RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000462357.1

IMP4-209, Transcript of IMP4, U3 small nucleolar ribonucleoprotein, humanhuman

TSL 5

Gene IMP4, Length 533 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IMP4-209ENST00000462357 MAPK7Q13164 816 aa22.62■■□□□ 1.21
IMP4-209ENST00000462357 GIT2Q14161 759 aa22.62■■□□□ 1.21
IMP4-209ENST00000462357 ADALQ6DHV7 355 aa22.62■■□□□ 1.21
IMP4-209ENST00000462357 FAM178BQ8IXR5 827 aa22.62■■□□□ 1.21
IMP4-209ENST00000462357 ZNF558Q96NG5 402 aa22.62■■□□□ 1.21
IMP4-209ENST00000462357 CCDC113Q9H0I3 377 aa22.62■■□□□ 1.21
IMP4-209ENST00000462357 TNMDQ9H2S6 317 aa22.62■■□□□ 1.21
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IMP4-209ENST00000462357 ZDHHC9Q9Y397 364 aa22.62■■□□□ 1.21
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IMP4-209ENST00000462357 CIZ1Q9ULV3 898 aaPredicted RBP22.6■■□□□ 1.21
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IMP4-209ENST00000462357 MATR3P43243 847 aaKnown RBP eCLIP22.58■■□□□ 1.21
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IMP4-209ENST00000462357 LPXNO60711 386 aa22.57■■□□□ 1.2
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IMP4-209ENST00000462357 HERC4Q5GLZ8 1057 aaPredicted RBP22.57■■□□□ 1.2
IMP4-209ENST00000462357 MICAL1Q8TDZ2 1067 aa22.57■■□□□ 1.2
IMP4-209ENST00000462357 TMEM175Q9BSA9 504 aa22.57■■□□□ 1.2
IMP4-209ENST00000462357 CWH43Q9H720 699 aa22.57■■□□□ 1.2
IMP4-209ENST00000462357 MRPL44Q9H9J2 332 aaKnown RBP22.57■■□□□ 1.2
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IMP4-209ENST00000462357 ARL5CA6NH57 179 aa22.56■■□□□ 1.2
IMP4-209ENST00000462357 EPOPA6NHQ4 379 aa22.56■■□□□ 1.2
IMP4-209ENST00000462357 MYMKA6NI61 221 aa22.56■■□□□ 1.2
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