RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000466097.1

SH3BP1-205, Transcript of SH3 domain binding protein 1, humanhuman

TSL 2

Gene SH3BP1, Length 777 nt, Biotype retained intron.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP1-205ENST00000466097 GPBP1Q86WP2 473 aa16.26■□□□□ 0.19
SH3BP1-205ENST00000466097 DAW1Q8N136 415 aa16.26■□□□□ 0.19
SH3BP1-205ENST00000466097 SMG8Q8ND04 991 aaKnown RBP16.26■□□□□ 0.19
SH3BP1-205ENST00000466097 SPPL3Q8TCT6 385 aa16.26■□□□□ 0.19
SH3BP1-205ENST00000466097 POF1BQ8WVV4 589 aa16.26■□□□□ 0.19
SH3BP1-205ENST00000466097 LARP4BQ92615 738 aaKnown RBP16.26■□□□□ 0.19
SH3BP1-205ENST00000466097 RAD54LQ92698 747 aa16.26■□□□□ 0.19
SH3BP1-205ENST00000466097 SYMPKQ92797 1274 aaKnown RBP16.26■□□□□ 0.19
SH3BP1-205ENST00000466097 PPP2R3CQ969Q6 453 aa16.26■□□□□ 0.19
SH3BP1-205ENST00000466097 EPSTI1Q96J88 318 aa16.26■□□□□ 0.19
SH3BP1-205ENST00000466097 KIFC3Q9BVG8 833 aa16.26■□□□□ 0.19
SH3BP1-205ENST00000466097 PRDM6Q9NQX0 595 aa16.26■□□□□ 0.19
SH3BP1-205ENST00000466097 TBC1D13Q9NVG8 400 aa16.26■□□□□ 0.19
SH3BP1-205ENST00000466097 SPTLC2O15270 562 aa16.25■□□□□ 0.19
SH3BP1-205ENST00000466097 ZC3H11AO75152 810 aaKnown RBP eCLIP16.25■□□□□ 0.19
SH3BP1-205ENST00000466097 YEATS4O95619 227 aa16.25■□□□□ 0.19
SH3BP1-205ENST00000466097 KRT18P05783 430 aaKnown RBP16.25■□□□□ 0.19
SH3BP1-205ENST00000466097 KRT17Q04695 432 aa16.25■□□□□ 0.19
SH3BP1-205ENST00000466097 DHX8Q14562 1220 aaKnown RBP16.25■□□□□ 0.19
SH3BP1-205ENST00000466097 AAK1Q2M2I8 961 aa16.25■□□□□ 0.19
SH3BP1-205ENST00000466097 ATL3Q6DD88 541 aa16.25■□□□□ 0.19
SH3BP1-205ENST00000466097 APBB1IPQ7Z5R6 666 aaPredicted RBP16.25■□□□□ 0.19
SH3BP1-205ENST00000466097 CDR2LQ86X02 465 aaPredicted RBP16.25■□□□□ 0.19
SH3BP1-205ENST00000466097 LINC00301Q8NCQ3 95 aa16.25■□□□□ 0.19
SH3BP1-205ENST00000466097 ATXN2LQ8WWM7 1075 aaKnown RBP16.25■□□□□ 0.19
SH3BP1-205ENST00000466097 HLA-CQ95604 372 aa16.25■□□□□ 0.19
SH3BP1-205ENST00000466097 CLIC6Q96NY7 704 aa16.25■□□□□ 0.19
SH3BP1-205ENST00000466097 FAM193BQ96PV7 902 aaPredicted RBP16.25■□□□□ 0.19
SH3BP1-205ENST00000466097 APOL6Q9BWW8 343 aa16.25■□□□□ 0.19
SH3BP1-205ENST00000466097 TMEM134Q9H6X4 195 aa16.25■□□□□ 0.19
SH3BP1-205ENST00000466097 BLOC1S4Q9NUP1 217 aa16.25■□□□□ 0.19
SH3BP1-205ENST00000466097 SPG21Q9NZD8 308 aa16.25■□□□□ 0.19
SH3BP1-205ENST00000466097 LARSQ9P2J5 1176 aaKnown RBP16.25■□□□□ 0.19
SH3BP1-205ENST00000466097 STK17AQ9UEE5 414 aa16.25■□□□□ 0.19
SH3BP1-205ENST00000466097 PUF60Q9UHX1 559 aaKnown RBP16.25■□□□□ 0.19
SH3BP1-205ENST00000466097 ODF2LQ9ULJ1 636 aa16.25■□□□□ 0.19
SH3BP1-205ENST00000466097 TCF20Q9UGU0 1960 aaKnown RBP16.24■□□□□ 0.19
SH3BP1-205ENST00000466097 H0YCG3 227 aa16.24■□□□□ 0.19
SH3BP1-205ENST00000466097 PPP6R2O75170 966 aa16.24■□□□□ 0.19
SH3BP1-205ENST00000466097 CSPG5O95196 566 aa16.24■□□□□ 0.19
SH3BP1-205ENST00000466097 PLS3P13797 630 aa16.24■□□□□ 0.19
SH3BP1-205ENST00000466097 PLCB3Q01970 1234 aa16.24■□□□□ 0.19
SH3BP1-205ENST00000466097 MCM6Q14566 821 aa16.24■□□□□ 0.19
SH3BP1-205ENST00000466097 TCEAL5Q5H9L2 206 aa16.24■□□□□ 0.19
SH3BP1-205ENST00000466097 RRAGBQ5VZM2 374 aa16.24■□□□□ 0.19
SH3BP1-205ENST00000466097 USP49Q70CQ1 688 aa16.24■□□□□ 0.19
SH3BP1-205ENST00000466097 SPIRE2Q8WWL2 714 aa16.24■□□□□ 0.19
SH3BP1-205ENST00000466097 NXF3Q9H4D5 531 aaKnown RBP16.24■□□□□ 0.19
SH3BP1-205ENST00000466097 PDZD7Q9H5P4 517 aa16.24■□□□□ 0.19
SH3BP1-205ENST00000466097 TLR9Q9NR96 1032 aa16.24■□□□□ 0.19
SH3BP1-205ENST00000466097 ARHGAP28Q9P2N2 729 aa16.24■□□□□ 0.19
SH3BP1-205ENST00000466097 TFIP11Q9UBB9 837 aaKnown RBP16.24■□□□□ 0.19
SH3BP1-205ENST00000466097 LZTS1Q9Y250 596 aa16.24■□□□□ 0.19
SH3BP1-205ENST00000466097 GIT1Q9Y2X7 761 aa16.24■□□□□ 0.19
SH3BP1-205ENST00000466097 ZMYM2Q9UBW7 1377 aa16.24■□□□□ 0.19
SH3BP1-205ENST00000466097 NCOR1O75376 2440 aa16.24■□□□□ 0.19
SH3BP1-205ENST00000466097 SFI1A8K8P3 1242 aa16.23■□□□□ 0.19
SH3BP1-205ENST00000466097 SLC16A4O15374 487 aa16.23■□□□□ 0.19
SH3BP1-205ENST00000466097 NCK2O43639 380 aa16.23■□□□□ 0.19
SH3BP1-205ENST00000466097 FAM13AO94988 1023 aa16.23■□□□□ 0.19
SH3BP1-205ENST00000466097 DDIT3P35638 169 aa16.23■□□□□ 0.19
SH3BP1-205ENST00000466097 PBX3P40426 434 aa16.23■□□□□ 0.19
SH3BP1-205ENST00000466097 BCAR1P56945 870 aa16.23■□□□□ 0.19
SH3BP1-205ENST00000466097 MRPS5P82675 430 aaKnown RBP16.23■□□□□ 0.19
SH3BP1-205ENST00000466097 STRN3Q13033 797 aa16.23■□□□□ 0.19
SH3BP1-205ENST00000466097 DCAF4L1Q3SXM0 396 aa16.23■□□□□ 0.19
SH3BP1-205ENST00000466097 FOXD4L6Q3SYB3 417 aaPredicted RBP16.23■□□□□ 0.19
SH3BP1-205ENST00000466097 ATF7IP2Q5U623 682 aa16.23■□□□□ 0.19
SH3BP1-205ENST00000466097 PDE12Q6L8Q7 609 aaKnown RBP16.23■□□□□ 0.19
SH3BP1-205ENST00000466097 FOXD4L3Q6VB84 417 aaPredicted RBP16.23■□□□□ 0.19
SH3BP1-205ENST00000466097 CCDC73Q6ZRK6 1079 aa16.23■□□□□ 0.19
SH3BP1-205ENST00000466097 MICAL1Q8TDZ2 1067 aa16.23■□□□□ 0.19
SH3BP1-205ENST00000466097 MRPS27Q92552 414 aaKnown RBP16.23■□□□□ 0.19
SH3BP1-205ENST00000466097 TMEM169Q96HH4 297 aa16.23■□□□□ 0.19
SH3BP1-205ENST00000466097 REEP2Q9BRK0 252 aa16.23■□□□□ 0.19
SH3BP1-205ENST00000466097 NTPCRQ9BSD7 190 aaKnown RBP16.23■□□□□ 0.19
SH3BP1-205ENST00000466097 MRPL4Q9BYD3 311 aaKnown RBP16.23■□□□□ 0.19
SH3BP1-205ENST00000466097 GBP3Q9H0R5 595 aa16.23■□□□□ 0.19
SH3BP1-205ENST00000466097 NRDE2Q9H7Z3 1164 aa16.23■□□□□ 0.19
SH3BP1-205ENST00000466097 PARP2Q9UGN5 583 aa16.23■□□□□ 0.19
SH3BP1-205ENST00000466097 CFAP45Q9UL16 551 aa16.23■□□□□ 0.19
SH3BP1-205ENST00000466097 HES2Q9Y543 173 aa16.23■□□□□ 0.19
SH3BP1-205ENST00000466097 SPTBN5Q9NRC6 3674 aaKnown RBP16.23■□□□□ 0.19
SH3BP1-205ENST00000466097 NPHP3-ACAD11A0A0J9YXS1 232 aa16.22■□□□□ 0.19
SH3BP1-205ENST00000466097 ARL5CA6NH57 179 aa16.22■□□□□ 0.19
SH3BP1-205ENST00000466097 TTLL13PA6NNM8 815 aa16.22■□□□□ 0.19
SH3BP1-205ENST00000466097 INPPL1O15357 1258 aa16.22■□□□□ 0.19
SH3BP1-205ENST00000466097 TBCAO75347 108 aaKnown RBP16.22■□□□□ 0.19
SH3BP1-205ENST00000466097 POMCP01189 267 aa16.22■□□□□ 0.19
SH3BP1-205ENST00000466097 DNAJB1P25685 340 aa16.22■□□□□ 0.19
SH3BP1-205ENST00000466097 MLH1P40692 756 aa16.22■□□□□ 0.19
SH3BP1-205ENST00000466097 PKP1Q13835 747 aa16.22■□□□□ 0.19
SH3BP1-205ENST00000466097 CAMK1Q14012 370 aa16.22■□□□□ 0.19
SH3BP1-205ENST00000466097 BMS1Q14692 1282 aaKnown RBP16.22■□□□□ 0.19
SH3BP1-205ENST00000466097 ARSHQ5FYA8 562 aa16.22■□□□□ 0.19
SH3BP1-205ENST00000466097 SLC39A11Q8N1S5 342 aa16.22■□□□□ 0.19
SH3BP1-205ENST00000466097 KCNG4Q8TDN1 519 aa16.22■□□□□ 0.19
SH3BP1-205ENST00000466097 RPS6KC1Q96S38 1066 aa16.22■□□□□ 0.19
SH3BP1-205ENST00000466097 GAD1Q99259 594 aa16.22■□□□□ 0.19
SH3BP1-205ENST00000466097 RNF39Q9H2S5 420 aa16.22■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 28.9 ms