□□ -0.62
TTLL3-223	ENST00000466245	LONP1	P36776	959 aa	Known RBP	11.15	□□□□□ -0.62
TTLL3-223	ENST00000466245	IL17A	Q16552	155 aa		11.15	□□□□□ -0.62
TTLL3-223	ENST00000466245	KRT79	Q5XKE5	535 aa		11.15	□□□□□ -0.62
TTLL3-223	ENST00000466245	TRMT1L	Q7Z2T5	733 aa	Known RBP	11.15	□□□□□ -0.62
TTLL3-223	ENST00000466245	FERMT3	Q86UX7	667 aa		11.15	□□□□□ -0.62
TTLL3-223	ENST00000466245	SIX5	Q8N196	739 aa		11.15	□□□□□ -0.62
TTLL3-223	ENST00000466245	ZNF579	Q8NAF0	562 aa	Known RBP	11.15	□□□□□ -0.62
TTLL3-223	ENST00000466245	PRPF31	Q8WWY3	499 aa	Known RBP	11.15	□□□□□ -0.62
TTLL3-223	ENST00000466245	CASD1	Q96PB1	797 aa		11.15	□□□□□ -0.62
TTLL3-223	ENST00000466245	DACT1	Q9NYF0	836 aa		11.15	□□□□□ -0.62
TTLL3-223	ENST00000466245	IGSF9	Q9P2J2	1179 aa		11.15	□□□□□ -0.62
TTLL3-223	ENST00000466245	HCST	Q9UBK5	93 aa		11.15	□□□□□ -0.62
TTLL3-223	ENST00000466245	DPP7	Q9UHL4	492 aa		11.15	□□□□□ -0.62
TTLL3-223	ENST00000466245	DUSP12	Q9UNI6	340 aa		11.15	□□□□□ -0.62
TTLL3-223	ENST00000466245	TPR	P12270	2363 aa	Known RBP	11.14	□□□□□ -0.63
TTLL3-223	ENST00000466245	ZBTB39	O15060	712 aa		11.14	□□□□□ -0.63
TTLL3-223	ENST00000466245	SKI	P12755	728 aa		11.14	□□□□□ -0.63
TTLL3-223	ENST00000466245	CYP11B2	P19099	503 aa		11.14	□□□□□ -0.63
TTLL3-223	ENST00000466245	CCT6A	P40227	531 aa	Known RBP	11.14	□□□□□ -0.63
TTLL3-223	ENST00000466245	PBX3	P40426	434 aa		11.14	□□□□□ -0.63

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 18.1 ms